Gene detail

Detailed information of ctg102-5.15-1 in Gigantopelta aegis Gene info

Gene ID	Annotation	Chromosome	Start	End	Strand
ctg102-5.15-1	SODIUM/NUCLEOSIDE COTRANSPORTER	chr9	14603250	14628183	+

Gene Structure

More details in Jbrowse Sequence

CDS

ctg102-5.15-1

ATCTTTCGTGCTGGGGTGTCGTTAAACATTAATTCATTCATTCTTTACCAAGATTATTGAGGATCCCACAAATCTAGAAAAACACGCAGAGGACCAGTAGATTGAGACATGGAGATGACGAAATTTGGAAACAGTATTGGATACGGCCCTGATGGAAATGATGGTTGTGAAAACACGGCGTATGTCCCAGATATCGGCGGTAGCAAATACGAGATGTCAGACCCTGACAACGTGCATGTGAACCCGGCTGAGGATAAGGGTGAGGATGAGGATGAGGATGAGGGTAACTGCTGCGCTAGAGGCATTCTGGTCGTCCAACAGGGCATCAGCTCTTGTGCGACCTCCTATAACAAACAGATCTGGATCGTCATCAAAGTCGTCCTGTTTCTCCTCTACTGGGCCTACTTCGGCTACGCCCTCTACTACCACTACGGCGGCGAGGGCTCGAAGAGACTTCTCGGTGCCAGTGTGTTTGGGGTGATTCTAATCATCTGGCACTTCATTGGAGACCGAGTTTTAAAGGTCGTGAGAAAGGTGGCTGACAGCTGTACCGGTGACTGCACGGAGACAGGTCGCCGCCGCTCACGGATCGGTGTCCGTATACTGCTATATGTGGCGATGTCGTTGTTTATAATTATCTACACGGTGATGGCGATCGCCCTGAAGACTCCCAATAATCTGATGTCTCTCTCCGGAATAGCGCTCTTCATCATTCTCCTCTTCGTTTTCTCTACCAACCCAGCAAAGGTTCTTCCAGTAATCATCTACTTCAGCACGATGATCTCCGTCTTGTACTATCTGGGCATCATGCAGGCCGTGATCAAGACGATCGGAAAGTTCCTCGCGTTCGCTCTCGACACGACGCCCGCGGAGTCGCTCAGTGCCGCCGGCAACATCTTCGCTGGGCAGACTGAGAGTCCACTATTGATCCGCCCATTCATGCCGTACATGACAAAGTCGGAACTGCATGCGATTATGACCGGTGGATTCGCTACCGTCTCCGGCAGTGTACTGGGAGCCTACACAAGTTACGGGGTGCCAGCCAATCATTTGCTATCAGCGTCTGTGATGTCCGCCCCAGCAGCCCTTGCGATGTCTAAACTGTTCTGTCCCGCTACCGAGAAAACCGAGGTAGACGAACAGGCTGTGTACAAGATGCAGAAAGGGTCTCACCGGAACGTGATCGAGGCTGCCTCTGACGGCGCGTCCACGGCCATTAAACTGGTGGCCAACGTCGCCGTCAACGTCATGGCGTTTCTGGCTATACTGGCCTTCGTTAATGGTACGTTGACGTGGTTTGGCGACAGAGTTGGAATCGAAGGACTGTCGTTTGAACTTATCTGTTCGTACGTGTTTTACCCCATCGCTTACACCATGGGTGTGGACCCGGTCGACTGTCGGCGGGTGGCCAAGCTGATTGGCTTCAAGACGTTCACGAACGAGTTTGTGGCCTACATCGAGATGGGCAAGCTGTTAGATAACGGGAAGGTATTCAATAACTACACGCTGGGCTTGAACAACACCAACTGGCACCTCAGCGACATGGACGTCGTCCTGGACGACTGGAACGTGACGCTAGCTGGAGGATACCTCCTGCCTCGTTCTGAGGTGATATCGACGTACGCCCTATGCGGCTTCTCGAACCTCGGCTCCATGGGGATCCAGCTGGGAGGTCTGGGCGCCATGGCTCCGAGCCGCAAGTCAGACATGAGCGACCTCGTCCTCAGGGCCATGATCGCCGGCAACGTGGCCTGCTTCATGACGGCCTGCATATCAGGTAAATCTTACTTACCTGTGACCACCTGTATATCAGGTAAAATTTTACTTACCTATGACTACCTGTATATCAGGATTGTTTTACGAAGAATTTTGAAGGAATATCCGGTCTCACACGAAGAAAGACGAAAGATACACGATGGTCTACAAAACAGCGGGTTGGCGCCCTCTGACATGGACGTGATAACAATGACTGTTGTTAGATCTTTTGACGGAGAACTAAAGTGAGAGTGACAACTGGCCAGTAGCGTGTGCTTTTAATAATTACAGGGGCAAGGAACTTTCTACTACACCCTGTAACAGACTCCATTTTAAATGTGGTTGGGTTTGTTTTGTTTTTTGTTGGGTTTTGTTTTGGGGTGGGTGGGTTTTATTATTTGTTGTTGTTGTTTTGTCAGTAATTCCAGTTTGGCATGACATAAAAGAAAACGTGTTTTAAAAATAACACATGAAAACATTGGTGAAGATGTAAACTAAACAGCAATACTCACTCACAGTGCACAAGGTCGTCTGCTCATGGACTTTGAAATTGTATTTGCTATAATCTTTTGGGATAATGCATCCCATACAAAACGGATCTCCATCTAGTAGAGCCAGATTAAAGGATCTGTCCTGAGTTTGCTGCCGCTGTAAGATGTTTCTTTGTAACGACTAAAATTACATTTCAAATAAATGTTCCTGCTTAGAACATCAGCCTGTTTATTACCCATATGGTTAAAACAATATCCTGGTACCTATCAAATTGATACGTCCCACTAGAACGCAAACACTTCGACGTTCTCGATTGGCAGACTATAACCTTAAAGGAACGTCAACTAAACGAGTTGAATGAAATAAATTAAGATCGATATTATGGGTAAAAAATAGGATATTAAAGTCGCTACCATTTCGTATCATGTTTATGTCCCTCGTGAAATAATTTTCGTTATCACTCGCTAAAACTCGTGACAACTGAAAATTGTTTCACTCAGGACATAAATATGATATGAAATGGAAGCTCGTTTAATGTCTTATAAATAAATATCCAGTGTGCTTCTGATCATCCTAGCGTTTGTAGTAGCTTAAATTTTAATTCCTAATATACGTGTATATTTTTCATGTACATGTATACGAAATTATTGGGAGATGAAATATGAAACACATTACATATACACACACCGATATTCTAAACAAGAACATACATTGCACGTCATCGTTGCAGTTAGAAAGGCTCTACTAGTCGGGAACATGTTACAATACCAGCAAACTCGGGACAGTCTTTTTAAGAAAATAATAATCACACAGTGTTTTGCAGAATTAATTAACAATGGAGTCTGGTTTGGGGTATAAGTGTTCAAGGTGTTGGCGGCTACCTAAGTCGTACATATTCGTCACACATAATGGTGCATTCATAATTAACATTAACAGTAGTCTCCATTACCTAACTGATGAACATATACCAAGGGCGGACCCAGGAAACATTTTAGGGAGGGGACCAATGGCAAAATGGCACATGGAGCAACTCCCTAAAAAGGGCACTTCAATGAAAATTGTAAACATATTGTTAAAAAAGGAGCACTTTTATTTTTAGGGGGAGGGACAGGTCCCCCTGGTCCCCTCCCTTGGATCTGCCCCTGAATACCGGTGTTGTAACAAAATTGTACGCACTACCAGTGTCGTACAGAAGTTGTCAATTTGACATCTTTTTTTCTTTGCGCCAACAGAATGTCTCATTTCATCCACAGTGATACACAGTTCAATGTATAGTTTACTGACACACTTATTAGTAAAGTATATTTTGGAATTTATATACAGTGAACCTCGCGAACGTTTCCTTATATCTGATCTAACTTTCGTTCAGTCAGATACCGGGAAAATTAGCTCGTTTCGTAAAAATCATATCTAACGAAAAGGAGTGTAGTATTCAATATCACGGGCGTAGGAAGGTGCCAAGAAGTGTCTGTGTGTGTGTGGGAGGGGGGTGTGGGGGGGGGGGGGGGCACACACACACACACATGCATGTATAAATATATACTCTTTAAAAAAGTAGGGGAACATGAAATATTAATGTTAATATCAACTATTAGACCGAGCATACGTTTTGACCACAGACATCCCAGTAAAGAACGTTCAGGTCTGTTTATCAACACACCAAAACACATTCCATAGTTTGCACGTACATCACGCAGTTGCCCCGTACACGTGCGTGAGGTGTCATTCTCGATTTTGACATTTTTCAAGAAGGTTCATTAATCAGTGTGGAACATTATTTCTGTCAATCTTTTTCATTCTGTTGATCATACATGTGTTATTGTTTTGTTTTTAGTCATTTTTATTGTTTGAATTTGCGATTTACTGATACAAAAACGTCAACTTTCAAATTTCACTTCTGACCCCAATCGTCCTTCAAGATCTTTGGTGGTCATAAAACCTACTGTAATACTGAATTACTGGTTGTAATGTTTGCCCAATTAATTCACTATTATATAAACCTGCGCCAGTGTATATAAACATTTTGTATAAGAGTTTTGCATACGTTTCATGTTGTTATATATATACCTATTATTAACATACAAGTCATATTTAATATTGTTAATATACACATTGTTTTTAATGGTCATATTTAATATTTAATCATGGGTTTGTAGATTTTGTATCATCGACGTTTGTAAATATTGTTTTCCTATACGTAGTCATAGCGTGTCAGTTACTACACAGAACTTATCAATTGTGGTTATTATAATATTATTAAATGTACATGTATATATAATATACAATCCATATTAATAATATGCTTAAAGGCATACTGTCACGGATTTAAGGACCTTATTTCTCTAAAAATGGATGATAAATAAAAAAATTACATTAATTGTTGGAAACCAAATCAGCTATCGATCACCTTAACTGAACCATGACGAAGTGAAATCCATGTCAACCCTCTCGACAATTTTAGTTTTTGAATTATGGACCATTGCAATAATTCAATTAGTTTTACAAAATATCATCAATAAATGGAGTATGGTGGTTATGAAGACGGTTGAATAAAGTACATTTAGGGACAAATCAAATTATTTTTGTTCCAGTAATACTTTATTAGACCATTAAATAGGTCAGTGGTCTGTGACAATATGCCTTTAACACATATCGAGTGATTAGAAATGTCCCCTTTTTGAAGTTCAACAGAAATAAAAGTATGCTGGACAGAACATTGGAATCTTTCACGCAACCAGTTTATTATGTTATGT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Transcript

