Gene detail

Detailed information of ctg1811-0.9-1 in Gigantopelta aegis Gene info

Gene ID	Annotation	Chromosome	Start	End	Strand
ctg1811-0.9-1	SALVADOR FAMILY WW DOMAIN-CONTAINING PROTEIN 1	chr4	86630475	86652715	+

Gene Structure

More details in Jbrowse Sequence

CDS

ctg1811-0.9-1

ACACAAGTCGTAGGTATTTCCTATCGGTTCTTGTTTGTTGTCAAAGTAAATTTATCATTTTGTTATCTACTGTTGCATCGATAGATTATTAAATCATGCCATAAGAAATATAAATATGATTTCTTCCTAACTACTTATTTTTCAAAATGCAGGCGTTCCATTTATTACCTGAACACCTATTAATAGTATTATTTGCTGGAATTTAACAGGTGCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCTCCATAATTTAAATGGCAGTGTTACTGTAAACATGTTGCAAGTAATTGTTACATTGTTTCCACAAACAATAATTGTTTTTATTGCCTGTTGGTAAAAAGAGACCTGTGGTTATAATTATAATAGTTCTGTACTTGACAAATTGAGAAGGGAAGATAATAAATGTGACATGGATAAGCGAAGAATGCTTTCCAAGAAAAAGGACTGTGGACTCAATGAAGGCATAGCAGGAAGATATGTGAAGCGGGATACACCACCAGTTCTTCGCAACTACCACACACCTGTAAGACAAGCCAACACCTCCCAGCGGCGAACAGCTAAAATCCCAGCATCTTACATTCCTCAACATGCACCAACTAACCCCATTTCAAACCCAGTCTTATCTATGCCGACTTCCCAACCACGAGTTCCTGGACAATCGCTGCACTACTCGCCACTGCCGGTTAACACATCCATCATACCTGAGCGTCAGTACTACTACCAGCAGCACCTTACTAATGCCTCCATCAACCAGTTGTCTCAAGGTCTTCAGAACATCAGAGTTAGTGCCCCATCAACTTCAAGGACAGAGTCGGTGATGGCATCTAGAGGCGTTGGCGTAGCTTACTCCTATCCCATTAGTGCTGTTGGACAAGTCAGTACTGGCGGAATGCTACAGCAGACATCTCCGGGGTACTATCACAATATGTCGAGTCAAGTCTCAACCCAGCACCAGCAGCAGGAACAACAACAGCAGCAACAACAACAGCAGCAACAACAACAACAGCCGCAGCTGCAGAACCAACAGCCGCAAGGTCACCAGGTACAGACTGTCGCCTTGTATCAGCCGTCAGACGAACACAGCACAGCACCACTGGCAATGGTCAGAGAAGAAGACAACAAGGACCCAGTTACAACCCAGTATGCAGGTAACCATGGTAACTATGGCAACAGTGAGTACATGAATCTGCAGTATGATGAAAACTACCAAATCGCCCAGTACCACCAGGAGATCCGGAACCACTATGCCCAGCAGAACAGCGCGACGAGCCAGCCCACCCTGCCCACCACCGCCGTGTACTCGGATATAGATCACACACACAACACACAGCACGAGGTGCTTCCAGCCTCGTCAGCACCATCAAGTGGTTACGCTACCCAGGAAGAATTGCGTCTTCCTCCTGGCTGGTCTGAGGACTGGACGATGCGAGGCCGCAAGTTTTACATTGATCACAACACACAGACAACCCACTGGAGCCATCCACTCGAGAAAGATAGTCTTCCTACTGGCTGGGAACGCATCGAATCAAAAGAATATGGAATATTTTATTATAATCATACCACGAAACAAGCTCAGTATTTACACCCACTGTCTCCAATAGTGCCACAACACAACATGCTGATAGCGTACGGTAGACCGATCCAGACTGAATACCGACCACAACGTCAGAGTAATGTGCTGGTACCGGCCAATCCATATCTACACACAGAAATTCCTCACTTTCTAATGGTGTACTCTAAAGCTCCACCGGAACATGACCACAAACTCAAGTGGGAGTTGTTCCAGTTGCCAGATCTAGAGTACTACGATGCCTTGCTGGTTAGGTTGTGTAAAGAAGACTTAAGAAAAATAGTAATGGCGTATGAAGGATATCGAAGTGCATTATTACGAGAACTTGAGCGTCGGAAAGACGAACGACAAGAACAACAACACAGAATGTTAACACAGAATGTTGAGACAAAAGTATAGTGTGAACACTGTACATTGTGCAATAATTTATACAGCTTTTTGTGATGTGAAGTCTGTGACATTTTCTGAGGCCCTGTTTGGGTTTATAAGGAATACATCATAAAATTATTATTATTTTGGTGCCGTCAGCTTTGCATAACGTTTTCATCTCCTTGTTACTAATAAACATATATATCATGTTATTTTGTTGACAGCTGTTAAGTAAATCATGTTGAAATGATGTTGAAGGAAGTCATATTTTATTATTTTTAGTACAACAAATTTTCGATTTAATCAAAAGCAGGCAAAATGGATACTGGTGTCCTATTTTATTATTTTCGAGTACAACAAATTTCTGATTTTAAAATCAAAAACATTGAATGTTTTTCAGTTATTTATAATAATTTTCAAATGAGATATCTTTAAATCTTTTAATTATTTGCTCGAAGTTTTTTGTTCTGTACTGAGGTGTTACTACTTTTGCTTCAACTTCTGTAACATTGTTTGTGTCTACTGACAAGTTGAATACTGTTGAAACATTTTTGTTTAGAAATATCTACTCTATATTATCAGTGCTTACCTCCCCTTGTTGGTTGTCATTCATTCAAATGGCTAAAATTAGACTTACGTTAAGTGTTTGGGCTCATTTATTGCAATTACATTCATGTATGTTGGAATATTTATAATCATTTCACTTACATAGGGTGTACGATACCAAATAAAATCCAATAGGCAACAGTGTTAACATAAGTGGTTAAAAACATTCTCTGCAATATATTAACCCATAAATATCAGTACTACAACTCCACCATCAAAGTATTAACTGAAGAAAGGTGGAACCTTTCATTGCTCATTTTCTATCTAACCAGACATTTTTACAACACCCCTAGTTTCCCACAAAATTGTAGTATTTAGTTTTACAGGTACAGCACACATATTTCATGCATAAAGCTACTTGACACAGTGGTACTATGGTAGATGAAAATTGCTTAAGTTACAAAAAGACTATATGGGGAAATCATTTTTTAATGTTTTTCTCCATATCAAATGTCTTCTATTTTAAATGAAAAAAATTGCAGTATATAAAATGTTTTTGCGATTCATTAAAATGGCATAATGACGTTTGACATTTTTGTCTAAAATTCAGAACTGTTGTGCAGAGAAAAAGGTAACTTTTAGTATATTTAGTGTATGACAGGCTTCAGAATGTTCAGTCCTGGTGTTTTACATGCCCACGCAAGTCAGGAGCTCTGTGTCAAATGACTGATGAGCAGTCAATGTGCTAATCATTATTTTCTCTTAACATTTTGAATGCTTTAGTTATTTAATGATGAAATGGGTGATGTTTCAGAATTAATACTGAAACCACATCACAAGTGATAATGTCCATTTTAAGCAATACAATGATGTTTTTTTTAAATGGATTTTAAATATACTACTCAAAAGAATTTAAGGGTCAAAAATTTATAACCAAATAAGTTTCAGAGTGTATTAGATTGATGATGTAAACTACATCAAAAATTTAATTTATCATTCCATATTTGCAAAAAACACAAATAAACGTCACTGTATACAAGAAAGTCACATGACATGCTGTCAAAGTTGAAGGTTGTCAAACATGGATTTTACACATTAGAACATTCGTTTAATAGTGTGTGAATCCACCCCTGGCGCGAATACACTCGACACATCGTTGCCTCATGCTGTTGATCAGACGTCTGAAGAACTCTTGGGGAATGGCCTGCCACTCTGCCATAAGAAGTTGACCCAGATCATGAAGGTTGGCCGGAGGGGCATGGTTATCCCGAACTCTCCTGCCTAATTCGTCCCAGGCGTTCTCTATTGGGGCCAAGTCAGGCGAATATGCTGGCCAATCCATCCTGGCGATACCTTGTTGTCTGAGAAAGTCCGTTACCACCCTGGCGCGGTGGGGTCTGGCATTGTCATCCTGCAGAACTGCCCCGCCGCCAATCTGCTGAAGGCCTGGGAGAACCAACGGCCGGATAATCTCATTCAGATAGAGGATTCCATTCAGATTGCCATCCACCACATAGAGGGGGGTCCTGTGGTGGATAGAGATGCCGCCCCACACCATGACGCTGCCACCACCGAACCGGTGACGTTGTCTAATGTTAACGTCAGCGAAGCGCTCCCCAGGACGTCTGTAGACACGAACCCGACCGTCGTTGAACTGGAGACTAAACCTGGACTCATCAGTGAACATCACTCGACCCTACTAAACACGTTGCCACCGCAGATGAAACGTGCACCAGTGACGTCTGGCCGTTCTGTGACGTGGTAGGAGTGGTGGTCGAACAGCCTGGCGACGGCAGCGTAGATTATTGGCTCTCAGACGATTGCGTATGGTTTGATCAGACACTCGAGTTCCAGTCGCAGTCCGCAGATTGTCACGTAATCGACGTGCAGTGGTTGTGCGTTGACGTAGAGCCATATTGGTGATGTAGCGGTCCTCTCTATTTGTAGTGCTTCGGGGTCTTCCCGAACGTGGACGATTTCGAACAGAATTCGTTGCTAGGTACCGTTGCCACAGTCGGCCAATGACACTCTGACTGACACCAAGTCTCAGAGCAACATTTCTTTGCGTATTGCCATCCTGAAGCCAAGCAATAGCCCTTCCTCGATCTTTGAGAGTCAGTTGACGTCGTACCATTGTCGAATTTGGAGTGTGCACCGTACATGAACGCAAGCTCCAATTATACGGAAATTCAGCATTGGGAACATGGAATACACATGCAAAGCGTGCAAATGAAGCGCTTTGTGAAAAAGCAAGTTATGGGCACTTAGCAGACCTTTCGCTTTCGCCCTAATTTACGTGCAAATGTAAGCATGTTTTCGCCATTAGAACTAGTCGACAGTGTCAATGACAGTGGATTTTAATTCATTTATGGGTTGCTTAGACCCACTTTCGTCAAAATGGAACAATACCATGCGTGACATTATGGTCTAGCTAATATAACTGACATTCAGAAAATAATGTCAAAAATATCGTCTGACCCTTAAATTCTTTTGAGTAGTATATATACTAGTACATCTCCCT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Transcript

