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Detailed information of Bpl_scaf_41172-3.3 in Gigantidas platifrons Gene info

Gene ID	Annotation	Scaffold	Start	End	Strand
Bpl_scaf_41172-3.3	HUNTINGTIN INTERACTING PROTEIN 1	Bpl_scaf_41172	243420	281173	-

Gene Structure

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CDS

Bpl_scaf_41172-3.3

ATGGCTGCTCAGAAAGAAGAAATTGCAAGATTAGAAAAGATATTATCTGAATTAAGATTGTCAGCTGATCGTGCACTGAAAGACAATGATGAGCTAAAGAAGAAATTAGATAAAGCATCAGTACATGTTGGAGCTGCTGTTAAACTTACAGAAGCTGAGAAGCAAGCTAAAAGTTATGAAGATAAGTTTAAAAAGATGAAGGATATTTATCAAAAGTTAAGAGAGGAACATGTCTCATTATTACGAACAAATGCTGAAGTAACAAAGAAATTAGATGCTGAAAAGAGAACAGTGGCAGAGAAAGAGCAATTATTAAAGGAATCAAAGTCAGAAATGGATCGAATAGAACAAGAAAGAAAAGTGATTCAGGAAAGTTTAAAACAGAACGCAGACGAGACGTCATCTCAACTGGCCATGACAATGGCTAAGAATACAGACCTACAGACAGACAAAGAGCATTTAGAGAATCAGTTAAAGATGTTGGAGGACACAAAGACAAGTCTCATGACACAGCTACAAACAGCTGAAGAGGAATGTACTAGTTTACAATCCCAACTGGACCAAGTGGAGGAGGACAAGAGAACACAGGAGAGTTCTCTATCAGGGGAGATAAGTACCCTTCAACAACAACTTACAGCATTAATGGTAGAAAAAGAGACTTTAGATTCCAAATTAAATCAGGAAATACATGAATTAAAGTCAAATTTAGAACAAGAGAGAGCAGAAAAGAATTCCTTGGAGGACCAATTAAGAAAACAGATTTCGGACTTAGAATCAAGACTAAGTCAGACAGAGAAAGATAAACAAAATACAGAGGATAAACTGACAGATGACATAAGTTTGTTACATAAAAGTTTATTGGGTACATCAATACAGGAAGGTAAAGCCATTATCCAGGATGCCTTAGATCAGTTTGAAAACCCTACACATATAGCTGTCAAATGTACTGCAGAATTCTTATTGTTAAGAACAGAACCAGTTTTATCCAGTATAGAGAATCTAAAAGGAATGCAGGGAAAATATACAAGTAATAAATCAGAATTAGCCAATCTTGTGAAGTCCATCACAGGATTTTCACATCATCTAGGGGATTGTGTGATACATGGTATAGCTACAACACATTCAGCTAACCTTGATGCTGGGGAAGAATTAGGTAACGTCTGTAGAGATGCTGGAGAAAGTGGACTTAAGGTGCTAGACACATTAGAAAAAGGTGCTAATATTGAGGGAGATGTTGACCATGCTATAAAGTGTATGAAGAAAATGATCGCTCTTGCTGAAGATTTGGTTCCCAAGATGGTGGATGTCAAGGAGAAAGAAATAGGAGATTTAGTAGACAATGAAATGGCCTCGACTACATCAGCCATTGAGGAAGCTGCTAGGAGGATAGCTGAAATGTTGGAGAAAACAAGAGATGAAACTACAGGCATTGAGCTGAAAGTCAACGAGAGTATTCTTGACTCTTGTACTAGTCTGATGCATGCTATCAGGCTTCTTATAGAACGTTCCAGAGATTTACAGAGAGAGATTGTGGCACAAGGCAGGGGAACATCGACAGAAAAAGAGTTTTATAAGAAAAATCATAGGTGGACAGAGGGACTATTGTCTGCAGCTAAAGCTGTTGGGTGGGGAGCCACAGCTTTGATGGAGGCAGCAGATAAAGTAATGAAGGGGGAGGGGAAATTTGAGGAATTAATTGTGTGTTCTAATGAGATAGCTGCTAGTACAGCACAACTAGTGGTGGCTTCAAAGGTCAAGTCTGATAGGAGGAGTAAAAAATTAACATTGTTGTCTGAGGCCTCCAGAGGGGTAACTCAGAATACTGGTAAAGTTGTAGGTTCAGCGAGGGAAGGATCACAGATTATTGAAGAACAAGGCCTTATGGATTTCTCCAAATTATCTCTGATGCAGTCTAAAAAACATGAGATGCAATCACAGGTTAGAGTGTTGGAACTGGAGAAGGAATTAGAAACAGAGAGATACAAACTGGGAGAGTTTAGAAAGAAACATTACCAGTTAGCAGGGGCCAGCGAAGGGTGGGATGATGATCAGGGAGATGAGAGTGACACTGAATCACCAGGACAACCAGTGAAGAAGTAA

