Gene detail

Detailed information of ctg1281-1.2-1 in Gigantopelta aegis Gene info

Gene ID	Annotation	Chromosome	Start	End	Strand
ctg1281-1.2-1	DYNAMIN	chr3	96430249	96438961	-

Gene Structure

More details in Jbrowse Sequence

CDS

ctg1281-1.2-1

CCAGATGAATCTTCCGGACAACGGTGGATCATGGAAGATCACAAACCTGATTCGTAACAGCAAGCTGGAGTTGTCTGCCGAACGCCTGTCTGAGCATGGCTCGTCCTCTTCACAGCCGAGTAGTGGCGCCAACAGTGCTGCACCTTCTCCATCCCGTGCACGCAAAGGAATTAACCTGCTTCCTGAAGTGCCAGAGCAACCAGTTATGAAGTTATCAGCAAGGGAACAAAGAGACTGTGAAGTTATTGAGCGTTTGATCAAGTCGTATTTCCTGATAGTCCGTAAGAACATCCAGGATAGTATCCCCAAGTCGATCATGCACTTCCTCGTGAACCACGTCAAGGACAACCTTCAGAGTGAGCTTGTCAGCCAGCTCTACAAGAAGGAGGAGGTAACTCTTCTGGAGGAATCCGAACACATCGCTGCCCGCAGGAAGGAAGCTCAGGACATGTTACAGGCTCTTCAAAAATCTAGCCATATTATCGGCGAAATCCGTGAGATCCACTTGTGGTGATATTTACAGTCAGGTGTACATTTATTGCATTCTCTTCTTTCTGGTGGTTCGTGTTGCCATGCTAACCAATACAGACATCGGGGAAAAAAATAGTCCAATTTGGCTGATCACCAGTAAAGGCAGATTTCTTTAGTTAATGCACTACTCTGAATGAAGTTGAATACAACTGTTAGTTGTTGATTTATGCCACTGTTAATCTCGATGTGTGATAAATTCTATATGACATACTGCGGAGTCTGGTCATTAGATATGGCTTATAAGAGTGACAACCCAGCAGATTGCTGTAGTCAAGGTTAGGCCAGGTTTGTGACCTGATCTGTCCTAGATGTGTAATTTGGTCATCTTAAAGATCAGACTCCAGCCTATAGTGTGATAGAAGTGACTGGTAGAATGTCTGATAGAAGCGACTCATAGTGTGTCTCATAGAACTGTGTGACAGTGACCCTTTCAGGCTGATGTGTGTGATAACTATGTTGATCTCTGGATGTGATGATGTCTATGAGAACCCTGCAGAGTTGTGTATTCCTTTGTTGAGCTTCACCCACTTCTAATAGTGACCGAAGACTGGGAAACTGACATTGTCGCTGCTACACCAAACAAGGTCGTTTTCAATGAAAGCAGTGTATTTTACTGTGCTGGCTTCATAGTGCATAAATCACTGAATGTGAATAATGGCGTGTTGCATGCCAGGAAAGCTGTGCTTAAGGGTTTTTTTTTGTCACAAACTAGTGGTGGCCATTTCGTTAATGTGTCTACTTTTGCTAATAGTATAAAAACACTGAAATAATTCATTAAAATATTTTATTTCATAATTTTCTTTCGCTTTACAATTACACAAATAACTTTTAAATGGTAATTGATTTTGTTGGGTACATTCAGATCACTTCGTATAACAGTATACATGTAGTCTTGTGTTTGGGTGGGCATTTCCTTGAAACGGTCACTCTTTTAATACATTTATCAATCAGAATGACAAAACAAGTATCCATGATCAAAACCACATCTCTGCACAATGCATTTTGTAAAATAGTGGTTGCTATCTAGTGCCTCATCAGGACAACTACTCCTGAGGAGATCCTTGATGATACATACTTCCTGCACTGTTCAAAGAGGACTGCAACTCCCAGAATAATTTACTAAATCATAACTAGAACAAGACCGAGCTGATTGGAATAAATATAGCTGTTATGACATGAACTACTGAATTGCTGACAAAACAGAGATGATATCAGGTGTTTAGGAAAGGTAAGCATACCCTTTCCCAACAATGGCACCCATCAGGATTAGTGCCACCCATCAGGAGTACTGCCACCCATCAGGAGTACTGCCACCCAACAGTACTGCCACTAATCAGGAGTACTGCCACCCATTAGGAGTACAGCCACCCATCAGGAGTACTGCAACCACAGCTGTTGAGTCAGTCACTTTATGCTAACCTTAAATAATAGATACCATTTTATGCATAAATGTATCACAGTGGCCTTTAATAAGAAATATTTATAACACTTTAGAAAAGAACATCCAAAATATGGGACTACACCTTAAAATTTTTGTAACTATTGTGATACATAAACACTGAACTTGTGGACCAGAAGATACCGTTTCCAGTTTGGTCAAGAAATGGGTTATGTGCACTAAAATGACTGTTGGGTTTTATTCTGTCCTCTATTAAATTGTCTTAAAGCGATGATTGGGCAAGGCTTTTGAACTGGTATGCATGTTCAATGATATTTGATGCATATTATTGCTGAATATCAACAAGTATATTGTATATTAAATTAATAAAATTGTACAAATGTGACGGCTATTATATATAGCACAGCCATTTAGTTCCACCCCAGTGAATCTGATCCTGGTGAGCAGGTGCTTACTGAATACTTAAAGCGTTACACCAGGTATTTGTCTGAACTACTGAAACAAAGTACCAGTCTCTGCATTTTTGAGTGATGATGAAACAGGCATATGTTGCAATGTCCTGTAATAATATCCATCCCAGTAAGCCTGATAAGTATATATTTTCCTATACAAAATCAACCACTGTTGTAAAACTGGCTACAAAACAAATCGAAATAACTGTCCAGTGATGTATCATGTTTTTTCCATGAAACAGCGGTATACTGAAATGATAAAATGACTGTTTACTTAGTTAATTGATATATTCTGTTGCCTCCACATGTGATTTCTGTTTTCCAGGACTTGGTGTGTATTTGGTGCCGTTGTCTGGGAACAAAAGGAATATGTATCGATATTATTAACAATTTAAAATCATATATATATATATATATTAGTCTTTGTTTAATTGTAAGGGGAAAATGTAGGCACTTGTGTTATTAGCATGTTGTGGATCATGACTTGTCACCCTATTGCTGAAGAAAATTAAAACGTGCTTTAGCAAATAACGTGTAACCCCAAAAATAGTAATGGACATTAACAACCAACAAGGTATGTTACTGTAAATAATTCTCTAATACTATTGATTAAGTAGACAGTCCCATCTAAAATCACAGAACTGACCAATCACGTACATACAGTAGTTCCAAAGAAAAGAAAATTACCACTTGGTTAATTATCTGGGCATTTATGTTGTTTCACAAGTTAGGCTGATCAAAGGCATGCGCCTTGTTTAATTACTGCATTTGTTTACTCTGTGCAGACAGCAGCAGTTTACTGGAGCTGACGTCACTTCCCTTCCAAGCTAGAGTGCCGGAGGCGACAAAAAAGAAACAAAATGGCTGCCCCCAGTTAAAAGGAATATCGTGTTTTTTTAAAAATTAATTCTAAAATTACACATTTTTCATTTGTTAAACTGTCCGTATGTGTAGGTGGTCCAGATATGCATTTTTCCAACACATAAGGCTCATATTTGACCTGAATATCCCTTTAACTCACTTGTGAATATTCTGTACACATTTTAGTTTGAAAAGTACTATGTGGCTAACACATAAAATCATGCAAATGGCAAACTGAAGACTGGACCTTCTTGCTCTGACAGGTTGATGTGCCACATATATTCATGTCTCGTATCTCTTAAGTCGGGGTCAAATCTTGCTAGCAAAATGGTACGCTTTTTATTTTGTTAGCCCAAAAGTTCAATATCAGTTATTGTAATATATTGGATCTCATTGAAGTCGCTGACTTGTTTCTGGTCGTAGTTAACTTAGCAACCAGTCAGTCCCTTATTTATTTTAGCATGAGATCTGTCATCAACTCACGTCACACTGGTTCTCGGCCAGATTCATTTCAGTAATGCAAAAAATACTAATTGTTACGTTCAATGGCACATTAATTATTAGTTTCTTAATAGTATCATGTTGTTAAAAAGAAAATATTACGATTTGGTCTGAGTTCAATTTTTGGAACCTTTTTGAATGAATGCGAAACATGATAAAACACTTTTGCTAATGGAGAAGTTACTTGTACTGTTCAGTCTTAGATTAGTACCTGTGATGTAACTGACTTGTTAATAATATTTATTTACGTTTTTCAGTTTAGAATTTAATTGTGCACAATGAAAATATCCAAGTATAAGTATACATGTGTGTATGCACGCACGCACTCGCACACATTTATATACATGTACACATACAAAACAGGCACGAAAACACCGTCAGATGTATATATAAATAGATAACTGGTGTGAATGTTGATAATGTAAATATTTCTTTTCATGACATGTACAAAAACATCTAGATGCGTTGTTGAGTGTGTAGGATGATAGACTTTTAAAACAATAGCTATTGTAGACCGCTAGAATATTGTATGTAAATTGTTTGGTTTTTGTATTTAATGTCGTGTTTGTCACTAAGAATGAGGAGTGTCACATTTTATATTCAGGTTTGTGTAGCATCCCATTTGTGTTTTTATCATGGCCATCTCTGCTAATGAACTGTCGGTCACTGAGAGCACCACAGGCCTGGGACTAGCTAGAGAAGGAATTGTTAAAAACTGCCTTGTCATAGAATTACATTTAAACCGGTTTCACGCCACTGGTGTTGGCAGGGTTAGGATGATTTTGACATTCCAGCTCCAACATTAACCAAGACTGTACGATTTCAGATGCAGTCAGTAAGGATATTCATACTGACTAGCTGCTGTGATGTTCACATGTGTTACCAGTGACGTCAGGTTGTGACTAGTGATCAGTGATGGTGTTTGATAGTTGGTGTTGTGTCGATGTGTGATGTATGATGTGCGAGCGTCTGTTACATACCTACTTAATCTTACTATAGTAATAAAGACATTGTGACCTGTATAGCACATTTTTTGTTTGTTATTGATAAAGGATTTCCACTTTCATGATGTAAACATTTTATAATGTCTGACTGAGCATCTTCTAAGTGAAGTACTAGAGAGGGTCAGGGCGGACTGATTTGATGTTGATCAAGAAACTAACAAGCGACTGACTACACGTGGCTTCTCTGTGGTCTCGTGGACAGTTAATGGCAATACACTTAACGTGCGATATTATCGCTATACTGATATTTAT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Transcript

