Gene detail

Detailed information of Bpl_scaf_5950-0.12 in Gigantidas platifrons Gene info

Gene ID	Annotation	Scaffold	Start	End	Strand
Bpl_scaf_5950-0.12	TENEURIN AND N-ACETYLGLUCOSAMINE-1-PHOSPHODIESTER ALPHA-N-ACETYLGLUCOSAMINIDASE	Bpl_scaf_5950	167730	179584	-

Gene Structure

More details in Jbrowse Sequence

CDS

Bpl_scaf_5950-0.12

ATGGGTATCTGTACTTGTGAACCTGGTTGGAAAGGAGATGACTGTGCCAAACCTAGCTGTCCTGGCACCCCAGAATGTCTTGGACCAGATCATGGAAACTGTACTGACGGAGGAATATGTGATTGTACTGACGACTGGTCTGGGGAATACTGCCATATAGCATGTTATAATGGTACCAATGTAGATGGTAGCTGTGTATGTCATCAACCATGTATTACTGGAATTAGTTGTCATTTGGAATGTACAACGCACGGTAAATGTGACGACAACGGAGAATGTGCATGTGATTTCTATGGAACTTACACAGGCGATAGATGTGATGAACCTAGTTGTCCAGGTTGGCCAGTTGCGTGTCAAGGACATGGTACATGTAATTCTGTAACTGGAGAGTGTGAATGTGATCTTTACTGGACCGGATCAGCATGTGAAAAAGCAGATTGTCCTGGGACTCCAGATTGTAATGGTGTTAATGCTACCTGTGGTGTTCCACCAGAGGGAGGTAATCCAAGATGTCTCGACTGCCAGTATCCCTACACAGGGGATTCTTGTGAATACAAATGTGTTCATGGAACTTCAGTACGAGCATTTGATGGTGTCTGGACATGTTCCTGTGATTTCTGTTACAGTGGTGTAGAATGTGATTCTCTTTGTTCTGGACAAGGAACCTGTCAAAATAACACATGTGACTGTGGATTTAATGGATACCGCGGCGACTGGTGTCAGATTAGAGGTTGTCCAGGATACAACATAGATTGTTCTGGAAACGGAGACTGTAACTCAGCTACAGGTCAGTGTGTCTGTAATGAAGGCTTTAAAGGAGTAGGATGTCATATACCCTCATGTCCACAAGACTGTAACTCCAACGGCAGTTGTATTTTAGATGACGACAATGTACCTACATGTAGTTGCCACTCAAATTATTTTGGATATGCTTGTCAATATGACTGTGAACACGGAACAGTTGTCAATGGTACCTGCAAATGTGACAATTGTTATAATGATTATACCTGCTCACTACAATGCTCTGGCACTGGGAACTGTACTAACGGAGCGTGCGATTGTGGATTTAATGGTGGACGAGGAGACTATTGTGAACAACCAGGATGTCAAGGATATGGGACAGATTGCAGTGGAAATGGAGAATGTAACGTAGGGACTGGTAATTGTATCTGCTATGAGGGATGGAAAGGGGATGGATGTGAACAGTCGGACTGTCCAGATAATTGTAACTTCAGAGGCTATTGTAATGTCTCCTTGGCCAGACCTAGATGTACTAGTTGTGAGACAGGGTGGATGGGAGAATCTTGTAACGAAGTCTGTAATGGAAACCAGGTGCCTATGGACAGTGGAAATTGTGTTTGTGGCAGCAAATGTGCCTCTGGAGATTCGTGTGAAGTTGTTTGTAGTGGCTCTGGAACATGTAACAATGAAACCTGTGTTTGTAATAGTGGATACTGGGGAGATCTGTGTGAAGATCATCTCTGTCTTGGAATCGGTGAGCTCTGTACTGGCCATGGAGACTGTAATACTGTTACTAGAGAATGTTTCTGTAATCCTGGGTGGTACGGTGAAGACTGTAGTGTTCCAGACTGTCCTGGTGATCCTGATTGTAACGATCGTGGTAATTGCAGTGCCGACACAACATATCCTACGTGTAAATGTAATGATGACTGGACAGGATACTCCTGTGAATTGCCATGTGTCTATGGTACACCACAAGCAGACTTCACCTGTGTATGTGAACCATGTTATGCTGGGACAGGTTGTGATTTCCTCTGTGGAAGACATGGAGCATGTAATAATGGTAACTGTACCTGTGATACAGCATGGTGGGGCAATTACTGTGATGAAAGAGGTTGTCCAGGTGACCCAGACCAACCAGAGAAAGGAAGTTGTACCGGACAGGGTACCTGTATCTTAGCTGACCAGAAATGTGATTGTAACTATGGATGGCAGGGTGATGGGTGTGAACTTCCTGATTGCCCTGGGGATCCAGACTGTAACTTGAAAGGTGACTGTGTTCTTCTTAATGGTGGACCAAAGTGTATTAACTGTAACGACACCATGGGACCAGCTTGTCAATACCCATGTGTCTATGGTGTAGAATACCCACCATTCAGTTCAACTTGTGTGTGTGATCCCTGTTACTCAGATACTGGATGTGAAACCTTGTGTTCCAATGTTGGTCAATGTACTAATGATACATGTTTCTGTGAAGAAGGCTACAAGGGAGAGCACTGTGAACTTTTGGACTGTCCAGGTGAACCTGACTGTAGTACCTATGGTATATGTAAAAGAAGTGACAATGCCTCTGTCTGTGTATGTAATGGTGGTTTTACAGGAGATGATTGTTCAGAGTTTATATGTCCAGGAACACCCAAATGTAGTGGCAATGGTCAATGTCTCCTTGCTGATGGAGCTAATGCTCCAGCTTGTCTATGTGATCATGGATTTGGAGGGTTGTCATGTGATTCCTGTTTGACACATTTTGAAGGCTCAAACTGTGAGAGGTGTGAAGCTGCTTACATTGGCTACAATACAACTTGTAGTGTACTGTGTATCCATGGTGATCCTACTGAACTAGGTGGTGATGTATGCAAATGTCATGATGATGATGTTAAAGGACATTGGATAGGTGATGCTTGTGACGAGTGTGTATCAGGCTGGGATCTACCATCCTGTACCGTGTGTATACCAGATTTTGTTGGTCCAGGACATTGTACAATTCCCTGTACAGATGGACATGGAGATTATGCTGACAAGTTTGATGGGACAGGAGAGACAGAAGCCATTGATGTTGTATTTAGATGCTATACAGAAGAATCTGATGGTAATTACACAGCATGGTTTGGCTACAACAATACAAACGACCATAATGTTTATATAACATCATCATATGAGAATTATATCACCAAATCTAGTACAACAGTATACCCACCAACCAAATTTACACAGGGATGGACAGCATATGCTCTTTCTGTAAAATCACTGACACCTACAGACGTTGTTACATGGTACCTATCATCAACGTTTGCCAGTGAAGCGAAACATGCTTCAGCAGTACTGTCAGCTGATAGGAAATGTTCAGGTGTTCCATTGGTGGTAACTATTAGTGACATGACTGGTTACTGTAAATGTGAGGATGGATACTGGGGAACTGAATGTAATAATGAATGTCCAGGTGGAGCCTCTAATCCATGCTATGGAAATGGTGCATGTGATAAGAGTACTGGGTCATGTGACTGCTATACAGGATCTGGAATGAACACAAATTGCCAACAATGTGAGACAGGATGGTTTGGTACAGATTGTTCTGTTGTACATGTAAACAATAATAACACTGACAGTGGCCATTACCTTGGGAAATGTTATCACAGTGGTCATTTTATCACATTTGATGGAACTGTTTACAATTACCACTATCCAGGGGAACATATGCTTGTGTCTGGTCGGTTGGTGTCCGGAATGCAAATCAAAATCCACGTCCTTCAAGTGTTCATGTCAGAGTATTACTCCAGTGTAGGAACATCTGCAGTAGGAATACAGATCAGTAGTCATAAACTGGTGATATCTGTAATAGACAAAATGGTTTCCACATGGTATGACAGTGAAAAAGTGGTGATTGGCTCTGGTTTAAATATATCTGGAGTACTATGTAAGCAAATTTCATCGTACCAATATCAAGTTGTGTCAGGATCAGAAATAACAATCAACGTTTATGTCTACGAGAACCACCTTGATGTCTATGTTGGTGCTTCTGCAACCTTTTGTGAAACTAGCAATGGTTTACTGAGCAGTTGTAACCAAAATCATGAAGATGATTTCAAAACAAGGACAGGAGTAGTATTGACAAGTACAGGAACTTTGAATACAAACTCAATACACAATGACTTTGGTCAATCATGGATTGTCAGTGATGCTGACTCAATTTTCAAAAACTTGCTATCATTATCCAATGGTGGAGGATATGGTCTGTTTGTCAATGGTTCAAACCTC

