Gene detail

Detailed information of ctg296-2.3-1 in Gigantopelta aegis Gene info

Gene ID	Annotation	Chromosome	Start	End	Strand
ctg296-2.3-1	FATTY ACID ACYL TRANSFERASE-RELATED	chr6	87777460	87802146	-

Gene Structure

More details in Jbrowse Sequence

CDS

ctg296-2.3-1

ATGCCACGTCTCAGTGAACCGCAGAGAAACAATGCCATCGGCCGACTAGACGCAGGCGAATCCAGAACGGCCGTTGCCAGGGCATTCCATGTGTCCCCAAGCACCATCTCCAGACTGTGGGACCGTTACCAGCAACATGGATCAACACGTGACCTCCCTAGATCCGGTCGACCACGGGTCACTACCCCCGGGCAGGACCGCTACATCCGGGTACGCCACCTTCGAGAACGATACCTTCGGGAACGATTGACTACTGCCACCTCCACAGCCGCAGCAATACCAGATCCAAGAACAAAAAACTGGTTTTTACTGAATAATAACCCGTTTCCGGTATGGATTTTGACCGCTCTGTACATCACAGTGGTGTTTGTGGGACCACGCATTATGAAAAACCGTCAGCCGTTCAACCTGCAGATGTTTATGATTGTCTACAACCTGGCGCTGGTCGGTCTGTCCATTTACATGTTTATAGAGCTATTCCTTGGAATATGGGGAGCAGACTATAACCTTTGGTGTGCCTCGTACAGTACAGACAAATCTCCAAAGGACCCGAGGGAAAATAGAGTTCAGTTTGTGATAACGTTTGTCCACACGTTCAACTCTCTGCGAGTAGGCTGCGACTTCCCGCACTGGGGCCAGAACCTACTGGCTGGATACATGCTCATCATGCTGACACTGTTCAGCAACTTCTACCTCCAGACGTACATCAAGAAGAAGAAACGTCTCCATCACAAGTCACATTCCAATGGAGGCATTGCCGACTACGAAAAGAAAGCTGTCATCAACGGCGACAAGAATGGCTTCATACACAACAAGGCTGATTGACGATGGATGGGTGGCAGTATGCAATAGTGCTGAAACTGGCAGTCATGTTTGCCTAACAGACTGACGAACATGAAGTGCAACTGATATTGTTTTGTCATAATTGTTTTTGTGGGTTTTTTTGTGGGTTTTTTTCTTTTCTGTTTATGTTTGAAATGTTATGTTTTTGTTTTGCCAACATGTGGTTGGTGTCTGAACGTAGGTTTAGTATGATAATATAATATACATCACAGTGCTTAATGTTTCTGTCGAAACGAAGCCTGTTTACTCATTGTTGTCCCACCAGTGCTCAGATTATATGCATGTGTAAAAGAGAGTTCCTTAACTACAGGCTATGCAATACATAGATTCATATATACATGTTTACCGTATACTCTCATGTGTATTGCATTAACATGCATAATGCTCGCTTCCATGATTTGATATTTGTAATAAGATTACGGTAAATGGAGAAATAAGCCTGTGTTTATTAGTTCCACTTACCATTATCGTGATTTCACTCGTTTCCGCATACAAGTTTATTTATTAATTGCATTTACACAGTACTTTTCCCATATGTTATTCCGCCTGTGGGCATTCATCACGCTAAAAAAATATGTCAATTAGCAGTTAACGTGAAGTGTTTACTTTCAGCATATTGGTACACTTCGACGACGTAAAAGTTTGTAATCCACTTGCGAAAACACAGATTTGGAAAAGCACATTCTTACACATGAAAACGTGCATAATAAATCATGTGTGGAATTTCATTTATGGAAAGTGGGCCTAAAGCTTGAGTCTGAAACATTACATTTCATTCAGATTGAATGGTGATTGATGAACATCCTAAGTTTGAGTCTCAAATTTAGACCCCAATGAATAATTGTCTTTTGTCTTGTTAGACGAGCTACCCATACTGATGCATAAAGAATGGAAAATGTCGGCGAATGATTCTTTTTCTGTTCTGATACTGCAAATGTCAGTATTGATTTCAATAGAGCTACATTGTAACAAATTACTTAGTTTGGCCTGTCTGACTTTAAAAAAAAATCCTAAAAAAATCCTAAAATATCATGAAACTATTAAAACAATTGATGATTAAATTTAAAAAAAACCTTTTTAGTGACCCAATATAAAACATTTAAAATTATTGGCTTTGAGTATATTGATTGACATTCTTGACCCAATCTAGATTAAAATCATTTGGTCTGAGGAGATGGAATCATGAATTCAGATGGTATATATTTTCACATAAACTGGCAGATACCTAAAATATATTGATTTCCTGTTCATATTTGATGCTGATGTAAATGGAGGAAAGCACTACATAATATTACTTGTTGATTCAGTTCAGACTCTTCAAGAATTGATCTCATGGGGTGGAGGGTGGTGGAGCTAGGGAAAGTTTTACTGTATGCCCACCATTTACTGAAATACAAAAACGTGCTCTTCCCGCCTCCCACATGTGATAGATTTTTGGGCTGTTATAGCTATTACAGAGGTTTCATTGTCCTGTCCAAGCAATGACCTCTCTTCCCCCACCTCCCAAGGTTTTCGTTCTCGTAATTGTATAAGAATAACATTGTGTTCAAAGTATGCAGGATCAGGAAACAAATGCAGTGTAGATGGCAAAAGTCCTGTTGATGAATGCATTAAAACAAAAATTAAGGTGGATCTGTTGGTCGAGTTGGAATTTGACTGCTAAATAAATAAACCTATTTCTGATCAAATTTGATGTGTTTAACATCATGTCAACACACACTGCAAAGACTCAACCGAGATCTGGCCTAGTGCTTATAAAACCTTTAAGAGTCTAGACTCAAGACTATAATAAGAGTCTGTATGTATGTGCCTGACGTCATTAGAGATTAAGTCTGGACTCTAAAGGTTTTATAAACACAGGCCTGGAGTCTCATTTCCATAAGCCAGCTATCAGAATGGAAACCAGTACACATGGAGTGATGACCTAGACCATAAAAGTTTCTTATTTATCGTTGGATCGGATATTGACATCTCTCTCCTCCTCCGCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCCTTCCCCCCCCCCCAGTTGTCAGCCAAACTTAAACCTAGTGAGTAATTCATAGTGAAAATGCAGCCAGCCTAACCAGTTTGGCAGATTGCACACTGGCATATTGTACTTTGTACTTTGTTTTATAATACTAATCATTCATCCTTGCCCTATGATCTTTGATAATCTTATGAAAAAACCCACCCCAAAAAAACAAAACAAAAACAACATTACTGTGTTAAACATTGTCCTCGTTATAGGCCTTGTAGATAAGATAAATAATGATTTGAATAGAGGACATTGTCCAACCCCATTCTGAAAATTTAATTAATTTGAAAGTTTTTAGACTAAAATTAGTACAGTGTAGTAAGAATACAGATTCCTATTCAGCATATTTAATAGCTCTATTGTGGTTTGACTCTGTAACGTGTGTAATTGGTATGGGCCTGCTGGTATGCTGAGCAATATAATATATGTAAATTGTGTTCTATTATGGGAATGAAATAATTTGTGTAAAGAATTCCTAATTTCAGTGAATCTTTGGCCAGCTTTCCATCAACACGATTAGTTATATTTCACAGTACCTTTTTCATATTCATGTTTCCACAGGTGAGCATAATGTGCATGGAGAAAAAGATTGATCAGAGAGTTTTCTGTGCTTAAAAGGAAGTGTTGACTGCATCAAATATTTTATAGTCATTGCAGATATGGAAATGTTCATTTTCATACACCGCTAATAGAATGTGGGAGTCAATGTCAACTATTTGATGTCTTTTGTATGAATACTTGCTATCAGTTAAAACTGTTTCTGTTTAGAAGATCTCTTTCCATTTAATTTAATCATTCCTGGTGGAATTTTATTTTCCAACTGTTAACCTGTTTTAGAATTTGATTTAATGGGTGGGCTATTGTAACTGGAAGGATACAAGTCTGAATTTTTGTTTATCCCTGGGCTCAAAGCTTTGAAGTGAAGTGGACTTTAAATTCCTTAATTTGTAATTGACTTAATTTGTAATTGACTTAATTGATATTTCCCTTCATAGGTTGCTACCCCCTCAAGAAAACATCCAAAACCCTAATGATCCTACCTGTAACAAAAGACAAAACTAGAAAGCGTTTGAATAGTTACGTTTTGAATGATTTGATTTTTGCACCTAACATTTGTGTGTTTGTCTAACTGAGGTAATGAGTTGAAAGTGTTGTCAGATACGTGTATTGTAAATTCTTATCATTTTTTCACAATTTTTCTTTTTTATTGTTTGAAATCCAATGTATATGTGAAATAGTTTCATTGATGTATAAATTGTTTGTTTGTTACCCAATTACTTATATTAAAACATGAACCCAGTTTCTTTATATAGAACATGAACAGTTTGTAAAGAACTTGAACCCAGTTATTTTATGTAGAACATTAACTATAATAATAATAATAATAAAATTTTATGTATAGAAGGTAGCTGTCAGTTCTAGACTATTCTCCCCTGAGGCCTTCTTACTAATTATAACAATAATAATCATAATCATAATCATATTAATTATTAATGCAGTTTATATAGAATTTGAACCCAGTTACTTTATACAGAACTACACCAAATACATTTAAATTTTTATAACAACCTTTTGTTAGCATGTTAGTATGATTATTTGAGTGTTCACATCTAATGTGATGATTGTGCAATGTCGTAGTTTTGATGAGCTATCTGACAAGTGTGCACAGACCAATCTATGAGATTCAAGAATAGTTTCCATTTTGTGTTCTGTTGGTGTTTTGGAATGTCCAAGATTATTGTGATTTCTTTGAAGATTGTTTTCATTAGTGCATCTTGACAATCTTCGTAAGATATTTGTTGAAGAAACATGTTTGTGTAAAACCAGTTAAAAAAACAAAACTGTTCTACAGGTAATCCCACTCGGAAAACCGTTATGTAGCCACACTCCAAATGTTTCACAATGTAACAAGCCTAGCAATTTACCTTTTTTTTTCATAATTATAATGACATTGGAAATAAACATTGTGTTTTATGCAGTGGTTTGAAATATGGAGTTTACTGCAACTCCTTGTTAGGTATTTAAATATGGAAGAATTTATCCTTATTTGTGGTGCATATATTTATTGCTAAGAATATTGAAT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Transcript

