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Detailed information of Bpl_scaf_12478-1.21 in Gigantidas platifrons Gene info

Gene ID	Annotation	Scaffold	Start	End	Strand
Bpl_scaf_12478-1.21	BILE ACID BETA-GLUCOSIDASE-RELATED	Bpl_scaf_12478	112372	161156	+

Gene Structure

More details in Jbrowse Sequence

CDS

Bpl_scaf_12478-1.21

ATGTCAAAGCAGCGAAATATTGACCACACTACTGATGCCAGTATTACAACACCAAGGACTGACATCAGTGGTATCCCCAAATTTGGCTGGAGGGTGAACTTTGATTATGAATGCAAAGAAAAATGTGATCCATTCACCAAACCAAGACTCGACCAGATTCCAGCATTGATTGGTCTTAGTTACAGGTACATGAAAGTATGGGTTAAATACAAGAGACAAGGCAGAAAGATGTTTATAGATCATTTAAACCAGGCAGAACACAAACCAATGTATGGTAAGTTAAACCAATGTAGTATGTTTATTTTATGTATACGGAAGAATAACAAGACAGTATACCAAAAGGTCCTTACAGGAAAGAAAGGCAAACATCTGAAGTCATGGGATTGGGGATTTCCTAGACAGGATGCTACTTATCATGCACTTTATCCTAGATCCTGGACAGTATATAATATACCTGAGTTTAATCTTAGACTTACCTGTCGTCAGATTTCACCTGTCTTCCCAAATGATTACAAAGATACTAGTTTTCCAATGGCTGTATTTGTATGGTCCGTAGAAAACAGTGGACCAGACCCATTAGACATTAGTATAGCATTTACATTTAAAAATGGTAGGGGTGTGAAGGATGATTGTAGTCCTGGTAACTGGACTGAACCATTTGAAAGTGAAGCTGAGGGACAAAAGGTTTCTGGGATGCAAATTAGGCAAACAATGAATGACATGAAATGTACATATGCAATTGCAGGAGCTTTCAAGGATGGAGTTGACATCAGTACCAAATCACAATTTAATCCACGAGGATCAGGTCAGGACTTGTGGGATGATCTTCATGAAAATGGAAAGCTCCAGTCTGCTTCTGATAAAAGTGCTTCCACAAGAAAAGGGAGTGAGATAGGAACAGCTGTCTGTCTGTCTACAACAGTAGAACCAGGAACCAGTAAAGATTTAGAGTTTACGTTGACCTGGGATATGCCTGTCATCCACTTTAAAGCCAGAAAACATCAATATTTAAAACGGTATGCTCGTTGGTTTGGCAGTGATGGAGATGCCTGTCCACGTTTGTGTAGTTATGCTCTGAAAAATTATGCAATGTGGGAAACAAAGATTGAGGAATGGCAGAATCCAATTTTGTCTAATAACAATTTACCTGCTTGGTATAAATCAGCTTTATTTAATGAATTATATTACGTGAGTGATGGTGGTTCAGTTTGGCTTGATTTAGCAGAGGAAAAAGATGGTCAGATTCAACGACATGAGTATAGGATGTATAACACATATGATGTTCATCACTATGCATCATTTGCTTTCATCATGTTGTGGCCTAAGCTTCAATTGTCTATACAGTATGATATGGCTCGTGCAGTTATGTCTGAAGATACTACTCCTATTGTGTTCTGTATGGAAGGTGATCGGGGGATCTATAAAACAAAGAATGCTGTTCCTCATGATTTAGGAGATCCTGAGAATGAACCATGGGACAAAGTCAATGCTTACATTGTACATCCAACTCACGACTGGAAAGATTTAAATTTAAAGTTTATACTACAGACATACAGAGACTATAGCGAGATACAAGACACTGGATATCTAAATGATATGTTTCCTGTTTGTAAGGCTGTAATGGAGCATGCTCTACAATGGGACAAAGATGGAGATGGCCTAATAGAGAATGGAGGTTATGCTGACCAGACATTTGATGCTTGGACCATGACTGGTGTCAGTGCTTACTGTGGTGGCTTGTGGTTAGCTGCTTTAAAGATGTACACAGAGATCTGTAGCTATTATAATTTTGACTCCAGTACAACCAGTAGACATGATGATAGTGTAATGACAGATCAGTTATCTGGACACTGGTTCCTCAGGGCCTCTGGTATGGAGGATGATACTATTTTTCCTCCAACCCATGTTAAAACAGCTCTGAAAACTATATTTAGAAATAATGTAATGGGATTTGAAAATGGAAACATGGGAGCCATCAACGGAACAAGGCCTAATGGGAAAAAAGATCTGAGTAGTTTACAGTCTGAGGAATTCTGGGTAGGAGTAACCTATGCCTTAGCAGCTAATATGATGCAAGAGGGTATGATAGATGAAGCATTCCAGACTGCCTGGGGATCTTACCACACCTGCTGGGAATGGTACGGACTAGCTTTCCAAACACCAGAGGCCTACACGTCAGATAGGCATTACAGATCTCTAGGGTACATGCGACCTCTATGTATATGGGCTATGCAGTGGGCATTGGAGAAGTTTCACCCACAGTTATTAAATTCTTGA