ctg102-5.15-1

Protein

Gene family

Gene family	Subfamily
-	-

Pfam domain

Pfam accession	Pfam name	Description	Type	Source
PF07662	Nucleos_tra2_C	Na+ dependent nucleoside transporter C-terminus	Family	Interproscan
PF07670	Gate	Nucleoside recognition	Domain	Interproscan

InterPro

InterPro term	Type	Description	Source
IPR008276	Family	Concentrative nucleoside transporter	Interproscan
IPR011642	Domain	Nucleoside transporter/FeoB GTPase, Gate domain	Interproscan
IPR011657	Domain	Concentrative nucleoside transporter C-terminal domain	Interproscan

PANTHER

PANTHER term	Description	Source
PTHR10590	SODIUM/NUCLEOSIDE COTRANSPORTER	Interproscan

Gene Ontology

GO terms	Category	Description	Source
GO:0005337	Molecular Function	nucleoside transmembrane transporter activity	Interproscan
GO:0005415	Molecular Function	nucleoside:sodium symporter activity	Interproscan
GO:0005886	Cellular Component	plasma membrane	Interproscan
GO:0005887	Cellular Component	plasma membrane	Interproscan
GO:0015293	Molecular Function	symporter activity	Interproscan
GO:0016020	Cellular Component	membrane	Interproscan
GO:1901642	Biological Process	nucleoside transmembrane transport	Interproscan

KEGG pathway

KO	Enzyme	Enzyme ID	pathway	mapID	Source
-	-	-	-	-	-

Expression pattern

1. Expression trend for ctg102-5.15-1 global RNA-seq network