Gene detail

Detailed information of ctg354-4.1-1 in Gigantopelta aegis Gene info

Gene ID	Annotation	Chromosome	Start	End	Strand
ctg354-4.1-1	RAN BINDING PROTEIN	chr3	19263726	19277063	+

Gene Structure

More details in Jbrowse Sequence

CDS

ctg354-4.1-1

ATGGAAGAAGTTATTGACTCGCCAGATATCCACTTTGAACCAGTGGTATGTTTGCCTCAAGTTGAACTGAAAAATATGGAAGAAGATGAAGAGGAGTTACTGAAATTACGGGCCAAGCTGTTCCGTTTTGATAAAGAAGCTGAGCCGGCTGAGTGGAAGGAGCGTGGAACGGGCGACGTGAAGCTGATGAAACACAAAGTGACGCGGATGATCCGGATCATCATGCGAAGAGACAAGACACTAAAGCTCTGTGCTAATCATTACGTGATGCCGTATATGGATCTGAAGCCAAACTGTGGTAGTGATAAAGCTTGGGTATGGACAACAACTGCAGATTTTGCTGACGAGGAGAAGAAAACTGAATTGCTTGCCATCAGATTCGCAAATGCAGAAAATGCACAAAAATTTAGAGAAAAGTTTGAAGAGAGTAAAGAAATTATGGAAGAGGTCTTGAAGAAGGAAAAAATAAATGAAAATGGCATAAGAGATGAAAACAAAGGTACTAAAGATGAATTGAGTAATGAAGCTGAATCAAATTCACCGCAGAAAAATGTGGAAGGAGATGCATCGAAAGACGACAGTGATAAAATTTCAGAAAAACTTGGTGAATTATCAGTGACTGATTCTGGTGATAAGAATGCTAGCAGTAACGGTGACAAGGGTAGCACTGACTGTGTACAGAACACTGGAGACTCGACAACTAAAGAGGACTGAAAGTAATACGAGTGTTTTTAAGCTAAAACGTTGTGCTCTGTGAGAATCCCATTTCATTTACAACAGTGTTTTACTCTGGAATTACTACTTGGCGTAATCGACAAGCTGATCAGGAAATTTAACATCATAAAGACTGAAAACTGAAATAGTTTGACGACGACCTCTTAAAATTGTCGAATGAGAGCAGTCATTTGACATTTTTGTGATAAGATTGACATGATTGTTTACACAAATAAGAATATTAGTGGATGTATTAGCAGCAAAGAATGTGTGCTTTAGAGCTTGTTCATTATTGATTACCTATATCTGACTTGGTTAATAACTACATAAAGCTTGGAAGTGGTTATATTGTATCCTGATGACATCCTCTGTTTTTGATATTATACACCTTGAAATTAATTTAGCATCACCTAAATTGTATTGCAAGTAAATGGCGCCTAGAAGCAGTTGTCTATGCTGATAGGGGTAAAGCCAGATATTGACAATTTTTACATGTTCTGTATCTACTCCGTATTTATTAAAATGGCATGAATGAATTACTTAACGAAACCACATAAATGTGGTGTCAGCTCCATAGTTAATTGCCATACATTTTCACACACATATTTATAGTTTGTCTTGTCCACTAGAATGTGTTCAGTGTGTCGTTAAATAAAACATTTCCTTCCCGTCCACTAGAATACATTCAATATTGATGCAATGTCGGTGTTACTTGCTGTCTATCATTTTTGAAATATCCCCTGTATACACACAGCATCAGGGAACATTTAGTTTTTTTTAATCTTGAGTAACGGTATTTCTTGTTGATTGACAATTGATTACCAACTGCTGTTTAATGTTTTAAAATTGTGTAGCGATCTTTGAAACTTATGTAGCGAATCGCAACGTGACACGAATAAAATGTTCCCTGAAAATTTGGTTTTATATCCACGAAATGTTCACAATTACTTGCAAAGTATTAAGTAGTGAAACGTAGGTGGTGCTTAATTAATTTCTAGGCATATGTTAGTATTTGGTGTATGGTCAACCTAGATGCTCTTTGAAACTGTGTGCTATGATTTCATGTCCAGTTGCTGTTAAACAGATTCGTTTTGTATTTGGTTTGCATAAGGAGAACTAACGAATTGTCATGTGTGTATACATTGTATGTAGCAGGGTTCAAACTGTCATTCACCATATTGTTCATAACCAATGGAGTTTGAAGTTGGCAAATATTTTTATATTTTCCAAACGGCTTAAATTGAGAATTGTTTAACAAGTGTGTACATGTATGTATTTGCATTTCGTTTCGTTGAGTAAACAAATATTGCCAAATTGCTGGCAATACACTTTGTGTGTGTGTGTACAACTTAAGTCTCCATTTGTGAATTTATGTCATCTGTTGTCATTATGGTAATACTGTAATGGTTTCCCATAATCCAAATTGGTGGAGCAATTAATACATCCACTCAGATTTTTTCATGGCAAGGTCTAATAATGTCTTCCCACGTATATCTTGTTTTCTCTTACACAATTATTGTTTTCTCTGCTTTCTTTTTCTTTCCTGGCACAAAGTATTGTGGTTCATTACATTTGTTCATGTCATTACATTTTAACATGAATGCCTACTTTGTCAACTAGTGTTCAAATGGGTAGGATTGCCTATAAGAATTTGTTAACTCTGTATGCTGCCCAGTGTTACAGTGTCTGGGACACTAGACAGGATCTGCTGCCTGGTGGAAGCACCTATATCTCTGTCCAAATTTAGATCGGGGTGTCCCCACTATCTTACTACTAACTGTAATAATTTAAACCCACCCAAAATGTTTCAATAATTGTGGAGGTACCATGTTTCAATGCAGCCAGTAGTGTTTAAAAACTAATCCTTTATACTTTAGAGAGGGAGGGAGGGGTTATTTAAGCATTTTGGTTTTTTTCAACTAATTGATTTTAGTTGTTGATGTATTCCATAGGTACCTTTATTCAAGATAGTTTTTTTTGTGATCTTCATCTTTCTCAAAAAAATTTTTATTTGTAAAAGGGTTCTTGTATTTCACTGGTTATCAGAAAGTACATTTTTATCCACATATTTTCGAAGCTATCTTGGCATGACAATATCGAAAACCGGCATAGCCTTTGACTAATAATATAACCCCTGATGGGTTTACGATACTGTCGCACTGGAATAGCTTTGAAAATATGGGCCCAGGTTTATTTGACTGTTTATTTTGTGCATTGTAATGATTTTGTTTTCACCAGTTGTATAATTCTGATCACCTGCTGTATAATCTGTTTCAAAATGAGATTCTTGTATGATGTCCTTTTTGAAAAATATATTTATCCTGTGGTCAAATAACTTTACCACACAGACATTTGCCATAAAGGCAGGTGTTAAAAGTAGCTACAAGCAAACATTTTTTTCGGTTCCTGCCTATTTAAAATAAACTACATGTACAGTTTGTAAATTTGGATCTAATTGTGTTTTGAGATGTGGTAAAAATAGTCGATTGAAATTGTTGAAAATCAGTTGTTGGGACTAATGTGTTACACAACTTGTACTTGTGTTATTAATATTCTGTCTGTGGATTTTTTTTACTGCTGCTATTGTCTTTCATCCTATGTAAATCATTGGGTTTCATTCATTCTATCAAATCTTGCAAGTCTGCCACCAGTTATGGGTGTTCATCACAGGGTTTGACAAATCCACTGGCCCTTAAGTGTCCCGGCTAGTGAATTTTTGGTCTGTGTTAGTGGAAATTATCAGCTGTAATACTATAGTACATAGGACACTATCCAAAGCTTCCGTAAGGGCTAGGAAATTTCTCAAACATTTGTCAAACACTGGTTCATTATCATTGAAAGTGCATGCAGGAGGCTGGTAGAAAAGTAAGACTTGGGCGAAACTGGTTTCCGGGCAAAAGATTTTTCCAACCCTGAAGAGTATCTATTGAGAATGGTGAAGTGTATAATTGTAAGCATGAAAAGTAGGCAGCAGTGGCACTAGCAGTAGCTGTTAAAGGTCTCTGCCAACAGTTAACTTAAGAACTCGTCTGATATTGTATTTAAGTCTGCTAATTCTGTTCAGTATTGCTGTACCGTGTCATCTCTTTTATGTTAGTTGAATTGACATTACTTATTGTTTTAAATCACCATTGGTGTTTGAAAATGCTCAGAATTTGTCAGTTAGAAATGTACCTACCTAAGGTGTTTATGGTACATGTTCATAATGTATGTGAATGTCTCAGAATTTGTCAGTTAGAAATGTACCTACCTAAGGTGTTTATGGTACATGTTCATAATGTATGTGAATGTCTCA

