Gene detail

Detailed information of ctg112-7.5-1 in Gigantopelta aegis Gene info

Gene ID	Annotation	Chromosome	Start	End	Strand
ctg112-7.5-1	EUKARYOTIC TRANSLATION INITIATION FACTOR	chr14	42187141	42206456	+

Gene Structure

More details in Jbrowse Sequence

CDS

ctg112-7.5-1

GATTTATCTGATGCAAGAGTTTGCGTGTAATTATTGATGCAATTTTAAAGTATTTGTACATCATACGGATTTTTTTTTTACATACACAAGGTTTAGTGAACACAGCCAGACAGAGTTGTACATCTCATACACAAAATAATGGCAGAAGATGAATTGTTGCCCTTTGATCCTTCTGTGAAGAAGAAAAAGAAGAAGAAGAAGACTCCGTTCGACCTGGCCATGGTAGACATTGAGGCGGCCGATGGAGCACCGTCGGTGGTGGGCGGGGATGAGCCGTCCACAGATGGCGGCGCAGAGAAAGAGAAGTCAGATGCTGATGTCTCACTTGATTTTGGAGGTATGAAGAAAAAGAAGAAGAAAAAGATGCCATTTAACCTGGATGAATTGGCTGAAGCTCTCCCTGATATCAACGAACAGATCTTAATTCCGACGATGGAAGACAAAGAAAACATTGCTATCGGAGATGAAGCTGACGAGGATTTCTCCCTCGACTTCTCTGCCAAAAAGAAAAAGAAGAAAAAGAAGAAGGTCGACTTTGAAGAAATTGTTCAAGAAGAGGATGAAAATGAAGACGTTGTTGATTCGGTTGGAGACAGTATGCAAAGTGCGAAGTCCTGGCACGGTTCCGACAGAGACTACACTTATGATGAGTTGTTGACACGAGTGTTTGATATTATGAGGGAAAAGAATCCAGACATGATCGCGGGTGAGAAGAAGAAATTTGTCATGAGACCGCCCCAAGTTCTTAGAGTCGGAACCCGGAAATCATCGTTTGCTAATTTTGCAGAAATCTGTCGTTTGCTCCATAGACAGCCTAAACATGTGTTGGCCTTCTTGTTAGCTGAGTTAGGAACAAGATATTAGGAGTATGTAACATGTCACACCTGCCGGTCGCCCGACACACTACTACAGAAAGACACGCGGTTATTTTTTCTCCAGTGTGAAACGTGTGGATCAAGATGTTCTGTGGCTAGCATCAAGTCTGGTTTCCAGGCCGTTACAAGCAAACGAGCCGCTATCAGAGCAAAGACTGCTTAAAGTTTAAACATTTTGGGGCAGTTACTTCAGGAAACTTCACTGGTTGTATTAATAACTTGTTGTCACTTGGTGCTACAGCATGCCATTTTGGGAAACGTTAGTGTCCAGACAGGAATAGCTTTATGATATTATTAATAAGTATTTAAGTAAAATGTTTGTTTTTTAGAAAACTAGCACATATATGAAATTGTTAATTTATTTCAAGTGGAACCTGTCATTTAATATAAAAAAGAAAAGAAAAAAAAAAACCATTTAACTTTGTGCTAAATGATTGGATCATGTTCCGATGGAAAGAAATAAAGGAACATATGTCATTTTAAACCAAATTTTATTCACAAATAGTATAGCAATGTCTGTATAACACACAAGATATAATATGTCCTTGAGTGTTAGTAATGTGGCACTGAATGTGAGTAAAATGGTTAATGATCTGACACTAAATATTTACTGTTGTTATTGATGTTATCCATTATTTCTTTCCATCAGTTTTAATGCTTGTAGGTACTGGGTTCAAATCCCAGTAACATCTCCAGTGAATGAACTAGTGATAGAATTAAAAATAAATTATATCGAAACCCATAGTATTCACGAAAGAGATTAATTGTTGCAGATTGATAGAATAAAACATCTTTAATGCTAAACTTTAGAATGAATGTAATGTGTAGATATAATATATCTAGTTTTGGACTTGTATTAAGTCTACCCCTAAAGCTCATGTCACGGGTCTTTTTCCTCTCTCAAAGTCTAATGGGTTCCAATGGAAATTCTAAAGACCGAGTTAAGTATTGTTGACTCGAATTTATAACTAATAAATTTACCTAACTGAACACGAGCAAGGCATACTTTTTTTAAAGGCTGAAAATAAATTTATAAATAACTTTAGCATAGTCTAGAGATCAATGTTTTAGTTATGTGGACACTTGATAAAGAAATCTAAACTGAATGTAATTTATTTTAACTACTGTCAGATATGGTATGAAAGAAATGCTTTGTTAATACTATGATCTGCTTTAATGCAGAATGTTTATTAACTATGATCTGTTTAAATGCAGAATGTTTATTTTGTTTAAGAAGGAGATGTCTGAGAGGGTGGCTACTTTTAACGATCACAGTTGTCGTATACAGTGTACATAATCCATGATAAAGTTGGGATTTTAAGAAGCCTATGTAGTACACAAAATGTAAATTTTATTCCTAATTGACCTGTCATTGCTGATGCCTATCTGTTGACTCTGTGAACAGTTTGCATCAGATCTCTATGTATTTAACTCTTTTTAACTATTTGTTGCCAGGATAGTTTACAATCAATGAATAGAATTGTTTTCAGTCAATAAATTGTCGGTTAGGTTAACTAACAACCAGCAAGAATAGTTTTTAGTCCGTGACCTTTTCATTCAGGTAATTTATAATCAATGAACGACTATGGTATAATACAGCTAATGAATGGTTGAGTGAGATGAGTTACAACCAATGAATGGGCAGCTATGGAATCTCTTAGAAGCAGAAAACAGCTGATAGATTATCTCAGTAAAGCAGTAAATATCTGCTTTAAGTTTAAATAATAACTATGTTAGTTTCATGCCACGTCCAGGGCCATACCTAGCCAATAATAAAGGGGGTGGCAGTACAAAAAGAGGACTTTCTCCAGGTAAACAAGGTCACTTTTTCGTAACATCCTCTCCCCTTGTCCATTCACCCCTCCCCAAGGTGTCTTTGACCTTTCTTAGGGTCCATCTTGATTGGGGGTGGATGTTGTGAATTTTCTGCACTATTTTTTTTTTTGTAACTGCACTCCCACTACGGCACCTGTATGACAGTGGAAATCTGCTGCTTGTGGTCTTTACCTGCAGTGTTCTTCACTCTTGCCATGATTTCACCACACCGTTTCCACTTCAATTCCTCGCACACACACACCCTCCTTTTTGCTGAACTTGTGGAAGGAGTCTTAATTGCATTTGATTTCAAATACTTTATTTAAAAATAAATTATTTGGGGTAATGTTTGTCGTTTCCTTGTAGTCCCAGCCCATGTAGACGGATAAACATGAATCTGGAAAACATAAGGATGTATAATTTAAATCATTTATCCCCAGATAGTAACATATTTCGTTAGCAGCCAATTTGTTAATTTCATTTTCAAATGAACCAAGTATAATTCTTAGCTAATGGATCTTTACCAATGCAGGGCTAGCAATTGTAAATTTTAAAAACAATTGGCAAATTTTATTTCAATTTGGCAAAATAATTTCACGTTTGATATTTTGCAGGAAAATAACTTCATTTCTGCAATTCATTAAAGTTTAAGAGATAATTTGGCAAAATTTACTTCTCTCCAAGAAGTTACCACCCTGCAATCAATTGAAATGCTGCATTTTGTGGAAATAGCCTGTACTGAAATCCTGTATAATGTCAGTTATACATTTATCAGGGGTTCTCTGTTAATGTGTGTGTGTGTGTGTCCAGAGTTATGTTGATTACAAATATCTTGAATTCTGATTTCAAAAGAGAGAAAAACAATAACCACATTAATGGTGTTTGTATGAGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTTTGTTAAAACATACTGGTAAATTTAGTCTGTATATCTCTGTTCTATGCTGTAAATAAAGCTGGTTTGTTTACTCATGAAAAACAGTACAGCATCATGTTGATGTTGACTCTCCTTTCTTATTTGGCGTGTTTTACAACCCCTGCAATGAAGAAAATGTCCACAGCAAAAAAAAATCCTAAACATAGTCCCAAGACGAAAAGGTGCCATGGAGAACTAACAACTACACGGCAATCTCCACGACATTGCTGATTGCTGTGGGTAATTGCAGGGGTTGGTTTTACACTGTACGATTTAATCACAGACAGAAACAAGCATGCAAGTCATGTGTCATTTTTGTGATAAGTGGATAGATATCTGGTAGATCACAACTAAAGTCCAAACCACTTATGTGTACAAGGATTTTTCCAGGCATTCTGTGGGTCAAAACAAAGACCTCTTCCCAAAAGAAAGTGGAACTGAAAATTACCAATTTGTATGTTAAAAATTCCCAATATATACAGTGAAACCTCTCAAAACCGGAACCTCTGTAAACAGGAATTTCCCCAAAACCGGAACCTTTGTAAACCAAAATTCTCCCAAAACCGAACATTTTTCAAGGTCCTTTTTGAAAAATCAGTACAGAAATTAACCTTTAAACCGGATACCTCTTAAAACCAGATATTTTACTTAGCCCCGAGGGTGTCTGGTTTAGAGGGGTTTTACTGTATATATATATTAAATTGTCTGTTATAATAAATTAATTTAGCAGTGGAGTCCTGCATCATTCAGTGGCCTGGAAAAATATCCCAAGTATGATTTACTCGCACTCATTTTCCCAATGAATCCCATCTGACATGGGACCCTGGCGATAAATCCCTCATGTAGTTGCCAACTGTGACAAATTATTTGGGGTAATTTTATACCAATATGTCATGCGATAAGGTATATAAATGTTAATCAGCGTTTAACAGTACAACATATGTCATATCCAGGTTTCACATCCTGGCACACCTCTTGAAGAATATTCCATGAAAGAAAAAGGGCGGATGGTGAAAACTTGTGTACTCTGTCTTGGGAGATCTTAGCGTGTACTTTATGTCTTAGGAGATCTCAGTGTGTACTTTGTCTTGAGAGATCTCAACGATGTTGATACATGTGACAGGTTTACAATCTAGTCTGGAATCTGTCGCTGTAATGTTTTTTTCACAGTCTGCACAAAATGTTGGAGAAATCTAATGGTAATTAAAGGCAGGAGAGTAATTTATCTTAAGTTTGAAAACTATGTGGTTTGGACTTTATACAATTTTTAATTCTCTTTTCTTTTTCTTTTTTCTAATTTCCTTTGCTTAAATCACTCCAAACCTATGGTAATGGTGTGGCTAGAGTGTTTAACCAATTCCACATGTACTGCTCCCTCTGT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Transcript

