Gene detail

Detailed information of Bpl_scaf_63978-0.6 in Gigantidas platifrons Gene info

Gene ID	Annotation	Scaffold	Start	End	Strand
Bpl_scaf_63978-0.6	CTP SYNTHASE	Bpl_scaf_63978	70711	88649	+

Gene Structure

More details in Jbrowse Sequence

CDS

Transcript

Bpl_scaf_63978-0.6

GCTTATTGGATTTTTATGAAACTTTACACACTTGTAGTACACTACCTGTAGATGTGCATGAAGGAATATGGTTGCTGTCCAAAATTTAAAAGGGGAGATAATTCAACTTATACTTTCACGAAAAAGGGGGGGGGCATGTACCTTGTAAGTGCAGCTCCTACTAAGCTGCAAGGGGGGGGGTATAACTCGGTGAGGTCACTCACAGTTCTAGTTTGAGTAGTTCTGTCACCCTAGCAATGGTTTTGTAAAGATTTAGTTAGCCTTTATTATTGCAATTAAAGGTTGGACTTTGACAATTACGCTCAGGGTTTCGGCCAGGATTTTGAGACCATTAGTCAATTTTGCGGAACTGTATTTTTGCTAGTCATGAATAAACAAGAAAATAATAAATATAATTTAACATATTTTATTTATATTTCAGCACTATTACAGAAAAGGTTACATAACAAATCAATGTGAAGTTATAGTTATATGAAATAAATAACAATAATGTATAATAAAGCTATTGTTTTACCAATAGTGACATCTTTTTCTTTCCCTGATTGCCCTTTGTGTTTAATAATTGAGGATTTGTCTGTCCTTAGCTGAACACCATACCTGAAATGCCCTCCTAAAGTTAAATGTCTTCAGTGTTGATGGGTGCAGACAAATTTTTACAATTGTGTTTACTGACGACACTTTCAATCTGTTTCTTATGTTGGTCTTAATTAAATTGTACCTACTAAAACCCCTCTCACAATCATCTGAGCTCACTGCAGAAAGCAAACAGATGGTAAAGAACTTTGACACATTTGGATAGTCAGAGGAGAAATTATCCTTGGCCAACAATGAAGAAAGAGAGCTTGACATTCTGACACCTTGATATCCTGTCAACACCTGCTTAACCATAAGCCATTCCTCCCTAAAATGGATCTCACTGATAAGAGCTTTGTTACCACTTCTATCCTGACCAAAATGCTTACACAAGAAATCCACCTGACCCTTTCCATAACAAAGTAAGTCCTGACTCAGCACAGGGAATCAACTGGGTGTCAAAGATAGAAAGGCTATGAAAAACCTCCTGTGATGGGAACCTACTCTGCAGATTAGCAACCAACTGATCAATAAAATCAACCTTAAGCTTATCAAAGTGAGAACTCTGACTACTACTGTACCTCATGACATTGCCACCAAAAATAAATTCACCACTATCATCAGCTGAGGAAGGAACTTGGGCCAAGAAGGACTCCAACCTAGGACCAGGTGACAACTTCATACCCAAGATAGCAGAACAAGCTGGGTCAATAACCTCCTTAACAACAGAAAATGTAAGATCCTCTCTTTGAAAAACCCTGCTAACACGACAAACAATACCCATGACATCAGCCATCAAGTGAGATACTGCTAGGAACTCATAAGTAGAGATGAACTTGACCAGACCTCCAGCTACAACATTACCACCCTCCTTATCTTGTAACAAACAACTGAGCAACACATCAAAATTATCCAACAAAGCACCAACAGCACCCTCAAAGGACAACCAATGAGTACCAAACACCTCTTGAAACTTTCTTTCAGCCTTGTCAAAGATCACACCCATTGCTTTCAGCCTTCTCAAAGATCATACCCATTGCTTTTAGGTTTGTCAAAGATCACACCCATTGCTTTTAGGTTTGCCATGTGTTTGCATGAATAGTGGTGATACTTGTATATTTCATTGATGGTACCCTGATATGTTTTAAGATATGTGATGGAGTTTGCTGCTTGTGATGCTGCTAGAGCTAACCTGTGTGCAATGCAATGTGTTTTTATTATGTATGGGTTGTTTTGGCTAAAAAGTGTAGTGAAACCTGATCGTACACCGGTCATCACACTAGCACCGTCGGTAGCTACAGAAATATATTTATCAAAGGATATACAATACATATTAAAAACTGACTTAACACAATCAAATATACACTGAGCTGTACCACCTGACAATTCAATTACTGACAAAAATCTTGTAACACTACAACTGTTTTTTAAATAGTGAACATATATCATTAATGTCTTTTCAGTGCTGCGGTCTGTAGATTCATCCAACATAACACTGAAATATTCTGATGTCTTTAAGTCCTCTATCAGTTCTTCATCAACAACTTTTTGAAGAGAAACTTGCATGTCGGAAACACTTTCCCAGCTGTTGTACTGCGCATTCTTCGCTTTCCGTAACTTGGATACACTCTCAACACCCTACGAAATAAAAAATAAAAATAAATTATAAAGTTTAAAAACAAAATTGTTTAAATCTCAATTTTAAATGAGTGTCGAAATATAAAAAAAAAAAAAACCACGTCGTGATGATGCTCTAGCAGTTCACGGTTTACATTTTTTTTGTGAGCCGAAATGAAATTTGAGTGTGAAAATATACAAAACCTATTAAAGATGTTATTTTATTCAGTAATTGATAATATATATTTTAACCACCACGATATAACTGAAATATTGTTAGACATCATAACCCTATCCCCTCAATATTTTATTTTAAAAAAATAATTGCCACACGTACATGATGCTCTAGGAGCTCGTTGACTGACTGGAACAGTGAGTTGGGTTGGTTTGTCTTTGCCATCCAGTAAACGTTGTTCATAGCACTAACGATCTCTGCCTCGTGTTGTTTGTATGCAGTGGCTACACCTTGGTTCCAAGTTGGTCTCATCGCCTTTGTTTGTATGGCCCTCTTATGATCAGCGGTCTTTATGTGCTTCTGTATGTTATCTTTCAAGAAGGTCTGACAACCTATCGTAAATGTATTAGATAACCCAGCATCTTTGCAGTCTGTGCAATACATAGCCCCATCTGAGTACTGTATGGATGGACAAATCTTTGACCATTCCGGTTTAAATTTGGAAATTTGCAGTCTATCGGCCCTTGAATTCTGTTTGGTAGTTGGTATTTTCTTTGTTACCGCATCAGACTTGTCACATGACAGCGTAAAATAATTTGTAATGGCAGACATGGCGACTGTTACATGGAGTAACAAATTCGCAATACTATCCATATCGACAATGCATGTGCTTTATATAGCAATTTTTTTTGCATAAAGAATTTTGAGAAAATATCTAAATAAACACAAGCTCATTATTAGCCTTGATTAATTCCTTTGTCGGGCAAAATGAATCGGCAGTCGATCATGATCAGGTAATTATCACACCTTTGAAGTTTTTTTGTGACTTGTTAATCATTTTGATTACGTAATTAAATAGATGCTACCTGTGCTTGATTGGCGTGGGTCGTAAACATGTCAAAGATTAATGAAATTTTTTTATGATTTTCAAAAATTTAAGTGGCGAATTGCTTTGAAAAATAATCGTCAATATTAAAATGCATTCGTCAATTACGAAAATGACGAGCGCTCGCTGAAACACTGATTACACTGTTTTGATTTGTTATTTGACTCAGTGGTACATTTTTGACACTCTTTTGAAGTTATACATTCTACAAATGTCATTTCATATTACAAAAATACATTTTACTATTTTTATTCAGTTGTGGCCCGGCCTTAGCAACCTGTTTCCCTGTATACAGTATTTCGCTTATAGATCTCATGAACCTTTTGTTTAACTAAGAAGAAATTTTCTACATCGACATCTAAGCAGAGACATCTTATCATTAACTAACCAGTATATATTAACCTTATAATGTCCCTAGTAAATAAAAATTATCCCTAGCAACCGCAGAAACTCATCAATTCCGAGCTCTGTAAATTGCTTTTTTTTTTTATCTTCAGGGTTCCCATGCTATGGGGAAAACGGGAAAAGTCCGGGAATTCGGTTTACGCTTTTCACGGTCGGGAAAAGTCCTTGAATTTCACAGAAATCGCAAATCCGGGAAAAAATCGGGAATTTTATCACCGGTCAAGGTTCATTTGTAGTACCAAATCTTTTTGGTTATTAGTCACTTCTTAACACATCTGATTCAGCTGAACGCTTAATGTAACGGCGTTTAGAAAAGCTTGATTAATGTAAACTATTAACCTGACGAAATGGTGCGACTTTCAACAGTGTCTTCTTTCTTTTTGTCACAAATTAGAGTTCAGGAATTTCTCCCAGACATTAATATCAACTCAAACATTCTCACCGAGGAATCTGTTGTGAACATTCTACAGTCTATAATTGTGAAAAATGTGAAGAAGTTATGTTTAAGTAGAAGAACATTGACGAAACAAAAACAGTTTTCAGAAACAACAATGGCCACGTGTGTCGATTTAATTTCAAAATGTACGACATTGGTTGATTTAGATTTGGAGGGATGTTTTTACCTCAGCCCCAGTCAAATTATTTGTGTATTTCTCCATAGCCAAAGATGACCTACCTAATTGGATGTTCATCAGAGAATTTGTTATGGTATTTACATTAGAGTTGTAAACAAGAACACAATGTTGTAATATAGGGGCACTGATTTTAGAAAATCATAATGAAATTAAATGTTCATTTACTATTCAAACATACAATGTATGCTGAGAAAACTACAGCATTTTTATGCTTTATGTTAAGGGATTGATTCAGACTGTCTCTTAGTTCATTGGGTATATTCAAGCTGACCTTGAAAAAATGAAGAAAACCCTTGAAAACTCCTTGAAAAGACCTGGAATTTCTTTGACAAAAAAGGGTGGGAACCCTGTATCTTTTTATAAACGAATTTGTGTTTGCAGGTAAAGAGAAGGTTGTTTTTTTTTTAATTTGCACTGCTATTTTTTCTCGTCTATGTGGTTACCATATAGATTTTACTTTAGCATCACATTTATCCTTGTGTAGTTGTGTAGCCAACAAAACTTATCAGAATAAAAAATATAGACTTAGTTGACAGTATATTGATAATTTGACTGTGTTGTAATTTAGGTGATAGATATGCCAGAACACAATACTGGACAGATGGGAGGGACTATGAGATTAGGAAAGAGAAAAACACTATTTAAGACAGACAGTTCTATATTAAGAAGGTTGTATGGAAATAAAAGCTCTGTTGAAGAGAGACACAGACATAGATATGAGGTAAACCCTACAGTTGTGTCCCAATTAGAGAGTAGAGGAATGAAATTTGTTGGTAGAAGTGAAGATGGAGAGAGAATGGAAATCATGGAACTCGAAGGACATCGATACTTTGTTGGTGTACAATATCATCCAGAATACATCTCACGACCCATGAAACCTTCTGCACCATACCTTGGTCTCCTACTGGCTTCTACAGGAAAACTATCTACTTATGTGCACAGAGGATTCCGTCTGTCTCCTCATCTCTCGTATAGTGAAGGCGATGAGGAAGAGCTAGATGAAGAACTAGCACAGCTAAGTTTGGAATATGGAAATTCTCAGAAACCAGACAGTGTTGATAAAAAAAGTTCTCTGAAATCAGACAGTATTGATAAAAGTTCATAGTGTCATCATTTTTTTGTCATTATTATTAATACATCTTTTTTTCTTTAGCGTTTGAATTCATGATCAGTTGATGATATAAAAAGGAGGTTGTTAGGCCATGCAAAGTTAATTATGTATACCACAGTCACTGCCTATATCTTTTTAAGGGGCAGCCCCACCCTTCACCCTTTAGTCAATTTTGCATGGCTTTGTTGTAAATGTGTAGATTTTTCTTTAAATATTTTCAGAGATTTTGTTTATGTGATGTTGATCAAGATTAAAATTATGTTAAATGAGATTGCCATCAAAATAGACATGGTATGTGTTTTTAGATCAATTTCTTGTGATTGGTTTATTTATCAAGAAATACAGAATTGTTCTATTTCCATTTCATAATATGAATCGCTAATGTTATAGATTTTATTTATAAAATTTTGGATTAAACAGGGCAGTGCCTCTATTTATTATGTATAACATATATTACAGGAATATGCTTTATTTTTATCATTGATATGGTTACCAAGGCATGATTGATTTATATATGTATAAATTCTACAAATTATGATATTTTAGCTCACGTGGCCAAATGTCAAACGTCTGTCTTATGTTGTAAACTTTCACATTTAAATCTTCTCCTCGGAACACAAAGAACCAAATGAAACAAAACTTTGCTGGGGTGATCCCCTTTCAAAACTGTTTGACTGCCTTGCAAATTTTGAATTAATTTATAAGGATTGATCAAAATTATTTTTTCTGTTCATTCGAAATAACCTCAATCAGGTTGTACACATCGATCAAATGAAACGAAACTTGGTAGGAAGCATCTATGAAAGGTCCTTTATAAAGATTGCTCATTTTGTCCCAATTCGTTAACAAACATGGCCGCCGCAGGCATCTCTTGTTACTGATTGTCGATTTCTAAAAATCTTCTCCCCTGAATTGAACCGAAACTTGGTAGGAAGCATATATGGAAGGTCGTCTATGAAGATTGCACATTTCAACCCGATCCGTTAACAAGCATGGCCACCACAGGCAATTCTTGTTTCTGATTGGTTGATTTCTAAAAAAAAATTCTCCTCTGAAACCGCTTGGCCGAAGGACCTATGAAAGGTTCTGTATAAAGTTTCCTCAAAGCAAAATGAAAGGTGAGCAACACAGGCTCAGCCCACTGAGTGAGAACCTAGTTTTGAAATGAGGTTTAATGGGCCCAAATTCTGAAATTTAGCATGTTTGAAAGGTATATTTAACACTTGACATAGAAAAATAAGACAAATGTCCAAAATACAATGGTCCAGCAAAATACTACATGTATGTCCACTCTTGCTTTTAATATACACTTGTTCACACATATTGCGGTGGTATCAAGCTTCATTCTGTAAAGCCCTTTATTATCCCACCGCGATAGCGGTGAGGGGATATAGTAACAGCGGCCGTCTGTCCATCCGTCACACTTTCTTGTTTATGCAATAACTTGAGTAAACATGGATAGATTTGAATAATTTTTTGCATGTGGCTTGTAATTATCATTATCTTGGATGGGTTCTAACATGGAAATATTTGAAGCAAGGGTTTTGGGAGAAGGAAATCTTAGTTTTTGGTTGAAAAATCACAAATTTTGAGAATTGTGTCTTGTTTACGTGATAACTTTAGTAAACATGGATAAATTTGAATAATTTTTTGTGGGTGGCTTGTAAATATCATTATCTTGGATGGGTTCTTACATGGAAATATTTGAAGCAAGGGTTTTGGGGGAAAATCTTAATTTTTGGTTGAAAAATCAACAATTTTGAGAATTTAGTCTTGTTTATGCGATAACTTCAGTAAACATGGATAGATTTGAATAATTTTTTGCATGTGGCTTGTAATTATCATTATCTTGGATGGGTTCTAACATGGAAATATTTGAAGCAAGGGTTTTGGGGGGAAATCTTAGTTTTTGGTTGAAAAATCACCAATTTTGAGAATTGTGTCTTGTTTACCCGATAACTTTAGTAAACATGGATAAATTTGAATAATTTTTTGTGTGTGGCTTGTAAATATCATTATCTTGGATGGGTTCTTACATGGAAATATTTGAAGCAAGGGTTTTGGTTGAAAAATCAACAATTTTGAGAATTGAGTCTTGTTTACGCAATAACATCAGTAAACATGGATAGATTTGAATAATATTTTGCAAGTAGCTTGTAATTATCATTATCTTGGATTGGATGGGTTCTAACATGGAAATATTTGAAGCAAGTGTTTTGGGGGAAAATGTTAGTTTTTGGTTGAAAAATCACCAATTTTGAGAATTGAGTCTTGTTTATGTGATAACTTTAGTAAACATGGATAGATTTGAATAATCTTTGCATGTGGCTTGTAAGTATGTTATACATTAAGACTGCAAGGCTGCTTGCTTTCTATAAATAGATAAAACTAAATATTATGCAAGTGCAGGGGGATACGTCGCACACTAGGCGGTTCTTTTATTTTTCTTTAGATTCCTTATGAAATTTCCTGGCTGCATATTTTTTCACCAGTTTTGGCCTAGCTCATGTGGTTCCCAAGATAAAAGGGGTTAAATGGAGTCAAAAGAGACCAACATCCAAAATGATAAGTTTTTTTTACTAACAAGTCAGATTTGTTTGCAATTTTTTCTATTAAAATCCTGTCTATAGACTATGGCAACAGATTTGTTGTAGCTTTTACCACTTCAGAGGTCTCAGATTGGCCTCTGGTTTTGACATGATTTTTGAATCGGATCAAGGACAGGTATATTTTGCAATAACATTTCAATGCAACTTGTACTTTGTTGCAGTAAGTACCACTTTGACTGATTGGCTGGATTATTGGAGTCTGACCTTTAATAAACACAGTTAATAGTACCATCACTAGTTATGTGGTGTTAGTCCACTCCCAAACCCTATCTCATCCTCCTCCCCCAAAAAAGAGAATAAGAATAGGAATGAATACTTTCAGAAGTATGATGATAAGAGTATTGATAGGGTATTTAAGTTAAAAGTGAGAATAAAGAAGACCAAGTGTTGCTTGAGAATGAAAGAAGGTAATACTGTATGACAGAGTGACCTTATTACAATCAGTTCTTCACAATAAATAGAATAAAGGTGTTT