Transcript

Bpl_scaf_41172-3.3

AGAGATTTAATTATTGAAAGATTAACAAAACAAATCAAGTATCTTACAGCGGAGATAGAAAGATTAAAGTTAGAGGATCAGAAAATAATGGCTGCTCAGAAAGAAGAAATTGCAAGATTAGAAAAGATATTATCTGAATTAAGATTGTCAGCTGATCGTGCACTGAAAGACAATGATGAGCTAAAGAAGAAATTAGATAAAGCATCAGTACATGTTGGAGCTGCTGTTAAACTTACAGAAGCTGAGAAGCAAGCTAAAAGTTATGAAGATAAGTTTAAAAAGATGAAGGATATTTATCAAAAGTTAAGAGAGGAACATGTCTCATTATTACGAACAAATGCTGAAGTAACAAAGAAATTAGATGCTGAAAAGAGAACAGTGGCAGAGAAAGAGCAATTATTAAAGGAATCAAAGTCAGAAATGGATCGAATAGAACAAGAAAGAAAAGTGATTCAGGAAAGTTTAAAACAGAACGCAGACGAGACGTCATCTCAACTGGCCATGACAATGGCTAAGAATACAGACCTACAGACAGACAAAGAGCATTTAGAGAATCAGTTAAAGATGTTGGAGGACACAAAGACAAGTCTCATGACACAGCTACAAACAGCTGAAGAGGAATGTACTAGTTTACAATCCCAACTGGACCAAGTGGAGGAGGACAAGAGAACACAGGAGAGTTCTCTATCAGGGGAGATAAGTACCCTTCAACAACAACTTACAGCATTAATGGTAGAAAAAGAGACTTTAGATTCCAAATTAAATCAGGAAATACATGAATTAAAGTCAAATTTAGAACAAGAGAGAGCAGAAAAGAATTCCTTGGAGGACCAATTAAGAAAACAGATTTCGGACTTAGAATCAAGACTAAGTCAGACAGAGAAAGATAAACAAAATACAGAGGATAAACTGACAGATGACATAAGTTTGTTACATAAAAGTTTATTGGGTACATCAATACAGGAAGGTAAAGCCATTATCCAGGATGCCTTAGATCAGTTTGAAAACCCTACACATATAGCTGTCAAATGTACTGCAGAATTCTTATTGTTAAGAACAGAACCAGTTTTATCCAGTATAGAGAATCTAAAAGGAATGCAGGGAAAATATACAAGTAATAAATCAGAATTAGCCAATCTTGTGAAGTCCATCACAGGATTTTCACATCATCTAGGGGATTGTGTGATACATGGTATAGCTACAACACATTCAGCTAACCTTGATGCTGGGGAAGAATTAGGTAACGTCTGTAGAGATGCTGGAGAAAGTGGACTTAAGGTGCTAGACACATTAGAAAAAGGTGCTAATATTGAGGGAGATGTTGACCATGCTATAAAGTGTATGAAGAAAATGATCGCTCTTGCTGAAGATTTGGTTCCCAAGATGGTGGATGTCAAGGAGAAAGAAATAGGAGATTTAGTAGACAATGAAATGGCCTCGACTACATCAGCCATTGAGGAAGCTGCTAGGAGGATAGCTGAAATGTTGGAGAAAACAAGAGATGAAACTACAGGCATTGAGCTGAAAGTCAACGAGAGTATTCTTGACTCTTGTACTAGTCTGATGCATGCTATCAGGCTTCTTATAGAACGTTCCAGAGATTTACAGAGAGAGATTGTGGCACAAGGCAGGGGAACATCGACAGAAAAAGAGTTTTATAAGAAAAATCATAGGTGGACAGAGGGACTATTGTCTGCAGCTAAAGCTGTTGGGTGGGGAGCCACAGCTTTGATGGAGGCAGCAGATAAAGTAATGAAGGGGGAGGGGAAATTTGAGGAATTAATTGTGTGTTCTAATGAGATAGCTGCTAGTACAGCACAACTAGTGGTGGCTTCAAAGGTCAAGTCTGATAGGAGGAGTAAAAAATTAACATTGTTGTCTGAGGCCTCCAGAGGGGTAACTCAGAATACTGGTAAAGTTGTAGGTTCAGCGAGGGAAGGATCACAGATTATTGAAGAACAAGGCCTTATGGATTTCTCCAAATTATCTCTGATGCAGTCTAAAAAACATGAGATGCAATCACAGGTTAGAGTGTTGGAACTGGAGAAGGAATTAGAAACAGAGAGATACAAACTGGGAGAGTTTAGAAAGAAACATTACCAGTTAGCAGGGGCCAGCGAAGGGTGGGATGATGATCAGGGAGATGAGAGTGACACTGAATCACCAGGACAACCAGTGAAGAAGTAAAGATGACTGCCATGTTGTATAGCACTGTATCCGTAGGCTTTATCACCAAGCTCTAGCTAAATGTTGTATCCTGTCACAAGTTCGGAGAACTAAAACGGGTTCCAGCTTCATTGCTTTGGTGACCAGTACAGTTGCTATGGAAACCATTTGTGTTAACATATCAAATGTTTTTGATATTGTTGTTAATTTTGTGCTATAATAATGGACGAGAACCATTTGTGTGCTTTGAATTGATTGTTTTTATAGGTAGTAGTGTTATGTGTTGCCTGCCGTAACAAATCAGACTTGTAGAGATCATTAGCCGTCATCTTGTGTTATTATCACTCTATTGTAAAACTACTTTTACAACACTTAATAGAAATCTGTCAACACCTTGCCACATTCCTTTTCATTTGTGGTTTCGTTCATCTTGGTTGATGTCAATCTTCATGGTTTGGCAGAAACTAAGATGTTGGTTGACATATTCATTGTTTTGATACATGTACTCTAGTTATATATGCCTTTCATTATACAATAATTTTTATGGATTGATTGAATCCAACAAGAACCACGAAAATTAGTATTCAACAAATAAAAATGGAATTTACAGTAATGTGTCATTTTCCTTGAAATTGATTGGTTTGAGGTTTCCACATGCTTGCCTCAGTTAAAGTCCTTTACAAAAGTTTCATGTTACACAGCAACACCGGGACAGGTGACACAAGTCATTCACTATAGATCCATGAAATTATTTCAGATTTGTCATGAAATATTCTCTCTTGCTATTTTGTTTATGCTCAAATTAAACTCTTTGGATAACGTTTATAATATAAGTAATATTAAAACTGGGTATAATTGAATGATATTTGGATATGTATATATTACTACATGTAATATACAAAATGTTCTTTCAATGATATTTTGCTAAATTGTGATCACTGAATATGAAAAATATAATTTAATGATTTCATGATAAACATTAATTGACCAAAAAGAAGATTGTCACAGAAATGTGGGAAAAACAAAATTGTAAAATAAATTATGCTACAAACATTTTCTGTTTCTAAGATTTATTTAAGCTATTTGTATTTTAAATGAGGCCTAGCCTTTTGTCGTTTTTTCTAAAACGAAAATGTCTTGAATGAAATGTTTGTGTTGAAGTGAATAAGTGTTTGGGAAAAAAATGGTTGATTGGCACTGTGTGTTTGTTCAGAGTATGACAATGTAGTTCATGTCAACATTGTATTTTGTTTGACACTGTTTGTTGGTTAAGAGTATGACAATGTAGTTTATGTCAATATTGTATTTTGTTTGACACTGTTTGTTGGTTAAGAGTATGACAATGTAGTTTATGTCAACATTGTATTTTATTTGACACTGTATGTTGGTTAAGAGTATGACAATGTAGTTCATGTCAACATTGTATTTTTGTTTGTTTTGTCATTTATTGTTATAGAACTGTATCATATATATATATATCATATTTACATGGATTATAATATATATTCAGTCTTTAATAAGTCTACATTAACATTTGAAATGGTATTTTTTAGAATCGTCAATTGATAGAAGTACTGTTCCTTACCTTCACTTGGAAATCAGCAATTGATATACATGCATGTATAAGTATTGTTCTTTACTGGAGCTAAGTATGGATATTCCTTTATGTATCCACACCCTTTAACGATAAATTACCGTAATTACTGGTGCATAATGCACAGGATTTTGTCCAGATTCTTTATTTTGTAGGAGGGGTGTGCATTATAAACAAGAACAATGTGTTTCACTCTCTCCCAGACCGGGAAATCACATGTCCGCCATGTTTTTTTGTTTACTATTGTCAACATGCAAAGTTAAATATTTCTTAAATTGTTTGGACACTATTCCACAAAATAATTAAGTGCATCTACTATGTTTTAATTATTGAAGAATTGAAACTGTCTAGTGCAGTTTTGTTTTGTACTTTAAAATATTTACCTTTGATAGATGCGAATATAAACTGGGCTAAATATAAACGTCTGTGTAAAATAATCAATAATTTCAATGTACGTGTGCAGATCAAAGATGTCACAATTACTTAGTGTATAATTAGACTGCCAAACTGTGTTTACACAAGATTATAGTGATTGAAATAAAAAGAAAGGAAACAATAAAATGTAATTGTCAATTATGTCAAGTCTAATTAGCTTGATTGCTCCAAGGTGAAGTTAAATCTGATTAACAAAAAAATACACAACAATCTGTTATGATTGTATGGCTTGGATGCTATTTCATCACTAAATAAAAGGCATTGTTTGTAGTTCATTCACGTTAATTATTTGGTCAATTTTAAAAATACAAAAAAATGGTCGGATTGTCGGCGCTCTTTGATGTATGCTATTTCATCACTAAATAGACAACTGTTTGTAGCAAACGTATTTTCTACAGCTCCTCACAAGCTTAGCAAAGTTCAACAGTGTCATAATAAGTGACAATTGTTTGCCTTTATTTAGTCTATATCGTTATTTTCTGTCACCTTCAACTATCAACTGCGTTAATATACGTTCAGATCTGAATTTAAACTTATATTTACCGATGCTGTACTAGATTTAGAATCCATTACACAACATCCGGATAATAAAAACATCATATGAAAATGCCAATAAAACCCAAAACATTTCGTATTTTGCAACTTAATTGAAGATGAAAGGAGATAAATGGTTCTTAAATTCTACTAGTAAATAAAACATGCTCAAGGACTGAAAAATATATACGATTGACATTTAATTCTTACATTTCCGACGGCGATTTTTTTTTAAAGTCCATGTGCATTATAGACACGAACTAGTTTTTTT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Protein

