Gene detail

Detailed information of WZF223880 in Chaetoderma shenloong Gene info

Gene ID	Annotation	Chromosome	Start	End	Strand
WZF223880	CAP BINDING PROTEIN	chr2	110254968	110352728	-

Gene Structure

More details in Jbrowse Sequence

CDS

WZF223880.2

ATGTCAAGAAGAAGGCGAAGCGATAGTGACGACGACGACGATGATGTATCTCGGAAGAGGCGACGTACCTCTGATGCGCTAGACATTGAAGATCGGCTCGAGTCATTGATTACAAGAGTTGGAGAAAAGAGCACATCATCGCTGGAGAGTAATTTAGAGGGTCTGGCCAGTGTTCTCGAAGCTGATCTCTCAAACTACAAACACAAGATCATCAAGATCCTCTTAGAGTGTGTATGGTTTCGTCCAGAGAAACTGACCGTATACAGCACGCTCGTGGGTCTGCTTAATGCCAAAAACTATAACTGTGGTGGTGAGTTTGTGGAGATGTTGGTGCGAAACTTGAAAGAGGGACTTAAAACTGGTCAGTTTGAACAGGCTTCAGTCATGGTGCGATTCCTGTCTGACCTGGTGAACTGTCACGTGATTGTAGCTGGTTCCCTGTTAGCGATGTTTGATAATTTTGTCGAAGTGACGCTCGAAGATAGTATTCCACAGGTTCGCGCTGACTGGTATGTGTTCGCTGTTCTTTCATCACTGCCATGGGTTGGTCGTGAACTTTATGAGAAGAAGGAAGCAGAGTTGAACAAGCTAATTACAAGCATTGACAAATATATCAGTAAGCGTCAGAAGATCCATGTTCCAGCGCTGCGTGTGTGGACATTGGATGTGCCACATCCTCAAGAGGAGTACCTCGACTGTCTGTGGTCTCAGATTAAAAACTTACAACAGAGCAAGTGGATTGAGAAGCAGATTTTGCGCCCATACCTGGCATTCGACAGCGTCCTGTGCGAGGCGCTTCAGCACACACTGCCTCTGATTATCCCCCCTTCGCATCACACGGACATGCTGTATCCATTGCCATACGTCGTGTTTCGCTTATTCGATTACACAGATGTGCCAGAGGGGCCAGTGCTGCCCGGAGCTCATGCCATCGAGAGGTATTTAATTGAGGAACAACTTCATGGAATAATTAAAACTAACTTCATGGAACGAAAAGATTGCGCTGCTGCTCTGCTGAGTTTCCCGACCAAAAACAAGTTTCCTTTGAACTACATGATTGTTGAGGTAATGTTCGCACAGTTATTCAGGTTTCCTCGACCACCCGCCTTGGAGATTTTCTACGGGTCAACGCTAATTGAGTTATGCAAGCTCCAGCCGGGGTCCATGCCACAAGTTTTAGCCCAGGCTACAGAGATGCTGTATGAGCGTGTTGATACCATGAACATCATCTGTTTAGACAGATTCTGCAACTGGTTTTCATATCATCTGAGTAACTTCCAGTTCCGCTGGAGCTGGGATGATTGGACTGGATGTCTGGAGTTGCCACCACATGAACCTAAGTTTGTTTTTGTTAAGGAGGTGCTGAGAAAATGCTTACGGCTTTCGTATTATCAGAGAATAGTTGACACATGTCCTGATAGCTTCAGCGTGATCATCCCAGATAAGCCAGCACCTATTTACAAATATGAACGTGAAGGATCAGGATCATTACCGGGGACAATGGCCGCTCATCAACTAATTCAGGCCATTAAGAATAAATGTACACCGGAGGAGGCCGTCGATCTACTGAAGGATCTTCAAAATCCGCTTGCGGAAGAGGACAGTGATGTTACATACAACCCGCTGAAGATTGATGTGTTTGTTTCGACGTTGCTTTTTCTCGGCTCAAAGTCGTTTAGTCATTCGTTTGCCGCTATTGCAAAATTTCACTTTGTGCTGAAGGCGCTCGCCGAGACAGAGGAAGGTCAGATCTGCCTTTTGAAGGTCATGTACGAGGTGTGGAGCAGTCACCAGCAAGTGATGGTTGTTCTGATTGACAAAATGCTCAAGACACGGGTGGTCGAACCGGCGGCGATCGCCAACTGGCTCTTTTCACGGGAGATGGCTGCGGATTTCAATAAGTTCTACATATGGGAGATAATGCACGGGACAATCCGAGTGATGCGACGTCAGGTGGATAAGTTAGAGAATGAAGTGGAAGAGTCACGAGATAAAATGGAGGATGCTCGAAGAGAGGGTGATGACTTTATGGATACTGATGTTCCGACAGAAGAGATGGTTGAACGGATGGAAGAGAAACTTGAAGCAGCAGAGAGTGAAGAAAAGAAACTCTTCCTCATCATTTTTCAGAGGTTCATTATTATACTCACGGACCACCTGGCTAAATGTGAGACAGACGGTATCGACTATAACACACCCTGGTACAGATACGCCATCGAGAGATTGCAACAGGTCTTCTTACAGCACCACGAGCTCGTCTACAAGTACATCAGCACTCTAGAGAGTCTCCTCTTCACCAGTGACATCGATTTTCACATACTCGAGATTTTCCAGCGATTCTGCGCCCTCAGGTCGTGA

