Gene detail

Detailed information of ctg99-7.8-1 in Gigantopelta aegis Gene info

Gene ID	Annotation	Chromosome	Start	End	Strand
ctg99-7.8-1	REVERSE TRANSCRIPTASE DOMAIN-CONTAINING PROTEIN	chr1	22630053	22647512	-

Gene Structure

More details in Jbrowse Sequence

CDS

ctg99-7.8-1

ATGGTAGCCACAGACAGTACTACCGCGGTGGCTTATATCAACCGTCAGGGCGGAACCCACTCCAGCAGTCTGCTGCAGTTGACTTATCGTCTCTACAAGCTGGTTGACGAGATTCCGTTGCAACTTCGGGCTCGCCATATTCCAGGGGTTTCCAATGTACTAGTCGACACACTGTCTCGGCCGTCGTCTCCACAGCCGACGGAATGGATGCTCCATCCCGAAGCGTTTCGATGGGTGTGCGACAGACTTTGGACACCAAACATCGATCTCTTCGCCACACGATTCAACCATCAGCTGAGGGTTTACGTGTCTCCGGTGCTGGATCCCGAAGCTCTGGATCTCGACGCCTTGGCCATCAGCTGGGAACAGATGGACGCGTACGCTTTTCCTCCACGAATCCTCCTTCCAAGGCAAAAAGTGATGTCGTGTTTCCGTGCGTGGGAGGATTGGGCGGTGTACCCGAATGAATTCCTTATCAAAATGCAGAACGTTTTCCTCGGATTGCTACCCACAAAACCAGAGATGATGGAGGCAGTTGTTGACAAACCAGACGACGACTTGGATGGGGCTCCTATTGAAGACTTGGATGGACTACCCATTAAGGAGCCTGACTTCGATGGGAAACCCATAGAAGACTTTGATGGGGAACCCCTACCAGATGATCTAGATGGAACACCGATTGACAAGACTGTTGAGCCGGATGTAAAACCCAGTGATGTGGCTGTGGTGCTGCCGAGATTCTCTCGTTCTAAGTGGGAATCTGTCGACGAAGCTGAACTCGAGGCTCAAGCTGTGACCACATCGAAGTGGGATAAACTGGATCAGCCGGATGAAGAGGAGAAAGGTCCATCAGAGGATATAGATGGAGCTCCAATGGAGGAGTCCCGATCTCAGGGTTCGGATTCATCGGAGGACAGTGAAGGGGAGATAACTTCGGAGACGACTCCACAACGACAGGAGATGACGGAAGAGAGACGTGCAAAACTGAGAGAAATAGAGGTTAAGGTAATGAAATACCAGGATGAGGTAGAGGCAGGCAAACGATCGCGTAAACCCAACATGTCCTTGTTACAACAGGTCGAACACTATCGCCAAAAACTGTTGGCTAAGGACTCTTATGAGGGACGGTCGTCAAGGAAACGTCACAGGTCAAGATCACCGTCTCCACCATTGTCATACAGGTCATTATCAGGAAGTCCTAAGAGATCACGCAAGGTCAAAAGCCCGAAGAGGTCTCGAGTTTCACGATCACCTAAGAAATCCCCATCCAGAAGTCCTAGCCGCCATCGACACAAGCACAAGAAAAACAAGTACAGAGACTGAAAACAAGTGTTATAATCCAGTGCTGTACGAGTGGATATTTATCTTACATGTGTGAGACGTGAGGACAAGTGTGCTACTGTGAGTGCCATGTGTAATCATTCTGCATTATGTGGGTGGGCTTCACCCAGCTGGATCCAGGAACTGTTGGGGTAAGGGAGGACTAAGGGGACACTTGGACCAACTCATGAAAAGAGCAACTCATTGAAAGATTTTTAAAAAAAAAGAAAAAAAGAGCTGCTTGATGCCCCTCCCCTTGGATCCTTCCCTGGATTCAGGTAATACAAACCAGGTGCTTCAGAATCAGCATTGCTTTGACAAATCTGTGTCTGTGTATATGTGTATACACAAACTGGGTATTAACACATGTACAGCTCTCATAAGGTATTAATGAATCAGGTCAGGTCAGGTCAGGTCAGGTCAGAGGGTTTTATGTGCACATTCAGAGCAAGCTGTTGTAGCTCGCGCCTGTCATGGACGCAGGTGCCGCCCATGGCCGGCACATGTCTAGGACAGGAAAGGGTTGGGGATGGGTGGGTGGGAGAAGGGACCGCCTGCACTGGCAGGTGTAAGAGAGCATTAGCAGCCCGACTGGATAATGAATTTATCATTTTCACTTTTAATGAGTGCGAATAACTGTGCTCTTGCATACCCGTTGATGGGTAAGACAATTTGTTGAATGAACCGCACTTCTACTGCAACACTGTTTATTGTGAGAAGATTGATTTTCCCATCTGTGACATTATGAGGACTGATTTTTTACACTTCTCTGTTTTTCTAAAGATAAAAAGTCTGATGTACATCACCTGAACATATTTGTGGGATTTGTTTTTTTAACAGCGGCTGTTAATGAAGGTACAATCCTTGGATACATCTGTGCTCTGAAGACTTGGCCTGGTGCTTATAAAAGTCGAGACTCGAATAGAGTCTGAGACACTAATGGCATGACCACACCATACAAATGGTATATGTGTGATGTCGTTAGAGATTGAGTCTGGACTATAAACACGGGGCCCAGGTGATTTAAGTGGATCAGTTAGTGAATCTAAACACAAAAATACATTTGTACGAGTTTACATATTAACAAACTGAAATTACTTGGTCAAATCTGTGTTTGTGAAGACCAGGTATTAATTGTTTGACCTGGACAAGTTTGTGTTTAGAAACACAATGTATTAACAAACATTCATTACCTGAATCTACCTGTATTGCTTAAGACTAGTATTAACATAGATATAACACCTGGACACATTGCGGTTTCTAAAGACCAGGCCTGGTGCTTATAAAACTTCTAGAGTTCTAGACTCAAGACTCTAATAGAGTCTGAGACACTAATGTCATGACAACGCCATACAACTTGTATTGTATACATGTGACGTCATTAGAGTTCTAGACTCAAGACTCTAATAGAGTCTGAGACAGTGATGCCATGACAACGCCATACAAATTGTATTGTATACATGTGACGTCATTAGAGTTCTAGACTCAAGACTCTAATAGAGTCTGAGACAGTGATGCCATGACAACGCCATACAAATTGTATTGTATACATGTGACGTCATTAGAATTCTAGACTCAAGACTCAAATAGAGTCTGAGACAATGATGCCATGACAATGCCATACAAATTGTATTGTATACATGTGACGTCATTAGAGTTCTAGACTCAAGACTCTAATAGAGTCTGAGACACTAATGCCATGACAACGCCATACAGATTGTATTGTATACATGTGACGTCATTAGAGATTGAGTCTGAACTGTAAAAGTTTTATAAGCAGGGGCCTTGGTGTTAAAATGACAGACCCTAGTTTCAACCCGTGAAAATTAATACTAAGTCTAGTTAATCTACAAACCTGTAACTCATATGGATAAAGTTACAACTGAGTGAAACATGAGTCTGTGACTTTGAAATGGTGAAATACCCTCTAAAAATAGACTAAAACTTTACTCCATAACTGTTACTTCTCAGATGCATATGCGTTTTTAAAAATATGATCAATGCAATTTGTGATATTAAAAACACAAGGATGACCAAAAACACTTCAGATGTATGGAAATGGATAATCTAAACAATAAAATCTCAGTAAAGTATGATTTCAATTTTCAAAAACGGATCTAATAGTCAAAAATATGCCTTAGTGTTTAAAATCTAGGGTATGCCCCTTTAACAAGTTTGTATCAGTTCATACAGGGTAACATGGGTGAATCGACTATTGTAATTCATCTGTGTATTGCATCATGATATTTAGTTTCAAAAGTGATAGAACAGATCTTTATTGGACATGTTAATTATTTCAGTTTAAAAAATATTAAAAACTGAAACATTTATTCTTTATCTTTTGTGTAACGAGATGCAGCTTTTCTTAGCAGTATGACATCTTTGTATCAGGAGAGGTCTTTTCTTTAACATTTAAAGGGTAGACAAAAACAAATATTGTTACCAATGCGGTGAAGTTTGTTTTATCCTGCAAACAATGTTTCTATTGACAGATTATGATGACCGATTAAAGCAACGTCATAAACGTATACTAGCAGATTATGACTTTTGACCTCACTCATATGACGTCACAAACATAGCTACATTACAAAATCACTCATTTGACCTCTAGGTCATCGTACAATGTCGCAGAAATAACAGAAATAATAGCTTTTCACCTAATTTTTATGGTCTGCAGGATAAAGATAATAACTAGTTACTGACGTCAGATATCTGCTCTAATCCACTTGGGTCTTGATCAGACAAAATCCAACATGCAGAGTTTCTGCCAGAAAGTAATATGAGGGTATGTAATAAAAATAAAACAGATCGTAACTATTCCTACTAGGTAATTATTGACTTGAAATCTCTGGAAATTGGACACTGCATTTCTTTTACTTGTTGTTTTCTCGTTCCAACCAGTGCACCACATCTGGTCATAGGCTTGTGGTATGTGCCTGCTTGCCAGTGGGAAAGTACATATAAAAAAATCCCTTGCTGCATTAGGGTAAATGTAGTGAGTTTGCTCTGATGACTATGTGTCAGAATTACCAAATGTTTGACCTACAATAGCTGATAATTAATTAATCAATATGCTCTAGTGGTGTCGTTAAACAAAACAAACTTTAACTTTTTTATGTATTTAGACAAATTTTAAATATTAGTTCTCAAACTATGTTTCAATAAATTTTAACAATGTATCCATTAATTTCTAAGAGTTTAAGTTATGTAAGTTTACCCTTCATACCCACTGGCAGAAACTCTGAGCAGTCGGTAACATGATGTAGGCTAAAATGACTGAGTAAAATATGGTCTGACTGTATTTTGGATGTGTTGAGATTTTATTTGGGGGCTCATTCCAGCCAGTGCACCACGACTGGTAGATCAAAGGC

Transcript

ctg99-7.8-1

Protein

Gene family

Gene family	Subfamily
-	-

Pfam domain

Pfam accession	Pfam name	Description	Type	Source
PF08312	cwf21	cwf21 domain	Domain	Interproscan

InterPro

InterPro term	Type	Description	Source
IPR013170	Domain	mRNA splicing factor Cwf21 domain	Interproscan
IPR047488	Domain	U2-associated protein SR140, cwf21 domain	Interproscan
IPR052055	Family	Hepadnavirus polymerase/reverse transcriptase	Interproscan

PANTHER

PANTHER term	Description	Source
PTHR33050	REVERSE TRANSCRIPTASE DOMAIN-CONTAINING PROTEIN	Interproscan

Gene Ontology

GO terms	Category	Description	Source
GO:0003723	Molecular Function	RNA binding	Interproscan

KEGG pathway

KO	Enzyme	Enzyme ID	pathway	mapID	Source
-	-	-	-	-	-

Expression pattern

1. Expression trend for ctg99-7.8-1 global RNA-seq network