Gene detail

Detailed information of ctg331-5.0-1 in Gigantopelta aegis Gene info

Gene ID	Annotation	Chromosome	Start	End	Strand
ctg331-5.0-1	STERILE20-LIKE KINASE, ISOFORM B-RELATED	chr1	3727405	3781562	+

Gene Structure

More details in Jbrowse Sequence

CDS

ctg331-5.0-1

ATGGCTGTTTGGTGTTTAGCACATTGTCAGTTTGACATCGCGTCAGGAGCAAGAGGCAGAGTAAAAAAAGAAAGAAAGATAGACATAGAGAAAAAGAGGAGGAGGAAGGGAAGTCTGGGTAAAATTTCAGTCGATCCAGAAGTTCGATTCTCCAAGTTGGAGAGAATAGGTAAAGGTTCTTTCGGAGAGGTGTTCAAAGGAATAGACAATGAAACGAAACAAGTGGTTGCAATTAAAATCATTGACTTGGAAGAAGCGGAGGATGAAATTGAAGACATTCAGCAAGAAATCATGGTGCTCTCGCAGTGCGATAGTCCCTATGTTACAAAGTACTTTGGTTCATACCTCAAGGGTTCCAAGTTATGGATTATCATGGAGTTTTTGGGTGGTGGATCTGCCCTAGATTTAATGAAGGCTGGTTCCTTCTGTGAAAATGACATTGCAATTATTCTTAGGGAAATATTAAAGGGCTTAGACTACCTTCATTCAGAAAAGAAGTTACACAGAGATATAAAAGCTGCCAATGTGTTGTTATCAGAACATGGCGATGTTAAGTTAGCTGATTTCGGAGTGGCTGGTCAGCTGACGGACACGATTGGAAAACGGAACACATTTGTGGGTACTCCTTTCTGGATGGCTCCAGAAGTCATTCGACAGTCGGCCTACGACACAAAGGCTGACATTTGGAGTTTAGGTATTACAGCCATAGAGCTTGCTAAAGGAGAGCCGCCCAACTCGGACCTCCATCCTATGCGGGTATTGTTCCTTATTCCAAAAAACAACCCCCCTCAGTTGACGGGCCCGGGATACAGCAAATCATTCAAGGAGTTTGTAGAGCTCTGTTTAAATAAGGATCCTAACAATAGGCCCACAGCAAAGGAATTGTTGCGGCATCCTTTTATTAAAAGAGCTAAGAAGACGGCCTACCTCATGGAACTGATAGACCGGTATAAACGGTGGAAAGCTGATCGACCTGATGACAGTGACAGTGACGAAAGTGATGGATCCGACACAAACAGTGACGACGATCACCACACAATCAACTGGATCAACACAATAAAAGAAATAGATCGTCAGAAGATCATCATGAATGGCAATGATGAGATAAAAGTTAGTCCTATTGTTCCAAGGCGCCCAGCGCCGTCGATTCCTAAGGAGACTGTGCAAGAGATAAAAGTTAGTCCTATTGTTCCAAGGCGCCCAGCGCCGTCGATTCCTAAGGAGACTGTGCAAGAGCCTCCACCATATGATAGTGCCTACCAGAGCCCTCCGCGACCTCTCCCTAGATCTCCGCCAACCAGTCCGGACGCCATGGTCGGTAGACAAAACCAGGCTTATTACAATGGGCAAAACGTGTACACCGGTCAAAACACCAACACTGCTTATAATGCATATCACAGTCCGTATCATCATGCAAACCCTGCTGTTCCCAGCATGCTGCATCAGAGAGATGACTCGGAACCCCCACAGATGGAATATCGTAGTGATAGTCCTGATAAAATTGATGAACAAAGCGATTCATACCCCGACCCTCCCCAAAATCAAAATTACATCCTAGAATCTGAGATGAGTCCAAAATCGCATCACCTGCGTAGTCATTCCGACCTCGAAGTTCCCCAACTCGTCACTCCGCCGCAGTACGAATCCCCTGATACGCGTCCCTTCATCAGCAGGCCCAAATCGCAGTATGATTTACCTGATGTGGTCAATGACCCCATGCTGCAACAAGGTTTTCCCAGTGACCCAGCGGTACACGTACCGTTCCGCGAACCCCAAAAACGAATACCCCCGGCCGTACCCTCAAAGCCCAGGGGCCATCACAATGACCCCCTACTTCAGCGGAACTATACTAGCGACCCGTCATTGCAGCATGGATATCTCGGGTCTCCGCAAAAGGCCTACCAGTCTCATCAAAAACCACAGGCTCCAGCTCCTCCTCGAAAAGAGCCTCGTCCGTCTGCGTGTCTGTCATCAACCATCATGCCAACATTGTCACAGTTAAAGGATGATTACAAGGATGAGTACCGACGTATCGGGCGCCCGGTCCAGAAGACAGAGGCGATAGAGGAGCTGAAGAACGCGTTCGATCTGGCCGAGAAGTCGTGTCCTGGTCTCGCCGATGACCTTGTGTCCGGCATCATATCCAGGCTAGGCAGTACCACGAACATGACCGAGGGGGAGGTGCGGCGAGCCACAGACAAAATAAAACAACCGTCCTAGTAAAAAAAAAAAAAGAAGAAACAAAGGAGCCATTTGGGAAAAAAACACTTTGTACATAAAGAGATTGTTGAGACGGGCATGGGATAGAATGTCGGCTGGTTTATTGTGATTCAGATGCAAACTTCATGTGATGCAAAAATATATATACATATATATAAAACAATTTAATTAAGTGCTATAATCATTCCTGTGGCGGTAAATTGAGTAAACAAGTTTGATACCGACCGACTTGCCGACAGCTGTGAGAAATGCCATGCTAATATTAATGATTTCATACTAGCACATGCCATTCAGTTATAACGGTGATAATGGTAAGATTGGTCATGATGGTAAAATTGGTCACCACTATTTTTAAAATTGGTCATCACTGTTGTAGCGATAACGGTAAGATTGGTCATGATCGTAAAATTGGTCGCCACTATGTTTAAAATTGGTCATCATCATCGGGTTATTCAAACACAGTTAAATAACAGTGATGATGGAATTGGTGTTAGGTTATTTTAACACAGTTATAACAGAAGATAGCATTGGTAATCCTCCACTGGCAAAATGCTGAGACAACGGGTCGATTGTCACTGTCATAAAATTGGTTATTACCGTTAGGTTATTCTAACACAGGTATACCTGTGATAAATAGGATTGGTGTTAGGTTATTTTAACAGTTATAACAGAAGATAGTATTGGTAAGCTCCATTGTGAAAAAATGCTGAGACACCATATCGCCACAGTTATAAAATAGGTCATCACCGTTAAGTTATACTAGCACATATCATTCAGTTATAATAGTAATGATAAAATTGGTTATCTTCCATTGTGGCAAAATGCTGAGACAATTGGTTATCACCTGGGGGTTATGCCACGACATACCAATCGGTTATAACAAGTATCATATGATTGGTAATCTCAGTCATGTTTTAGCATTGATAAGATTGATGGCCACTGCTATATAAATGGTTATCACTGTTAGTCATGCCCTTTTGTTGTAACACTACTGAAAAAGACGGGTCATTGGAGTATGATGCATTAGTCTTCTGGCGATAGATTGTTCGCTGGATTTTAATGCTGACGATAGATTGGTGAAAGGGTTGTAGCACTGCCGATAGATTGGTCGTTGGATTGTAATGTTGACGATAGATCGGTGGTCATTTGGTTGTAACATTGACAATAAATTTCATTGCATTGTAATGCTGACGATAGATTGGTCATCGGAATGTAGCACTGATGATAGACTGATTATTGAGTTGTAACACTGACGATAGGTTGGTCATAGGGTTGTAACACTGATGATAGGTTGGTCATAGGGTTGTAACACTGATGATAGGTTGGTCATAGGGTTGTAACACTGATGATAGGTTGGTCCAACACTAATAATAGATTGTTCATCTGGTTTTTAACACTGAGATCAGATGGTCATCATACTAACAATAAAATGATCATTCGGTTATAACACTGATGATATAAAACTGATCATAAGACTTTAAGATGGATGATAAGATAGGTCCTTGTGGTTACAACCGCTGATAAGGTAGATCATTTTATAACACAGACAGTAGGATTGATTATCAACTATCAAATTAAAAATTAAATTGGTGACCTAGTTATAAACTGACAATAAAACTGGTCTTCAAGTTACAACACTGACAGCAAGATATTTCACCTGGTTATAAGACTGACAATGTGATTGGTCAGCTGGTGATAAAACTGACAGTATGATTGGTCAGCTGGTTATAAAACTGACAGTATTATTGGTTAGTTGTTTATAAAACTGATGATGTGATTGGTCAGCTGGGTATAAGACGGACAATACGATTGGTCTTTTAGTTATAATGCTGATAAGATTCTTCCAGTGTTTCCATGATGACATCTAGATAAATTTTTAAAAACTACAATATTACAAGATGGACATCTTCCAGTGCAAACGTGTATGAAATGTTCTTCAAAGATGAACACTTCATCAACAAATTATCATTTTTGTTTTCTTTAATTACCATGAGCTATATTTTCTTTTTGCTTACTTAATTACATAATGGTGTTTTCCCCTTTCATTGTAATGTAATGGTTAATGTTGACAATCATGTTCCATACAATGTTTGACTTGCTTAGACTGTTCACCTCCTTTGCACAGTAGTTAAAAAAAACGATAGTTCCTTAATCATAGCTGCTATGTTAAAAAAAAATTCACCACACACCATTATTACTTTAATTTCTGTAGCATTCCTAGTTTTTAAAAATGGACATCAATTAAATTCTCTTTCTAATTATTTAATTAAATAGTCCTTTCCTGATTAGTTGTTAGGTCCATGGGATAAATGGACATCTCTTGCATTCTGAGCACAATATTGTAGGAGAACCATCATATTCCCATGTAAGCTAAATCAAGCCAGATTTTAAAAAGATTTTTGGATTTTAATGCTACCCAAAAAGTTTTGTACCGTGTCCAGTAATCACCTTTTCTTTTCAAGACCCATATTTTCTAAATTTGTTGTTTGGACTTGACATCTGATGCTTTTCAAATCTATTTAAACAAGTTTATTATGACTGTGCCACCTTATTTAAGGAATTATGGTAAAAGCTTTTTTCTTTTCAATTTGATTTATCAGTGGTTTTTAATATATAACAGGAAATAGGGAAGTCTCTTTTCTTTTTTGTTCTCTTTTTTTTGACTTCCTTAAGACTGGTCCTGTCTATGAGAAGGGCATATAAAAGATCCTTGCTCCTTGGCTGGTTTATCAGTAGCTATAACTCAAGGCAGCAGTGGATTTTCTGACTGGATCTCTCTC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Transcript