Gene family

Gene family	Subfamily
-	-

Pfam domain

Pfam accession	Pfam name	Description	Type	Source
PF01608	I_LWEQ	I/LWEQ domain	Family	Interproscan

InterPro

InterPro term	Type	Description	Source
IPR002558	Domain	I/LWEQ domain	Interproscan
IPR030224	Family	Sla2 family	Interproscan
IPR035964	Homologous_superfamily	I/LWEQ domain superfamily	Interproscan

PANTHER

PANTHER term	Description	Source
PTHR10407	HUNTINGTIN INTERACTING PROTEIN 1	Interproscan

Gene Ontology

GO terms	Category	Description	Source
GO:0003779	Molecular Function	actin binding	Interproscan
GO:0006897	Biological Process	endocytosis	Interproscan
GO:0007015	Biological Process	actin filament organization	Interproscan
GO:0030136	Cellular Component	clathrin-coated vesicle	Interproscan
GO:0030276	Molecular Function	clathrin binding	Interproscan
GO:0030479	Cellular Component	actin cortical patch	Interproscan
GO:0032051	Molecular Function	clathrin light chain binding	Interproscan
GO:0035615	Molecular Function	clathrin adaptor activity	Interproscan
GO:0043325	Molecular Function	phosphatidylinositol-3,4-bisphosphate binding	Interproscan
GO:0048268	Biological Process	clathrin coat assembly	Interproscan
GO:0051015	Molecular Function	actin filament binding	Interproscan
GO:0080025	Molecular Function	phosphatidylinositol-3,5-bisphosphate binding	Interproscan

KEGG pathway

KO	Enzyme	Enzyme ID	pathway	mapID	Source
K04559	HIP1; huntingtin interacting protein 1	-	Huntington's disease	ko05016	PMID: 28812709

Expression pattern

1. Expression trend for Bpl_scaf_41172-3.3 global RNA-seq network