Transcript

ctg354-4.1-1

Protein

Gene family

Gene family	Subfamily
-	-

Pfam domain

Pfam accession	Pfam name	Description	Type	Source
PF00638	Ran_BP1	RanBP1 domain	Domain	Interproscan

InterPro

InterPro term	Type	Description	Source
IPR000156	Domain	Ran binding domain	Interproscan
IPR011993	Homologous_superfamily	PH-like domain superfamily	Interproscan
IPR045255	Family	Ran binding protein RanBP1-like	Interproscan
IPR045256	Domain	Ran-specific GTPase-activating protein 1, Ran-binding domain	Interproscan

PANTHER

PANTHER term	Description	Source
PTHR23138	RAN BINDING PROTEIN	Interproscan

Gene Ontology

GO terms	Category	Description	Source
GO:0005096	Molecular Function	GTPase activator activity	Interproscan
GO:0005643	Cellular Component	nuclear pore	Interproscan
GO:0005737	Cellular Component	cytoplasm	Interproscan
GO:0006913	Biological Process	nucleocytoplasmic transport	Interproscan
GO:0046907	Biological Process	intracellular transport	Interproscan

KEGG pathway

KO	Enzyme	Enzyme ID	pathway	mapID	Source
-	-	-	-	-	-

Expression pattern

1. Expression trend for ctg354-4.1-1 global RNA-seq network