Transcript

Bpl_scaf_5950-0.12

TTGTTTCAGTGAGCTAGCACTTTAAAAATCCAACTAAGCATGTTGGTTTAGTACAAAGCGGACCACATCATCATGATAAAATGCTGAGTTGGCATTAAACAACAATCACTCACTGATTCACTCTACGAAATATTATATTTACTGTTGATATCATTACTGACTGTTGCTTTATACAGGTAACAGCTGGGTTGGAGACAAATGTCAAGAATCAGGATGTCCAGGTGAGGACGGGGCATGTAATGGCCATGGGAGCTGTAACAGTGCCATGGGTATCTGTACTTGTGAACCTGGTTGGAAAGGAGATGACTGTGCCAAACCTAGCTGTCCTGGCACCCCAGAATGTCTTGGACCAGATCATGGAAACTGTACTGACGGAGGAATATGTGATTGTACTGACGACTGGTCTGGGGAATACTGCCATATAGCATGTTATAATGGTACCAATGTAGATGGTAGCTGTGTATGTCATCAACCATGTATTACTGGAATTAGTTGTCATTTGGAATGTACAACGCACGGTAAATGTGACGACAACGGAGAATGTGCATGTGATTTCTATGGAACTTACACAGGCGATAGATGTGATGAACCTAGTTGTCCAGGTTGGCCAGTTGCGTGTCAAGGACATGGTACATGTAATTCTGTAACTGGAGAGTGTGAATGTGATCTTTACTGGACCGGATCAGCATGTGAAAAAGCAGATTGTCCTGGGACTCCAGATTGTAATGGTGTTAATGCTACCTGTGGTGTTCCACCAGAGGGAGGTAATCCAAGATGTCTCGACTGCCAGTATCCCTACACAGGGGATTCTTGTGAATACAAATGTGTTCATGGAACTTCAGTACGAGCATTTGATGGTGTCTGGACATGTTCCTGTGATTTCTGTTACAGTGGTGTAGAATGTGATTCTCTTTGTTCTGGACAAGGAACCTGTCAAAATAACACATGTGACTGTGGATTTAATGGATACCGCGGCGACTGGTGTCAGATTAGAGGTTGTCCAGGATACAACATAGATTGTTCTGGAAACGGAGACTGTAACTCAGCTACAGGTCAGTGTGTCTGTAATGAAGGCTTTAAAGGAGTAGGATGTCATATACCCTCATGTCCACAAGACTGTAACTCCAACGGCAGTTGTATTTTAGATGACGACAATGTACCTACATGTAGTTGCCACTCAAATTATTTTGGATATGCTTGTCAATATGACTGTGAACACGGAACAGTTGTCAATGGTACCTGCAAATGTGACAATTGTTATAATGATTATACCTGCTCACTACAATGCTCTGGCACTGGGAACTGTACTAACGGAGCGTGCGATTGTGGATTTAATGGTGGACGAGGAGACTATTGTGAACAACCAGGATGTCAAGGATATGGGACAGATTGCAGTGGAAATGGAGAATGTAACGTAGGGACTGGTAATTGTATCTGCTATGAGGGATGGAAAGGGGATGGATGTGAACAGTCGGACTGTCCAGATAATTGTAACTTCAGAGGCTATTGTAATGTCTCCTTGGCCAGACCTAGATGTACTAGTTGTGAGACAGGGTGGATGGGAGAATCTTGTAACGAAGTCTGTAATGGAAACCAGGTGCCTATGGACAGTGGAAATTGTGTTTGTGGCAGCAAATGTGCCTCTGGAGATTCGTGTGAAGTTGTTTGTAGTGGCTCTGGAACATGTAACAATGAAACCTGTGTTTGTAATAGTGGATACTGGGGAGATCTGTGTGAAGATCATCTCTGTCTTGGAATCGGTGAGCTCTGTACTGGCCATGGAGACTGTAATACTGTTACTAGAGAATGTTTCTGTAATCCTGGGTGGTACGGTGAAGACTGTAGTGTTCCAGACTGTCCTGGTGATCCTGATTGTAACGATCGTGGTAATTGCAGTGCCGACACAACATATCCTACGTGTAAATGTAATGATGACTGGACAGGATACTCCTGTGAATTGCCATGTGTCTATGGTACACCACAAGCAGACTTCACCTGTGTATGTGAACCATGTTATGCTGGGACAGGTTGTGATTTCCTCTGTGGAAGACATGGAGCATGTAATAATGGTAACTGTACCTGTGATACAGCATGGTGGGGCAATTACTGTGATGAAAGAGGTTGTCCAGGTGACCCAGACCAACCAGAGAAAGGAAGTTGTACCGGACAGGGTACCTGTATCTTAGCTGACCAGAAATGTGATTGTAACTATGGATGGCAGGGTGATGGGTGTGAACTTCCTGATTGCCCTGGGGATCCAGACTGTAACTTGAAAGGTGACTGTGTTCTTCTTAATGGTGGACCAAAGTGTATTAACTGTAACGACACCATGGGACCAGCTTGTCAATACCCATGTGTCTATGGTGTAGAATACCCACCATTCAGTTCAACTTGTGTGTGTGATCCCTGTTACTCAGATACTGGATGTGAAACCTTGTGTTCCAATGTTGGTCAATGTACTAATGATACATGTTTCTGTGAAGAAGGCTACAAGGGAGAGCACTGTGAACTTTTGGACTGTCCAGGTGAACCTGACTGTAGTACCTATGGTATATGTAAAAGAAGTGACAATGCCTCTGTCTGTGTATGTAATGGTGGTTTTACAGGAGATGATTGTTCAGAGTTTATATGTCCAGGAACACCCAAATGTAGTGGCAATGGTCAATGTCTCCTTGCTGATGGAGCTAATGCTCCAGCTTGTCTATGTGATCATGGATTTGGAGGGTTGTCATGTGATTCCTGTTTGACACATTTTGAAGGCTCAAACTGTGAGAGGTGTGAAGCTGCTTACATTGGCTACAATACAACTTGTAGTGTACTGTGTATCCATGGTGATCCTACTGAACTAGGTGGTGATGTATGCAAATGTCATGATGATGATGTTAAAGGACATTGGATAGGTGATGCTTGTGACGAGTGTGTATCAGGCTGGGATCTACCATCCTGTACCGTGTGTATACCAGATTTTGTTGGTCCAGGACATTGTACAATTCCCTGTACAGATGGACATGGAGATTATGCTGACAAGTTTGATGGGACAGGAGAGACAGAAGCCATTGATGTTGTATTTAGATGCTATACAGAAGAATCTGATGGTAATTACACAGCATGGTTTGGCTACAACAATACAAACGACCATAATGTTTATATAACATCATCATATGAGAATTATATCACCAAATCTAGTACAACAGTATACCCACCAACCAAATTTACACAGGGATGGACAGCATATGCTCTTTCTGTAAAATCACTGACACCTACAGACGTTGTTACATGGTACCTATCATCAACGTTTGCCAGTGAAGCGAAACATGCTTCAGCAGTACTGTCAGCTGATAGGAAATGTTCAGGTGTTCCATTGGTGGTAACTATTAGTGACATGACTGGTTACTGTAAATGTGAGGATGGATACTGGGGAACTGAATGTAATAATGAATGTCCAGGTGGAGCCTCTAATCCATGCTATGGAAATGGTGCATGTGATAAGAGTACTGGGTCATGTGACTGCTATACAGGATCTGGAATGAACACAAATTGCCAACAATGTGAGACAGGATGGTTTGGTACAGATTGTTCTGTTGTACATGTAAACAATAATAACACTGACAGTGGCCATTACCTTGGGAAATGTTATCACAGTGGTCATTTTATCACATTTGATGGAACTGTTTACAATTACCACTATCCAGGGGAACATATGCTTGTGTCTGGTCGGTTGGTGTCCGGAATGCAAATCAAAATCCACGTCCTTCAAGTGTTCATGTCAGAGTATTACTCCAGTGTAGGAACATCTGCAGTAGGAATACAGATCAGTAGTCATAAACTGGTGATATCTGTAATAGACAAAATGGTTTCCACATGGTATGACAGTGAAAAAGTGGTGATTGGCTCTGGTTTAAATATATCTGGAGTACTATGTAAGCAAATTTCATCGTACCAATATCAAGTTGTGTCAGGATCAGAAATAACAATCAACGTTTATGTCTACGAGAACCACCTTGATGTCTATGTTGGTGCTTCTGCAACCTTTTGTGAAACTAGCAATGGTTTACTGAGCAGTTGTAACCAAAATCATGAAGATGATTTCAAAACAAGGACAGGAGTAGTATTGACAAGTACAGGAACTTTGAATACAAACTCAATACACAATGACTTTGGTCAATCATGGATTGTCAGTGATGCTGACTCAATTTTCAAAAACTTGCTATCATTATCCAATGGTGGAGGATATGGTCTGTTTGTCAATGGTTCAAACCTC

