Gene detail

Detailed information of ctg1520-0.0-1 in Gigantopelta aegis Gene info

Gene ID	Annotation	Chromosome	Start	End	Strand
ctg1520-0.0-1	PROLYL 4-HYDROXYLASE ALPHA SUBUNIT	chr8	78617725	78631407	+

Gene Structure

More details in Jbrowse Sequence

CDS

ctg1520-0.0-1

ATGGCCAAGTTGGTGACGTCTCTTCACTCTTTGGTAGCTGAAGATTGCTACATACTTGGGAAATATGCCTACTACTCACAAGACTTCTACCACACGTATTTGTGGATGCAAGCCGCCCTTGGTAGAGAATTACTCGAGCAGAACAAAACTGTGGCTCGGTCAGAGATCCTCGATTACTGTGCATACGCCACGTCTAGGCAAGGAAATATACGCCACGCACTGAGTCTAACAAAGGAATGGTTATTGTTAGACCCTAATCATGAACGAGCGAAAAACAACAAGCTGTATTATGAACGAATGATCCTTGATGAAGAAAGGAGAGAAGGAAAACGCGGAGACGAAGAAATTCCCATCAAGAATGAGCGTCAGGTTGACGACTATCGGAAGTCAGTTGAATTCACGTCCTATGAGGCGCTGTGTCGGGGGGAGGATATCATGGCTATAAAAGATGAGCACCGGTTAAAATGCCGCTTTGAAACGAACAACCACCCACTCCTGATGATTCGGCCCGTCAAGCTGGAAGAAGTTCATCTCAAACCGTGGATAGTCCTGTATCATGATTTTCTCAGTGACGCCGAGATAGAAACAATTAAAACAATAGCATTGCCACGGTTGAATCGAGCGACCGTCAATAATGTTGTAACCGGACAACTAGAAACAGCCAGCTATAGAGTTAGTAAGAGTGCCTGGCTGCAGTCACAAGAACACATACACATTGACAGAGTGGTCAACAGAATCGAGGCTGCCACAGGCTTGAACATGGAAACAGCTGAGGAGCTTCAGGTTGCCAATTATGGACTAGGAGGTCATTATGAGCCACATTTTGATTTTTCAAGGAGAGAAGAGGAAGGTGCGTTTAAGTCACTTGGGACTGGAAACCGACTTGCGACTATGTTAAATTATGGTGTTTCTGCGTTCTGGTACAACCTGTATAGAAACGGGCAGGGAATTGAAAAGACCCGCCATGCTGCGTGTCCCGTGCTGGTCGGGACGAAGTGGGTTTCAACCAAGTGGATTCACGAACTCGGACAAGAATTCCGCAGAAAGTGTAGTTTAAACCCAGATGAATAACACATGCACACACATTTACGTATCAAGATGAATAACATGTGCACATACATTTACGTATCAGAAGGTGCTAATTTCAAAACAAATCATTCCTAATAATACATGATTATTGTATTTTGCATTATATAAATTAGAGGAAATGCAACCAAATTTATGATGTTTTTGTAGTGTAATGTATGCATATTTCTGTTGTTACTAAAAAAAAGAGGTTTTATTTCACTGTGTGGAATAGTTTGCACTTAAATATAGCAGTCAAACGATCATTTTATAGTGTAATATATACCGGTAATACATATATCCTGTTGTTACCAACAAGTGTGTTATTTTACTGTATGGAATAGATGACACTTAAACTTGATCTTTTGGTAAGCATGTATTTTTCCCCCAGGCTGTAGTCAACAACCGATGGATCTCTTTGATTTAACCTCCAAATTGACTTTACCATTTGTATACAAAAGGTTGTGGGGAAAGTATATTATCGTGTATAAACAAAGATATAATAGTACCGGTAGCCTATTTACACTGTTTCCTTAGCTTTATTTGTATACACAATAGGTACAGACAACATGGTGGCCATGACAACTGCTGATGTGTCATTTCATGTAAGGGTCTCCTTTTCATTCGGTTTAAACATTGTACAGACCAAAAGATGTATAAATACAACACTGAGCCAAAATTATACAAGTTTGAATAATGTTGTTGTTTTGTAATTCAAATCTGTAAATAACTCTTATTATAATAATAAATAATATCATCTCAATTTTGCATTACTTTCGGCAATACTTTGAAACCGAAATAGATCCCTTCATTTGTTTTCTTTATTTCATATTAATAAATTGACTGTTTACATTAGTTGTTAAGTGTTGAATCAGTAAATGTTATCTATCAATGTACGACAGAATGTAAAAATTCCCTCATTGACAGAAAAAGCCGAAGCGCAGAATGGGGATTCCCCTTAATTTGTATATTAATTATCTGAAGAAAGAGTTTGAATGTTATTTCATAGTATTTTATGCCACTATACACACTTATGTAATTAATGGCTTCACACTCACAGTGGGTAAAGCGGTTCTGTTTCACATACTTAAAAATCATCGAAAATTATCACATTAAATTTTTATAATTCCATGTGAATAATAATTTCATTAATATAAAATACTATGAAGTAAAAATCAAACTCTTCAATTTATAATAAACGGAGTGTTCTGGACGAAAAGGAGACTCTTATATGAAACTGTCCAAATACAAATATTATTTGAATGTTTGTGTCTAGTCATTTCAAATGTTGCAAACACAAGTCAGTTTTTATGAGAAAGTCTCCAGGGTGAGAATGATTTCAAATTGATAAAATACTTCGGATGGGGTTGCTAGTTACACAATGGAACAATAGAAGTGTGTGTACTTTTATAGACATGGGTATTAATATACATATTCTGTCATATTGTAATAGTGAAGACCTTTCTTATATGTTCAGTAAAATATTGTTATATTTAACAATATTTTAAGGGGTTATGGAAATCCCCTGAAACATAGTTTAAAAAGAAAAAAAATTCCTGTGAAATAAAACAAAAAATTCCAGTACATAAAATATTTTTCCAGGAAGTTTTAACTACTTTCCAGAGTAGTTTTGAAAGCATTTTTTCAGGGTTTTCCTGATGTATCTGAACTCTAAAATCAGGTTTTGTTGTTCAACTAACAAAATATTTTTCCCTCACTACCCCCGGGTTTTGTACGATTTTATACCAGCAATGGTTTGTTTACAAATTTTATATTCCCTGGCTTGCAACTATAATAATGCAAAGTTAATATAAAAACTACTTAAGAAAAAAAAAATTCTTACACTATTGGTGCTAGAATGAATGTGAGCCCGGGCTGTTATTACCGTCTCATATCTCATCTGAACTTGTTATAGTTGTTTTAGCTAGTCTGTTTTATAGTCAAGAGGCTGTTGTGTCCATGAAAACAACTTTTAAGAATTGGTACCTTATACATACTAATCTCGGTGTTTACAGAGGTGACAAATCTTCACTAATAATATGCATCTTTTGTAGGACTTTGGGGCAAGAACAGCATAATTTTGTTGGCAGATTTACTTGTTTTTTATTATACAGATCTGAAATGTTGTTATGTTTAATGTATACCGACATCCAAAAGAAACTTTACATACATAAAATTTGATAAATATTGTTGCTAATCAAAAATAACCAATTAATAGAAATCAAATTAAAAAAACTTTGCATATATCACGAAGTGCATTATGTTTAGATTTTGAACTTCATGATGCTTTCATATCCCACTGTACCGTTTGTTTTTGGGGGGTTTTATAATACAATTTTAAGACTTGTAGTTTCTTTTGGACGTCAGTATAGTTAATTTTGTAGGACTATGGGGCACAAGAACAGCATAATTTTGTTAGCAGGTTTATCTGAATGTTGATACCAGTAATGTTGTTATCAGGTGGGACAAACCACACTCAAATGGGAGTCTTTTTGTTCATTTTGTCTTCCTAGTCCATAAATGTCGTTTTTCACAATCCAAACAGTTAGAAAAAAAAAAAATGGTGGAGCATTAAAAGCCATGTTTAAATTGCTTTTCAATCAAACATCATCGGTATATTCCGTCTACAAAGAATAATTAACTTGTTGTGGCCGTCTCTAGTAGTAGTAAACCAAATAACATCCGGTTGGGTCAAAGTTTGAGGTGCAACTTTTGATGAAGCAGTCAATACCACAAGTCCTGCCATTGGTGATAAATGTGACTGTGCTTGTTTAAAAATAAAATTAGTTTTATCTAAGCAAAAAATGTATGCAATTTTATTTCTTCTCATACCACTTGTGGAGTAGCCTTGTGCTTAAAACATGCATGGGGTACCTGTAAACAAAACACCTACTCCAATTTGGTGCTAAACTAGAGGTGTTGTAAAAATATCCAGTTATATCGAACATGAGCATTGAAAGGTACCGTTTTATTCAGTTAATACTTTGAACCTAAAAGACTGCAACAGATTCATATTTTTTAGGTTTGTATTGGCCTGACAAAGTTGGTGATGGATATCAAACTGAAAGAATGGGGATATGGAGGCAGTCAAACCTAACCCATGCATTAAGATTGTGAAAAATAGCAACATTTATGGACTGTTCCATATTTCCTGTATTCAAATATTTTTAACATTATTTGTTACAAACATTAAGTTAGGTGTTGATTGTTCAGCAGACAATACATGTACCTACCTTGTGAAGGTCCTAAATGCTCATGTCAATTGGTGCAGTAGCTTGGGAGTCTGGCCAGGAAACGCTTTGGTGTTTTAATTCCAAACTCTAACTCAATAAATGATTAACCGGTTTTTGACTGAATGTTATTGTTTTAAGGCCAAAATTATTTACTGGTTAACCGGTTTTTGACTGAATGTTATTGTTTTAAGGCCAAAATTATTTACTGGATGAACTATAAGAATTGGACAAATCTGATGACCAATTCAAAACAAGCATGTACTTAAAATTGTTGATCCACTGCTTTGATAATAAAGTGTTTTATATACATTTTGTGTCCATGTTTTGTTTTTTCTTTAACAACACAGACTAGCACCTGGTGGATCTGAGTGAGCATTGCGAAACAAATAGGGCCCCCATGTGTGCAGTCGCTTTTCACATCCTTGTTTTAGCACCGGCGTC

