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Detailed information of Bpl_scaf_61879-1.16 in Gigantidas platifrons Gene info

Gene ID	Annotation	Scaffold	Start	End	Strand
Bpl_scaf_61879-1.16	ZINC FINGER PROTEIN	Bpl_scaf_61879	64469	91700	+

Gene Structure

More details in Jbrowse Sequence

CDS

Bpl_scaf_61879-1.16

ATGGATAAAGTCATTAGTGCAACAGTCCCTGGTTATGGAGATCAAATGTTACATTCATTACACCAATTACAGCAAAGGGGTGTTAACTGTGAAGTGACACTCCAAGCATACAATGGATCTGCTCATATTCACAACATAATTTTAGCAGCTGGTAGCAACTCTTACATTGAACATCAACAACGATATCATATAATTGATTGTACACAGTATAGCATTCTAGTGGTTGAAGCTGCCATTGTTGTATTGTATACTGGCAAGATTTTAATTGAAGAGAGATACCTGGTAGATTTAATGGCACTTTGTGAAGATTTGAATATAGATTCAGTCTGTACCACACTCCGACAACAATTTTCACACAAAGATACAAATTCTTTAGAAACAAATTATGAAAGGAGGGAACCGTCTTTAAAAGCTTGTGAATCGGGCATTCCAAACTTGGCAGCTACGCGTAAATTTTCTACTGACAAAAATGTATCAGTACATGGTCCAGCTTCAGAAAATTCAGGACTTTATCAAGAACTGGTATCAAAATCTTTTCAAATTGCTGAAGATGTGTATACATGTACTACTCAGCTTGAAACAGTAAACGAATGCAACAATTTATATCTCAGAATTTCTGATGAAATTGAAACCACAAATGATACTAAATCGCACAGCGAAAGAAGTCCCGTCCAAAATCAAATGCCAGTTAACAATAATGAATTAAAATCTACTGCCGAACATAATTTACTTAATCAAATAAACAAAGAATATGATTTCTCTAAAAGGAACAAAAGAATAGAAAATAGTTTACACGGAACATTGATGACAAGTGACTTTGATGAAATTGTCACGGTAACGACGAGAAGTAAAGATAAAATAATTAATAATACATGTAAAGATATAGAATATAGCAATCTTAGTATTAGTAAAGACAATGTTCCTGTTAAAAAGAGAAAGATAGAACCGTCAACGGAAATGCAGGAAACAAACGAAATCACAGAACAAAATGCGCATTCGATAAAACTTGAAGAAGAGCAAAGTTTTCTTCCTGATAAATATGAAAATACTGGTTGTAATTATTCAATAGATGCTAGAAAAGCTCCTCGAAATAAAATAGTTTCAATCCAGGAAACACAAGAAAATTTGTTGTTGGAAAAGAAGCTTAAAAAGAATAAAAATGATGAAATTCAAATATCAAGGGGAGATAATCCTTCAATAAAAGAGAGAAAAAATATGGACACTGAAAAACAAGATTTAGCAAAAATATCTGAAACGGACAAAGAAGATGGTAATGTTGATAATAGTACAAAAAAGGAATTTAAATGTGCTAAATGTAATACGATGTTTCCTAATTATTCTGAGCGTAGAAAACATATGACGGAGATACATCGACCATATCCTTGTGAACTATGTAGTTGGGTTGGATGTCAACCACATCTATTTGCGGCACATATGTACGGTCAGCACAAAGTTGTGATCTTTCCAAAGAAATATCCATTGGTTGAGTGTGATGTAGAGGGGTGTTTCCATAAATGTTTAAACATCAGTTTATATAACCACAATCGATGCCACCGGTATAAAACAGATAAGTTAGTATGTCATGTCTGTGGCATGAAGTTTACATCTCAAGGAGGACTTAGATCCCATACCTCATACCATGCAGAAGAAAATTTAAAACATAAATGCAGGGAATGTGGTAAAGTGTTTGGATGGGATCATGAATTGTCAAAACACATGAATGCAGAGCATAGGAATTATATACTGTGTCACAAATGTCCATTCAAGACAAAATATCAGACAACTCTGAAAATTCATCTACATCACAAACATGGGGAACCTGTTCCTCCCAATGTTAAAATATGTAAATGTGATTCCTGTGATTTTTACTGCTTTTATCCAAGTTATCTGAGGGTTCATAAAGAAGAAAATCATTCAGATAGTTTAAATTTTAGTTGTGCCATCTGTACCAAAAGTTTCAAAACTAGAAAGTCATGGAGATGTCATCAAAATAATGCTCACAGCACCGATGTATACAATTGTGACCTGTGTAGTTATACCACCAACCATCAAAAAACCCTGATGATTCACAAGAATTGTAGACATTCTGAAGTTCGGCCATATGGATGCCATCTTTGTGAATACAGTTGTAAATTCAAAGGGAATTTAAATAAACATATGAAGAATAAACATAAAGTAGAGATTGTTTCATCGTATAAGTTGCGCGAAAAAATGATAAAAACAGGCATAGGTTATGTTGAGTATATGAATTCAAGGAGAAGTGAACTGGAAAAAATATCAACAGAAATAAAGACACAGCCAATTAATAAAAATTGTGATGAGACATATTTGTGA

