Gene detail

Detailed information of Bpl_scaf_2201-4.11 in Gigantidas platifrons Gene info

Gene ID	Annotation	Scaffold	Start	End	Strand
Bpl_scaf_2201-4.11	GLYCOSYLPHOSPHATIDYLINOSITOL PHOSPHOLIPASE D	Bpl_scaf_2201	371489	414822	-

Gene Structure

More details in Jbrowse Sequence

CDS

Bpl_scaf_2201-4.11

ATGCTCTATTTCACAGGGGGTGAATTTATTAGTGCAGTCGACTTGGACGCTGATTTAGTCGTAGATCTTAATAAATGGTATATTCCGACACATGACTTGTTTAATATATACCAGGAATTATATGGAGCAACTAAAATAAGTCAGACTGTCATAGATGTATGTTCTATATTTTTAGCTATAGAAAGTTTTGGGGTTATGATTTCTAAAGATGAGGTTTATCCCGGTATTGTTGACAGAAGTCCATTTCTTGTCGAAGAAATGGAAAATTATTTCCTTGGTGGAATAAATGACATGGTAGGATGGACACAGAGAAGTTGGAATAATGTTGTAACAATGTTAGAAAAAGGAACTGGGTCTTGTAACTTGGAATATAACCCAGTATTTGTCACCTGTAATAAAACTACAAAAATGAACCATGCCAAGGATGACAAGGTCAAGAATGGACATTATATAAAATATAACAAACATGGCTTGACTGAGAAAGATTTTGATGTGACAAGAACATCTAGAGGAATCAACATTCAACCTGGAAAAAACTTACAGAAACGCCTACAGAAAAATAAAGACCGAATTAATCTGAAGGAAAAACCCTTCATGGACAAGAAAACTGATGCTAAAAATGATATATCGTCAGCAAAAATCATGGTCAGCGGATCATATTCTAGATTTGGTTGGTCAATTTCTTCAGGTGATATTGATCATGATGGAAATAAAGATATTATTGTGGGTTCCCCTGGTTACAGTCATATAAACAACTGGCAGAGAGGAAGAGTGTATATTATTTATGGAAGTGAATCAAAGTCTGGTTTATATGGGTCGGCAGACATTAATTTGGATGATCAGGATTTGTTGAATACAACATTTATAGATGGACCAGATCAGATGCAGTCGAGATTTGGATCAAGCGTGACTGTACTGGATGTTAATGTAGATGGTGTTGATGATATTCTGGTTGGAAGTCCAGCATTTTGGAACAAAAGCCCTTTAGATTATAATGGTCTTGTATCAATATATTTTGGACAAAAAATGGTCAGAAAGAAGTTTAGTAAACCAGATATCATTATAACCTGTAAGATAAAATATTGCAATTTGGGTCGCACGTTGGCAAGTGCAGATGTTAGAAACAATGGACTTCTTGACCTATTAATTGGTGCACCATTTTACAATGAACAGAGCGGAATTGTGACCTCATTTCCTTCAAGTAAAAACAACAAAGCAAACCAAACCTATGAATTTGAGAATCTGATTCAGAAATGGAAATTGATGCCAGACAAAGACCAACCCTATGCATGGTTTGGACATAACATCAAGGGATTAGATACAGTAGTGATTGTCAATTCTCCTAATTACAGGAAATGTTACCATTTAAATTGTTCATATTCGGAATATGATATACAGTGTGTTGGTCAGTCACATCTATTCAGTTATTGGCCACAATTGTCTAACTTTTCAATAATGGGAACATTTGAGTACCAGTCGGCTGGCTACGATATGGACTTTGGATTTCCCTATGACACCAAGTCTTGGAACTCGTTAATGATCGCTTATAGTATTCCTGGAAATAACGTAATCGGTAGACTGAATGGCGAGGAAGACAAAATATATAGAGCTGGAAGTGTAATATTGGTTAATTATACAGATAATATGTCCCATGTAATGGCACGGTTCGATGGGAATCGGAAATATGCAAGATTTGGACATGCTATAAGGTTTCCTGACTTAAATTATGATGGGATTGCCGATTTGGTCATCACTGAACCAAGCAGAATAAAAGACAGATCAGAACTGCAACAAAATAAAAATGGTAGAATATACATATTTTATGGTGGAAATCAGATGCCAAAAGGAAATGCAACATTTTCTCATCTGTGTGATCAGGAACAACCATGTCCATCAAATATTGCAAATTATACATCTAATTCATATGAAGAACAGAGTAATAATGGATTTTTAATTCACACTGTATCAACTAAAAAAGGGGCAATACTATTATCATCAGATGTAACATCAGATGCAGGATTTTATACTAAAGGAGCTGGAAGACGATCTGGTGTTGTATGGAGTTATTATTTTAAAATCTAA