Protein

Gene family

Gene family	Subfamily
-	-

Pfam domain

Pfam accession	Pfam name	Description	Type	Source
PF07974	EGF_2	EGF-like domain	Domain	Interproscan

InterPro

InterPro term	Type	Description	Source
IPR000742	Domain	EGF-like domain	Interproscan
IPR001846	Domain	von Willebrand factor, type D domain	Interproscan
IPR002049	Domain	Laminin-type EGF domain	Interproscan
IPR013111	Domain	EGF-like domain, extracellular	Interproscan
IPR051216	Family	Teneurin domain-containing protein	Interproscan

PANTHER

PANTHER term	Description	Source
PTHR11219	TENEURIN AND N-ACETYLGLUCOSAMINE-1-PHOSPHODIESTER ALPHA-N-ACETYLGLUCOSAMINIDASE	Interproscan

Gene Ontology

GO terms	Category	Description	Source
GO:0007157	Biological Process	heterophilic cell-cell adhesion via plasma membrane cell adhesion molecules	Interproscan
GO:0042803	Molecular Function	protein homodimerization activity	Interproscan
GO:0043005	Cellular Component	neuron projection	Interproscan
GO:0046982	Molecular Function	protein heterodimerization activity	Interproscan
GO:0048666	Biological Process	neuron development	Interproscan
GO:0050839	Molecular Function	cell adhesion molecule binding	Interproscan

KEGG pathway

KO	Enzyme	Enzyme ID	pathway	mapID	Source
-	-	-	-	-	-

Expression pattern

1. Expression trend for Bpl_scaf_5950-0.12 global RNA-seq network