Transcript

Bpl_scaf_12478-1.21

ATTCTTTTAATAAAAGAAATATAGGGAGTTTAGTGAAGTCGGCATGTGCGACTAAATAAGAATCAGCATGTCAAAGCAGCGAAATATTGACCACACTACTGATGCCAGTATTACAACACCAAGGACTGACATCAGTGGTATCCCCAAATTTGGCTGGAGGGTGAACTTTGATTATGAATGCAAAGAAAAATGTGATCCATTCACCAAACCAAGACTCGACCAGATTCCAGCATTGATTGGTCTTAGTTACAGGTACATGAAAGTATGGGTTAAATACAAGAGACAAGGCAGAAAGATGTTTATAGATCATTTAAACCAGGCAGAACACAAACCAATGTATGGTAAGTTAAACCAATGTAGTATGTTTATTTTATGTATACGGAAGAATAACAAGACAGTATACCAAAAGGTCCTTACAGGAAAGAAAGGCAAACATCTGAAGTCATGGGATTGGGGATTTCCTAGACAGGATGCTACTTATCATGCACTTTATCCTAGATCCTGGACAGTATATAATATACCTGAGTTTAATCTTAGACTTACCTGTCGTCAGATTTCACCTGTCTTCCCAAATGATTACAAAGATACTAGTTTTCCAATGGCTGTATTTGTATGGTCCGTAGAAAACAGTGGACCAGACCCATTAGACATTAGTATAGCATTTACATTTAAAAATGGTAGGGGTGTGAAGGATGATTGTAGTCCTGGTAACTGGACTGAACCATTTGAAAGTGAAGCTGAGGGACAAAAGGTTTCTGGGATGCAAATTAGGCAAACAATGAATGACATGAAATGTACATATGCAATTGCAGGAGCTTTCAAGGATGGAGTTGACATCAGTACCAAATCACAATTTAATCCACGAGGATCAGGTCAGGACTTGTGGGATGATCTTCATGAAAATGGAAAGCTCCAGTCTGCTTCTGATAAAAGTGCTTCCACAAGAAAAGGGAGTGAGATAGGAACAGCTGTCTGTCTGTCTACAACAGTAGAACCAGGAACCAGTAAAGATTTAGAGTTTACGTTGACCTGGGATATGCCTGTCATCCACTTTAAAGCCAGAAAACATCAATATTTAAAACGGTATGCTCGTTGGTTTGGCAGTGATGGAGATGCCTGTCCACGTTTGTGTAGTTATGCTCTGAAAAATTATGCAATGTGGGAAACAAAGATTGAGGAATGGCAGAATCCAATTTTGTCTAATAACAATTTACCTGCTTGGTATAAATCAGCTTTATTTAATGAATTATATTACGTGAGTGATGGTGGTTCAGTTTGGCTTGATTTAGCAGAGGAAAAAGATGGTCAGATTCAACGACATGAGTATAGGATGTATAACACATATGATGTTCATCACTATGCATCATTTGCTTTCATCATGTTGTGGCCTAAGCTTCAATTGTCTATACAGTATGATATGGCTCGTGCAGTTATGTCTGAAGATACTACTCCTATTGTGTTCTGTATGGAAGGTGATCGGGGGATCTATAAAACAAAGAATGCTGTTCCTCATGATTTAGGAGATCCTGAGAATGAACCATGGGACAAAGTCAATGCTTACATTGTACATCCAACTCACGACTGGAAAGATTTAAATTTAAAGTTTATACTACAGACATACAGAGACTATAGCGAGATACAAGACACTGGATATCTAAATGATATGTTTCCTGTTTGTAAGGCTGTAATGGAGCATGCTCTACAATGGGACAAAGATGGAGATGGCCTAATAGAGAATGGAGGTTATGCTGACCAGACATTTGATGCTTGGACCATGACTGGTGTCAGTGCTTACTGTGGTGGCTTGTGGTTAGCTGCTTTAAAGATGTACACAGAGATCTGTAGCTATTATAATTTTGACTCCAGTACAACCAGTAGACATGATGATAGTGTAATGACAGATCAGTTATCTGGACACTGGTTCCTCAGGGCCTCTGGTATGGAGGATGATACTATTTTTCCTCCAACCCATGTTAAAACAGCTCTGAAAACTATATTTAGAAATAATGTAATGGGATTTGAAAATGGAAACATGGGAGCCATCAACGGAACAAGGCCTAATGGGAAAAAAGATCTGAGTAGTTTACAGTCTGAGGAATTCTGGGTAGGAGTAACCTATGCCTTAGCAGCTAATATGATGCAAGAGGGTATGATAGATGAAGCATTCCAGACTGCCTGGGGATCTTACCACACCTGCTGGGAATGGTACGGACTAGCTTTCCAAACACCAGAGGCCTACACGTCAGATAGGCATTACAGATCTCTAGGGTACATGCGACCTCTATGTATATGGGCTATGCAGTGGGCATTGGAGAAGTTTCACCCACAGTTATTAAATTCTTGAATGTGCAATAGATAGAATAAAAGTACTCTTTAAATAATAGACCTTGTACACATCTACTATTTGATTCTAAAATTAAGGTTAGTTTTTTTTTAATATTAGAGTTATTTCCCTTACGGCAGGCAAAATTTTACCTGTTCTAGTAAAAGTAATGGAAAGGACAAAGAATTGGAGTTTAGTTTTCTTAAAATTTGTTGATATTTGAACCTTGTAAACAATCATGAGATAATTTTGTGGCAAATAGAAAATTCACAAGTTGTTATGATGCAGATTATGGGAAAATATGTTTTTTTCCATTGTACTTTGCATGAAAAGGGACCATTTTATCTGCATTAAAAGAGATAACTCGTAAAAGCGTATAATTTTAGAATCAAGTTGGAAGTGTGCAAATGGTCAATTGTTAATGGCGTGAAATGTTCATTGGTGCCATACTAGAGTTTGTTGTGTAATGATTTAGTTTACAAATATCTTTATACATGTTGTGTATCATAACATTTAACATTTAATTGATAATTATATAATAGATGAAGTCATTGTTTTCTTTACAGCTGTATGTTAATGTTGATTTAGAATGATATGACTGATTTGTTCAGATATGTTGACAAAATTGACATGCACAAGAAATATGCAAAAATGTACAAAATGTATACAAATATAAGTCATAATCTTTGTTTTTTATGTGAATACTGCACAAGAATGCAAATCCTGATGAACTTTTAGAAAAAGTTTTATATATCATTTATCTGTCCATATATTGTTAACTTTTCTCATTTAGTTGATCTCTTCTGAAACTATTGAGCCAATATAAACCAAACTTAGATGAGATAGAAGATGGTAGTGGGTCCCAATAATTACAACATTTGTCTCCTTTGACCTGTTTTCTATTATACATGACTTCAATATATTATTTATTATTATTACAAGGCATTTATATAGCGCTTATCTAATTACACAATTACCCTAAGCACTTATTATAATGGTAGGGGGTGTACATATATTTGGTTTCTGTGTTCTTAATTTAGTTTCCCTTTACCAAATGTGAAATTTTTACTCACTGTTTTTTAACACAATACACAGCCCAAGTGTGAATTTGGTCAACATTCATTTGATTGGACTAGAATTATGCTAGTGTTTACTTCAGCTGGAAGTATCTGTGTCCTATAGGTCCTACAGACACATTCTACCAATATTATTTATTTTAAGTTTACTGATACCCATCCGAGCCCTTTTCAATTTTGTCATTTAAGATACACCAAGTTGGGACAAATGGCATGCATCCTTCATTAAAGGCTCATAAAAGTTTTAAATTAAGATTTTATGTTTCCACACATTTAAATTTTATGTTAAAATGAACTGACTTTACAGATAATTTATTTTATTTATTACTTTATTTGTATGTATGGTTTAGGTTTATGGTGCTTAATGTCATTTTCAACAATATTTCAGTTATATCATGGCAGTCAGTTTTATTGGTGGAGGAAACCGGCATACCAGCAGAAAACCACCGACCTGTCACAAGTCACTGACAAACTTTATCACATAATGCTGTATCGAGTACACCTCACCGTGAATGAGGTTTGAACTCACAATTTTAGTGGTGATAGGCACTGATTGCACAAATAGTTGTAAATCCAGCTACCATATTTGTGTGTATGTATCTGTTGTTGTTTATTTCTAATTTTTTATGATTGTAAGTTGATAATGACTTGTTATCATACATTTTTCTCTATAATAAAATTATAGACTAATATGAGTACAAATTTGATGTTTTGATAAAATTCCTTATCAAGTCACACAGGGCATTCTAACTTGTGGAATATTCCTTATCAAGTCACACAGGGCACTCTAACTTGTGGAATATTCCTTATCAAGTCACACAGGGCATTCTAACTTGTGGAATATTCCTTATCAAGTCACACAGG

