Gene detail

Detailed information of WZF233130 in Chaetoderma shenloong Gene info

Gene ID	Annotation	Chromosome	Start	End	Strand
WZF233130	2-OXOGLUTARATE DEHYDROGENASE	HiC_scaffold_1	4651666	4658072	+

Gene Structure

More details in Jbrowse Sequence

CDS

WZF233130.1

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Transcript

WZF233130.1

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Protein

Gene family

Gene family	Subfamily
-	-

Pfam domain

Pfam accession	Pfam name	Description	Type	Source
PF00198	2-oxoacid_dh	2-oxoacid dehydrogenases acyltransferase (catalytic domain)	Domain	Interproscan
PF00364	Biotin_lipoyl	Biotin-requiring enzyme	Domain	Interproscan
PF00549	Ligase_CoA	CoA-ligase	Domain	Interproscan
PF00676	E1_dh	Dehydrogenase E1 component	Family	Interproscan
PF02629	CoA_binding	CoA binding domain	Domain	Interproscan
PF02779	Transket_pyr	Transketolase, pyrimidine binding domain	Domain	Interproscan
PF08442	ATP-grasp_2	ATP-grasp domain	Domain	Interproscan

InterPro

InterPro term	Type	Description	Source
IPR000089	Domain	Biotin/lipoyl attachment	Interproscan
IPR001017	Domain	Dehydrogenase, E1 component	Interproscan
IPR001078	Domain	2-oxoacid dehydrogenase acyltransferase, catalytic domain	Interproscan
IPR003016	Binding_site	2-oxo acid dehydrogenase, lipoyl-binding site	Interproscan
IPR003781	Domain	CoA-binding	Interproscan
IPR005475	Domain	Transketolase-like, pyrimidine-binding domain	Interproscan
IPR005809	Family	Succinate--CoA ligase-like, beta subunit	Interproscan
IPR005810	Family	Succinyl-CoA ligase, alpha subunit	Interproscan
IPR005811	Domain	ATP-citrate synthase/succinyl-CoA ligase, C-terminal domain	Interproscan
IPR006255	Family	Dihydrolipoamide succinyltransferase	Interproscan
IPR011053	Homologous_superfamily	Single hybrid motif	Interproscan
IPR011603	Family	2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component	Interproscan
IPR011761	Domain	ATP-grasp fold	Interproscan
IPR013650	Domain	ATP-grasp fold, succinyl-CoA synthetase-type	Interproscan
IPR013815	Homologous_superfamily	ATP-grasp fold, subdomain 1	Interproscan
IPR016102	Homologous_superfamily	Succinyl-CoA synthetase-like	Interproscan
IPR017440	Active_site	ATP-citrate lyase/succinyl-CoA ligase, active site	Interproscan
IPR023213	Homologous_superfamily	Chloramphenicol acetyltransferase-like domain superfamily	Interproscan
IPR029061	Homologous_superfamily	Thiamin diphosphate-binding fold	Interproscan
IPR033847	Conserved_site	ATP-citrate lyase/succinyl-CoA ligase, conserved site	Interproscan
IPR036291	Homologous_superfamily	NAD(P)-binding domain superfamily	Interproscan
IPR036625	Homologous_superfamily	E3-binding domain superfamily	Interproscan

PANTHER

PANTHER term	Description	Source
PTHR23152	2-OXOGLUTARATE DEHYDROGENASE	Interproscan

Gene Ontology

GO terms	Category	Description	Source
GO:0003824	Molecular Function	catalytic activity	Interproscan
GO:0004149	Molecular Function	dihydrolipoyllysine-residue succinyltransferase activity	Interproscan
GO:0004591	Molecular Function	oxoglutarate dehydrogenase (succinyl-transferring) activity	Interproscan
GO:0005524	Molecular Function	ATP binding	Interproscan
GO:0005829	Cellular Component	cytosol	Interproscan
GO:0006099	Biological Process	tricarboxylic acid cycle	Interproscan
GO:0016624	Molecular Function	oxidoreductase activity, acting on the aldehyde or oxo group of donors, disulfide as acceptor	Interproscan
GO:0016746	Molecular Function	acyltransferase activity	Interproscan
GO:0030976	Molecular Function	thiamine pyrophosphate binding	Interproscan
GO:0045252	Cellular Component	oxoglutarate dehydrogenase complex	Interproscan
GO:0046872	Molecular Function	metal ion binding	Interproscan

KEGG pathway

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-	-	-	-	-	-