Gene detail

Detailed information of Bpl_scaf_22863-0.5 in Gigantidas platifrons Gene info

Gene ID	Annotation	Scaffold	Start	End	Strand
Bpl_scaf_22863-0.5	UBIQUITIN-CONJUGATING ENZYME E2	Bpl_scaf_22863	41494	57256	-

Gene Structure

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CDS

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Bpl_scaf_22863-0.5

ATGGCAAGTGATCAGTCTTCCCTCCTTTTACAGAGGCAGCTTAGAGGTGAGGAGAGTAAAACTAGACCAAATATGTTGAAGAATCCTATCCCAGGATTCTCAGCAGGACTAGTTGATGATGATGACATCTACAAATGGGAAGTAGTCATCTATGGTCCCCCAGACACAAATTTAGAAGGTGGTGTGTTTAAAGCTCATTTAACATTTCCTAGAGAATATCCACAGAAACCTCCAAAAATGCAATTTATTTCAGAGATGTGGCATCCTAACATTGGTCACGATGGATATGTGTGTATATCAATCCTCCATGAGCCTGGTGATGACAAGTGGGGTTATGAGTCAGCATCAGAACGATGGTTACCAGTACATACTGTGGAGACCATTCTAATAAGTGTGATATCAATGTTGGCTGATCCTAATGATGAATCACCTGCTAATGTTGATGCTGCTAAGGAATTTAGAGAAAACAGAGGTGATTTTAACAAGAAAGTAGCAAGATGTGTACGGAAAAGCCAAGATGACTTCTTATAGCACAGGCTGATGTTGTGCTGCATTTATATCAGAAATCATCATCAGGAATCTAACCATTTTGTGGCCTATTAGCATGACAGAAGAAAATTAAAACTTCAAAAGTCAAAACCAGACATTGAGAGAGGATTTAATTCTCAGGACTATTTACTATTACTCACAGATTTACTCATTGTGTAAATAGTCATTATAGAAAATCTGTGATTTTCATTTTCATGTGGACAAGAATGTGGGTTTTTTCTGTTAATTTATAGAAACTGCAAAACTGACAATATTAGAAGCGAGACTTTAATCTTGTACAAATGTACTTATGTAAGTTAGATGGCTTGCTGTAGTAATAATGCGTCTGGACATGCTTGTTTTGGAGCGGTTATTTGTATACCTATTTACTTTATGTCATGTAGTATATATTTTAAAATCTCATATATTTTTGTCATTTTGGACATCTTGTACTCACTTATCTCAGAACATCAAGACTTATGCAATATATAATGGTCTCAGTAATAATATGCATTTTACAGAGCAAAAGGAATGTTTTAAATCTTGTCATTCTTCATAAACTTGCGTAATTTCATGGTTCCTGTAAAATTGGTTGTTCTACTGGTGGTAATCATTTGTTTGTTGGTATAGTATTTATTACCTTTGTTGGTGTTGGTAAGGAGTTGTATTTCAGTCAGTGTCAAAAACTTTTTCAGCTACTAGCCCGAATAGCTAATTTTGAGGTTTTCTTCTATTTGTTTATATAAATTTCAGTAAAATTTCACTAGCCCGAACAAAATTTTACTAGTCTCGGGCATAGGGCTAGTGGCTAAAGGCACAGACTGGTCTTTATGCAACACAATTCATAACAGAAAGTTTATAAAAGAACATGGAAAAAGTCGAGCAAACCCTTACTGTAGGCCATGTTCTTCAAACTCGGGCACTATTTAATTTGTTTTTTTTTGTAAATACAAATGTATTACTATACTGCTTATCCTGTTTAGCTCAGGATCACATGAGCCTATAGTTATAAATTTTACCTCTATTTTACAACGTTTGGAATTTGAAATAATTATGTGTGCTTGAATATTTAGGAAAAAGAATTAAAAAAAATCAATTAATCACCATATTTGGTCGTTTATCAAATATTCATAAATTTAATGAAAATCAGACTAAATATCTGTACCAAAAGATCTTTAATTTTTTGTTTGTGGTGTTTAATGCCACTTTTAGCAATATTTCTTCAGAACCGGTTATCTCTGAAAATCTTAACATGGGCAATAGTTAAATGTTATCTTCTTTTTTTAAATTCTTTCTTATTTATTTTTTTCTGGGGAAAGTAGGAGGAGGGTTAAAGGCATGTATCATTGTGTCACAAAGTTGTAAAAATGTTGATCAAATTTTGTATTTTATTGTATTTTAGATACATTTTGTTATTGTAGCAGGTAGTGTGACATGTAAATCTGTTCAAACATTGTATCAGTACTAAAATGATTCTACTGTAAACACATGTAAATCTGTTGAAACATTGTATCAGTGCTAAAATGATTCTACTGTAAACACATGTAAATCTGTTCAAACATTGTATCAGTACTAAAATGATTCTACTGTAAACACATGTAAATCTGTTCAAACATTGTATCAGTGCTAAAATGATTCTACTGTAAACACAATATCACATTTACTGCAGTCCTCGAAATGAAAATTTGAATTTACTGGTCCAAATCAAATTCTTGAATTTATTTTTAAAACTGATAAATTTACTGGTCTGAACAAATTGGTCTTGGTGCCGGAGGACTCTTGATGACTGCTACTGGACTGTTAAGTCTTTGTACACTATAGGTCTAATTGGTATGTTTTATTTATGCTTGTAATTAATTTAGAAAATTTCTTTATGAAGTAAAAATAGTTTTTACCTATAGTCTGTAAAATATGGGTTATATTTTTCTTGTCAGATACAGAGCAAAAAATTTAACCTATAGATTAGGAAAAGGTACAACAAAATATACTGGAAATTTTCACAATTGATTTTTTTTTGCTTATTTGACAACAATGCATGAAAAATACTCTCATGTGAATTATTTTAGCAACATACTCAATATTTTATATTGAACTTTAACCCTCAGTGAAAATTGTTTATTGTGATCATATTGCTGATAATTATTATGCTGAGTTTATCTTATGTTGTAAATTTCACATATCGAAAGTTGACAACAATGGGGCATTTTGGTTAAAGAATATATTTTCACCATTAAAAGCTGACAAAAATGGGCCTTTGGTTAGAGAATAAATTTTTACAATGGAAAACTGACAACTATTGGACATTTTGGTTAGAGACTAAATTTACACAATGGAAAACTGACAACTATTGGACATTTTGGTTAGAGACTAAATTTTTACAATTTAAAAACTGGACAACTATTGGGACTTTTTGGTTAGAGACTACATTTTCACAATTAAAAGCTGACAACAATGGGACATTTTGGTTAGAGACTGACAGTATCTGTGTAACCAAAATCTTGGTAAAGGTATATAGTTCACAAACATTTCCAAATATTGATGACTGCTCAATTTTAGGACTTAGTTGCTGTTTAGTTTTAATGTAAATCATCACCTCTCTCTGTGAATCAAATGGATTGTCTTGAGAAAAGTTGCATATTTGTACAGTGTACATGTATGCATTGATATTCTAGTCACTATACATTTGTTGGTCCATGTCAGAATGGGTTAACATTAAGCACCTATAAATTAAAATTTGACACAAGTGAATTATCTCCCTTTACCCAAAATTAGTGAAGGGACACATCATGTGTCTTGAATGCAACAAGACTGAATTTTAGCAAATCTAAATATTAAATATTAGTAACATCTTAAATTACCTTACAACAAATTCCATAAAATTTGAGCTTTCCATGTTTTTCATGTCTACAAGTTTTTTCTGAGTTGTGTTTTTTCCCACAAATAGGTAAATGTTTATTTCCAAGAAAATTGTATATTTTTACCAAAAAGCTTTGAAGTGCTGTATAAATTCTTAAGTATTAATTTATGATGCTTTTTCAGTATTATATAGAATAGTGCTATTTATTTTTGCTGGTAATAATACTGATATTGAGGAGAAAAGATATATTTTTACAATTGAATTTGGAGATTTCTGATCTACAGATTAGATTTAATTTTTCTGCTGTGAAAGAATGTCATTGAGTTTGATATGACAAGAGTGTACTACCATTCCTTAATCTGTACAACCCTATGCCATATTTTCTTACCAGTTGTACATGTACTTTTGTATACTGGCAAGTTTTAAGGGAAACATTCAGGGAGTAATTTAACAAAAAGAGTCCTACTGCCATTTTTTTCTTTCAGTTTATAAAATTTTAGTTTCAATTTCACTTTAAAATATGTTTATAGTGTTCTACGGTGACCATCACTTGACAAAATTTCTTTCATGGTCTGTCATATGGGAATGAAATGAAGGAGCAGAATTTTAAATTAGATTATTAAACAAATTGTTTGTGTGATGAAGTAGAGGAGAAATTTACATCTACAATTATTCTAAAAATTACTGCATTATTATTGTCATACTGTACATACATCTATTGAAGTATCATATTTCATGGAATTATTTATGTTTGAAATAAAAAATGCACCAATA

