Gene detail

Detailed information of Bpl_scaf_54789-0.56 in Gigantidas platifrons Gene info

Gene ID	Annotation	Scaffold	Start	End	Strand
Bpl_scaf_54789-0.56	UDP-N-ACETYLGLUCOSAMINE--PEPTIDE N-ACETYLGLUCOSAMINYLTRANSFERASE 110 KDA SUBUNIT	Bpl_scaf_54789	46822	68884	-

Gene Structure

More details in Jbrowse Sequence

CDS

Bpl_scaf_54789-0.56

ATGAAGGAAATGCCTACAATGGCACATATAACATTGTCAGATGTTACAGGTCTAGCAGAATTAGCTCATAGAGAATACCAAGCTGGTAACTATGAGAATGCAGAACAACTTTGTATGCAGCTGTGGAGACAGGAACCAGACAATACTGGAGTTCTTTTATCAGCTTACTTCAGCCAGCTAGCTATCAAACAGAATCCCATGTTAGCAGAAGCTTATTCTAACCTTGGAAATGTATATAAAGAAAGAGGGCAATTGCAGGAGGCTCTAGAGAATTATAGACATGCTGTCCGATTAAAACCAGATTTTATTGATGGCTATATCAACTTAGCAGCAGCTTTAGATCTTTACTGTGTGAGGAGTGATCTTGGTAATCTGCTGAAAGCACTGGGGAGATTGGATGAGGCCAAGGCTTGTTATTTGAAGGCCATTGAAACCCAACCAAACTTTGCTGTAGCTTGGAGTAACTTGGGTTGTGTGTTCAATGCTCAGGGTGAAATATGGTTGGCAATTCATCATTTTGAAAAGGGCTGTGGCTGCCTACCTGAGGGCATTAAACTTAACTTGATAGATCTTGCCATTGATACATATAAAAGAGCCATAGAATTACAGCCAAATTTCCCAGATGCCTACTGCAATCTTGCCAATGCCTTGAAAGAGAAAGGAAAGGTTGTTGATGCAGAAGAATGTTACAACACAGCGTTAAAGTTGTGTCCTACACATGCAGATTCATTGAACAATTTAGCTAACATCAAAAGGGAACAAGGTTTAACAGAGGAGGCTGTCAAATTATACCTCAAAGCTTTGGAGGTCTATCCTGAATTTGCTGTGGCACATTCTAATTTAGCTAGTGTATTACAACAACAAGGCAAATTACATGAGGCATTACTACATTATAAAGAAGCTATCAGGATTTCACCAACATTTGCTGATGCCTACTCTAATATGGGAAACACATTGAAAGAAATGCAGGATATACAAGGAGCATTACAATGTTATACTAGAGCTATACAAATCAACCCTGCATTTGCTGATGCACATAGTAACTTGGCATCAATTCATAAGGATTCTGGTAACATCCCAGAAGCTATTGCATCTTATAGAACAGCTCTCAAGTTGAAACCTGATTTTCCTGATGCTTATTGTAATTTAGCACATTGTTTACAAATAAATGTTTTACACAAGCCAGAATTTGAACATCCTAATGTACAGATCGATCCCAATGCCAGGCTGAAAATATTTTGTTATTCCCTCAGTCCTGATGATGGTACAACATTTAGAAATAAGATATCTTCTGGAGCAGAACATTTTATTGACTTATCACAGTTACCATGTAATGGTAAAGCAGCAGACAGAATTTATGCAGATGGAATCCAGATTCTTGTCAATATGAATGGGTACACAAAAGGAGCCAGAAATGAATTGTTTGCTCTTAGACCTGCTCCTATTCAGGTGATGTGGCTGGGTTATCCTGGTACAAGTGGTGCTTCCTTCATGGACTACATATTAACAGACGAAATTACATCACCGATACATCTGGCTGATCAGTATTCTGAAAAATTGGCTTTCATGGCTGACACATTTTTCATTGGTGATCATCAACAAATGTTCCCACATCTGAAAGAAAAAATTCTAATTGAACGAGTACTGTATGAAGCAGATCACGGTGAAACAACAGATGAAGAGGATGGATCACCTGCCACGGTTTCCTTTGATGTGATGGATTTACCTGTACATACTATCCTGCAGACCATGATCCAGACAGGCTTGTCTCATTCCATGGTCAATGATGTCATTATTCAGAATGGTGTCACTACGAACCAAACTAACAACAAAGCAGCAACCGGAGAGGAAGTACCACAAAATATCATTATCAGTGGTCGTTGTCAGTACAATCTGCCAGATGATGCTATTGTCTATTGTAACTTTAATCAGTTATATAAGATTGATCCAGCCACTCTGGACATGTGGATTGAAATTCTGAAAAATGTTCCCAACAGCGTATTATGGCTGTTGAAATTTCCTGCAGTTGGTGCAGCCAATGTCATAAAACGGGCAACTTCAAGTGGTCTTGATGCTGAAAGAATTATATTTTCACATGTGGCTCCCAAGGAGGAACATGTACGACGTGGACAGTTGGCTGATGTATGTTTAGATACCCCATTATGTAATGGACATACAACAGGGATGGATGTTTTATGGGCAGGAACACCTATGGTCACTCTTCCAGGTGAAACCTTAGCATCCAGAGTTGCTTCCTCACAGCTGCACACTTTAAGAAAAATGAGAGCAAAGGTTTGGAGAGCAAGAACGTCGAGTCCCTTATTTAACTGTAGACATTATGCTCATAATATGGAGACACTGTTTAAAGAAATGTGGAGGAAATATGAAAACGGAGAAGAAGTTGATCATATAACTGAAGCATAA

Transcript

Bpl_scaf_54789-0.56

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Protein

Gene family

Gene family	Subfamily
-	-

Pfam domain

Pfam accession	Pfam name	Description	Type	Source
PF13414	TPR_11	TPR repeat	Repeat	Interproscan
PF13424	TPR_12	Tetratricopeptide repeat	Repeat	Interproscan
PF13844	Glyco_transf_41	Glycosyl transferase family 41	Family	Interproscan

InterPro

InterPro term	Type	Description	Source
IPR011990	Homologous_superfamily	Tetratricopeptide-like helical domain superfamily	Interproscan
IPR019734	Repeat	Tetratricopeptide repeat	Interproscan
IPR029489	Domain	O-GlcNAc transferase, C-terminal	Interproscan

PANTHER

PANTHER term	Description	Source
PTHR44366	UDP-N-ACETYLGLUCOSAMINE--PEPTIDE N-ACETYLGLUCOSAMINYLTRANSFERASE 110 KDA SUBUNIT	Interproscan

Gene Ontology

GO terms	Category	Description	Source
GO:0005515	Molecular Function	protein binding	Interproscan
GO:0006493	Biological Process	protein O-linked glycosylation	Interproscan
GO:0097363	Molecular Function	protein O-acetylglucosaminyltransferase activity	Interproscan

KEGG pathway

KO	Enzyme	Enzyme ID	pathway	mapID	Source
K09667	OGT; protein O-GlcNAc transferase	EC:2.4.1.255	Other types of O-glycan biosynthesis	ko00514	PMID: 28812709
K09667	OGT; protein O-GlcNAc transferase	EC:2.4.1.255	Insulin resistance	ko04931	PMID: 28812709

Expression pattern

1. Expression trend for Bpl_scaf_54789-0.56 global RNA-seq network