Transcript

Bpl_scaf_2201-4.11

TTTTCTGTTCTTCTTTTAGACTCGCCGAACCATTATAACCATGTGATGAAGATATTGTAAGATCATCAGTGTTATATTGCCATTGGTCGAGTGCAATCATCATTCCTAGTAAAGTAGTGGGAAAAAAGCAGATCCAGGAAAATCATAGATTTGGAAAAATATAGATATTATCACCATGGTTACCACTGTATTGTGTATTGTTTACTTATATTGGTTGTCATCAGCGGATGGATGTGGTGTACTTACTCACATGTTAATAAGCGGAAGAGCTACAGAATATTATAATGTCAGTGACAAATACACTAATTATAGACAGCTGTTTGACAATCACAGAGATGCTTTACAAGGAGGAAGTGCATATCCTGATTCTTTTTATGACAGCCTTTGTTTTGGTGGAAAATATCACAATGTTTCAGAAGACACACATTGGACACCTTTTATAAATGCATCTGTGAATTATATCAGGAAAACTTATCCACATCCTTGGAACCAGGAAACAGAAAAGTTGGTTGTGTTCCTGTTTGGTGTAATGTCACATCAAACTGCTGATATATTATGGCACAGTCTTGGTATCGATCAAGGATTTTTATCTACAATGGCTAAGGTTTGAATATTTCTTCAGTAATATAAATAAAAAAAATGCTCTATTTCACAGGGGGTGAATTTATTAGTGCAGTCGACTTGGACGCTGATTTAGTCGTAGATCTTAATAAATGGTATATTCCGACACATGACTTGTTTAATATATACCAGGAATTATATGGAGCAACTAAAATAAGTCAGACTGTCATAGATGTATGTTCTATATTTTTAGCTATAGAAAGTTTTGGGGTTATGATTTCTAAAGATGAGGTTTATCCCGGTATTGTTGACAGAAGTCCATTTCTTGTCGAAGAAATGGAAAATTATTTCCTTGGTGGAATAAATGACATGGTAGGATGGACACAGAGAAGTTGGAATAATGTTGTAACAATGTTAGAAAAAGGAACTGGGTCTTGTAACTTGGAATATAACCCAGTATTTGTCACCTGTAATAAAACTACAAAAATGAACCATGCCAAGGATGACAAGGTCAAGAATGGACATTATATAAAATATAACAAACATGGCTTGACTGAGAAAGATTTTGATGTGACAAGAACATCTAGAGGAATCAACATTCAACCTGGAAAAAACTTACAGAAACGCCTACAGAAAAATAAAGACCGAATTAATCTGAAGGAAAAACCCTTCATGGACAAGAAAACTGATGCTAAAAATGATATATCGTCAGCAAAAATCATGGTCAGCGGATCATATTCTAGATTTGGTTGGTCAATTTCTTCAGGTGATATTGATCATGATGGAAATAAAGATATTATTGTGGGTTCCCCTGGTTACAGTCATATAAACAACTGGCAGAGAGGAAGAGTGTATATTATTTATGGAAGTGAATCAAAGTCTGGTTTATATGGGTCGGCAGACATTAATTTGGATGATCAGGATTTGTTGAATACAACATTTATAGATGGACCAGATCAGATGCAGTCGAGATTTGGATCAAGCGTGACTGTACTGGATGTTAATGTAGATGGTGTTGATGATATTCTGGTTGGAAGTCCAGCATTTTGGAACAAAAGCCCTTTAGATTATAATGGTCTTGTATCAATATATTTTGGACAAAAAATGGTCAGAAAGAAGTTTAGTAAACCAGATATCATTATAACCTGTAAGATAAAATATTGCAATTTGGGTCGCACGTTGGCAAGTGCAGATGTTAGAAACAATGGACTTCTTGACCTATTAATTGGTGCACCATTTTACAATGAACAGAGCGGAATTGTGACCTCATTTCCTTCAAGTAAAAACAACAAAGCAAACCAAACCTATGAATTTGAGAATCTGATTCAGAAATGGAAATTGATGCCAGACAAAGACCAACCCTATGCATGGTTTGGACATAACATCAAGGGATTAGATACAGTAGTGATTGTCAATTCTCCTAATTACAGGAAATGTTACCATTTAAATTGTTCATATTCGGAATATGATATACAGTGTGTTGGTCAGTCACATCTATTCAGTTATTGGCCACAATTGTCTAACTTTTCAATAATGGGAACATTTGAGTACCAGTCGGCTGGCTACGATATGGACTTTGGATTTCCCTATGACACCAAGTCTTGGAACTCGTTAATGATCGCTTATAGTATTCCTGGAAATAACGTAATCGGTAGACTGAATGGCGAGGAAGACAAAATATATAGAGCTGGAAGTGTAATATTGGTTAATTATACAGATAATATGTCCCATGTAATGGCACGGTTCGATGGGAATCGGAAATATGCAAGATTTGGACATGCTATAAGGTTTCCTGACTTAAATTATGATGGGATTGCCGATTTGGTCATCACTGAACCAAGCAGAATAAAAGACAGATCAGAACTGCAACAAAATAAAAATGGTAGAATATACATATTTTATGGTGGAAATCAGATGCCAAAAGGAAATGCAACATTTTCTCATCTGTGTGATCAGGAACAACCATGTCCATCAAATATTGCAAATTATACATCTAATTCATATGAAGAACAGAGTAATAATGGATTTTTAATTCACACTGTATCAACTAAAAAAGGGGCAATACTATTATCATCAGATGTAACATCAGATGCAGGATTTTATACTAAAGGAGCTGGAAGACGATCTGGTGTTGTATGGAGTTATTATTTTAAAATCTAAGATCTGATATTGAAATATCAAAACATCTTGATCTCAAAGTTGTAATGTATTGAAAGTATGTTGGTTTTGTTATGATGTAGGAGAGTGGTGTTGTTAAGATCAAAGCAAATTTATTGTTTTGACATACTTGTGCAATCATTAAAAAATTGTCATAAGATGATTTCCATCATCCATATCTTCTTATTATGGTAACTAACCTGACCCAAAGAGTTATTTGAGGAATTGTCATCACCTTGGTGTCTGTCATCATCATCAGCTGTAAAGTTTTACATTTCAATTTATTTTTCTTTGAAACCACTGGGCCAATTGAAACCAAACTTGGTAGGAATGCATATTAGATTGTTCTCTACAAGACATGTTTTTTGTTCCGATTAAAAATCCACTACAGAAGCAAGAGGACCCTAGGTGTTTTTGTTTTTGTTTTTTTGTTTTTTGTATTTGGAGCATTTATTTTTCAACTACTATTTTTTTCTTCATATACCGGTATATATTAAAAATTTCTCTTTATGTATTATTCCAACAAGGTTTGTATGACTGTTACCATTTTTGAATTTTATGGTTTGCTTGTCAAAGGGAGCCAAAAGGGATCAATGCCCAAAGTAATAATCTTTTTTTCATATGAAGTCACTGTCATGATTTGTATGCAGGTTTTCTGTTGAATTCCACAAAAAAAATTCCTGTCAGGAGTTGTTAAACAGATTTGCTGTAACTTATACAATTTCTGAGATATGAGGTGGCCAAAGGGGGCCAATGCCCAAATTTAGTTATTTTTAAGTCTGAATTTAATTAGGATTGTTTTCTCTAAATTCCTTATGAAATTCCTTCCTGCATTTATCAAACAGACTCTGTGAACTAGTGATGACATTTGCTGGATAATAATCACATTAAAACTGGTGTGTAGCCTTTTATTATTAATTATGTTATCTATTTTATGTATTTTGTTTTATTTTTACCGCATAGTTCTCTTATTAATAGTTCACTGGTGCAGAATTAAGTCATTGTTGACAAACAGTGGTTGCATCATGCTGCACCCTTCAGAGTCTTTTATTATTTATTATATTATACTTTGTCTTGGGCCAATATGGGCATCTCAGGATGATAACCAGGCCAATATGGAAATGCCCATGTATTAATCTGTATATATTGTTTAAAATAGAAAAACAAACTTTATTTTTTATTTTTATTTTATTTTTATACATATGATATTTATATTGTTCATTAAGCTGAATGAGCTTTATATATATTAATTTGCAATTACTTAAATAATGAATTGTTTTTGCATTAAATATTTTTATTGTTCACTATCATTAGCTTGGGACACAGTTTAGTGATAGAAGGTTTGTGTAAGCCTTCTAGTATTAAAACTACCAGTCTTCATGGAGTGGGGGATAGGGCAGGAGAAAATCTGAACAGATACAGTGAACTGAACGATGAAACCCTGGGTCATGTCTAAAAACCTTAACACTTGAGATGGGTATTAGGGGGTGAGAATCAAAGACAGTGGTGTTATGCCACCCACCTCACTATCTATATAATAATGTTGTGTAGTATTTGAAAATGGTAGCCAGGGTGGAAGACATAGTGCATGACCTGAAGGGTACTATTAAGAAATACTAACAGAATTAAATTTTCAAATTATTCAAGGGTAGATAATATATACTTCATGTATTTTCAATATTGTCATTTCACATTGTCATACTATGTCTCAGTGTCAGACATTGAAATGATTCAAGCATTTTGGTGATTGTATGCTATTGCCTATAGTAACCTATCCTATTGCAATGCTATGCCTCAATACTTATTGCACAATTAAATTACTGTAGAAAATTACAGGAAGCATAATAATATAGATTTTATTTTTTTGTGCATTTGCATTTTTATACGCCCGTCTCGTGATTATGTGATTATTGGATTATGTGATTGGGTATGGCGGGCGGCGGGCGGGCGTTCACACAGGTTTCCGCACAATAACTTTAGTTCTGTATATTGAATCTTTACCAAACTTGGTCACATGATTCCCCTGTGGAAGGGGAAGAACCGTATTTATTTTGGAGTTATTAGGTCAAAGGTCAAGATCACCGTTACTATAAATATAATTTTTGACAACAGGGTCGTTTCCGCACGATAAATTTAGTTCTGTATACTGGATCTTTACCAAACTTGGTCACATAATTCCCCTGTGGAAGGGGATGAACCCTATTTATTTTGGGGTCATTAGGTCAAAGGTCAAGGTCACCATTACTATAAATAGAATTGTTGACAACAGGGTCGTTTCCGCACGATAACTTTAGTTCTGTATATTGGATCTTTAACAATCTTGGCCACATGATTCCTCTG