ctg1811-0.9-1

Protein

Gene family

Gene family	Subfamily
-	-

Pfam domain

Pfam accession	Pfam name	Description	Type	Source
PF00397	WW	WW domain	Domain	Interproscan

InterPro

InterPro term	Type	Description	Source
IPR001202	Domain	WW domain	Interproscan
IPR011524	Domain	SARAH domain	Interproscan
IPR030030	Family	Scaffold protein salvador	Interproscan
IPR036020	Homologous_superfamily	WW domain superfamily	Interproscan

PANTHER

PANTHER term	Description	Source
PTHR47522	SALVADOR FAMILY WW DOMAIN-CONTAINING PROTEIN 1	Interproscan

Gene Ontology

GO terms	Category	Description	Source
GO:0005515	Molecular Function	protein binding	Interproscan
GO:0005829	Cellular Component	cytosol	Interproscan
GO:0006915	Biological Process	apoptotic process	Interproscan
GO:0007165	Biological Process	signal transduction	Interproscan
GO:0008285	Biological Process	negative regulation of cell population proliferation	Interproscan
GO:0035329	Biological Process	hippo signaling	Interproscan
GO:0042127	Biological Process	regulation of cell population proliferation	Interproscan
GO:0043065	Biological Process	positive regulation of apoptotic process	Interproscan
GO:0060090	Molecular Function	molecular adaptor activity	Interproscan

KEGG pathway

KO	Enzyme	Enzyme ID	pathway	mapID	Source
-	-	-	-	-	-

Expression pattern

1. Expression trend for ctg1811-0.9-1 global RNA-seq network