Transcript

WZF223880.2

CCAGACGGTTGGAGTCACATCCAAAAAGACAATAAAGAGAAAAAAAAATTTCTTGTCGGCGTCTCCGTTTGATCCAAATTTCTAAGAATGTCAAGAAGAAGGCGAAGCGATAGTGACGACGACGACGATGATGTATCTCGGAAGAGGCGACGTACCTCTGATGCGCTAGACATTGAAGATCGGCTCGAGTCATTGATTACAAGAGTTGGAGAAAAGAGCACATCATCGCTGGAGAGTAATTTAGAGGGTCTGGCCAGTGTTCTCGAAGCTGATCTCTCAAACTACAAACACAAGATCATCAAGATCCTCTTAGAGTGTGTATGGTTTCGTCCAGAGAAACTGACCGTATACAGCACGCTCGTGGGTCTGCTTAATGCCAAAAACTATAACTGTGGTGGTGAGTTTGTGGAGATGTTGGTGCGAAACTTGAAAGAGGGACTTAAAACTGGTCAGTTTGAACAGGCTTCAGTCATGGTGCGATTCCTGTCTGACCTGGTGAACTGTCACGTGATTGTAGCTGGTTCCCTGTTAGCGATGTTTGATAATTTTGTCGAAGTGACGCTCGAAGATAGTATTCCACAGGTTCGCGCTGACTGGTATGTGTTCGCTGTTCTTTCATCACTGCCATGGGTTGGTCGTGAACTTTATGAGAAGAAGGAAGCAGAGTTGAACAAGCTAATTACAAGCATTGACAAATATATCAGTAAGCGTCAGAAGATCCATGTTCCAGCGCTGCGTGTGTGGACATTGGATGTGCCACATCCTCAAGAGGAGTACCTCGACTGTCTGTGGTCTCAGATTAAAAACTTACAACAGAGCAAGTGGATTGAGAAGCAGATTTTGCGCCCATACCTGGCATTCGACAGCGTCCTGTGCGAGGCGCTTCAGCACACACTGCCTCTGATTATCCCCCCTTCGCATCACACGGACATGCTGTATCCATTGCCATACGTCGTGTTTCGCTTATTCGATTACACAGATGTGCCAGAGGGGCCAGTGCTGCCCGGAGCTCATGCCATCGAGAGGTATTTAATTGAGGAACAACTTCATGGAATAATTAAAACTAACTTCATGGAACGAAAAGATTGCGCTGCTGCTCTGCTGAGTTTCCCGACCAAAAACAAGTTTCCTTTGAACTACATGATTGTTGAGGTAATGTTCGCACAGTTATTCAGGTTTCCTCGACCACCCGCCTTGGAGATTTTCTACGGGTCAACGCTAATTGAGTTATGCAAGCTCCAGCCGGGGTCCATGCCACAAGTTTTAGCCCAGGCTACAGAGATGCTGTATGAGCGTGTTGATACCATGAACATCATCTGTTTAGACAGATTCTGCAACTGGTTTTCATATCATCTGAGTAACTTCCAGTTCCGCTGGAGCTGGGATGATTGGACTGGATGTCTGGAGTTGCCACCACATGAACCTAAGTTTGTTTTTGTTAAGGAGGTGCTGAGAAAATGCTTACGGCTTTCGTATTATCAGAGAATAGTTGACACATGTCCTGATAGCTTCAGCGTGATCATCCCAGATAAGCCAGCACCTATTTACAAATATGAACGTGAAGGATCAGGATCATTACCGGGGACAATGGCCGCTCATCAACTAATTCAGGCCATTAAGAATAAATGTACACCGGAGGAGGCCGTCGATCTACTGAAGGATCTTCAAAATCCGCTTGCGGAAGAGGACAGTGATGTTACATACAACCCGCTGAAGATTGATGTGTTTGTTTCGACGTTGCTTTTTCTCGGCTCAAAGTCGTTTAGTCATTCGTTTGCCGCTATTGCAAAATTTCACTTTGTGCTGAAGGCGCTCGCCGAGACAGAGGAAGGTCAGATCTGCCTTTTGAAGGTCATGTACGAGGTGTGGAGCAGTCACCAGCAAGTGATGGTTGTTCTGATTGACAAAATGCTCAAGACACGGGTGGTCGAACCGGCGGCGATCGCCAACTGGCTCTTTTCACGGGAGATGGCTGCGGATTTCAATAAGTTCTACATATGGGAGATAATGCACGGGACAATCCGAGTGATGCGACGTCAGGTGGATAAGTTAGAGAATGAAGTGGAAGAGTCACGAGATAAAATGGAGGATGCTCGAAGAGAGGGTGATGACTTTATGGATACTGATGTTCCGACAGAAGAGATGGTTGAACGGATGGAAGAGAAACTTGAAGCAGCAGAGAGTGAAGAAAAGAAACTCTTCCTCATCATTTTTCAGAGGTTCATTATTATACTCACGGACCACCTGGCTAAATGTGAGACAGACGGTATCGACTATAACACACCCTGGTACAGATACGCCATCGAGAGATTGCAACAGGTCTTCTTACAGCACCACGAGCTCGTCTACAAGTACATCAGCACTCTAGAGAGTCTCCTCTTCACCAGTGACATCGATTTTCACATACTCGAGATTTTCCAGCGATTCTGCGCCCTCAGGTCGTGACCCCACTATACCAGATATCGCTACAGTGATGACAGTGCTATGACTCTGAACGTCAAACCCATCCAGAGTCGAGAGATACTAGCTATTAGAACTAACATCGCTATAACAAGCAATCAGACTTGCAAATACATAGGAATCTTGATTCACACAAGTAGTCAAAAATATGTTTCTATATCGCTGATTGTAAAACGCTTAGTCTACTAATTGCTATTGCTAATTTAAATTTCATGATTTCGTTTTGGAAAAGGAAGAGATAAATGAATTTGTTAATTTATATTTAGCAGTATTTTTCATGCAGGCTGTTTGAGTGCCAGGTATGTCAAATGAATGACATCAGTGCTTGAAATCTGGCTAATGAAAATCAGAAATGGCTAAATCATTTGCAAATGATTAAAATTAATTTAATTTTCTTGATTGGCTGAATCCTTATTATGACTGAAAGCTGTTGCTGTCTTAGGCGGCAACAGCTTTCAGTCATATTACTTTCAAAATATTCAACACATTTCTTGTATATTTCTTATATATTAAGATCCTATTGTATCTGGACTGTAAAATCGATATTGACTGCAAACATGTCCATAAGTGATATTGAAGTAATGATGTGACTAAAATATTTACTATTTAGCTAACAAAAATGCTATTTGGTTAATCTATTGGCCAGAACATTGCAAAAGCCAGATCTGTCCCTGACAGGTTATTTATTTCACCTACGAACCAGAAAGCGTGACATAGGTATTATAACACTTTTCCAACGACAGCGGCAGCATCAATATTAAGTTTTTGCATTTAGCAAATCATATTTTCCTCTATTTTAGGATTGCTTAATCCTACTGGAACTGAACTTGGACACATGTTTGGCATTGTTTCCCTATACCATAGGGAGGCAGCCTGATGATAATGAGACCACTATATCAAAGGTCACGGTCATTCTGACCTTGCTAATGTCACCTCTGTTTTTCCAATGTTTAGGTTTTTGCATAAAATTTAGCAAATCATTTACTTTTATATTTCAGGATTGGTTAATCCTATTGTAACTAGCGTTAGACACAAGGTTACCTATAATGTTAGGAAGCAGCCTGATGACATTGAGGTCACACGGTCAAGGTCAGTATGCCAAAGAGGAAACGGGCGAGACATTTAATTCCACCACAACATTTTTGTTTGGTAAAATTATACTAAGTGACTATACTATAGAAATAAATGTCAGTGTAAATAATATTGTGTATATATTTTGAATCAGTTTTAATATGAGCCACATTCAGTTGTCTAATTAGTGTATCATTTATTATGCTCCTGATATACAGGTGATAATTAGGGGGTGGGGGTATGTAGCATTTGCTTTGTCTATCCGTTTGGCCACGCTTTCATTTACACATAACTGAAGATATTCTAGAGCTTTCATCAAGGAACTTTGGTGGTACTGTGTTGATTTCAGCAATCTTTGTCATTCGTGTCATTGTACTGTCTAGTTTTAACTTCTTTATCTAGATTTTTTAACATAAATATGAGGAATTATCATTGAAGCGTGACCTTCATACACATGTACAGGTCCATACTTAGTTTATAGTGGTATATCTAATTTTATGTTTTCGCTATGTCTGGGTATATAAATTGATTCCAACATGCGGGAGCTTGTATCTAGAAATGGGCGGGAAAAAGCTAGAAATGCCTTCAAATGGATTCCCCTGTTTATTTAGAAACTGTTTGTTGTTGAAATAGCAACAGTTTTCAGTTAAATTAGTTTCGAAATATTCAACAACAGCTTATGGTCAGGGTTCATACAAACTTGAAAAGCCCTTGAATTTTGGCATCTGCCTTGAAAAGCCTTGAATTTGAAATTTTTCTTGAAAAGTACTGGAATTTCACCCATCCACCTTGAAAAGCCTTTTAAAATCAACATTTCCTCCCATGTGATTTTTACTGTCTGCAAAACATTCACGTACTGATGTAAATAAAGATTTAAGAAAATTTGATTGGCAATTTGACTGGCAAAATCCATCTGGAACCGAGTAAGTTCCAAAATTCAAACTAATTTTAAAGATTCTAAAGGTATGCTGTGTAAATCTTTGCATCAGTGTCATATCCTCACTTCATCCAGGATCCTGGTTCTGAGCCCTTAAGAAATCAACTTTTTTAGTCTTGAAAGTCCTTGAATAAGAAAACCTGCCAGCTGTATGAACCGTTACCTGTATGCATGTCTAACCTTATAATTGTCCAATTTTGTCATGAAAGTAAAAATATTTCATTATTGAATGTTCATTTGGTGGCCAAAAGACTACTTTTTGACAATTTACCACTGGAATGACTGGCTTGATAAAAAAAATCTCTTGATATGCAAATGGACATTTCGTGTCGTGGCTTAATACAAAAATGTGACTTTGACAGGCAGTTTAGTACAATATGTCATCCATATGACGGATGACATCTACTCTGCCTGGTAGTCATTTGTGTTGTTGGGAATTGGTACTATTTTTGTGATCAATGACTGGTTTTATATACTAACCGATGATCAGTTAATGATTGATCATAACAGATTCTCATTTTTTACCCATTTT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Protein

