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Detailed information of Bpl_scaf_1363-7.3 in Gigantidas platifrons Gene info

Gene ID	Annotation	Scaffold	Start	End	Strand
Bpl_scaf_1363-7.3	RAS GTPASE-ACTIVATING PROTEINS	Bpl_scaf_1363	673471	695974	-

Gene Structure

More details in Jbrowse Sequence

CDS

Bpl_scaf_1363-7.3

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Transcript

Bpl_scaf_1363-7.3

ACAGGTATTTCTGTGAGATATGTTTAGACAAGACACTGTATGCCAGAACATCAAGTAAAACAAAAGCTGACATGTTGTTCTGGGGAGAGCATTTTGAATTCAATAACTTGAGGGATACATTTTATGTGACAGTTAACTTATTCAGAGAGGCTGATAAAAAGAAGAAAAAAGACAAAAATGTGTTGATAGGTTACATCAAGATACCAACATCAGAAATCACAGGACGAACGTTTGTAGAAAAATGGTTCAATTCCACGTCTGGAACTGTGGGTCGAGTTGGGAAAGAAAATAAAAGTGAAAATCCATTGATACGGATCAAAGCTAGATATCATACAGTAGATATATTACCTGTTGAAATGTACCAAGACTTTTCTAATTACCTGACAACAGACTATTGTAAACTGTGTGATGTTTTAGAACCAGTTGTCAGTGTTAAAGACAAAGAAGACATCGCTACATGTTTAGTCCATATTATGCAAAAGTTAAACAAAGCTAAAGACTTTCTAACAGATATTATAATGGCCGAAGTCTCTCAACTTGATAATAACCATCTCACATTTAGAGGAAATTCTATTGGTACCAAAGCAATGGAAGCCTACATGAAACTTGTTGGTGAAAAGTATTTACAAGATACACTGACAGAGTTTGTCAAGACTTTGATAGACTCTGGTGATGATTGTGAGGTTGATCCTACTAAAGTTCCTCCTCAGTTTCTACAGAACCATAAAGGACTACTGGATATGTACAGTGAAATGGTCTTTGCCAAAATTATTAACTCTCACTGCTATTTCCCAAGTGAATTAAGAGATGTTTTTACAAGTTTTAGATCTTGTTGTTGTGATCTGGAGAGAGAAAATGTAGCAGAGAATTTGATAAGTGCCTCAATATTCCTACGTTTCCTGTGTCCATCGATCATGTCTCCTAGTCTCTTTAATTTAATACAAGAATACCCTCCAGACAAGGCTGCCAGGAATTTAGTACTACTCGCCAAGACAATCCAAACCCTAGCCAATTTTACTAAGTTTGGTGCTAAAGAAGAATACATGACTTTTATGAATGATTTCATTGAACGTCATAGAGAAAGTATGAATGATTTCCTCCGACAAATATCTACAACAGATACAAGTGGAGGGAACCAGTTTCTTGAGTTTGATGGTTATATAGATCTGGGTAAAGAAATGTCTGTATTACACAGTTTATTGTCAGAATCTTTAGAGAAATGTAATCAGGAGTCTTTATCCAGACTGGGAAAACTGCCAGATATTTTGAGTACTGTGAAAACTGCCTTAGAAAATCCAGATGTCGGAATGACAATCCCGTCACCAAAACAAAATAGGAAGTCCCAAATTTACGACAATCTAGTCAACATGCCTCCCCAAACCAGCCAAACCTCGCCCACAGAACTCCTCAGGGAAATGCTAAGACATTGTGGTGAGGATGATATACCTGTGTTAAGTGGAAGGCGTGGATCAAATACAGGTGTGTTCGATTCCGAAAATAATATTGAAGAAGATGATTTTGGATTTTATAAAAGTTCTAGATCACATTTTGATGTGTCAGACGTTTCAGTGAAAAGTGTAAATAATGAGCAAAAAGTGAACGAATCGTGGAATGAAATTGTCAACGTGGCAAAAAATCACCATGGAGATTATATTGACCTTCTGTCTTTCGCTGACGAGGACGTACATAACTCATCAATGGACTCTGACCATAATATGAATGGAAGTCAAATATCAATTAGTCAGTTATCGACGATAGCGTCCTCGGGATATCAGTCTTTCGGATATAGTCAGTCCAGTTCACCTATTGATCCTAATACACAGGATTTGTCCAAATCTCATTCATCTCACGCTCCCCTCCAGCCATTATCATTCTCAAATCCAGTCTATAGACATCAATTTAACAGTACAAAAAATTCAGTTTCTAGTCCAAATGTGTTGCCTACTCAGCAGGGATCCAGCTCAGGATCCGTAAGTAGTGAAGAGGATACGGTGAAACACAGAAGTCCGTTGAAATCCTCAGAAAGAGACTTGTACGGATCTAGTCGCAATGATCCGCTACGTAATCTTGCCCCAAAACTTTCTAGTTCAAGTAGTAGTGAATCTCTGGAACAAGAACAATTTCGAATGACTCGTTCAAGTTCGTCAATGTCAACAAATGAATCTACCAAATTTACTCGTTCAAATTCAGTTCAGTCAGCACATGAACAAGTTAAATTTTCTTTGGATTTGCATTCGTCTGTTTCTTCTCAAAACAGTGACGATTTACGAAATAGCAATGTTACATCATCTAATTTTACCAGTAATCATTACTCGTTAAGCCGTGCACCCTCACGACCGAAGGAACTTTCACATACAGGCAGTATGGACTTTTCTCACATGAGACAGCGATATAATGATCCTATTAGACGCACGGCGACCGATTCACACATTTCTCAGTATGTGAGTTTTGGACCAAGTCACGCCTACAGTAACAGTGATATTACAAATAATTCCAGTCGCTGTAATGACAGCAATGATAATTCTGATCAAGGTTCCAATAAGAAACTGTCTCCACAGAATGCTGTACATATGGGAATTAAATCAGTTCAAAGAAAAATCCAGGAACAAGAGAAAACTAAGCAGGAATATGAACAAGAAGTTGAAGTGTTACGCCTACAACTACAAGAGGCACAACAACGTCTTCAACAGGCCGAGGTCAAACTTCAAGAACACGAATCGGGCACACAGCAATTAGTTGACGATTGGCAAGTTCGTTTGTCTGAAAGCGAGGAAAGACTACGTCGGCAGCAAGTTCAAAAAGACGACCAAATGAAACAGATAATCCAAAGATTGATGACGGTGGAAAAAGAATTGAAAGCTGATCAAGAAGACATGCAATCATTAGTCCGTCAAAAACAACGTGTGATAGAGGCCCAGGAGAGGAGAATCCAAACTCTTGATAACGCAAATGCCAAATTAATGACTGCTTTAACTCAGCTCCGAAGCGTGTCACAACAGAGTCATAATGGAATGATAGGTCCTCTTAGATCTACGATAATGTCAACAGAAATAGCTGAATTCAAGACTAGCTCATGTTGACATGATCATGTTACGGAGGAATGATAAATGACTATATATAGATCGCTGATCAATTGAAATAACTATTTATTATCTTGCATTGTATGCTATCCTGATATTATGATCGTAAAGTCTTGAGTAGAAGGTTTATACTCATGCTCTGAATTAACCAATCAGAACACTGGATTTAGTAGAAAGAGCATAGAACTTAGCAATACTCCTAAACACTTATAAATACAAATTACTCTTCATAAATACATTGTTCTGATTGGTTATCCAATCAGAAGTCTTGGTTAAGTAGAGTATAAGACTTACACCTAAAAACTTATAAATAGACAATGCTGTTCATGAATACACTGTTCTGATTGGATGATTTTTTTTAGTATGAGTACTGTATATTTTTAGACTTGAAAGTGACTTTTTCAGAAATCCTCCATCAATGACTTTATACATAGCTAAGTTTCATTACATGTGGTCGGACTTTTAATATGTATATAGAAGTCTTTCAAGTGTTTTGTGAAATGGCGGCTGGATCTCAATACAGATTTAAATATTTAGATATTAATTTATTCTGCAGTTTTTGATTAAATTATAAAGATGTCATAAACAAACACTATATTCTGCCACTAGCATAATATAACTATATCTGGTACCCCTATCGCATGTATTACCTGTTGAGCTTAAGTAAGGTAGTTTAAACTATGTGTAAATCAGTTCACTTCCTGTTGACAGAAAACATCAAAAGTGACAAATAAGGGATAATTGTATAAATTTCTTATTTAGAATGAAATATAACTTTCAATGAATATTAATGAAGTGTCTTAAACAATAAAGTTTGTGTATTCGGTGCAAAACTGGGGAAAGCTCTGTAAAACCCGCATCTCTCCCAGTCTTTAAGTCTCGTAGAAATAAACTTTATATATTAAGACACTGCACTAATATTGTGTATTTATACCTACTCTATGATTATTTGATAGACATTGGGTAATCACCATTATACCAGTAAACATTTTAATACATTTTATTGGATTTGTTTACGATGTATGTATGTATCAAAGCTTTTGAAAATCATCGCTATACTTAAGGACATATTTAAGATATGAACATTTCTTAAATTTATTTAGAATGTAAAATTGTAAAATAAATGAAAAAAACCAAATTATGGAACAAATAAATTTGTGTCAGAAAAAAATCTAGCAAAAAAGGTAAAACTTCATACTTTATTTTATCGTTGCAATTCCAAGTAAATCATATATACATATCATAATAGGAGACTGCCATTGCATAAGTGCTATAATTAGATTTATCTTGTGTTATCATCATATAATTATTTATGTGTGCAAATAAAAAGTGCATGTGTGCAAATAAAAAGTGCAATGATCATCTTATTAAATAAAATATATTATTTAAATAAATATCATGAATTCCATTAACAGAAAACAGTATTATAATTCATTCACAAAAACTGAAAAAATGTCTAAATACAGGTATTTATTATAAAACTGTCAAAATACAGGTATTTATTATAAAAATGTCTAATTACAGGTATTTATTATAAAAATGTCTAAATATTGGTATTTATGGCCTTTTTGTATTTCATTAATATCATTCAGATAAATATTTTTTCCTAGTTTATCATATTATTGCAGTAGTCCCCCTCTTGTACGGCCAACCCTTTCTGCAATGATAAAGTGGCTTTAAAATAGGGTGGCCTCTCTTAACGGAAACAATTTAGTAGTATTTTACTACCTCATTGCATTTGAAATCTGGCCTGATAAGAGAGGTGGTCTTATATGAGGGCTACTACTGTATTAAAAACAAACATTAAATTGTCTGAAATATAGGTTCTGAATCATGTACCAGCAATAACAAGAAAACAGCATTGCTTTTTGATTCAACACAAATAAGATGTACACCATAAAAAAGTAATCATGCCATCCA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Protein