Transcript

ctg1520-0.0-1

Protein

Gene family

Gene family	Subfamily
-	-

Pfam domain

Pfam accession	Pfam name	Description	Type	Source
--	--	--	--	--

InterPro

InterPro term	Type	Description	Source
IPR005123	Domain	Oxoglutarate/iron-dependent dioxygenase	Interproscan
IPR006620	Domain	Prolyl 4-hydroxylase, alpha subunit	Interproscan
IPR011990	Homologous_superfamily	Tetratricopeptide-like helical domain superfamily	Interproscan
IPR045054	Family	Prolyl 4-hydroxylase	Interproscan

PANTHER

PANTHER term	Description	Source
PTHR10869	PROLYL 4-HYDROXYLASE ALPHA SUBUNIT	Interproscan

Gene Ontology

GO terms	Category	Description	Source
GO:0004656	Molecular Function	procollagen-proline 4-dioxygenase activity	Interproscan
GO:0005506	Molecular Function	iron ion binding	Interproscan
GO:0005515	Molecular Function	protein binding	Interproscan
GO:0005783	Cellular Component	endoplasmic reticulum	Interproscan
GO:0016705	Molecular Function	oxidoreductase activity, acting on paired donors, with incorporation or reduction of molecular oxygen	Interproscan
GO:0018401	Biological Process	peptidyl-proline hydroxylation to 4-hydroxy-L-proline	Interproscan
GO:0031418	Molecular Function	L-ascorbic acid binding	Interproscan

KEGG pathway

KO	Enzyme	Enzyme ID	pathway	mapID	Source
-	-	-	-	-	-

Expression pattern

1. Expression trend for ctg1520-0.0-1 global RNA-seq network