Gene detail

Detailed information of ctg29-3.2-1 in Gigantopelta aegis Gene info

Gene ID	Annotation	Chromosome	Start	End	Strand
ctg29-3.2-1	DELTA-AMINOLEVULINIC ACID DEHYDRATASE	chr10	72973563	72994146	-

Gene Structure

More details in Jbrowse Sequence

CDS

ctg29-3.2-1

GCCATGCATGACAATGAACATGTATGCATCTGCAGTACTGTGCCACTCGAGAAAACGTTTCCGAAACTGATCATGAGATGGGTCATGTGTGATCGTTAATTTTCACAGTAATATTTTTAACAAGACAAAATAAAAAAGTACTAAAATAATTTTGGGACAATAGTCTAGTTTATGGGCTAAAAATGAGGTCATGGGCGGTCTATAAATAGCGGGGTCAACGATCCACATCTACTGCGCCGAATCACCGGACATGCAAATCATTTTGGACACAAGGGGGTGCCTATATTTATGCACCATTTTAAAATGTTTATTTACTACAGACATAAAACAATTTGTAGTGTATTTCAGATTATGAACTGCTTCATTGGTGAGAGACACATTTCATTAAGTATTTCACAGTGTTCACATAGAAAATGGTCCTTGAATGCTTAGATGCGCCGATACGTGTGCCGGACAGCACTGTAGCTCTTTAGTCGAGAGACGCGTTCCATGTCGAAAGGAAGCCACGTGATTTTCAGCTGTAGGTCGGTATCCGGTCGGCAGTCGTCAGCATGGCCGAACACACTGTTCTTCACAGCGGCTACTTCCACCCCTTACTGAGGGACTGGCAGTCCGGCAACACGGCCATCACGCCAGAAAACCTCATCTACCCTCTGTTTATTGTGGAGGACCCCGATGCGGTTCAGCAGATATCGAGTATGCCTGGTCAGTGTCGGTATGGTGTTAACCAGCTGCAGGAGGCGGTGGCGCCGCTCGTGAAGAAAGGTCTCAGAGCGGTGCTGCTCTTTGGCGTGCCGGAGAACATTGAAAAGGATGCACGGGGAACTGGGGCGGATGTTCCAAACTCACCAGTGATTGCAGCCATAAAGTTGTTGAGAAAAAGTTTTCCTGATCTCCTAGTCATTTGTGATGTCTGTCTCTGTCCATACACATCTCACGGACACTGTGGTATCCTGCGGGAGGATGGCAGTATTGATAATGAACCCAGCATTGCCAGGTTAGCCGAGGTGGCTGAGAATTACGCAAAAGCAGGCTGTCAAGTGATCGCTCCGTCTGACATGATGGATGGCCGGATTGGAGCCATCAAGAAGCGACTGCGTGCAGCCGGACTCGACAACAAGGTTTCAGTCATGAGCTACAGCGCCAAGTTTGCATCCAGCTTTTATGGCCCTTTCAGGTCAGTAGTGAATTTAATGTCTAACACAGGGCATTTGGCACCATTATTGACACTTCATACACCATAAATAGTGCTTATCTTTAGTTTTGATGTTACAGTTCACATATGAGATGCTGCAAAGAGTGCCCCGTCATTTGGAGATCGAAAATGCTATCAGCTGCCTCCTGGATCAATTGCCCTTGCTGAAAGAGCTGTGAAACGAGACGTGGCGGAAGGGGCTGATATGTTGATGGTGAAACCAGGAACTGCCTACCTCGATGTTGTCCGCATGGTCAAGAAAAAGTATCCAACTCACCCGCTAGCAATCTATCAGGTGTCTGGAGAATACGCAATGCTATACCATGGTGCCCAGGCTGGTGCTTTTCAACTCAAATCTGTTGTCATGGAGACACTGACAAGCATGAGAAGAGCAGGAGCTGATATAATCATCTCATACTTCACACCACAGTTATTGGACTGGATTAGAGAGTGATCGGTTGGTCATCTTCAATGGATAATGAACACAGTTTTCTAATATCCTGGAATTCACTGAGATGGTTTCTCTTGATCAGGGGCCTAATTCACTAAACTCTCAACTTTTAGATCTTGCAGTGCAATGCTAAAAGACTTGCAAAGAGGATGCTTTGTTGTCTAGCAGAGCCTAAGAGAGCTTTGTGAATTAGGCCCCTGGGCATTATTACTAACGTGCTGAACATGAGTGTCAGAAGATGATAGCAACAAGGAGAGTGGTCACTTGTATATTAATTCTTTTTTCAACGGTGGGGCCAAAGTATTATTTTAAGAGTTTGGGCAGTGCCCTTTTCCCATGCCCCTTCTTCCCCCCCCCCCCCCCTTTGCTTCAGATGCCTATGCTGATATATGTGTGTGCCTGAATGTAGATTGTGTTACATGTGAAAGCAAATTAACATGGGTGAGCCAAATTTATCAAAGTTGATTTTTGCACATTTATTTTAGAGTTATGTAAGTCTTCAGTGCAAACAAAATAAATGTGTGTACTCGATTAAACACCAGGGTTTATAATAAATTATTCAGTATTCGCTGCCATTTTGGGAAGTTACATGTGAATAAGGAATAAATACTTTTCAGTAATTTAACCATATATCTTAAATTTTAAAAAAGTAAGAAAGACGCAGATGATAGTTATATATAGGATGTGTATTTGTATTCACAAGGGCAAATGTTATAACCTTTACACAGTGCCTTCTTTACCAGATTCAACATGTAGTGCATATTTGGTAATAGTCTTGGGTCTCATTCACCGAACTCTTGTTGCAATTTTGCTCTCTCGCAGTGTAATACGAAACAACTTGCAAGGATGATGTGACATTACTTAATTAAGAGATCTTTGTGAAGTAGACCTCAAGCCAGCTTCTGTGCAAGTCACTTTTGTGCTCACTGTGATGATATATACTGCCAGGTTTATTATTTACCATTTGCATGTTCTATTCCCACGGTTAAAACAAAATGTTTTATTTCTGTAATGTACCAAAATTATAAAAAAATTAATTCACTCTTAAGGTACACATTTTAAATACTTGCATCAAGACATTGTTTTACTTGCCAAACACATACAGTTGTTGAGATTATTAGAAAATATTTAAACTTTTTTTAAAATTATATACCTAACATGGACCATTTGATTTAAAAGACATTGTGTTTTTTGTGTAAAACGTTTGTAACATACCCTATATTTAAACAGACTATCAATGTGTACTTAAAGATTGAGAAACCTGGGACACTTGAGTTATTGAGAACCCATGCCATAATTACAGCAAGTCGTAATACTTGGCAAATGCTAACTGATTTGATGCGGCCAAGTGTTAATTCACAAATCGCTAGCCACTTTACGATCTTACAGTGCATTACAAAAGGACTTGCAAGGACAGTGCAATGTTACTTAGGAGAGCTTTGTGAATTGGGACCCTAAAGCACCATGACTGGTATATTAAAGTCTTTTTCTTTTGTTTTTTGCAAGAAATGGTAAATTCTTCACAATGTACTCGCATGGAATTTATTTTCAGTGTGTATAATCACCTGCCAATGTGACTGGTATTCCCAAAGTCAGATTTTACATTTTTTTTAATGTATGTGTTTATGATCAGTTTCTGATCAGCTGAAGTATTGCAAATTTTATAAACATCTTGATAATTTAGTACGTGTACTAAGTAAGAAGCATTTCTAAAAGGTATTTATGAAAATCTTGTTCTGTCAAAATTTTGGTGCTTGTCAAACATTCACAGCATGCAACAACTTGTTTTGAGCTTTTGATCATATGGCCACAAATCTTTTATCTTTCATTTAGTGGAGTTGTGGAAGCAGGTTTCCTCTTTAATTACCTCTGTGGTCCTTAACCAGTGCTCCAACTGGAATTAAAATGTGTTAAACCTTTTCTTTCTTTCTTTCATATAGCATAAATAATGGTGGCCACATCAGTACCATCAACATATAAATGGACGTAAATGAATTAATAGTATATTCAGGACTAGCTCTAGCAAATTGTGAATTTCAAAAACAATTGGCAAATTTTATTTTGGTTTGGTTTAGCCCTGATATTCTTAGCAAGATAATGTACATTTGACCAGAAATTTAAGACAATATTTTTTTAGTTCCACGACCCTTTGAAACATCTCCACTGAATTTGCTGTCATGAATCCTTTACAATATATACTTGCCGAAAAAGGTTCCTGTGCCCCAAATAAAATGGTCTTAAACCAACTAAAGATGAATTGGTCGAAATTTGTGACTAAATGGATTGTCTATAAAGCATAATTGTGCAATTGACTCACTCTTTACAATTTACCAGTAAATAATTTCATAAAAATTATTTGATTTTTCATTTAATACCGTTAATATATACCGTGTGCAATACATACATGGGACCGTTGGGTGTATGTGTGTGTATATACATATGCACACATTTTTGGTGCATACTATTTTCTCAAATGGTGCTAACTACATTAGTAGTTTAAGTTTAGGCAGTAGTACAAAATATCATTACTTTATTTTCAGTAAATGTAGTTTGTTTTTATAAAAGTTTACTAATTTAAAAATAAATTATTCTGCATTTGTGAGAAGAAGAAAAATCTGTTTTATTACAAGAATATTCCATTTAGGTTTTTTGCGGCCCACTTTTAAATATCTGTACATAAGAGAACCTCACTAAACTGGATACCTCTTAATAACGGACATTTTGCTTAATCCCTAGGGGGTCCGGTTTAGAAGAGTTTCACTGTATATCAAAAAACATGTTACCACTTTAATCCTAGAAAATATAACTTTCTGATTATATATTACAAAAATTATGTCAGTATTATGATCACTATCAAAGTAGCCCATTTTTTAGCTGTTTTTTGTGGTTTGATTTTCACTAGTTAAACTAGTTTTATTAGTTAAAAATCATAAACGAAAAATTATTTTGTTTTGAAAACATTTATTTTATTATATCTATAAGTAACTGAATATTTTTTTTTATATGAAAACAAGTATTTGATACCTGTGAAGACATGCATTTGTATTTTTAGGCCTATATATAGTGTGTTGTGTTGTAGTGTAGATTCTGTGAGCAGTTTTGTTGTGGAATTCATTATAATACTGCAAATGACAGAAATATGTGATCATTTTTTTCTCACAAACTCAAGTGGATTTGAATGTTTTGATTTAATTAACCAGAAAATCAAAAATTGTTAGGTACATGATTTAACTTTTGCTTTGACTTTTAAAGAATAACTCATATTATGATGTTTAATTCTCACTCGGTCTTTCAGAAAGTTGAACCCACTTTTAAGTAGGGCAGTTCAAAATTCATATTTCATAAAGCGTATTA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Transcript