Gene family

Gene family	Subfamily
-	-

Pfam domain

Pfam accession	Pfam name	Description	Type	Source
PF00616	RasGAP	GTPase-activator protein for Ras-like GTPase	Family	Interproscan
PF12004	DAB2P_C	Disabled homolog 2-interacting protein, C-terminal domain	Domain	Interproscan

InterPro

InterPro term	Type	Description	Source
IPR001936	Domain	Ras GTPase-activating domain	Interproscan
IPR008936	Homologous_superfamily	Rho GTPase activation protein	Interproscan
IPR021887	Domain	Disabled homolog 2-interacting protein, C-terminal domain	Interproscan
IPR039360	Family	Ras GTPase-activating protein	Interproscan

PANTHER

PANTHER term	Description	Source
PTHR10194	RAS GTPASE-ACTIVATING PROTEINS	Interproscan

Gene Ontology

GO terms	Category	Description	Source
GO:0043087	Biological Process	regulation of GTPase activity	Interproscan

KEGG pathway

KO	Enzyme	Enzyme ID	pathway	mapID	Source
K17633	RASAL2; RAS protein activator-like 2	-	Ras signaling pathway	ko04014	PMID: 28812709

Expression pattern

1. Expression trend for Bpl_scaf_1363-7.3 global RNA-seq network