Gene detail

Detailed information of ctg1322-0.2-1 in Gigantopelta aegis Gene info

Gene ID	Annotation	Chromosome	Start	End	Strand
ctg1322-0.2-1	DED DOMAIN-CONTAINING PROTEIN	chr11	23284125	23306155	+

Gene Structure

More details in Jbrowse Sequence

CDS

ctg1322-0.2-1

ATGGCGTCTGAGACGGATGAAGACCAGCAGAATTTGCGCATTGACTTCTGGGCTCATTTATTGTCAGTAGACCGCGACCTTGGCACAGAAGATGTGGCTGCACTGATATTTCTATGTAGAGATATCCTTCCACGGAACAAACTAAAATGCATAAAAAGTGGACGCGAACTGTTCAAGTATCTCGAAGAAGACGAGTACCTAAGGTACAACAAGAGGTGGATTCTGGCCGAGATGTTGAAACTAATCCAGAAGCGGAGTCTGCTCTACAAGCTATGTGTCAAGGAACAAGATCTCGACTCACACTTGGCCGTGAACGTCTCTCCTTTATCTCCATACCGAAAGTTACTTCTGAAACTAGCGGATGAAATGACAAATGAAGATCAAGACATTTTATTAAGTTACCTGGTTGATATTCCAAAAGGGAAAAAAGAAAAGATAAAATCATCCTTCGATATTTTTGTTCTTTTAGAAGAAAGGAACAAAATCAGTCCACAAAATGTCGTTTTACTAGAGCAGCACTTCAAAACATCGTATGCTGGCCGATTGGACCTGTCGCTGATTGTTACAGACTATACTCGGAAGCTAGGTTGCTTACCACACAACCTTTCGATTGACGGTCCAGCTGAAGGAACTGCGATCAATTATGGAGGACTGTCAGGTTCCTTACCACACAACCGGTTTGACAGTCCTGCTGAAAGAGCCATGGACATATATCACAGACTATCAGATGGATACATCTCGCTAATACGGAACCTGAAACCTGGTACGTATGGAACACTACGCGTGAAGATCATCGACAAATCAACACTGAAGAAAAACACAAGAGGAGAAGAATACCTCTTTGTTATATTTGCCGATGTAACTGGCGAAATTGCCGGTATAGCGGTTAATGAATTAGCAAAACTCGTAAATGAATCTATGGATATTGGAAATGTTTACATGTTATATAACGTACGTGTGGTTCCGATGTTAAAACGTCATTGTAAATATACGTCAGTGGGTAAATCAGCTGATACGGTTCAAATTATTTTGGACAATAACACACGAGTAGAGACGTACACTGGCAATTCGACTGTTAAGTTCATAACTGTAAAGTTGTACGGTAAAGTTCTCGATGTGTCTAAGAGCAGGCAGCCATACGATGGATGCCCCGTGCACGACTGCACGATGTCCACCATACGTTTATCAAACGGCATGTATTTCTGCAGCAACTGCAAACTGAAATACTTGAAAGCGATAGCGCATCATAAGATGTTTTTAAAAGTAATAAATACAACAACCAATATTAAATTTGCCGCATTTTGTTTTGAAAGTGTAGCTTGCAAACTTCTGCGTGTTAGTGGTGACACATTTAATAAGCTGGAGAAAAGTGTTCTGTCCGAACGTTTTGTTAATAACGAGTATGAATTCACATGTGTACACAAAATTAAAAATGGTGATCTTAAGTACACAAGGCTTATTGATGCCAATTTGTGCAGCCTTGTTTAAGTGGGATAACTAATGAAGTGAATCATTCCTCATGTGTTAATGCGTAGTTCATAGTTATTGCATATTACAATGTTTATTTTATTATATTATTTATTTATTTATTATTATTTTATCTATTTTTTTTATCCCCCCTCCCCCACCAAGATCAATCAATGTCAAGGATGGGGGGGGGGGGGGTTGAATAATTGATTTATACATTATTTTTAACATTCATGTTTAGTTAATTGCAGAAATGTTTTTGTTTTTTGTGTTGTTGGTTTTTGGGGTTTTTGTTTTTTTGACGACTTAAATACAGTATTAAAATATGTCACAAAATTGTGAATATTTTAATTTCTATATCTTTTAACAGTGTAAGAATAAATTAGCTCCTTTTTTTCTTTCTTTTTTTGTTCCTACGTGGCAGTTGCATATCCAAATTGCATGAGAAGTGATTCAGTTCTTTGGTTGTCACTAAAACACATGTATAATGTAATCATGAACCTTTACATAAAAGTAAATACGATTTTTATATTTTCACTGTAGCTAAAATAGTGAAAATATGACTTTTTTTTTTTTTAACGGATATCACTTTTTATGGTTTCTGTAGATCTATATATTTCATTGCTATGTATATATAATATGTATTGTTATGGATGTCCATGTTTCTTAACCTGGACTTTTAAAATTAATTTTCTAATTTAATTTACTAATTTTTGAATCAAAAATATTATTGGTAGTAAATCTGAAGGCAGAGGTGAATTTTACTTGTAGCAGTTGCATTTCAGGACATCTAGTTTTCAAAATTTTAGGTGGGGGGGGGGGGGCATACCCCCAACCCTCGTAGAAAGTTTGCTTTACGCCCTCGATTTCAGTCAGCCCCCAATATCGACTTCCTTCCTGGTGTGCATTTAGGCCTACAAACTATAAATTGCAAACGGAAGTTGGACCAAAAAACAAATACTTTATTTATTGAGCAATTGTGTGCGTAAGATAATTATTAAATTAAATGGTATTTATTATGTAAAAGGTTCCTGGCGTAACGTAATCTCTGATGGGTTGTTATGACGTCACGTGGTACTTCTGAGACACTACAAAAGGCCGACGTCAGTGGACGTAAAAATTATTTGGCTAAATTCCGACCGCTCCTTCCAAATTCAAAAACCCATAGCACCCATACACCCACCCCACCTGCTACCAGCCCCGGCCGACCGGCCTCGGTGGCGTCGTGGCAAGCCATCGGTCTACAGGCTGGTAGGTACTGGGTTCGGATCCCAGTCGAGGCATGGGATTTTTAATCGAGATATCGACTCCAAACCCTGAGTGAGTGCTCCGCAAGGCTCAATGGGTAGGTGTAAACCACTTGCACCGACCAGTGATCCATAACTGGTTCAACAAAGGCCATGGTTTGTGCTATCCTGCCTGTGGGAAGCGCAAATAAAAGATCCCTTGCTGCCTGTCGTAAAAAGAGTAGCCTATGTGGCGACAGCGGGTTTCCTCTAAAAACAGTGTCAGAATGACCATATGTTTGACGTCCAATAGCCGATGATAAGATAAAAAATCAATGTGCTCTAGCGGCGTCGTTAAATAAAACAAACTTTACTTTTTTTACCAGCCCCGGCCGGACTGCTGGTGCTCCCTTGCACCTTCTAGTGCAGGTGGTCCTTCCTTCCACACACACACACACCCCCCACCCCCCACCTTTCCTGTCCTGGACGGAGGAGCCGGCACCTGTGCCCAGGACAGGCGTGCGCTGCAACAGCTTGCTCTGAATGTGCACGTTCAACCCTCTGACCTGACCTGACCTGAGGTAAAAATCCCCTTTCCAATGTCAGGCCTGCTTTACCGGAATCTCCTTTCAGTTTTTATCGGTTTTTATTATTGAACTAATAGCCATTTTATCCTCACTCAAGTGGATTTTAGTTCAAATACAGGTGACTACATCTCTACATAAATATTTAATTATTTCTGACTCTCTCAGCTCTTTACAGGCTTTACTTAAATCCAAGTTCAGCAGCTTTCAGTACATTAATTAATCAAAAAGGACATATTGTTACTTTCGATTGGGTACCTGCTCATGTGGGTATCACTGGTAACGAGATGGCAGATCAAAATGCTAAGAAAGCTTTAGATGATGACAAAATTATAGTTAAAAGTAAATATAATTTTAGAAAAATTATGTCCATAGCACAAAGTAATTTAAATACATTTTGGCAAAAGGACTGGGATAACAAAACTAGACTATGACACTATTTGATTAAACCTAAAGTTAACTCCCCCAGCCCTATTTCGGTCGATAATCAAACTACTAAAATAATAACCCGCCTTAGACTTTTGGCTTGATAGTGGATTATGTAGTGGCAACTAAAGTTATAATTTGAGACCTTTTTGTTATATGGTTAATATATAATTCTGAAGGTTAATCACGATTGAAATATCTACCTAACGCACCAAATTGTGCTGAGTTTGATTCCTTTTTTTTTCTTTTGTTGTTGTTGTATATGTTATACATATGGGTGTGTGAGTTGGGTGTGTGAGTTGGGTGTGTGAGTTGGGCGTGTGTGGTGACTCAGTTGGACATGCGGGAGCTGACTTTTGACAGTGTCGCCTTCTCCATGCTAATTTATTGTTTTATATTAGTAGGAGAAACGTTATTAGTGGTCTATAATGTAGTTATATTTTTAAGGCGCATGGCGTGTAGACTATAATTATTTGGTTCTATCTTTTTCTTTTAATAGTTGTGATGTATATTATGTTTATTGGTACTTATTGGGTCGACCTGTGCGACCGACTGCCATATCGCCTTCTGGTGGGTGGTGGAAGGGTGCATTTGTTTAGCCCATTTAACTACCTGTATGTATTCTTTTTTTTAACTTGGTTTTAATGTTGATGTTATAAATCCTCTTAGCATTTTTTATGTATATATGTTATATTTTGTATTACATGTATGCGTATTTAACACTTATTAGAATTTTATGTATTACATGTACTTTTAATTATGTTGTATGATTGACTTGTGTTACTTTTATTCTTTAATTTTATTATGTATTGGTGTTGGTATTAATTCCTCTTAGCATTTTAATTATATATGTTTGTATATATTTTATATATGATATGTGTCTCTTCTTTGCGTAGCCTTTTTTTTATCCTATTGCTCCAGTTTCAATGGGTTTTAATGTATCATCCAATTCACAACTCTTTTAACCATTGTCATGTTCATTTTATTGTGCCCATAACAGCTGTATGGATAACCATGGGGAGGGAGGGATGGGGGCGGGACGCCGTGATAGGGTGCGTCAAGGAGCGATAGGGCGTAGGCGGTCTTTGCCGATAGGGTGCCTGGTAGGAGGCCTCCCCTCCCTGGAACCCCAAACCATGGAAATGCGGTTTAGCAACTTTGGGCACCTTCTGGCCTGTCCCTTGGTGAACCTTTCTTCCAGGGCCTAAAAATATATTTTATAATTTAATTATAATTACCAGTTTTGGAATGCCGGATCTAAATTAAGCACCAACTAATCTGTTAAATAAATCAATGA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Transcript

ctg1322-0.2-1

Protein

Gene family

Gene family	Subfamily
-	-

Pfam domain

Pfam accession	Pfam name	Description	Type	Source
PF01335	DED	Death effector domain	Domain	Interproscan

InterPro

InterPro term	Type	Description	Source
IPR001875	Domain	Death effector domain	Interproscan
IPR011029	Homologous_superfamily	Death-like domain superfamily	Interproscan
IPR012340	Homologous_superfamily	Nucleic acid-binding, OB-fold	Interproscan
IPR051290	Family	CASP8 and FADD-like apoptosis regulator	Interproscan

PANTHER

PANTHER term	Description	Source
PTHR48169	DED DOMAIN-CONTAINING PROTEIN	Interproscan

Gene Ontology

GO terms	Category	Description	Source
GO:0005515	Molecular Function	protein binding	Interproscan
GO:0042981	Biological Process	regulation of apoptotic process	Interproscan

KEGG pathway

KO	Enzyme	Enzyme ID	pathway	mapID	Source
-	-	-	-	-	-

Expression pattern

1. Expression trend for ctg1322-0.2-1 global RNA-seq network