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Detailed information of Bpl_scaf_36169-2.34 in Gigantidas platifrons Gene info

Gene ID	Annotation	Scaffold	Start	End	Strand
Bpl_scaf_36169-2.34	ATP7, ISOFORM B	Bpl_scaf_36169	207535	246627	-

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Bpl_scaf_36169-2.34

ATGATCTGTCTTGCGGTTCGTCTCCTTTTGAGGTTAGTGGTTAGTGGCGAGAGTGACTCTGTTCAGGCATCATCTGAAGGAGAAAGGGGAGGGGGGGCTGTAAATGACGTGAATATATTGCCATATCAGTTTGAGCCGTATCTACCAGAGCCCGAGGCAACATCGTCCGATGACAACGACGCTAGTGGAGAAAGGATTGACAGACGAAATGATAATTCTTGTCCAACAGAAATATCACCACCAATCATAGCAGGGAAGATTGACGACATGGGTTTCTCAGCAAAAGTCAAAACAGTACACCCAGCCACAACTGACATCAAGGGAGATAACTCTGAACAAAAGACAGAAATAAACATAAAAGGAATGACATGCATGTCATGTGTTCGAAATATAGAAAATAATATTTCCAGAATTGAGGGAGTGAATCATATTTCAGTGTCTTTAAAGAATGAAAAGGCTAATGTTTTGTATGATTCAACAAAAATTTCCCCAACTCAAATTGCAGAAGCCATTGATGATATGGGGTTCGATGCAAGTGTGTTCCAGCATCCAAAATCGCTGATAACTCGAATAAAGATAGAGGGCATGACTTGTCAGTCATGTGTAAAAAATATCGAGAATAATTTGAAAAATAATCCAGGAGTGGAGGACATCAGAGTTTCTCTCACAGATAAGGAAGCTTTTATTATTTACAATCCTGATCATACAAATCCTGAGAATTTAAGAGAAAGCATTGATGATATGGGCTTTGATGCCTCTTTTCCAAGGCACCCTTCGATTGAACTTGAATTTGATCGTCTGGCAGAACGAAGTTCGACCAGGTCGGGAAGTCCTGAACAAGAATGTGTGATTTCTATTGTGGGAATGACTTGTAACTCATGTGTAAGAAATATTGAAAATAATATAAAGGACAATCCTGGAATCAAGTCGATAAAAGTCAGTCTAGAAAATGAAAATGGAACCGTGAAGTACAACAAATTGATCACAACTCCTGAAAAAATTGCCGATATGATCGATGATATGGGATTTGATGCAAAAGTTGCAGATGATGTTCAAACTGAAACAGTTACCATCAATATATCTGGAATGACATGTAATTCATGTGTCAAAAATATAGAAGGGAACATCTCAAAGAATCCCGGTGTCAAGTCTATTAAAGTTTCATTGGCAAATCAAAATGGAGTCATCGAGTACTTTAAAAACAGAGCGACACCAACAATGTTATGTGAAGCTATAGAAGATATGGGGTTTGATGCTTCATTGGCAGTGGCATTGATGGCACAGAAAGCTGAGATTAAATATGATCCTGAATATATCTTATCTAACCAGATAGCTAACAAAGTTAATGATCTTGGATTCCATGCCACTGTTATGGAGTCTGAGTCACTTGGCAAAGGCACAGTCGAGTTACTTAATTTAGGATTTACTGCAGATCTGTTCACAGATGATGATACAAATGCATCAAGATACGATCACAGACACGCTATTCGAAGATGGCGTAATTCTTTTCTCTGGTCATTGATATTTGGTGTACCAGCCATGTCTATTATGATCTATTTTATGTTTGCCGACCCACCAGACGACGACCATAGTAACCATGGTAACATGACAGAAAACATGACGACAACTACAGCAAAGCCTAAATCTAGTCACATGTACCAGATAATGTTGTTACCTGGCCTTTCTCTTGAAAACTTACTGATGTTTTTATTGGCCTCACCTGTGCAGGGTAAGACATCTGAAGCTTTAGCCAAATTGATGTCACTTCAAGCTTCTGAAGCTGTTCTATGAAATGATGTGATTGGTGGATCTATAAACCAGAATGGAATGTTATTGATGGAAGCTACTCATGTTGGAGCAGAAACAACTTTATCACAAATTGTAAAACTGGTTGAAGAAGCACAAACATCGAAGGCTCCAATTCAGCAACTTGCAGACACAATAGCTGGTTATTTTGTTCCTATCGTCTGCACATTGTCCATTTTGACCTTGACCGGTTGGGTAATTGTGGGATATGTCGACATCTTCAATATTGATCCCGAGTTTGATGAGAACTATGGCGTAACTAAGCATGAACTGATATTCCAGAAAGCTTTCCAATTTGCTATTACTGTATTGAGTATAGCCTGTCCCTGTGCCTTAGGATTGGCCACACCTACAGCTGTCATGGTTGGTACAGGGGTAGGGGCCATCAATGGTATTCTCATCAAGGGAGGAGAACCCTTAGAAACAACACATAAGATCAAGATTATTGTATTTGACAAGACCGGTACTGTTACCCATGGTGTACCTCGAGTAGCTAAGGTGGCTAAGTTTGTTGATGATCGAACATTAGACACAGAGACCCTTGGTAAAGTTAGTGACTTCCAAGCCATCCCTGGATGTGGATTAAAATGTACAGTAACCCAGATAGAACAACTTTTGACAAATCTAGATCTTGAACAAGCCAACAATCGTAAAAATGAAGTGGAAATGGAACTGATGGGTGCATCGGCTCCACAACCTTACCAGGTCTTGATTGGTAACAGAGAATGGATGCAGCGTAATGGCTTACTGGTGACAGAGGTCATGGACAAGAGTATGTCTGAACATGAAGATCTGGGTCACACAGCTGTTTTATGTGCAATTGATGGTGTGTTGATAGCCATGATGGCTGTTGCAGACACAGTAAAATCAGAGGCTCATCTTGCCATCACAACACTGAGAAATATGGGATTACAGGTGGGCATACACAAAGTATTTGCTGAAGTTTTGCCATCACATAAAGTCAAGAAAATAAAACAGTTACAGAGTAGTGGTCAGAAAGTGGCCATGGTTGGAGACGGTGTGAATGATTCTCCTGCCCTGGCCCAGGCTGATGTTGGGATAGCTATAGGAACAGGCACAGATGTAGCTGTGGAAGCTGCAGATATTGTTTTGATAAAGGTATGTTTTAAGGAAGATTGTTTTGATAAAGGTATGTTTAAGAAGCCTAAAAAAGAGAAGTTATTGACACCACACTACTACAAGCAGTATCTAAATGACCAGACAGCTGATATTTCAGTACAGAGAGGAATAGGTTACGAAGGAACCAGTAGAGAGGGAAGTATTCAAGGGAGCATTCTGTCTCGTTTGAGTGGGAAACGTAAACCTCCCTCTGTGGACCATGTAAGTCTTCTAGAGAACAATGATGATGAAGAAGACGATTCTGAACAAAATACACATATTTAGGTTGATACATATGCATTGTGTGTATATTATTCCAATGCTTCTTAGGAATCATGGTGTATTTCATCTTAAGTTTAGACACAAAGAAACTCTCAATGTAATAGATTATCTAATAACAGACTATTGTTTTTATAGTCAATCAATGAGATATTTTATACTATATGGGACCAATATAAATATATTGTACATAAGGTCAGAACTGGACTGAAAGAGTGAATATAATTTTTAGATTTACAGTGCTTTTACATACTTTTTGAGAAAATTATTGTTATCTCCCTTAGATACGGTGTATTTATCTCCCTTTACTAAGCTTACAGTTTTTATACAGACAAAATAATCAACACATTACCAATAACAAAAGAATAGTTATAAATATTTATCCCTGGATGATTTTTTTTTCAGTTATTTAGCTGATTTCAGCTATTTTCCTCTGATAAAAATATTTCGAAAGTTGCTGGACGTGGTCAGAAAAGATAAAAAAAAAAAAAAACAACCTTTTTTTCAGCTTTTTTCATTGATTTTCAGTTATTTTATTTTCTAACCAGAATCATCCATGATATTTACAATGATAAATAATTTTGACACATGCCATATATATACAATCAAACCTGCCCATGCGGTCACCTCTATTAAGCAGTCACCTGTATTAAGAGGTCACCTTTTTAATGTCCTTTCATAGATAATTTCATATGAACTGAACCTCTTTTAAGAGGTCACTTGTCTTATAAGGCCTTTTTTTTTCTTTGTCCCAAAGGTGACCTCTTAATACAGGTTTGACTGTATATGAAATATTTATAACTTAGTTTAAACATATTTGTTCATGGAAGAAACAGACTATACTATAACACAAATATAAAATTACATATTGTATGATGAGGAAACAATTAAGCTAATTATAGCTCGTACTAATCTGTTTCCTAGTTACGACTTTTTTGTTATTGGTATAAAGCTGACATGTCACTGTTGTTATGATATGAAAAAAGATATTTCACCAACACATGCTTTCATTGTTACAATTTTTTGTGTTTTTTTTTTATTATTAAAAGTTAAAGGATATTTTTAATTTATTGATTATTTGTAAATTTTCCCTTTGATCTTTGCATAAGATGATACCGATTATGAAGCAACAAGCATGATACCATCATATTAATGTTAATTTCTATGTGTAATAATGTGATGCTTTATTGAGGTCACTGATGTCATCTAGCTCTGAGAAATCTATTCGCCCAAAAACAGATCAAGGATAGTGTATACAGTCAAATCCTATTAATGTTGATTTCTATGTGTAATAATGTGATGCTTTATTGAGGTCACTGATGTCATCTAGCTCTGAGAAATCTATTTGCCAAAAACAGATCAAGGATAGTGTATACAGTCAAATCCTGCCCATGAGGTCACCTCTATTAAGCAGTCTCCTGTATTAAAAGGTCACCCTTTTCTTTCCTGTCATAGAAAATTGCATTTGAATTGAACCTCTTTTAAGAGGTCACTTGTCTTAAAAGGTCACTTTTTATTTGTTCCAAAGGTGACCTCTTAATACAACTTTGACTGTATAGTATATATCATTTTTGTTAAAAACTAATTTTTTTTTTAACGAAAATCTGGTAGATATTTTACAAATATAGCTGCTTAATTCTTTAAGTATGGTTTTAAGACAATTTCATATTTACATATATGTAAATCAAAATCTTTTAAATAATGTCACAAATTTATTTGTTTAATATTTACATGTGTATGATTAAATAAAAATATTTTACATTGAACAAATCAATGAAATCTAATTGTTACTGTCG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Protein

