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Detailed information of Bpl_scaf_49856-0.2 in Gigantidas platifrons Gene info

Gene ID	Annotation	Scaffold	Start	End	Strand
Bpl_scaf_49856-0.2	ATAXIN 2-BINDING PROTEIN 1-RELATED	Bpl_scaf_49856	6408	40423	-

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Bpl_scaf_49856-0.2

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Protein

Gene family

Gene family	Subfamily
-	-

Pfam domain

Pfam accession	Pfam name	Description	Type	Source
PF00076	RRM_1	RNA recognition motif	Domain	Interproscan

InterPro

InterPro term	Type	Description	Source
IPR000504	Domain	RNA recognition motif domain	Interproscan
IPR012677	Homologous_superfamily	Nucleotide-binding alpha-beta plait domain superfamily	Interproscan
IPR034237	Domain	FOX1, RNA recognition motif	Interproscan
IPR035979	Homologous_superfamily	RNA-binding domain superfamily	Interproscan
IPR047131	Family	RNA binding protein fox-1 homolog 1-like	Interproscan

PANTHER

PANTHER term	Description	Source
PTHR15597	ATAXIN 2-BINDING PROTEIN 1-RELATED	Interproscan

Gene Ontology

GO terms	Category	Description	Source
GO:0000381	Biological Process	regulation of alternative mRNA splicing, via spliceosome	Interproscan
GO:0003676	Molecular Function	nucleic acid binding	Interproscan
GO:0003723	Molecular Function	RNA binding	Interproscan
GO:0003729	Molecular Function	mRNA binding	Interproscan
GO:0005634	Cellular Component	nucleus	Interproscan
GO:0005737	Cellular Component	cytoplasm	Interproscan
GO:0007399	Biological Process	nervous system development	Interproscan

KEGG pathway

KO	Enzyme	Enzyme ID	pathway	mapID	Source
K14946	RBFOX, FOX; RNA binding protein fox-1	-	Spliceosome	ko03041	PMID: 28812709

Expression pattern

1. Expression trend for Bpl_scaf_49856-0.2 global RNA-seq network