ctg112-7.5-1

Protein

Gene family

Gene family	Subfamily
-	-

Pfam domain

Pfam accession	Pfam name	Description	Type	Source
PF01873	eIF-5_eIF-2B	Domain found in IF2B/IF5	Family	Interproscan

InterPro

InterPro term	Type	Description	Source
IPR002735	Domain	Translation initiation factor IF2/IF5 domain	Interproscan
IPR016189	Homologous_superfamily	Translation initiation factor IF2/IF5, N-terminal	Interproscan
IPR045196	Family	Translation initiation factor IF2/IF5	Interproscan

PANTHER

PANTHER term	Description	Source
PTHR23001	EUKARYOTIC TRANSLATION INITIATION FACTOR	Interproscan

Gene Ontology

GO terms	Category	Description	Source
GO:0001731	Biological Process	formation of translation preinitiation complex	Interproscan
GO:0001732	Biological Process	formation of cytoplasmic translation initiation complex	Interproscan
GO:0003729	Molecular Function	mRNA binding	Interproscan
GO:0003743	Molecular Function	translation initiation factor activity	Interproscan
GO:0005850	Cellular Component	eukaryotic translation initiation factor 2 complex	Interproscan
GO:0006413	Biological Process	translational initiation	Interproscan
GO:0031369	Molecular Function	translation initiation factor binding	Interproscan

KEGG pathway

KO	Enzyme	Enzyme ID	pathway	mapID	Source
-	-	-	-	-	-

Expression pattern

1. Expression trend for ctg112-7.5-1 global RNA-seq network