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Detailed information of Bpl_scaf_64483-1.8 in Gigantidas platifrons Gene info

Gene ID	Annotation	Scaffold	Start	End	Strand
Bpl_scaf_64483-1.8	AMINOTRANSFERASE CLASS III	Bpl_scaf_64483	109473	131858	-

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CDS

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Bpl_scaf_64483-1.8

TTGAGTTGCACGGTGTCGAGCTGTTGTTGTAGTGTTGAACAACGAAGGAGACATATTACTATTGGAACGACATAAATAAAGATGTTTCACTTGTTAGTAAGACAGCCAATCAAACATGTTTTTAATCAAGGAATAAGAACTGTAGCTTCACAAACACAGAAATCTCAGCAAGTCTTTGATCGAGAGAACAAGTTTGGAGCACATAACTATGGTCCTTTACCAGTAGCTCTGGACAGAGGGGAAGGTATCTATGTGTGGGATGTAGAGGGTAATAAATATTTTGATTACCTTAGTGCATATAGTGCATGTAACCAAGGACACTGTCATCCAAAGATTGTCAAAGCTTTAACAGATCAGGCATCTAAATTAACTTTAACTTCTAGAGCTTTCTACAATACTGTGTTGGGAGAATTTGAAGAGTACATAACAAAGCTGTTTGGATATGATAAAGTTCTCCCTATGAATACTGGTGTTGAGGGTGGTGAAACAGCATGTAAGTTAGCTAGAAAGTGGGCTTATAAAGTAAAGAAAGTACCAAGTAATCAAGCTAAGATAGTGTTTGCTGCTGGCAACTTCTGGGGTCGTACATTAGCAGCAATATCGTCATCCACAGATCCCTCTAGCTACGATGGGTATGGACCATACATGCCAGGATTAAGTATTGTTCCATACGATGATTTAGGGGCTCTGGAGAGGGAATTCCAGGACTCTAATGTGTGTGCCTATATGGTAGAGCCAATCCAAGGAGAGGCTGGTGTGGTTGTACCGTCCCCAGGATATCTGAAGGGTGTCAGAGAATTGTGTACAAAATATAATGTATTGTGGATAGCTGATGAAGTACAGACTGGGTTGTGCAGAACAGGAAAAATGCTGTGTGTTGAACATGACAATGTAAGACCAGACATGCTAATCTTAGGTAAAGCACTGTCTGGTGGTGTATTCCCAGTGTCAGCAGTGCTGGCAGATGATGAAATCATGCTTACCATTAAACCAGGAGAACATGGATCTACATATGGTGGAAATCCACTGGGATGTAAAGTAGCCATAGCTTCTCTTGAGGTTTTATTGGAAGAAAAGTTGGCAGAGAATGCAGAAAAACTTGGAGTAATACTAAGAGATGAGCTGAATACACTACCTAAGGATGTCGTTAAGACTGTCAGAGGAAAAGGGCTCCTTAATGCTATTGTCATAAATGACAAATTTGATGCCTGGAAGGTATGTGTCAGACTTAGAGACAATGGACTCCTTGCCAAGCCTACACATGGTGACATCATTAGATTTGCCCCACCCCTCACAATGAATGAAGAACAGCTAAGAGAATCTCTTGATATCATTAAATCAACAGTGATGTCATTCAACTAGTCATCAGTTAAACACCTAGGTTCTGGTAGGCAGAGGATAACAGCTTTTTATGCAATTACTTACTACTGTAGAACTCAAAATCATATTATACATTCAGTTATTTTTATAAATCGTGCTACTCATTCTTTATTTTTTGATTTTTGGGGAAGGGTACTGATGAATTTGTGTGTTTTTTAAACTTCTATAAGTATATATTACTGTATTATTATACAAATTGTATGGGTGATAGTGGTGGAAAAACAACCACTGGTTTGGTTATTGATTTGCGAAAAATACCACTGGTATTGGCGATATATATATATATGTAAAAAAAACAAATTTTAGATGATACTTCTCTAGTGATAGTACAAGATCTGAAGAAACCGGTGTTATATTTTTTATATAACGATAAATTGAGATTAATCAGAATCAATTAAAGAATGCATTTTTTGTTTCTGGTCGATAATGAATAAAGTTACATTCATCAGGTGGATAGTTAATGAATGGTACATTAATGAGGTTGATAGTAAATTGAATTTACATCAATCTGGTGGATAGTAAATACAGGTTACATTAATGAGGTCAGTAATGAATAAATATTACATTCATCAGGTCATTAGTAAATGAAAGTTACAGTAATGAGGTTGATAGTAAATTGAATTTACATCAATCTGGTCCATAATAAATAAATGTTACATTAATGAGCTGGATAATAAATTTTAATTATATTATTCAAGACAATAATAAATCCAGATTTTGTTTTGTATGTCAATAAGAAATCCAATTATGTGTGTGTTTATTTTTATCAATTTTATCACTCAGGTCTGCAGTCTTTGACTTAATATTTTTCATCTACTTGCTCGAAAGCCAAATTTAGAAAAATGTTCTATTTATTAAAACAAATTCTTACATAATTTTCACTTGTCCGAATCCAGTTTTACTTGTCCCAGGCTTCCGGCAAGTGGGTTAGCGTGAAGACTGGGTCTATTTAACAAATCCATGTTGATAATTCCATTCCTAATTCTGTTATTTTGGTTTATCTGTAATTTTGACATTTTTCCTTTGATTTCATGTAGTAATATTTTCAGTATCAACAAACTGACTGTGATACTGAATATTATCAGTCAGTGTGACATCAAACACATTAACATGTTACTGATAAATACAATAGTTTTAAAGGTCTCAACAAACAATATTACTATTACCACAACTCGTCCTATCAGACTCACTGCGATACTAATGATAGTTTAAACATATTTTATTGTCTTATAAATGTACAATTAGATTGGAAATAAGTTATATCAACTTAGTATATCTGCTCAATACAATAATGTTATATACATAAATAAGAAAATGACTGCAAGTTACATAATATAATAAATGTATACATGAATATATTTGATAAACGAACGTAATGGGGGAAAAAAGGGGGGGATAAGGGAATTGAGTGCAAATAAATGATAGCATCCTGAGTACAGAGTATAATTTCGTATCATTCAAATCTATTAGTATGGTGTATATATTTTTGGACATAACTAAACACTATTAAATTGTTTTCATCCGTTAAATTATCAGAGCCAAATAATAAGTTTTCAATCAAAATAACTGTATACAGTGTAATACTCATAAATAATTGCATTCTTGCATTCATATAAAGGGGACATTCTAATAAATAATTAATAGCATCTTCTAAAGGACATCCGCAGGCGCAGCTGGGGTCACTAACTATATTTGCTCTAAATAAATCTGCTCCCAGTGAACTACACTGGTGTCTTAATCTAGTATGTATTATATTACATTTCCTACTTCCTAACAAATAGTATTTAGAAACCTTAAATAAATTCGTCCTTAAAGTTTGTTCGAACTTTGAAGTATTTTGTATAGATTTAAAATTTGGATCCAATGAATTCCATGAACGTATAGTAGACGGAAAAAATGATTTGGAAAATGTTTCTAAATGACATCTTGGTACCCTATATTGTAAAGAATTTCTCAGATTATAATTGTTAACAACTAAATATTCACTAATGATAATGTTTGTATCGACCTTAATAACTCCCGTTATTCTATATATCTATATATTTTGATTATGTTATGCTATTAAGTGATGATTTTGTTTGACATTCCCACATACAGTGTAAGGGATACAACATCTCATATCTTCTACATACATTCCTTAGGTAATAATATTTGCCTATGCATATGGAATAGCGGCAGTTTTGAAGGTAGAGACAGATATTATCATCAGTGATAATGCTGAGATCTTCAAAACTGATGTTGTTATTATTATACCCCCACTCGTAGAGAGGGGGCTATATTGCAATCACCTCATCCGTCCGTCCGTTCATACTTTCATAACAGATATCTCAGCTTCTACTGGAAGAAATGATTTTATATTTGATATATGGCTTTGGCATGGTGACTTGTACCGTGTCTCCCCTTTCCAGATTTACCGCACATCTACTTCCTGTTTACATTGCGACTTCGAATTTTTCATGTTTGCCGTAATGAAAACTTTCGTAAGTTATCTCAGCTTCTACTGAAAGAAATGATTTTATATTTGATAGATGGCTTTGGCATGGTGACTTGTACCGTGTCTCCCCTTTCCAGGTTTACCGCACATCTACTTCCTGTTTACCGTGCGAATTACAAATGAACGAGTGGGGTATTCTTAGCACGACGTAGCATGCAGCATCTTGTTTGTTTGTGATATAAAGTATTAATATTCCATATAATATTTGACACCGGTTTAGATTTGTGTTAAAATGACACATGAATACACAGCTGTCTATGTTATTCTAGGTTTTTTTTTAATTCTGTCCCTAAAGATTTACATGTCAGAGCTTGTATTAGATCTCTCTATATATTGTATGATACAGACTGAATTCTAGTCATTTAAAATGATTTACACATATATCTTAAAGACAAAATACTCTATCTGATACAGATAAATAGAAGGATAATCATTTAGTATTAATTGTTTCTTTACTATTGTATAAATTTAGAAACAAAACATAGTGTTTATTGTAAGATTTCATATTTAATAGTTGAAGCAGGAACTCATTGTCATTTTACACAGTACATATGATACCATACAAAATGTTATAGTTTGAATCTCAGTTTTATTTAAATGTAGAAAGGTGCTTTTATTTAAGAATACTTTTGTTTTATTTGTATTCATTATGTAACAAGGCATTTCAAGTTTAGATAGTAACGAGTAGATTTTGGTTACCGGTATAAGCATTTACATTTTAAAATTTAAAATTTAAAATTTGTGTGTCTATATTATTGTTTTGAATAGCTTTAAGACATTTTTGTTATCACTTGTTAAGTTGGTATATTTTAGAAGATATCTATTATATATTTTTAT