ctg331-5.0-1

Protein

Gene family

Gene family	Subfamily
-	-

Pfam domain

Pfam accession	Pfam name	Description	Type	Source
PF00069	Pkinase	Protein kinase domain	Domain	Interproscan
PF20929	PDCD10_N	Programmed cell death protein 10, dimerisation domain	Domain	Interproscan

InterPro

InterPro term	Type	Description	Source
IPR000719	Domain	Protein kinase domain	Interproscan
IPR011009	Homologous_superfamily	Protein kinase-like domain superfamily	Interproscan
IPR017441	Binding_site	Protein kinase, ATP binding site	Interproscan
IPR046409	Homologous_superfamily	Programmed cell death protein 10, dimerisation domain superfamily	Interproscan
IPR048288	Domain	Programmed cell death protein 10, dimerisation domain	Interproscan
IPR050629	Family	STE20/SPS1-related Proline-Alanine-rich Kinase	Interproscan

PANTHER

PANTHER term	Description	Source
PTHR48012	STERILE20-LIKE KINASE, ISOFORM B-RELATED	Interproscan

Gene Ontology

GO terms	Category	Description	Source
GO:0004672	Molecular Function	protein kinase activity	Interproscan
GO:0004674	Molecular Function	protein serine/threonine kinase activity	Interproscan
GO:0005524	Molecular Function	ATP binding	Interproscan
GO:0005737	Cellular Component	cytoplasm	Interproscan
GO:0006468	Biological Process	protein phosphorylation	Interproscan

KEGG pathway

KO	Enzyme	Enzyme ID	pathway	mapID	Source
-	-	-	-	-	-

Expression pattern

1. Expression trend for ctg331-5.0-1 global RNA-seq network