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Detailed information of Bpl_scaf_53430-2.9 in Gigantidas platifrons Gene info

Gene ID	Annotation	Scaffold	Start	End	Strand
Bpl_scaf_53430-2.9	PROTEIN SIDEKICK	Bpl_scaf_53430	245992	280350	+

Gene Structure

More details in Jbrowse Sequence

CDS

Bpl_scaf_53430-2.9

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Transcript

Bpl_scaf_53430-2.9

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Protein

Gene family

Gene family	Subfamily
-	-

Pfam domain

Pfam accession	Pfam name	Description	Type	Source
PF00041	fn3	Fibronectin type III domain	Domain	Interproscan
PF07679	I-set	Immunoglobulin I-set domain	Domain	Interproscan

InterPro

InterPro term	Type	Description	Source
IPR003598	Domain	Immunoglobulin subtype 2	Interproscan
IPR003599	Domain	Immunoglobulin subtype	Interproscan
IPR003961	Domain	Fibronectin type III	Interproscan
IPR007110	Domain	Immunoglobulin-like domain	Interproscan
IPR013098	Domain	Immunoglobulin I-set	Interproscan
IPR013106	Domain	Immunoglobulin V-set domain	Interproscan
IPR013783	Homologous_superfamily	Immunoglobulin-like fold	Interproscan
IPR036116	Homologous_superfamily	Fibronectin type III superfamily	Interproscan
IPR036179	Homologous_superfamily	Immunoglobulin-like domain superfamily	Interproscan

PANTHER

PANTHER term	Description	Source
PTHR44170	PROTEIN SIDEKICK	Interproscan

Gene Ontology

GO terms	Category	Description	Source
GO:0005515	Molecular Function	protein binding	Interproscan
GO:0098609	Biological Process	cell-cell adhesion	Interproscan

KEGG pathway

KO	Enzyme	Enzyme ID	pathway	mapID	Source
K06753	ROBO1; roundabout, axon guidance receptor 1	-	Axon guidance	ko04360	PMID: 28812709

Expression pattern

1. Expression trend for Bpl_scaf_53430-2.9 global RNA-seq network