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Detailed information of Bpl_scaf_10277-13.24 in Gigantidas platifrons Gene info

Gene ID	Annotation	Scaffold	Start	End	Strand
Bpl_scaf_10277-13.24	CATION-TRANSPORTING ATPASE-RELATED	Bpl_scaf_10277	1278521	1313013	-

Gene Structure

More details in Jbrowse Sequence

CDS

Bpl_scaf_10277-13.24

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Transcript

Bpl_scaf_10277-13.24

GGAAAAAATAAAAATGCCCTCGTCAACATCAGTAAACGAAGAAATTCAAAGCATTACATGTTACAACATTCGTCCATTGTTTTTCCATGGTTATATTGGACCTTTTGTCATTTTATATTCTGCCTGGTTTTATTTCTGGGTTTTCGTGTATGGCTTAGAACATTATTTTGAAGCCGGTCTGATCGCCTTGGCCATCATTGGTTTGCTCCAGATCTTGGTATCACTATTCTGTGTATGGTCGGTGGATGTTAGGTGTAAACTAACATGTGCAAAGGCAAGAAATCCTGATGAAGCAAGCTGGCTGATGGTAGTACCTACCACGAATAATGGATCAACTGAATTTGTTAAGCTACACAGTGAAACTTCGACAACCCCGCCAGAACTTTGGTTCAACTTCCAGAAGACGAGATACATCTATGATCGTGAGGAGAAGAAACAGTTTTTATCAATCCCGTTCCCAGATGATAAATCTGTTGGATATTACATGGATTGGAAAGGTTATCAAGAGGAGGAGGATATTAAACAAGCAGAAAAATTTTATGGTCGTAATAAAATGGAGATGGATTTACCCACGTTTGTGGAATTGTTCAAGGAGAGAGCTACAGCGCCGTTCTTTGTGTTCCAAGTTTTCTGTGTTGGTTTGTGGTGTTTAGATGAGTATTGGTATTATAGTGTCTTTACTCTCTTTATGTTAATTGCTTTTGAAGCTACGCTGGTTCAACAACAGTTAAGAAATCTGTCAGAGATTAGGAAGATGGGCAGTAAACCTTATCCAATACAGGTATACAGAAACAGAAAATGGAGACCAGTTATGAGTGATGAATTAGTTCCTGGAGATATTGTATCTATAGGAAGATCACAAGAAGATCGTGTTGTACCATGTGATATGTTATTACTACGGGGACCGTGTATTGTTGATGAAGCAATGTTAACAGGAGAATCAGTTCCTGTAATGAAGGAACCTGTTGAAAATATAGACAGGGAACATTTGTTAGACATGGAGAGTGATGGCAAATTGCATGTTCTTTATGGTGGAACAAAAGTGGTTCAACATACACCTCCAAGTAAAACAGGGGCAGGTCTCAAAGCAAGCGATAATGGGTGCATTGCCTATGTTGTACGTCATAGTTTCAGTACATCACAAGGGAGATTACTCAGAACGATATTATTTGGTGTTAAGAGAGTGACAGCAAACAATTTAGAGACATTCTGTTTTATTTTGTTTCTACTGATTTTTGCCATCTCTGCAGCATCCTATGTGTGGATTAAAGGAACAGAAGATCCAAAGAGAAATCGCTACAAGTTATTTTTAGAATGTACACTAATTTTGACCTCAGTAGTTCCCCCTGAATTGCCAATAGAATTATCATTAGCAGTTAATACAAGTTTATTAGCTCTTACAAAGCTGTATGTGTTTTGTACAGAACCTTTCAGAATACCATTTGCAGGGAAAGTTGATATATGTTGCTTTGATAAAACAGGCACATTAACAGCAGACGACTTAGTTGTAGAGGGTGTGGCTGGAATAAATGGAACAGAAATCATGGCTGCTAGTGAAGCTCCATTAGAAACCATCCACGTCATGGCAACATGTCATAGTCTGGTCGTGTTAGATGATGAAATGGTCGGAGATCCATTAGAAAAGGCCACACTTAAAGCTGTGGACTGGAATTTGACCAAAGGAGAAACTGTTGTTCCCACAAAGCGAAAGACACATGGACTTAAGATCTACCAGAGATTCCACTTTGCTAGTGCTTTGAAGAGAATGTCAGTCATAGCTGGCCACACCCCTGCTGGTAGTAGTGAAACAGAATATTTAGGAGTGGTCAAAGGAGCCCCAGAAACATTACAATCAATGTTTAAAAATTGTCCAGCTGATTATGAAGAGGTCTATTTAGAGATGGCAAGAAGAGGAGCTAGAGTGTTAGCTTTAGGGTACAAGAAATTAGGAGTTCTTTCTCATCAACAGGTTAGAGATCAAACGAGAGCTACCGTGGAATGTGACCTGTCGTTCTGTGGATTCGTCATTATATCCTGCCCCTTTAAAGCGGATTCTAAATCTGTTATCAAAGAAATCATCAGTGCATCTCATTATGTAACAATGATCACAGGAGATAATCCATTGACAGCATGTCATGTGGCAAAAAAACTAAAATTTACAGACAAGACAACGCTGATCCTTCAACATCCAAATGATAAAGATTCTTCATGGCATTGGCAGTCTATTAATGATAAGATTGTCTTACCACTGAGTAGCAAGAATATTAGGAAAGATGTAATAGAAAAATATGATTTATGTCTGACAGGGGAGGCTTTTACATACTTACAAACAGAGGAAACAAAATTACTGAAGATATTATTACCTAATGTTAGAGTCTTTGCACGAGTTGCTCCAAAGCAAAAAGAAGTTGTCGTGACGACATTGAAAAGTCTTGGTTTTACAACACTTATGTGTGGTGATGGCACTAATGATGTAGGAGCATTGAAACATGCACACGTTGGAGTAGCACTTTTAGCAAATGCACCTGAAAAAATTCCAGAAAAGAAGAAGAAAAAAGCAGAAGAAGATGGAGGGACTAATCATGTTATGAATGATAGAGGTGGAAAGGGGAAAATGAGTGGCAGAGTTGCTAAACAACGAGCTATAGCCAGAGGAGATAACATAGCTCCATCACAGAAAAAGTTAGCTAATATGATGAAAGAACTTGAAGAGGAAGAAAAAGCCCAAGTTGTCAAGTTAGGAGACGCTAGCATTGCTTCACCGTTTACATCAAAATTATCAACTACCACCTGTGTATGTCACATAATAAAGCAAGGCAGATGTACATTAGTGACAACGTTGCAGATGTTTAAGATCCTGGCATTAAATGCCTTAGTACTAGCCTACAGTCAGAGTGTATTATATCTAGATGGTATTAAGTTTAGTGACAGTCAGGCTACCATGCAGGGATTACTCTTAGCTGGATGTTTCTTATTCATATCAAGGTCGAAGCCATTAAAGACATTGTCAAGAGAACGGCCTCTACCTAATATATTTAACTTCTACACACTACTGACTGTGTTATGTCAATTTGCAGTACATTTTTCATGTTTAGTATACCTAGTACAAGGAGCAAAAGCTGTTACCCCACCAAGTGATGAAGAATTTGTAGATTTAGAAAAGAAGTTTACACCTAGTATACTAAATACAACAGTATATATAATATCAATGGCGTTACAAGTATCAACATTTGCTGTTAATTATAGAGGTGAACCATTTATGGAGAGTTTAAAAGAAAACAAACCATTATTATATAGTTTGATATTTTCTGGAGGTGCAATAACTCTATTAGCTAGTGGAACTGTACCAGAACTTACAGAACAGTTTGAACTAGTCCATTTACCACCAGAGTTCAGAAACACAGTTTTGCAAGTGTTAGCAGCAGATATAGGTGGATCCTTCATCATAGATCGAGTCATGAGATTTTTGTTTGGGAAAGGTCGTTTAAGGTCAACATAATGTTCTCATTTAGACATACATATTTGATTGATGGTGCTTGCTCAAATCAGAGGTGTTTTATGGATCTGTTTCCATCGTGTGGACAGTGGTGTTTAATGTACAAATTATCTGCTGTAGAATTTGATAAAGAGAAAAACATACAAAAAATGGAATAACCCTCATAGTTAATTGTCATTGAAATAATACAAGGCTATTGTCTTTGATAATACCAGTCTTAATTAATTGGTGGAAAAATATATGTTAAGTTAAAAATCATGTTGTACGTTTTGAAACTGGTATCGTAAATTTCATGTACATTCATATGAATAAGTGGAAATATATATGAATAATGTGTTTTATCGGTAATTTAGACATTTTTTCTTTGATTTCACCGAATGATATTACCATATAGCGGGGGGGGGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGGACTCCAATTTTCGCTTTATTCGCGATAGTCATCAATCAGCGAAAAAAAGAATCCGCATAAATTTCCACCCTTTAGTACATAAGTTTTTTCTTTCTTAGATAATTGTATAAGATCTATCGTAGTATGACTGTGTGAATATATAACAATCATAATATTATGGTACCTGTCATTCTTAAAGTTGTTGAAATGACGCTTTTAAAATATCCAACATGGGGGGAATCCTTCCCTAAAACAATGCATATGTTGACAATGATCATGAATGAACAGCAAACAATACCTTATTATTTAAGTGATGAAATAGCATCCAAGTCATACAATCATAAATGAGATAATTTATTGTTAATCGGATTATACTTCACAGCTGGGGACTCGTAATCAAACTTCCAGACTTGACATACAAATTGACAAATACATTTGAATACTTCTTTTCTTTTTATTTCAATCATTAAAAGCTTGTGTAAACACAGCCTGACAGTCTAATTATACATTAAATAATTATGACACCTTTATGTAAAGTATACACACACTAACATCTTGGTGAATGTTATTTACACAACATGGATACAATAATTACAATTATTTTATTTTTTCCTGGAACACAATACCGCAAAATTTTATGCTCGCTTAAATTAAATACCCTCTTTTACATCGACATCACGATAATTGCAACCCGCGTAAATTACCCGCTATACAGTATTAGTATCAACGAACTGACTCTTGACACTGAAAATTATCTGTCGGTGTGATGTCAAACACATTATGATTTTACCGATAAAAACAATAAGGTCTGTTTTGAAGGTCTTGAAAAATATTATCACTGTCTCTCAGCTTGTACTATCGGACTCACTGTGATACTAGTGGTCATGTCTGTCTCGACCTTCAAAACTGCCATTATTCTATACCTATTACATAGATGTCCATGAAATATTAAAATTCCCATGTGAAAGAAATACGGTTATTGAAATAAATTGTTTATTTGTCTGCTTGACGTTGCCGTACCAACATTGTCATAATCAAAAATATCATTGAGTATCGGGCAATGAAAACAAGGTATAATTTGTTAGCGTCTTATCAGCGG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Protein

