Gene detail

Detailed information of Bpl_scaf_21348-0.16 in Gigantidas platifrons Gene info

Gene ID	Annotation	Scaffold	Start	End	Strand
Bpl_scaf_21348-0.16	IGGFC_BINDING DOMAIN-CONTAINING PROTEIN	Bpl_scaf_21348	19574	45106	+

Gene Structure

More details in Jbrowse Sequence

CDS

Bpl_scaf_21348-0.16

ATGACTTGTGACATAGTTTTTGTTTTCCTTTTGTTACCTATATTTTTGGGTAACGTAATGGCACAACCAAAGATAGTTCGTTCATTTGGAGATTGTGGAAAAACATTGACAGCAGCAACTGGAACCGTTGCAACTCCTACGGTTTTTAATTCAAACCTGGATGATGTTTGTACATTTTTGTTTACCAGACCAAAGACAGAGCGCATATATATTGGACCTTTTGAAATGAACAGAATGGACTGTTGCTTTGAAATTAAGGTATACGCTGGTATGACAAACACAAGTAGCCTGGTAATGACGTTTACCAGAAAGAATGGAAATGACATTGCACCACAATCCGTACCTACTAATACAAATACAGTGCTTGTTACATTTAGAAGATTGAAGGAGCGTTTTGAAAGTCCACCAGTTCTAATTTATTATTATAGCAGAGGGCCACCTGATAACAAGGGAAGCAGATTTGCTATCGCTGATGGAGATTTGTTTTTCGTATCAACACTTAAGTCTCAAGATGTGAATGTTCACGTACGTTGTCCAGATATTCCAATTAAAAGCTTCAGCGTATCGGTGGGACAAACCTATGTTTTACAAAATATGTCACCAATGAGCATGATAAAAGGTCAAAAATATCTTGATTATAGCGGTATAAGCCTAGAAGCAGACGACGACATCGTCATATATGGAGCCAGAAATAATTTCAAATCAATTCCTTTTATTACAATGCCTTCGGATGTTTTGGGAACAGAATATAGGGTGATTTCTGTGGATCAAGATATTGAACGTATTTTGATAATCGGAACAGAAGATATTGTTTTAGTTAATTTAACCTTTCCAGAGTGTAAAGGGAACTGCTCTACTTTCCCTGATTGTGCACAGTCAAACCTAAATTTTACATTAATGCCCTGTCAACGTGTAGTATTTTCATGTCCAACCAATTTAACGGGAATTATGATTACCAGTAGTTCAGCGATTTCTGTGATGATCGAATCAACTACACAAGTGATACAACTACCACCGGTAAACACTTGGGGAAAGATCTTTATATTAACAGCAATGCCTGGAAAATTAAAAGTTATTGCAATGAATCCTAAAACAAACATGTCTATAGAGTGTTACAAGACAGCCAATAACGCTGTTGAAATAACACTTTCAATATTTTTACAAGATGGCGGCGATTATGATGTTGTCACAATACCAACAGCCACAAATTGCTGGATATCCTCAAACAAACCAATTTTACCACTCCATCTTATCAGAACCAAATCCACACAACAAGAATCAGCCTTGATTATCACCCCTGTTGAACAATATTCAACTGACTACATTTTACCAGCAGAGTACTGCGATTCTTCAATGTATGTTAGCCTTCTTATACTAGTGATCAAGACAAATGCCTTAGATGGATTAAGAATGAATGGCGTTCGCTTACCAGCAGAATCAGAGCATCAAACGATTGGGATGACGGGATACAGCAACGTATATATCAATATAACATCTTCATACATACAAAATATTGTACGTCATGTCGAACCAAATGTTGTTTTTGGAGCCTTCCAATTCTGTGTTTCGAATGTCAGTGTACATGCAATGCCACTAGGAATGAGAATGGCACCAATAGCAGAGGAATGTGAGCCATCTGTTTCCATCCCTGGGGATGGTGTTGACAATAACTGTGATGGTAGTATTGATGAGGGCACTTGTAATCAACAGTCAGATTTATTGAATACAAAGAATGACTGTGCTACGAACACACCTGAAATCGTACCATGCGTAGGCTACACAGATTCTAAAGGGTATAAATGGCAGACAACGTCACCAAACAAAGAGATATACCAGCCTTGTCTAAAAATTGACACAGGTATTGTCTCAAACTTTTGTGAACTTAGAGATGGAATAAATGGTGTATGGAGAGGACCTGATACCTCTTTGTGTATCAATGAAGGGCTCAGTCTTATTTATCTGAAGTTAAATTTAACATTGAACGGAACATTCGAAGAGGCATTAGAGGACATCTTGAATGAAACGCTGGTAACGACCAATCGTCTGCTTGATAATGATGACTTCAGTGCTGGTAGTTTAAGATCCCTGGTCAATAGTCTGGATACGGTAACCGATATTTTTGAAAAGAGAGCTACAGGGATAAATGCTCCTGAAAGAGAGAACTTTATATCACTTGTTGATAGAGCACTATCCACTAGAACGTCACCAACATGGAGTATGTTACATAGCAAGGTCAACACAAGTAATCACGCAGCATTTATGATGAACGTGGTAACTAGATTCGGGCGTCAGTTGTTGGATAACCAAACAGAAAAAGGTGTTATCTATGTCAGGGAAAATATAGTTTTAGAAGCTAGACAAGCAGGCATCGATGATGTCATTTTCCCTAATGATACGGCCATTACAGACATTAATTTAGTAAAGAACACAACATTCAACGCTCATCTATTCTTGAGTAAGGATACCATCAAGAATAATCTTGCAGGAAGTGTTGACTATACAGCGACCTACTACAAAACTTTAGATCAACTTTTACCAAGTCTTAATAGTGGAAATTTAGGTTCTGACATCGTGGCATTTTCGCTGCCAAAAAATATAGCTGCAGACAATCTATATCCTCCAGTTCAACTTAGGTTTGATCTTATGAAAACAAATCGAACGAATGCAACATGTTGTTTCTGGGATTTTGATTTACCTCTTGGTGGCGGATGGTCAACGGAAGGATGTTATGCTGAATATACGAATTCAACATATCTATCATGTCGATGTAACCATTTGACCAATTTTGCTGTTCTTATGAGTGCATCCACATTTGTAAGTGTAAATACGTAA