Gene family

Gene family	Subfamily
-	-

Pfam domain

Pfam accession	Pfam name	Description	Type	Source
PF02854	MIF4G	MIF4G domain	Repeat	Interproscan
PF09088	MIF4G_like	MIF4G like	Repeat	Interproscan
PF09090	MIF4G_like_2	MIF4G like	Repeat	Interproscan

InterPro

InterPro term	Type	Description	Source
IPR003890	Domain	MIF4G-like, type 3	Interproscan
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IPR016024	Homologous_superfamily	Armadillo-type fold	Interproscan
IPR027159	Family	Nuclear cap-binding protein subunit 1	Interproscan

PANTHER

PANTHER term	Description	Source
PTHR12412	CAP BINDING PROTEIN	Interproscan

Gene Ontology

GO terms	Category	Description	Source
GO:0000184	Biological Process	nuclear-transcribed mRNA catabolic process, nonsense-mediated decay	Interproscan
GO:0000339	Molecular Function	RNA cap binding	Interproscan
GO:0003723	Molecular Function	RNA binding	Interproscan
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GO:0005634	Cellular Component	nucleus	Interproscan
GO:0005845	Cellular Component	obsolete mRNA cap binding complex	Interproscan
GO:0005846	Cellular Component	nuclear cap binding complex	Interproscan
GO:0006406	Biological Process	mRNA export from nucleus	Interproscan
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KEGG pathway

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