Gene family

Gene family	Subfamily
-	-

Pfam domain

Pfam accession	Pfam name	Description	Type	Source
PF00122	E1-E2_ATPase	E1-E2 ATPase	Family	Interproscan
PF13246	Cation_ATPase	Cation transport ATPase (P-type)	Family	Interproscan

InterPro

InterPro term	Type	Description	Source
IPR001757	Family	P-type ATPase	Interproscan
IPR006544	Family	P-type ATPase, subfamily V	Interproscan
IPR008250	Homologous_superfamily	P-type ATPase, A domain superfamily	Interproscan
IPR018303	PTM	P-type ATPase, phosphorylation site	Interproscan
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IPR023298	Homologous_superfamily	P-type ATPase, transmembrane domain superfamily	Interproscan
IPR023299	Homologous_superfamily	P-type ATPase, cytoplasmic domain N	Interproscan
IPR036412	Homologous_superfamily	HAD-like superfamily	Interproscan
IPR044492	Domain	P-type ATPase, haloacid dehalogenase domain	Interproscan
IPR047820	Family	P5A-type ATPase	Interproscan

PANTHER

PANTHER term	Description	Source
PTHR45630	CATION-TRANSPORTING ATPASE-RELATED	Interproscan

Gene Ontology

GO terms	Category	Description	Source
GO:0000166	Molecular Function	nucleotide binding	Interproscan
GO:0005215	Molecular Function	transporter activity	Interproscan
GO:0005524	Molecular Function	ATP binding	Interproscan
GO:0006874	Biological Process	intracellular calcium ion homeostasis	Interproscan
GO:0015662	Molecular Function	P-type ion transporter activity	Interproscan
GO:0016020	Cellular Component	membrane	Interproscan
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GO:0019829	Molecular Function	ATPase-coupled monoatomic cation transmembrane transporter activity	Interproscan
GO:0030176	Cellular Component	obsolete integral component of endoplasmic reticulum membrane	Interproscan
GO:0055085	Biological Process	transmembrane transport	Interproscan
GO:0140358	Molecular Function	P-type transmembrane transporter activity	Interproscan

KEGG pathway

KO	Enzyme	Enzyme ID	pathway	mapID	Source
K14950	ATP13A1, SPF1; manganese-transporting P-type ATPase	EC:7.2.2.-	Transporters	ko02000	PMID: 28812709

Expression pattern

1. Expression trend for Bpl_scaf_10277-13.24 global RNA-seq network