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Detailed information of Bpl_scaf_63384-4.9 in Gigantidas platifrons Gene info

Gene ID	Annotation	Scaffold	Start	End	Strand
Bpl_scaf_63384-4.9	SACCHAROPINE DEHYDROGENASE	Bpl_scaf_63384	402669	453059	-

Gene Structure

More details in Jbrowse Sequence

CDS

Bpl_scaf_63384-4.9

ATGTGGAAGTTCCAGTCAACTTCAGTATGCATGTTCAAACTGAATAAAGGTGCAATAACAACAGCCATATCTTCTGTGATGCCTAGAGTAGTATCTGTCGGGCAACATGGAACCCACATTATTGGTAGACGGTCATCCCAGTTGTGTGGGCATGGTCAGGAAAATTGCATACAAGTAATGGTTAAACGTTCCAATAGAAGATGCTACAATGCTCAGATGGACAGATCATCGTATAGAACTTTGTGTGAACCCCCTGTCTGTAGCAGGGATATTAGAAGAACAATTACTTCAACCACCGACTCAGTGAAAACAAGCTCGAATCAGAAAAAGATTTTGATACTCGGAGCCGGACGGACATCAGGATCTGTCATTGAATATTTGAACAGGAATAAAGATTACACCGTAACTGTTGCATCTCGAACTAAGCAAAGTTTGGATATTCACCACGAAAAATATCCCACGATCAACATATGTACACTTGATGCACAGAGAGATGATGACGAACTTAATGGTTTAGTTAGAGACAGTGATATAGTTGTCGGTTTGTTGGCACCTGATTTAAATGACAAAGTAGCTTCAATCTGTATCAAGTACAGACGTGACATGGTTTACAATAGTTACCTTTCACAGGATGTAAAAGACCTAAACCAACAAGCAAAAGATGCAGGAGTAACAATTTTGAGTGAAACAGGATCATGCCCAGGACTTGATCACATGCTGGCTATGAAATGTTTTGATGAAGTAACGTCTTCCGGTGGCAAGGTCACTTCATATGTTTCATATTGTGGTGGTATACCAGCTCCAGAATGTTCAGATACACCCATGGTGTACAGATTTAGTTGGTGTCCTTTGGGTGCAATGAGATCCTGTTTTCTGGACGCTACGTTTCTACGCAACGGACAGAAAATAGAAATACCCGGTGAACGCATTTTGGAAAGTGTTGAAGAACTAAATTTTTTCCCAGGGATAAATTTGGAAGGACTGTATAGTAAGGATGCATTAGTATATCTACCAGACTATGGAATAGAGACGTTACAAACCATTATAAGAGGCCGAATTAGATATAAGGGCTTCTCTGATATAATGCAGGGACTGGTGGCACTCAATCTATTTAGCGAAGACGAACGTGTAGACTTTCACCCAAATGGATCACATATAACATGGAAATCTTACTTATGTGGAATGTTGGGAAAGCCCGCTGACATAAGTTTCAATTCTTTGAAAAATATAGTTTATGAAAAAGTTGGTAAATGTGAAAAACGTTTAAACAATATTATAGACCTTGGTTTACTTGGGGATACTGTTATCGAGAAGAAAGCTACTCCTATGAAAACAATATGTCATTACCTACAAAGCAGATTATCATATGAAGCTAGTGAGAGAGACATGGTAATGATACATAACATTATCGATGTCGAATTGCCCGACGGTTCTCTGCAAAGGCGAATTTCCAACATCACAGATTATGGGGTACTTAATGGCTACACTGCGATGTCTAGAACAACAGGACTACCTACTGCTATGGCTACTGAGTCAATTTTAAATGGAGAGTTCCGACAAAACGGTGTCTGTCTACCTTTGTCACCAGATATTTACAGAAATATGTTGCCACGACTGAGGAAAGAAGGAATGCAAACAAAAGAAGCGACACATGATTTAGAAAGAACAGTGAAAAAAACGATGTGGCTTCTGAATGAGTCAAATATGTCTGGTGACAAAAATGCTTTAGTGTATGACGAATTAAGTGAAACATATGATCAGTACGTTCAGGATGTCAACTTGCGGGCTCCATCAATGTGTGCAGATATACTTGCTAAATACTTCACAGAAAACAGAGAACATGTGGAAATATTAGATATAGGTGCTGGTACAGGACTAGTTGGAGACAACTTGCATAAACATGGATTTCGATTATTTGATGGCATAGATTCATCTCCAGGCATGCTCAGTGTGGCAGAAAAAAAGAAGAAATATCGTAATTTATATTGTGAGTTTGTCACAGGTGAACCAATGAGTATCAAAGAAAATACCTACGATGCAATTATTATGTCTGCAGCTTTTGGTAGTGGCGACGTTCCTGCAGAGTTTATTTATGAAATTGTACGGCTTGCAAAGCCAGGTTGTATTCTTTGTTTCATCAGTAGAAAAGTATCACTGGATGAGTTGATACCATATCTAGACCAATTAGAAAAGAAGAAAGTATTGGAAAAAATAGAACTATACGAAACAGACGAATACCATAGTCACTATACCGGACTGGTTGCGATTTACAGAGTGTTATAA

Transcript

Bpl_scaf_63384-4.9

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Protein

Gene family

Gene family	Subfamily
-	-

Pfam domain

Pfam accession	Pfam name	Description	Type	Source
PF03435	Sacchrp_dh_NADP	Saccharopine dehydrogenase NADP binding domain	Family	Interproscan
PF08241	Methyltransf_11	Methyltransferase domain	Domain	Interproscan
PF16653	Sacchrp_dh_C	Saccharopine dehydrogenase C-terminal domain	Domain	Interproscan

InterPro

InterPro term	Type	Description	Source
IPR005097	Domain	Saccharopine dehydrogenase, NADP binding domain	Interproscan
IPR013216	Domain	Methyltransferase type 11	Interproscan
IPR029063	Homologous_superfamily	S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase superfamily	Interproscan
IPR032095	Domain	Saccharopine dehydrogenase-like, C-terminal	Interproscan
IPR036291	Homologous_superfamily	NAD(P)-binding domain superfamily	Interproscan
IPR051168	Family	Alpha-aminoadipic semialdehyde synthase	Interproscan

PANTHER

PANTHER term	Description	Source
PTHR11133	SACCHAROPINE DEHYDROGENASE	Interproscan

Gene Ontology

GO terms	Category	Description	Source
GO:0004753	Molecular Function	saccharopine dehydrogenase activity	Interproscan
GO:0005737	Cellular Component	cytoplasm	Interproscan
GO:0008757	Molecular Function	S-adenosylmethionine-dependent methyltransferase activity	Interproscan
GO:0019878	Biological Process	lysine biosynthetic process via aminoadipic acid	Interproscan

KEGG pathway

KO	Enzyme	Enzyme ID	pathway	mapID	Source
-	-	-	-	-	-

Expression pattern

1. Expression trend for Bpl_scaf_63384-4.9 global RNA-seq network