Protein

Gene family

Gene family	Subfamily
-	-

Pfam domain

Pfam accession	Pfam name	Description	Type	Source
PF04685	DUF608	Glycosyl-hydrolase family 116, catalytic region	Repeat	Interproscan
PF12215	Glyco_hydr_116N	beta-glucosidase 2, glycosyl-hydrolase family 116 N-term	Family	Interproscan

InterPro

InterPro term	Type	Description	Source
IPR006775	Domain	Glycosyl-hydrolase family 116, catalytic region	Interproscan
IPR008928	Homologous_superfamily	Six-hairpin glycosidase superfamily	Interproscan
IPR024462	Domain	Glycosyl-hydrolase family 116, N-terminal	Interproscan
IPR052566	Family	Non-lysosomal glucosylceramidase	Interproscan

PANTHER

PANTHER term	Description	Source
PTHR12654	BILE ACID BETA-GLUCOSIDASE-RELATED	Interproscan

Gene Ontology

GO terms	Category	Description	Source
GO:0004553	Molecular Function	hydrolase activity, hydrolyzing O-glycosyl compounds	Interproscan
GO:0005975	Biological Process	carbohydrate metabolic process	Interproscan
GO:0008422	Molecular Function	beta-glucosidase activity	Interproscan

KEGG pathway

KO	Enzyme	Enzyme ID	pathway	mapID	Source
K17108	GBA2; non-lysosomal glucosylceramidase	EC:3.2.1.45	Sphingolipid metabolism	ko00600	PMID: 28812709
K17108	GBA2; non-lysosomal glucosylceramidase	EC:3.2.1.45	Other glycan degradation	ko00511	PMID: 28812709

Expression pattern

1. Expression trend for Bpl_scaf_12478-1.21 global RNA-seq network