Protein

Gene family

Gene family	Subfamily
Ubiquitin Family	E2\|UBC\|UBC
Ubiquitin Family	UBD\|UBC-like\|UBC
Ubiquitin Family	E2\|UEV\|UEV

Pfam domain

Pfam accession	Pfam name	Description	Type	Source
PF00179	UQ_con	Ubiquitin-conjugating enzyme	Domain	Interproscan

InterPro

InterPro term	Type	Description	Source
IPR000608	Domain	Ubiquitin-conjugating enzyme E2	Interproscan
IPR016135	Homologous_superfamily	Ubiquitin-conjugating enzyme/RWD-like	Interproscan
IPR023313	Active_site	Ubiquitin-conjugating enzyme, active site	Interproscan
IPR050113	Family	Ubiquitin-conjugating enzyme	Interproscan

PANTHER

PANTHER term	Description	Source
PTHR24067	UBIQUITIN-CONJUGATING ENZYME E2	Interproscan

Gene Ontology

GO terms	Category	Description	Source
GO:0000209	Biological Process	protein polyubiquitination	Interproscan
GO:0006511	Biological Process	ubiquitin-dependent protein catabolic process	Interproscan
GO:0061631	Molecular Function	ubiquitin conjugating enzyme activity	Interproscan

KEGG pathway

KO	Enzyme	Enzyme ID	pathway	mapID	Source
K10575	UBE2G1, UBC7; ubiquitin-conjugating enzyme E2 G1	EC:2.3.2.23	Protein processing in endoplasmic reticulum	ko04141	PMID: 28812709
			Ubiquitin mediated proteolysis	ko04120	PMID: 28812709
			Parkinson's disease	ko05012	PMID: 28812709

Expression pattern

1. Expression trend for Bpl_scaf_22863-0.5 global RNA-seq network