Gene family

Gene family	Subfamily
-	-

Pfam domain

Pfam accession	Pfam name	Description	Type	Source
PF00403	HMA	Heavy-metal-associated domain	Domain	Interproscan

InterPro

InterPro term	Type	Description	Source
IPR006121	Domain	Heavy metal-associated domain, HMA	Interproscan
IPR006122	Domain	Heavy metal-associated domain, copper ion-binding	Interproscan
IPR017969	Conserved_site	Heavy-metal-associated, conserved site	Interproscan
IPR036163	Homologous_superfamily	Heavy metal-associated domain superfamily	Interproscan

PANTHER

PANTHER term	Description	Source
PTHR43520	ATP7, ISOFORM B	Interproscan

Gene Ontology

GO terms	Category	Description	Source
GO:0005507	Molecular Function	copper ion binding	Interproscan
GO:0016020	Cellular Component	membrane	Interproscan
GO:0043682	Molecular Function	P-type divalent copper transporter activity	Interproscan
GO:0046872	Molecular Function	metal ion binding	Interproscan
GO:0055070	Biological Process	copper ion homeostasis	Interproscan

KEGG pathway

KO	Enzyme	Enzyme ID	pathway	mapID	Source
K17686	copA, ATP7; Cu+-exporting ATPase	EC:3.6.3.54	MAPK signaling pathway - plant	ko04016	PMID: 28812709
K17686	copA, ATP7; Cu+-exporting ATPase	EC:3.6.3.54	Platinum drug resistance	ko01524	PMID: 28812709

Expression pattern

1. Expression trend for Bpl_scaf_36169-2.34 global RNA-seq network