Protein

Gene family

Gene family	Subfamily
-	-

Pfam domain

Pfam accession	Pfam name	Description	Type	Source
PF01839	FG-GAP	FG-GAP repeat	Repeat	Interproscan

InterPro

InterPro term	Type	Description	Source
IPR000413	Family	Integrin alpha chain	Interproscan
IPR013517	Repeat	FG-GAP repeat	Interproscan
IPR013519	Repeat	Integrin alpha beta-propellor	Interproscan
IPR028994	Homologous_superfamily	Integrin alpha, N-terminal	Interproscan

PANTHER

PANTHER term	Description	Source
PTHR23221	GLYCOSYLPHOSPHATIDYLINOSITOL PHOSPHOLIPASE D	Interproscan

Gene Ontology

GO terms	Category	Description	Source
GO:0004621	Molecular Function	glycosylphosphatidylinositol phospholipase D activity	Interproscan
GO:0005615	Cellular Component	extracellular space	Interproscan
GO:0006507	Biological Process	obsolete GPI anchor release	Interproscan
GO:0007155	Biological Process	cell adhesion	Interproscan
GO:0008305	Cellular Component	integrin complex	Interproscan
GO:0031012	Cellular Component	extracellular matrix	Interproscan

KEGG pathway

KO	Enzyme	Enzyme ID	pathway	mapID	Source
K01127	E3.1.4.50; glycosylphosphatidylinositol phospholipase D	EC:3.1.4.50	Glycosylphosphatidylinositol(GPI)-anchor biosynthesis	ko00563	PMID: 28812709

Expression pattern

1. Expression trend for Bpl_scaf_2201-4.11 global RNA-seq network