Gene detail

Detailed information of ctg626-3.15-1 in Gigantopelta aegis Gene info

Gene ID	Annotation	Chromosome	Start	End	Strand
ctg626-3.15-1	TRANSMEMBRANE PROTEIN HTP-1 RELATED	chr6	43247352	43264632	+

Gene Structure

More details in Jbrowse Sequence

CDS

ctg626-3.15-1

ATGCCACGTCTCAGTGAACCGCAGAGAAACAATGCCATCGGCCGACTAGACGCAGGCGAATCCAGAACGGCCGTTGCCAGGGCATTCCATGTGTCCCCAAGCACCATCTCCAGACTGTGGGACCGTTACCAGCAACATGGATCAACACGTGACTTCCCTAGATCCGGTCGACCACGGGTCACTACCCCCGGGCAGGACCACTACATCCGGGTACGCCACCTTCTGGAACGATTGACTACTGCCACCTCCACAGCCGCAGCAATACCAGCTCTTTTAGGTTACGCAACTACTGTGATTCCAAGAAAATACACTCTTTATGCTTCATCGATTCTGTTTGGTGTATTTGGTTTGAAGATGTTACGAGAAGCTTGGGTAATGTCAGCTGAAGAGGCTCAGGAGGAATTCAATGAAGTACAAGCCGATTTAAAAAAGAAGGAAGACGAGATAGCACAGCGGAATGCCCCGGTACAGGATATAGAAACTGGTATTATTCGAACACCAGGTCGACAGTTTGTATCGGGAATTTTATCAACAGTTTTTCTTCAGTCCTTCACATTGACCTTTTTAGCAGAATGGGGAGACAGATCACAGATAGCTACTATTGCTCTAGCAGCCAGAGAAGATATATGGGGTGTACTTATTGGAGGCTCCCTGGGCCACGCCCTGTGCACTGGACTTGCTGTTGTAGGTGGGCGAATGATAGCTCAGAGGATCTCTATCAGAACAGTAACAATGACGGGTGGTGTTGTCTTCATAATATTTGCCTTCTCAGCACTAATGTTCAACATTGACTGAAAAGAATCTGCCCCAGTACCACCATGCCAACCAGTGTCACAGGAACATTTTGTTTTAGATAGATATTAAATAGCAGGGAACATTTTGTTTAAAACATTTTGATTTGCAACACTATGACATATTTTTCACTATTAAAGCACTTTTTAATACTTGAAATCGGACATTACTTTAGATTTTATTATTCATAATATTCATTTCTGTACCTCAAAGCAGGGCTAGCTCTGGCACTCGCCGAATTCACCAACTGTGAATTTTGAAAGCAGTTGGCGAATTTTATTTTAATTTGGCGAAAACAATTCATATAATAATTGACATTAACTGTTGAATTCTGCAATTTTTGAAGTTTAATAGACAATTTGGCGAAATGTTTTGCTCACCCAGAGCTAGCTCTGCAAAGTATTGATGGTCATCCTGGTGTTTCTGATGCTCTACAAAATACATTTTTCATATTTTTTAAAATGCATGTACCTCTGAGAAGTAATGTTTATGAAGACAAGCTGTCGTCTATTTTTTATGGATATTACCCCATTTCAGCATTACAGACTCTTTGTTTCACTCCATTGTAACTTTATCCAAATGTGCTACAGGTTTGTAAATTAATCAAGCTTAGTGTCCATTCTCACGACTTGAAACTAGAGTGTGTGAGTTTAATGTTTTAGAATTGTGGAGTGATATCTGAAAGATGCATAGCGAAATGCACTGCGATACTGAAAATAATGTTCCCTGTTACAGTGTATGGATGACAAAATGCTAGTACTGAATGTTTACTGATAATATTTATACATTTTGTGAAAGTAAAATACAATTTTAATTTTTTAATGAATTTATTTTATATACATTTTATGTTTATATCAAAGCTAGGGTACATTGATTATTTTTGTTTTTCAGACTTGAAAATGCAACATTTAAAGTGCATGCTAGCTTTTGAATGTGTGTGTTTGATTTTATTTTTTAAAATTTCAGTTGTTTTTATTGATGTACACTAGTTGCATTAAAATTACTTCGAAAATTCTGAGATTAATCATTAGATATGGTACCTACTTTACAAAGATTTTAGTCCATCAAGTTAAAAATAGCATATTTTCATAACTGACAAATTATTATTATTGTATTATTTTAGTGGAGTGACCTGTTATAAGTTTATTATTAATTTTTTTTATTAGACCAAAAAATGTCGTCATCAGTTTTTAGCATCTTATGGCCACCAAGAATAAGCTACCATCTTTTCACATCACTTATACCAATACTTACCCAGCTTTATGTGTCTATGCATGGAATTGAAGCTGAAGGAGATCTCATGAATTTGTGATTCACGTGACCTCTCGATAGTGTTGTATTTTTCACAGAATGTATTGTGACATAGTATGATAGAAATTGTATATAACTGCATGGAGTAATTAATGGTGGTATGCAACCTAAAACTGATAACCCACCTCATTAACCTGAGATAGTTTTTATCCTGCAATCCAATGAAATGAGTAGGCAGTGTCTGGGACTGACACTAGATATTGCTAGTGTCCTAACTACAAATCTTGCTGGTACAATTAAGAGAAAATAATTATTATATCTGTTTTCTGGTGGTCACTTACCATTATTCAACTTTTTAGAAGTTCATATAACATTAACAATGTAGCACATATTATACTTAATAATGCATTTCTTTGATAACAAATAAATTGCAATGGTGGTGTATGGGGAAATTGCCATACCAGTTATTTTTACAATCTTGAACTATGTTCAACTTGTTTACTCATTGGTTTGATGTATTTGTTAAAATGTTTAAACATTTGATAACAAATAAATTGCAATGGTGGTGTGTGGGGAAATTGCCATACCAGTTATTTTTACAATCTTGAACTATGTTCAACTTGTTTACTCATTGGTTTGATGTATTTGTTAAAATGTTTAAACATTTGTTTATAATTGCTTAAGTATCAGTTATAACTTCATTTTTTATGTTAAAACAATTTTATTCAGTAGTTTAGTTGTGGTACCAAGGTCTGTAGTCATATGTGTTGCTATGACAATAGAAATATCGTTTGTTGGTCCCAAACAGAGGTGGGGGAATTGTACTGTTTTCTAACTTTGATAACCCCTTTTTTTTTTACAATCTTAAAAAAGCAAGCAAGTCTTGCAGCATGCCATGTTTTTAAGATGTTAAATTAGTCATATCTATTATTATTTTTAAAACTCCTAATTCATAAATAAATGATATGTTATGTTTACCAAGATATACAATTTTATTTTAATATTCTATAGTCTAAAGGAAACAAGTTGAATCAGGCTTGTATGAAATAATAAATACTTTGCTAATAACATCATATTCTATCAATGCAAAGAGTGATTTCAAAATAAACATCATATTATTCTATCATGCAAAGAGTGATTGCAAAATAAAATTATCTATATTGCAGTACCAAATGCAGTAGTGTAAGATATATATATATATATATATATATAAATTGTGTCCTAATTTCCTCATAATTCTATAAATAATTTTGAGGACTAATAAAATCAAAAGTGTAAATAATTATTTGCAGACCAAACTACAGACAAAACCCCAGTTATGTGATATATTGTGCTGATGTGACAACAGTTTTGTATATTTTTCTTCTATTATTTATGATTGTGAGAGATTAGAGGTCGTTCATAATAATCAATATTCATATGGTCATACAGAACATATTAAGATCCCTCGATCTCCAATCTCCCTTACATAGTATAGCTACTTGTCCAGCATTTTCGGTGATACTTGTAGCAACCCCCCCCCCCCATTCCTACCAAACAGAAAAAGGAGAAACCCCCCAAACATTTTGGAATTGCAAATAATCACATCAAATGGGATGCAGTCATTCTCAGTAACCAAAGGGGTGTGATGTAGCACATTGGGGTTTCCTCAACACAGCCTGTGTTCCATGATTGGTTGTATCAAAGGCTATGATGTGTACTGCCTGTCTAAGAAAATACATAAAAAGATCCCTTGCTACAGTAGCAGTAGCCTACTGGGTGGTAGTAGCAGTATCCCAATTCACGAAGCTCTCTTTAGCAGCATCACTTTCCCTTTTATATCTATTTGCATTGGATTGTGAGATCACAGTTACAGGAGTTTGATGTATTAGACCCCAGATGTCTTCTCTTACTTTCTAGGCCAAGTGTAATAAAAACTCTGTGTTAGACGGCAAATAATTAAAGTTAAATATTCCTTTCTTTTCCTTTTAAACATCCATCATGACCAGCAACAAAGCGTTTTTTCTTTTTCCCCATTAGAGAGAATTTCAATAAACCAACTAGCCATAAAATTGTAATTATGTTTAGTGGCACCCATCCTGTATGATTATTTCTGAGACAACTCATAGCCTCCTTCGCCCACCACCAATATACACATTTGATACTATAATTTTAGATGACCTGATAATGATTATAGAAATTGTATACTCTATTAATGGTGTTAAAACAGAGTATATTGTATTAGTTATAGAATAACAACACTTGGTCATGAGTCACCTACCACTATTTAGGAATAACAAACAATTTGATTAATTAATTAGACAGTGCTATTTGGTATTATTGTTTGTAAATAATTAACTATTCAGTGACATTTTTTAAATCAGATATGTAAGTTATATAATTTGTGACTATGATATAGAATTAGTAGTATTTGTATTATTTGTCTTGATGTGAATGCTGCACTTCTGCAAACTCAAGTCGGTGTCAAATGTTTTCAGAAAAAAATATATACTAATTTTATTTTAAAAACTGTGAACACTACTATGTAGCTGTTGTTGTAGTGATGTAATATGTCAGTGACAGTTTGATGTAAAACAATAATGTCGGGACTATTTATTATTCTTTGGGATTTGTGACTTTTCTTGACTACTTGCTCCTCTGGCCAGAGAGACATTTTTCTTTATTTCTATTCCTGAAATATATGGTCAGCTTTAGAAAAAAGTTGTTATAGATGTTGCCATTACTATAAAAAAAAAAACCCAACTTGTTGGCATTTCTGATCTTAAACATTTAACTGCAGACTGCAAATTTGCTTAGAGGAAATAGACTGTCACCCATGGAAATGTTTTATCTATGAATATGCATAGGTTTGGTGATAGAACCTTAAAGACTGAATTTACAAACATCGTTGTGAGAATTGTGTGAATGATTGTTGCTACTCTTCACACGAAGGTAGTCATCTTACAGATTTTTAGTCC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Transcript