ctg29-3.2-1

Protein

Gene family

Gene family	Subfamily
-	-

Pfam domain

Pfam accession	Pfam name	Description	Type	Source
PF00490	ALAD	Delta-aminolevulinic acid dehydratase	Domain	Interproscan

InterPro

InterPro term	Type	Description	Source
IPR001731	Family	Delta-aminolevulinic acid dehydratase	Interproscan
IPR013785	Homologous_superfamily	Aldolase-type TIM barrel	Interproscan

PANTHER

PANTHER term	Description	Source
PTHR11458	DELTA-AMINOLEVULINIC ACID DEHYDRATASE	Interproscan

Gene Ontology

GO terms	Category	Description	Source
GO:0004655	Molecular Function	porphobilinogen synthase activity	Interproscan
GO:0005829	Cellular Component	cytosol	Interproscan
GO:0006783	Biological Process	heme biosynthetic process	Interproscan
GO:0008270	Molecular Function	zinc ion binding	Interproscan
GO:0033014	Biological Process	tetrapyrrole biosynthetic process	Interproscan
GO:0046872	Molecular Function	metal ion binding	Interproscan

KEGG pathway

KO	Enzyme	Enzyme ID	pathway	mapID	Source
-	-	-	-	-	-

Expression pattern

1. Expression trend for ctg29-3.2-1 global RNA-seq network