Transcript

Bpl_scaf_61879-1.16

ATATTTTTCGACTTTTGACCAATGAAAAGACGTGTTACAAATTAATATTGGCGTGACATTTAATGTAAAATGAAACGGAATTTGATTGGCTTCTCAAATAACAATACTTTATGGGAATGATATATTGCTGAAGAGGATTAAAGACTGAAGAAAAGACTGTCTGAACATCCCCGCTGTCCGAACATCCCCGGTTTTACCCTATAGATCTATACATCATATACCAAACATGTTCCAATGGATAATAGGATTTCAACTTTTATTAACATTAAGTTGTTCTTGAAGCATCTGGAAAGGGGAGGTAACTGAGATATATAACAAACAGTGATGGATAAAGTCATTAGTGCAACAGTCCCTGGTTATGGAGATCAAATGTTACATTCATTACACCAATTACAGCAAAGGGGTGTTAACTGTGAAGTGACACTCCAAGCATACAATGGATCTGCTCATATTCACAACATAATTTTAGCAGCTGGTAGCAACTCTTACATTGAACATCAACAACGATATCATATAATTGATTGTACACAGTATAGCATTCTAGTGGTTGAAGCTGCCATTGTTGTATTGTATACTGGCAAGATTTTAATTGAAGAGAGATACCTGGTAGATTTAATGGCACTTTGTGAAGATTTGAATATAGATTCAGTCTGTACCACACTCCGACAACAATTTTCACACAAAGATACAAATTCTTTAGAAACAAATTATGAAAGGAGGGAACCGTCTTTAAAAGCTTGTGAATCGGGCATTCCAAACTTGGCAGCTACGCGTAAATTTTCTACTGACAAAAATGTATCAGTACATGGTCCAGCTTCAGAAAATTCAGGACTTTATCAAGAACTGGTATCAAAATCTTTTCAAATTGCTGAAGATGTGTATACATGTACTACTCAGCTTGAAACAGTAAACGAATGCAACAATTTATATCTCAGAATTTCTGATGAAATTGAAACCACAAATGATACTAAATCGCACAGCGAAAGAAGTCCCGTCCAAAATCAAATGCCAGTTAACAATAATGAATTAAAATCTACTGCCGAACATAATTTACTTAATCAAATAAACAAAGAATATGATTTCTCTAAAAGGAACAAAAGAATAGAAAATAGTTTACACGGAACATTGATGACAAGTGACTTTGATGAAATTGTCACGGTAACGACGAGAAGTAAAGATAAAATAATTAATAATACATGTAAAGATATAGAATATAGCAATCTTAGTATTAGTAAAGACAATGTTCCTGTTAAAAAGAGAAAGATAGAACCGTCAACGGAAATGCAGGAAACAAACGAAATCACAGAACAAAATGCGCATTCGATAAAACTTGAAGAAGAGCAAAGTTTTCTTCCTGATAAATATGAAAATACTGGTTGTAATTATTCAATAGATGCTAGAAAAGCTCCTCGAAATAAAATAGTTTCAATCCAGGAAACACAAGAAAATTTGTTGTTGGAAAAGAAGCTTAAAAAGAATAAAAATGATGAAATTCAAATATCAAGGGGAGATAATCCTTCAATAAAAGAGAGAAAAAATATGGACACTGAAAAACAAGATTTAGCAAAAATATCTGAAACGGACAAAGAAGATGGTAATGTTGATAATAGTACAAAAAAGGAATTTAAATGTGCTAAATGTAATACGATGTTTCCTAATTATTCTGAGCGTAGAAAACATATGACGGAGATACATCGACCATATCCTTGTGAACTATGTAGTTGGGTTGGATGTCAACCACATCTATTTGCGGCACATATGTACGGTCAGCACAAAGTTGTGATCTTTCCAAAGAAATATCCATTGGTTGAGTGTGATGTAGAGGGGTGTTTCCATAAATGTTTAAACATCAGTTTATATAACCACAATCGATGCCACCGGTATAAAACAGATAAGTTAGTATGTCATGTCTGTGGCATGAAGTTTACATCTCAAGGAGGACTTAGATCCCATACCTCATACCATGCAGAAGAAAATTTAAAACATAAATGCAGGGAATGTGGTAAAGTGTTTGGATGGGATCATGAATTGTCAAAACACATGAATGCAGAGCATAGGAATTATATACTGTGTCACAAATGTCCATTCAAGACAAAATATCAGACAACTCTGAAAATTCATCTACATCACAAACATGGGGAACCTGTTCCTCCCAATGTTAAAATATGTAAATGTGATTCCTGTGATTTTTACTGCTTTTATCCAAGTTATCTGAGGGTTCATAAAGAAGAAAATCATTCAGATAGTTTAAATTTTAGTTGTGCCATCTGTACCAAAAGTTTCAAAACTAGAAAGTCATGGAGATGTCATCAAAATAATGCTCACAGCACCGATGTATACAATTGTGACCTGTGTAGTTATACCACCAACCATCAAAAAACCCTGATGATTCACAAGAATTGTAGACATTCTGAAGTTCGGCCATATGGATGCCATCTTTGTGAATACAGTTGTAAATTCAAAGGGAATTTAAATAAACATATGAAGAATAAACATAAAGTAGAGATTGTTTCATCGTATAAGTTGCGCGAAAAAATGATAAAAACAGGCATAGGTTATGTTGAGTATATGAATTCAAGGAGAAGTGAACTGGAAAAAATATCAACAGAAATAAAGACACAGCCAATTAATAAAAATTGTGATGAGACATATTTGTGAAAACTCACAGGATTTTTATTAACAGGGATAGTTGAATATTGTGATATGAGTGAGTGAGTGATTGTTGAAATGATCATGAGGTCCGCCTTGTTCTAGACCAACACGCTTAGTTGGATTTTTATAGTGCTAGCTCACTGAAACAACAGTCCGAGGGTAGACATGTCGCTCCACTCTAACACAATATCATGATCCAGAGCCAACAGTCTTTGCTCTTTCTCCTTAATACTGTGAGCTTAGCGGAGAAGCAACAAATACCAATTTTATTATCTTTGGTTTGACCCGATCAGGACTAGAACCTATGATCTACCACACTCAAGGTCAGCATGCAAACCATTACACCACCAATTCGTTTTTTTTTCATTAACGATTCCATTTTCTTTCGATATAAATTTAAAATTTTACATAAAAAATTGTGATATGATGCAATATTCGTTATATCATTATTTTATTCTATTTTCACTGCTAGAGTTGTAGATACAAGTGTTACCCATGTCCGTATGTCTGTCCTGCAATTAGTATTTGCTCAATAAATTATGTTCCCCTTAAGCAAATCATTTGAAATTTGCACTTTAGCTGAAAGTGAGAGCATCCATGTCCTATGGAAAATTCTTCGATTTTTTGTCAAGTAAGTTTTTATGGTAAATTTTTCCATCCAAAGTTGTTGTTGAGTGAAGAACCAAATAACTAGTCTTGTATCCATTTAATGTTTTTTCAGTTTTACATATATTTTTAAGTTGTTTGGTTTTTCTCAATTTTTTTGTGATTATTTTTTTAGTAAGAATTGTTTTTTTGATATTAGACAATGTCTTCTCAATCTGATTAAAATTAAATCTTTAATTGATTTCCACTTTCTGATATATGTTGTATATAAAAATCTAAGAAAACCGTTACAGGTGACGTTCATCAGGTGACCATTATCTGTCCAACCAAATTGTCACTTGCCAAAGTTTGAGGCATATCTGAAATCTGATTAAGGGGCTTTGTGGTCGTGATTGCATGGTAGTTGGGTTTACAACATGTGCAATCAGTGCCTATCACCTCTAAAGTTGTGAGTTCGAACCCTGTTCATGTAGAGTTGAACTCGATACAACATTATGGGATAAAGTTTGTCAGTGACTTGTGACAGGTCAGTGGTTTTCTCCGGTTTCTTCCACCAATAAAACTGACCACCACGATATAACTGAAATATTGTTGAAAGTGGCATTAAACACCATAAACCAAACTAAACCAAACCTTATTTAATAAAAAAAAAATTAACTTTCTGATATTTTAAAGAAACCAAGGATGCATATACAGTCCTTGAAGTAATGCATCACTGGATTTGCCAGCTCTAGTTTTATCATAAAAAGTAACCTGAACATGATTATGAAATCTCACAGGATTTTATTAGATCTTTATGTGGGAGGGGCCGTTGTGGTCGTGATCACATGATATTTAGATTTACAACTACCTATGCAATCGGTACCTATCACAAGTAACTTTGTGAGTTCGAATTCCACTCAGGCGATACAACATTATGTGATAAATTTTGTCAGTGACTTGCGAAAATATAATTTGCCAATATTCAATAATTTACCTTGATCCATTTTCCAGTATAGAATGAACAATCTACATCTATATGAAATGCATTATGCAAAAATACTTTCTGACATAATAGTAAAGAGGCAACATTTTGTTGATTTAAGGTGGTACCATACACTTCAGGTAAAATTTGATCTGCTCGGTTAATTTTCTTATTTTTTTGGCAGTGTTTGAATATATCCACTGTAATAAATATTAAAATTTTAACAAATTCCAACCAACAGACTCAGAGCTATAAATTCACTAGCCACATAGCAGCTTTTCTCTCTCTGGTTTTGATCACCAAGATGCTTGAAATCTGCATACAAACATCATATGATAAAAATGTTCCAACTGATTTTAAAGAGTTGTCTCCCTGTAGTGTATGGTACCACCTTAAACAATTAATTCAACAATTCTATATATATGACAGAAAATAATAACATTGATGATTCATGGCTAAGATGTAAAACTTTAAGATGCTTATTTAATAGAAAGTTTATAACTTTCTGGCATTTTAAAGAAACCAATTTTAAGACGCTATACAGTCCTTGATGTAATGCACCATCTAGTTTTATCATAAAAAGTCACCTTAACAAGACCCCATACAGGGTTTTGTTAGATGTTTATGTGGGACATAATGGAAAGTAGAAGCTTTTAAAAGATCCAATTTTAATTAGATTGATTCACTTCTATGTAAATTAAGGGAGTTACAGTTTATGCACTTTTTTACCTAAATACAACCAATACAACCTCATAGAAACTGTGTGTTTTATCAAGTT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Protein