Protein

Gene family

Gene family	Subfamily
-	-

Pfam domain

Pfam accession	Pfam name	Description	Type	Source
PF00202	Aminotran_3	Aminotransferase class-III	Domain	Interproscan

InterPro

InterPro term	Type	Description	Source
IPR005814	Family	Aminotransferase class-III	Interproscan
IPR010164	Family	Ornithine aminotransferase	Interproscan
IPR015421	Homologous_superfamily	Pyridoxal phosphate-dependent transferase, major domain	Interproscan
IPR015422	Homologous_superfamily	Pyridoxal phosphate-dependent transferase, small domain	Interproscan
IPR015424	Homologous_superfamily	Pyridoxal phosphate-dependent transferase	Interproscan
IPR049704	Conserved_site	Aminotransferases class-III pyridoxal-phosphate attachment site	Interproscan
IPR050103	Family	Class-III Pyridoxal-phosphate-dependent Aminotransferase	Interproscan

PANTHER

PANTHER term	Description	Source
PTHR11986	AMINOTRANSFERASE CLASS III	Interproscan

Gene Ontology

GO terms	Category	Description	Source
GO:0004587	Molecular Function	ornithine aminotransferase activity	Interproscan
GO:0005737	Cellular Component	cytoplasm	Interproscan
GO:0008483	Molecular Function	transaminase activity	Interproscan
GO:0010121	Biological Process	arginine catabolic process to proline via ornithine	Interproscan
GO:0019544	Biological Process	arginine catabolic process to glutamate	Interproscan
GO:0030170	Molecular Function	pyridoxal phosphate binding	Interproscan
GO:0042802	Molecular Function	identical protein binding	Interproscan

KEGG pathway

KO	Enzyme	Enzyme ID	pathway	mapID	Source
K00819	rocD, OAT; ornithine--oxo-acid transaminase	EC:2.6.1.13	Arginine and proline metabolism	ko00330	PMID: 28812709

Expression pattern

1. Expression trend for Bpl_scaf_64483-1.8 global RNA-seq network