Transcript

Bpl_scaf_21348-0.16

GTTTAATGTTGTGTCAGTGTGTTTGTCTAAAATGACTTGTGACATAGTTTTTGTTTTCCTTTTGTTACCTATATTTTTGGGTAACGTAATGGCACAACCAAAGATAGTTCGTTCATTTGGAGATTGTGGAAAAACATTGACAGCAGCAACTGGAACCGTTGCAACTCCTACGGTTTTTAATTCAAACCTGGATGATGTTTGTACATTTTTGTTTACCAGACCAAAGACAGAGCGCATATATATTGGACCTTTTGAAATGAACAGAATGGACTGTTGCTTTGAAATTAAGGTATACGCTGGTATGACAAACACAAGTAGCCTGGTAATGACGTTTACCAGAAAGAATGGAAATGACATTGCACCACAATCCGTACCTACTAATACAAATACAGTGCTTGTTACATTTAGAAGATTGAAGGAGCGTTTTGAAAGTCCACCAGTTCTAATTTATTATTATAGCAGAGGGCCACCTGATAACAAGGGAAGCAGATTTGCTATCGCTGATGGAGATTTGTTTTTCGTATCAACACTTAAGTCTCAAGATGTGAATGTTCACGTACGTTGTCCAGATATTCCAATTAAAAGCTTCAGCGTATCGGTGGGACAAACCTATGTTTTACAAAATATGTCACCAATGAGCATGATAAAAGGTCAAAAATATCTTGATTATAGCGGTATAAGCCTAGAAGCAGACGACGACATCGTCATATATGGAGCCAGAAATAATTTCAAATCAATTCCTTTTATTACAATGCCTTCGGATGTTTTGGGAACAGAATATAGGGTGATTTCTGTGGATCAAGATATTGAACGTATTTTGATAATCGGAACAGAAGATATTGTTTTAGTTAATTTAACCTTTCCAGAGTGTAAAGGGAACTGCTCTACTTTCCCTGATTGTGCACAGTCAAACCTAAATTTTACATTAATGCCCTGTCAACGTGTAGTATTTTCATGTCCAACCAATTTAACGGGAATTATGATTACCAGTAGTTCAGCGATTTCTGTGATGATCGAATCAACTACACAAGTGATACAACTACCACCGGTAAACACTTGGGGAAAGATCTTTATATTAACAGCAATGCCTGGAAAATTAAAAGTTATTGCAATGAATCCTAAAACAAACATGTCTATAGAGTGTTACAAGACAGCCAATAACGCTGTTGAAATAACACTTTCAATATTTTTACAAGATGGCGGCGATTATGATGTTGTCACAATACCAACAGCCACAAATTGCTGGATATCCTCAAACAAACCAATTTTACCACTCCATCTTATCAGAACCAAATCCACACAACAAGAATCAGCCTTGATTATCACCCCTGTTGAACAATATTCAACTGACTACATTTTACCAGCAGAGTACTGCGATTCTTCAATGTATGTTAGCCTTCTTATACTAGTGATCAAGACAAATGCCTTAGATGGATTAAGAATGAATGGCGTTCGCTTACCAGCAGAATCAGAGCATCAAACGATTGGGATGACGGGATACAGCAACGTATATATCAATATAACATCTTCATACATACAAAATATTGTACGTCATGTCGAACCAAATGTTGTTTTTGGAGCCTTCCAATTCTGTGTTTCGAATGTCAGTGTACATGCAATGCCACTAGGAATGAGAATGGCACCAATAGCAGAGGAATGTGAGCCATCTGTTTCCATCCCTGGGGATGGTGTTGACAATAACTGTGATGGTAGTATTGATGAGGGCACTTGTAATCAACAGTCAGATTTATTGAATACAAAGAATGACTGTGCTACGAACACACCTGAAATCGTACCATGCGTAGGCTACACAGATTCTAAAGGGTATAAATGGCAGACAACGTCACCAAACAAAGAGATATACCAGCCTTGTCTAAAAATTGACACAGGTATTGTCTCAAACTTTTGTGAACTTAGAGATGGAATAAATGGTGTATGGAGAGGACCTGATACCTCTTTGTGTATCAATGAAGGGCTCAGTCTTATTTATCTGAAGTTAAATTTAACATTGAACGGAACATTCGAAGAGGCATTAGAGGACATCTTGAATGAAACGCTGGTAACGACCAATCGTCTGCTTGATAATGATGACTTCAGTGCTGGTAGTTTAAGATCCCTGGTCAATAGTCTGGATACGGTAACCGATATTTTTGAAAAGAGAGCTACAGGGATAAATGCTCCTGAAAGAGAGAACTTTATATCACTTGTTGATAGAGCACTATCCACTAGAACGTCACCAACATGGAGTATGTTACATAGCAAGGTCAACACAAGTAATCACGCAGCATTTATGATGAACGTGGTAACTAGATTCGGGCGTCAGTTGTTGGATAACCAAACAGAAAAAGGTGTTATCTATGTCAGGGAAAATATAGTTTTAGAAGCTAGACAAGCAGGCATCGATGATGTCATTTTCCCTAATGATACGGCCATTACAGACATTAATTTAGTAAAGAACACAACATTCAACGCTCATCTATTCTTGAGTAAGGATACCATCAAGAATAATCTTGCAGGAAGTGTTGACTATACAGCGACCTACTACAAAACTTTAGATCAACTTTTACCAAGTCTTAATAGTGGAAATTTAGGTTCTGACATCGTGGCATTTTCGCTGCCAAAAAATATAGCTGCAGACAATCTATATCCTCCAGTTCAACTTAGGTTTGATCTTATGAAAACAAATCGAACGAATGCAACATGTTGTTTCTGGGATTTTGATTTACCTCTTGGTGGCGGATGGTCAACGGAAGGATGTTATGCTGAATATACGAATTCAACATATCTATCATGTCGATGTAACCATTTGACCAATTTTGCTGTTCTTATGAGTGCATCCACATTTGTAAGTGTAAATACGTAATAAAAACAAAAGCAGAAAACTGATTAAATTCTTAAAAAAAAAAAGAAAAAAAAAGAACGTTAAACTATCCAATTGTAAGACAGACGAAAACATAGCGAAATGAGCTTTCCGGTTCAAAGTAACATATCATGACAAGGCGACAGATAATCTGTCACTTAGCAGTAAATAAAAGTTAGAGAATATCGAAGGAGCAATCAGAAATGGACAATCCAGAGAAACTGGCAACTTGGGATACACAAGACGAAGTAAAATCGTTAAATCGCCTCTCTTTATGATAATGATAGCTGCAGAGTGCCCAAGTCCGCAGAGTGTTTGTATAAAGATCCGAATACAAATACAAAGAAAAACATAATTAAACAACCAAAGAACAGACAGTTAGAAATCTCTCATCAGCCGGAATTCAGATAAATGCACCGGAAATCATAACATCCATTCCCATATAACACCTAAAATGATCGAATCTGTATAATATGATAATAGGTGTTACCTAGCTTGGGACGAAGTCCAATAATTTTCTTAAACAATATATCGGGGACCAAACTCTG