Gene family

Gene family	Subfamily
Transcription Factors Family	zf-C2H2
Transcription Factors Family	ZBTB

Pfam domain

Pfam accession	Pfam name	Description	Type	Source
PF00096	zf-C2H2	Zinc finger, C2H2 type	Domain	Interproscan
PF00651	BTB	BTB/POZ domain	Domain	Interproscan

InterPro

InterPro term	Type	Description	Source
IPR000210	Domain	BTB/POZ domain	Interproscan
IPR011333	Homologous_superfamily	SKP1/BTB/POZ domain superfamily	Interproscan
IPR013087	Domain	Zinc finger C2H2-type	Interproscan
IPR036236	Homologous_superfamily	Zinc finger C2H2 superfamily	Interproscan

PANTHER

PANTHER term	Description	Source
PTHR24376	ZINC FINGER PROTEIN	Interproscan

Gene Ontology

GO terms	Category	Description	Source
GO:0000978	Molecular Function	RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding	Interproscan
GO:0001228	Molecular Function	DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific	Interproscan
GO:0005515	Molecular Function	protein binding	Interproscan
GO:0005634	Cellular Component	nucleus	Interproscan
GO:0006357	Biological Process	regulation of transcription by RNA polymerase II	Interproscan

KEGG pathway

KO	Enzyme	Enzyme ID	pathway	mapID	Source
-	-	-	-	-	-

Expression pattern

1. Expression trend for Bpl_scaf_61879-1.16 global RNA-seq network