ctg296-2.3-1

Protein

Gene family

Gene family	Subfamily
-	-

Pfam domain

Pfam accession	Pfam name	Description	Type	Source
PF01151	ELO	GNS1/SUR4 family	Family	Interproscan
PF13518	HTH_28	Helix-turn-helix domain	Domain	Interproscan

InterPro

InterPro term	Type	Description	Source
IPR002076	Family	ELO family	Interproscan
IPR009057	Homologous_superfamily	Homeobox-like domain superfamily	Interproscan

PANTHER

PANTHER term	Description	Source
PTHR11157	FATTY ACID ACYL TRANSFERASE-RELATED	Interproscan

Gene Ontology

GO terms	Category	Description	Source
GO:0009922	Molecular Function	fatty acid elongase activity	Interproscan
GO:0016020	Cellular Component	membrane	Interproscan
GO:0019367	Biological Process	fatty acid elongation, saturated fatty acid	Interproscan
GO:0030148	Biological Process	sphingolipid biosynthetic process	Interproscan
GO:0030176	Cellular Component	obsolete integral component of endoplasmic reticulum membrane	Interproscan
GO:0034625	Biological Process	fatty acid elongation, monounsaturated fatty acid	Interproscan
GO:0034626	Biological Process	fatty acid elongation, polyunsaturated fatty acid	Interproscan
GO:0042761	Biological Process	very long-chain fatty acid biosynthetic process	Interproscan

KEGG pathway

KO	Enzyme	Enzyme ID	pathway	mapID	Source
-	-	-	-	-	-

Expression pattern

1. Expression trend for ctg296-2.3-1 global RNA-seq network