ctg626-3.15-1

Protein

Gene family

Gene family	Subfamily
-	-

Pfam domain

Pfam accession	Pfam name	Description	Type	Source
PF01169	UPF0016	Uncharacterized protein family UPF0016	Family	Interproscan
PF13518	HTH_28	Helix-turn-helix domain	Domain	Interproscan

InterPro

InterPro term	Type	Description	Source
IPR001727	Family	GDT1-like	Interproscan
IPR009057	Homologous_superfamily	Homeobox-like domain superfamily	Interproscan

PANTHER

PANTHER term	Description	Source
PTHR12608	TRANSMEMBRANE PROTEIN HTP-1 RELATED	Interproscan

Gene Ontology

GO terms	Category	Description	Source
GO:0005384	Molecular Function	manganese ion transmembrane transporter activity	Interproscan
GO:0005794	Cellular Component	Golgi apparatus	Interproscan
GO:0015085	Molecular Function	calcium ion transmembrane transporter activity	Interproscan
GO:0032468	Biological Process	Golgi calcium ion homeostasis	Interproscan
GO:0032472	Biological Process	Golgi calcium ion transport	Interproscan
GO:0046873	Molecular Function	metal ion transmembrane transporter activity	Interproscan
GO:0070588	Biological Process	calcium ion transmembrane transport	Interproscan
GO:0071421	Biological Process	manganese ion transmembrane transport	Interproscan

KEGG pathway

KO	Enzyme	Enzyme ID	pathway	mapID	Source
-	-	-	-	-	-

Expression pattern

1. Expression trend for ctg626-3.15-1 global RNA-seq network