Gene detail

Detailed information of ctg694-4.3-1 in Gigantopelta aegis Gene info

Gene ID	Annotation	Chromosome	Start	End	Strand
ctg694-4.3-1	L-THREONINE ALDOLASE-RELATED	chr8	26953118	26977752	+

Gene Structure

More details in Jbrowse Sequence

CDS

ctg694-4.3-1

ACGCCATATAAGCGTCAATAAAATGTGTTAAGTGCGTCGTTAAATAAACATTTCCTTCTTCTGTCTGTAAGAGAGCTAGACTAACAAATGTCCGTCTAGCTCGATCTCATGTAGCGGGTTTCCTCTCTAAGACTATTCGTCAAAAATTGCCAAATGTTTGACATCCAATAGCCGATGATCAATAAATCAATGTACTCTAGTGGTGTAGTTAAACAAAACAAACTTCAACAATAATTATTAGGACCACTCGGTCGATTACGTATCGTCGTTTACAGAATCGGCCGATGAATGCCGATAGCGATACCGGATTTTACCGAAGTAGTACCATATGTTACAAGAGAGGAGGGTAAAACAAGAAAGAGAGAAGGTTCGGTTCGAAAAGCAATCATTGTCATCTTACAGAGCGTGACCTCGGAAGATGTTAATAAACCATACGTGATTGACCTACGTAGTGACACGGCCACAAAACCAACCAAAGAGATGAGAGATGCCATGGCCAGTGCCAAAGTCGGAGACGACTGTTTCAAGGAAGATCCCACTGTTAATGAATTACAGAGCCGAGTTGCCAAGCTTCTGGGAACTGAAGACGCACTGCTGATGCCGTCTGGTTGTATGGCCAATCTTGTTGCAGCATTGTCCCACTGCCAGAACAAATATTGTGAAGTCATTCTTGGAGATCAGTCTCATATGTTTTTGTATGAAGTTGGAGGAATGGCACAGTATGGAGGACTGCAGACAAACATAGTTAAGAATCTGGGCGACGGGACCCTGGATCTTGATCAAATAAGCAGCCACATCCGACCAGCCGATGACAGAGACCAGCCGCAGACGGAACTGATCTGTCTGGAGAACACACAGAATCAGTGTGGAGGAAGAGTGCTGCCTCTCAACTACTTGAAAGAGGCATATTCAGTGGCCAAGAAACACAACATAAAGTTGCACATGGATGGTGCCCGGGTACTAAATGCAGCAACACACCTTGGTGTGCCTCCCTCTGATGTCACACAATACTGTGATTCTGTCATGACCAGCTTTTCTAAGGGTCTTGCCTGTCCAATGGGATCCGTTTTAGCTGGCTCAAAGGACTTTATTGCGAGAGCATTTCGTGTAAGGAAGTCTTTAGGTGGAGGTTTGCATCAGGCTGGAATCCTGGCTGCTTGTATGTTAGTTGCTCTGGACACAACTGCACACAGATTGCATGAAGACCACCAAAGAGCTAGAATGATTGCTGAAGGAGTGATCGAGGTATCTAGTCCAGCTGCGAATGTTGACATGGATGGTGTCGACACCAACATCGTCATGATCGACATCAATAAGGAAGGAGTGTCTACTGAAGACTTCTGCAACAGACTGGCGCAGGTGACAGAAGCAGAAAGTGTTGATCTCGGCGAACGTATAGTAACCAAGATGTTCCCATTCACCAAGAAGTCTGTGAGGCTGGTCACTCATAATGACATCAGCGATGACGATGTTAGAAAAACCGTAAAAAAACTCCAGTATGTTATTCGGGAGATTTCGGCCTGATTCGCTGGTGATTCATAATGACATCAGCGATGACGATGTTAGAAAAACTGTGAAAAAACTCCAGTACGTTATCCGGGAGATTTTGGCCTGATTTGGAATCTCTGTGTGCATATAATAATTGACGAAAGTCTTGTCTAGACTGGATCTATTTGAAACTCAAAAACATTTCCAAGATTGTAAAAAGAAATATTTTAATCCCATGTATAAAAGATACTGTTATATATATATATGAAATATTAGCCATATTTCAGGTATGGATTCAAGGGTTCTGGATGTGGATCAGACACCTGTTCTGACTCATGCATACACACACACTTACACACCACACCACACCACATCAAACATACACTACACCACACCATATCACATACACTTGCACACATACCATGCACCACACCACATACACACACTTGCACAATTATGACACACCACACACACACTTTCACACATACTACACACCACACACACACACACACCACAACACACTCGCACACATAATACACACTACAACTTAATGCAACACAAACTAACACAGACAACACAACACAAACTAACAGACAACACAACACAAACTATCACAGACAAAACAACACAACACAAACTAACACGGACAACCATACTTGTACTTCAAATCCTGGTGATTTTTTTATGATTTGATGTACATGTATATCTGTAACTAGCTTCTCAGTTATGGAAAATTATTTTGATTATATCTTCTGGAACATTTTAAAATGTTTAGTGTTATTAAACAATGTTATAAGGGGAAGAAGAAGTTTGTACTATGATATATACTTGTATATATTGTAATTTGATTGCCCAAAAATCAAATTTAACTCTATGAATATATATATAGTGCCGTATTCAGACCCAGTTTTTAGAGAAATGGAATGGAATTGCTTTATATTTTATTCCTCTCACCATTGATGCACGGTCAGTTTGGGATCGATCCCCATCAGTGGGCCCATTGGACTATTTCTCGTTCCAGCCAGTGCGCTACAACTGGTATATCAAAGGCTGTGGTATGTGCTATCCTGTCTATGGGATGGTGCATATAAAAGATCCCTAGCGGGTTTCTTCTGATGACTACTTGTCAAAATTACCAAATGTTTGACATCCATTAGGTGATGATTAATTAATCGATGTGCTCCAGTGGTGGTGTTAAACAAAAAAACAAACATCCTCTCACCAAGTATGTTTTACACCATACTTTTAGACTGAGCAAATCTATCTGTAAGAGTGAAAATTTTTTTTGGAAAGAACAAGTACGCACATAAATAGTCACGGTCTTAATTTTAAGATATTGACTTTATCCTGTTGTAATTAAAATGACATTCGCCCTTTGGCCTGAGCAGAAAAAAGCCAATATCTAACACAGTAACTAGTTATTTTCTTTTATCCTGCAATCCTACTTAACATGTTTACAGTTTTATGAGTACTACATGTAGGTCCATGCATAATGACAAATAGTTCTTATTGAAATAATGTATTGCTAAAGGTAGTACTAAACCAAATAACTTTCGGCTGGGTCAAAGTTCAAGATGCATCAAACTTTTGATAGAGAAGTGAACATCACTAGCCCTGTGATTGGTGATAAGTGTGAGTGTGTTGGTTGTAAAAAAAAATAGTTTCATCTGGGCAAAAAAATTTATGCAATTTTATTTCATCTAATACCACTGTGTCAAGTAGCCTTGTGCTTGAAACATGTATGGGGTACCTGTAAAGAAAAGTACTCAAATTTTGTGTGGAACTAGGGTAGTCATAAACACTACCCGTTATCTCAGAAATGAGCAGCTTGACCCCCCCAATTTTTTCTGATTCACTTTAAGGGTTAGGGGTGGTAGTATTTATATCCATAGCATTTATGTCGATTGATATGCTGCAAGTAGGAGATTTAGCCACATATGTTACTATTGTCGTCTGGGATTTGATTTGGTAGTATTTTATTTAACATTAACATTAACTTTATTTGTCTTTACAACATGGCAGCTACGTGGTACACAAATTGTAAAACACTGGTACCAGTTATTTAAAGGTGCCAAATTGTAAGACAAAAAAGTTATCTCCCCCTTGGCCACATTTGTGGTGAATGGTAATCCAAGGGTATTTACTTTTGTGATATGTCACATATACTGTACTAAAATGAATGATTTTATGAGTATGTTATTGAAATCTAGTTTGAAATACTAGTTGAGTTGGGCTTATCTCACTGATGGAAAACAGAAATATATCGACCATAGCCATCAAGTCATATGTACTTTTGAAACCAATGTTCTATATTGTAAAATGTGGGGTTTTTTTTACAAATAAATTGTTGTTGTTATCTTTCCATTTATATGTAGTGATTGCACGATAAATGGAAATGAGTACCCTTAACACAATGGAAGATGTAGCCAGTTGATTGGCTGTTGAGATATGTCTGTGGTCGATTTCTTTTTTTAAAAGCATGTTTACATGTAGCCAAATTATTTAGGGTTTTTTTTAACTGAGGAAGTTTATTGATACAATACTTGCATATTCATAAGTCATGTTTTTATAATCACTTTAATTGTTTTTATATTTCAGAAATTAATGGGAACTTACTTTTTTGTTCTCTTTATTTTATTCATTGAGCAATTTTTTCAGTTACCACAGGTGTCAGAAAATGACAGTGACTGGGTAGGGTGGGGTGGGGTGGGGTGGGGGCAGGTATATATTAATTTGATTTTTAACTGGGGAGGGTAATGCACAATTTCCCCCCACACCCACTTCTGATGTCTATGGTTACATCAATTTAAATTGTTACAAAATGTACACTGCTTGCATGTGTTCCATGATTGTAATATTGTAACAGGGTTGTAAATGAAAAAGGAAAATTTGTGTAGAAGCACTGTTAAATACCGGTACATCCGCATGAGAGATTTATAATATCAGTTGATGATATTCAACAAAAGTTGGAGATATGTTTTAAGACATTTGATTGACTGCTTCATGGTGATGAGCTACATGTTAAATCCAGTTTCTCTACTGAAATTAATACTAAACATACAAGTTTCAATATAATCTTCTAATAACCTGGTTTTGGCAGATTTTTAACGAATAGAATCCTACATACACGTTCTTTTAAATATCAATTTTTATCCTATAACTTACCTATAATATCCATGTCATAAACGCATGTGATAATTTGTGTATTAACCCGGTCAAACTAATTAGTGCTAATCATGATGATGTCATATTACCGATGGCGACGGCTTTAGTACTGTGATTTACTAAGAATTGAAATAAAATGCTATGTTAGAAGTGTTATATAAATAGAATTTTCTTCTCGCTGCCTCGTCTAGTTAATCGGTATTTGTTGAGGCTCGGTTGATATTTTCCATATTAAAAAACACTCGTGACGAATCCTTTATATCTTACACTGTTTAAAAATGTATCCAACTTGCTTTTGCTCGTTAAATACATTTTGAAATATTAAAAATGTTTCACACCTATTTGTTTTTATTGTACTTTCATTATATTTGAAATGTATTTCTGTTTTTGATTAAAAAAAAAAGATGTGTGGAATATTTGATAATTGTTACTATATTTTAATCACATTAAAGATACAATCATTATTAA