Protein

Gene family

Gene family	Subfamily
-	-

Pfam domain

Pfam accession	Pfam name	Description	Type	Source
PF01825	GPS	GPCR proteolysis site, GPS, motif	Motif	Interproscan
PF17517	IgGFc_binding	IgGFc binding protein	Family	Interproscan

InterPro

InterPro term	Type	Description	Source
IPR000203	Conserved_site	GPS motif	Interproscan
IPR001879	Domain	GPCR, family 2, extracellular hormone receptor domain	Interproscan
IPR035234	Domain	IgGFc-binding protein, N-terminal	Interproscan
IPR035914	Homologous_superfamily	Spermadhesin, CUB domain superfamily	Interproscan
IPR036445	Homologous_superfamily	GPCR family 2, extracellular hormone receptor domain superfamily	Interproscan
IPR046338	Homologous_superfamily	GAIN domain superfamily	Interproscan

PANTHER

PANTHER term	Description	Source
PTHR46534	IGGFC_BINDING DOMAIN-CONTAINING PROTEIN	Interproscan

Gene Ontology

GO terms	Category	Description	Source
GO:0004930	Molecular Function	G protein-coupled receptor activity	Interproscan
GO:0016020	Cellular Component	membrane	Interproscan

KEGG pathway

KO	Enzyme	Enzyme ID	pathway	mapID	Source
-	-	-	-	-	-

Expression pattern

1. Expression trend for Bpl_scaf_21348-0.16 global RNA-seq network