Protein

Gene family

Gene family	Subfamily
-	-

Pfam domain

Pfam accession	Pfam name	Description	Type	Source
PF00117	GATase	Glutamine amidotransferase class-I	Domain	Interproscan

InterPro

InterPro term	Type	Description	Source
IPR004468	Family	CTP synthase	Interproscan
IPR017926	Domain	Glutamine amidotransferase	Interproscan
IPR029062	Homologous_superfamily	Class I glutamine amidotransferase-like	Interproscan

PANTHER

PANTHER term	Description	Source
PTHR11550	CTP SYNTHASE	Interproscan

Gene Ontology

GO terms	Category	Description	Source
GO:0003883	Molecular Function	CTP synthase activity	Interproscan
GO:0005737	Cellular Component	cytoplasm	Interproscan
GO:0006221	Biological Process	pyrimidine nucleotide biosynthetic process	Interproscan
GO:0006241	Biological Process	CTP biosynthetic process	Interproscan
GO:0019856	Biological Process	pyrimidine nucleobase biosynthetic process	Interproscan
GO:0042802	Molecular Function	identical protein binding	Interproscan
GO:0097268	Cellular Component	cytoophidium	Interproscan

KEGG pathway

KO	Enzyme	Enzyme ID	pathway	mapID	Source
K01937	pyrG, CTPS; CTP synthase	EC:6.3.4.2	Pyrimidine metabolism	ko00240	PMID: 28812709

Expression pattern

1. Expression trend for Bpl_scaf_63978-0.6 global RNA-seq network