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Detailed information of Bpl_scaf_28864-2.11 in Gigantidas platifrons Gene info

Gene ID	Annotation	Scaffold	Start	End	Strand
Bpl_scaf_28864-2.11	KH DOMAIN CONTAINING RNA BINDING PROTEIN	Bpl_scaf_28864	162562	201246	-

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Bpl_scaf_28864-2.11

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Protein

Gene family

Gene family	Subfamily
-	-

Pfam domain

Pfam accession	Pfam name	Description	Type	Source
PF00013	KH_1	KH domain	Domain	Interproscan
PF00076	RRM_1	RNA recognition motif	Domain	Interproscan

InterPro

InterPro term	Type	Description	Source
IPR000504	Domain	RNA recognition motif domain	Interproscan
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IPR004088	Domain	K Homology domain, type 1	Interproscan
IPR012677	Homologous_superfamily	Nucleotide-binding alpha-beta plait domain superfamily	Interproscan
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PANTHER

PANTHER term	Description	Source
PTHR10288	KH DOMAIN CONTAINING RNA BINDING PROTEIN	Interproscan

Gene Ontology

GO terms	Category	Description	Source
GO:0003676	Molecular Function	nucleic acid binding	Interproscan
GO:0003723	Molecular Function	RNA binding	Interproscan
GO:0003729	Molecular Function	mRNA binding	Interproscan
GO:0003730	Molecular Function	mRNA 3'-UTR binding	Interproscan
GO:0005634	Cellular Component	nucleus	Interproscan
GO:0005737	Cellular Component	cytoplasm	Interproscan
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GO:0007399	Biological Process	nervous system development	Interproscan
GO:0010468	Biological Process	regulation of gene expression	Interproscan

KEGG pathway

KO	Enzyme	Enzyme ID	pathway	mapID	Source
K17391	IGF2BP1; insulin-like growth factor 2 mRNA-binding protein 1	-	MicroRNAs in cancer	ko05206	PMID: 28812709

Expression pattern

1. Expression trend for Bpl_scaf_28864-2.11 global RNA-seq network