ctg1281-1.2-1

Protein

Gene family

Gene family	Subfamily
-	-

Pfam domain

Pfam accession	Pfam name	Description	Type	Source
PF02212	GED	Dynamin GTPase effector domain	Family	Interproscan

InterPro

InterPro term	Type	Description	Source
IPR003130	Domain	Dynamin GTPase effector	Interproscan
IPR020850	Domain	GTPase effector domain	Interproscan
IPR022812	Family	Dynamin	Interproscan

PANTHER

PANTHER term	Description	Source
PTHR11566	DYNAMIN	Interproscan

Gene Ontology

GO terms	Category	Description	Source
GO:0000266	Biological Process	mitochondrial fission	Interproscan
GO:0003924	Molecular Function	GTPase activity	Interproscan
GO:0005525	Molecular Function	GTP binding	Interproscan
GO:0005737	Cellular Component	cytoplasm	Interproscan
GO:0005739	Cellular Component	mitochondrion	Interproscan
GO:0005874	Cellular Component	microtubule	Interproscan
GO:0008017	Molecular Function	microtubule binding	Interproscan
GO:0016020	Cellular Component	membrane	Interproscan

KEGG pathway

KO	Enzyme	Enzyme ID	pathway	mapID	Source
-	-	-	-	-	-

Expression pattern

1. Expression trend for ctg1281-1.2-1 global RNA-seq network