Transcript

ctg694-4.3-1

Protein

Gene family

Gene family	Subfamily
-	-

Pfam domain

Pfam accession	Pfam name	Description	Type	Source
PF01212	Beta_elim_lyase	Beta-eliminating lyase	Domain	Interproscan

InterPro

InterPro term	Type	Description	Source
IPR001597	Domain	Aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase	Interproscan
IPR015421	Homologous_superfamily	Pyridoxal phosphate-dependent transferase, major domain	Interproscan
IPR015422	Homologous_superfamily	Pyridoxal phosphate-dependent transferase, small domain	Interproscan
IPR015424	Homologous_superfamily	Pyridoxal phosphate-dependent transferase	Interproscan
IPR023603	Family	Low specificity L-threonine aldolase-like	Interproscan

PANTHER

PANTHER term	Description	Source
PTHR48097	L-THREONINE ALDOLASE-RELATED	Interproscan

Gene Ontology

GO terms	Category	Description	Source
GO:0005829	Cellular Component	cytosol	Interproscan
GO:0006520	Biological Process	amino acid metabolic process	Interproscan
GO:0006545	Biological Process	glycine biosynthetic process	Interproscan
GO:0006567	Biological Process	threonine catabolic process	Interproscan
GO:0008732	Molecular Function	L-allo-threonine aldolase activity	Interproscan
GO:0016829	Molecular Function	lyase activity	Interproscan

KEGG pathway

KO	Enzyme	Enzyme ID	pathway	mapID	Source
-	-	-	-	-	-

Expression pattern

1. Expression trend for ctg694-4.3-1 global RNA-seq network