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Detailed information of PE_Scaf6973_3.2 in Paraescarpia echinospica Gene info

Gene ID	Annotation	Chromosome	Start	End	Strand
PE_Scaf6973_3.2	ACIDIC LEUCINE-RICH NUCLEAR PHOSPHOPROTEIN 32	Superscaffold2	308654	318828	-

Gene Structure

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CDS

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PE_Scaf6973_3.2

GTTTTTGTGAGTTGGACGCAGCTAGGCACGCACTGGACGCACTTCAATCAACAAGCATTTCGCGCCGATCTTATACGAACGCTCATTGGACGATTTGAATGACATCGATAAATATGCATGAGTCGGCAGCCGTCTTTGGGGTTGGAGCAATTGGCCAATAGCGGTACCCCTCTGGGAAGCAATGACGAACCCGCGCGTTGTGGCGATCACTTCAGTTGTCGTGGTTTGAACAAGGAGGGGTAGTGTTTTACAATATAGTAGGTGTCTACAGAAGCTTCGTAAACAAAAATGGAGAAGAGGATAGAGTTGGAAAAGCGAGGCAGAGCTGCAGAAGAGGTTGGCATGTGCTTAGTTTAACTCGATTTATCTGTGATTGTATTTGTTTACGAGTGTGCAGCAGTACAAGATGATGATGATAGCGAATGAAGCGGGCTCATGTTCATAACGTTGACCGCACGTGTGCTTCCAGCCGGTCAAACTGCACGAATATTTTTACAGGCATATTTAAAAATGTAATACAACCACCAGTCGTTGACTATGTTATCTCCGATTATTTATATGCGGTCGGTCACGGCATAGTACCCTTACATTGAACTAGTCGAGCAGTCCTAAAACTTTCGGGGCCGTATCGCCTTCACATGGCTCTCAAATATGGCGCCCTTTTGCTTGAGCCTCAAAATTACTGGATACCAGCGATGGCGTTCAGAAAGATTATAGGCACGCTGATTAAACACAACTAATTGGTAAAATGTATATGTTATTGTGATATGGTAGTGGCACGAAGCCAAATGCTCTGCTGTCATCTGGTCGATCGTGTGTTGATGTGTTTTGTAAAACGATGCTGGGCGTCGTTGTTGGCACTGCTGTGTCAACAAGCACATCACGCATTTCGCATCCTTTTACTTGTATGCCACTGCGTAAAGGTGGATATAAAGAGATCATAATCCACGAAGATGTCATGAGCTACATGACCAATACAAATTGTTTAATGTGCATGCATATAGAAACACAGAACATCGATTTTATGTGGCGGTGGTTGGGAAGCCATTTTGTACTTGTAGTAGGATTGTGCTCTTCAATGACACTAGAGACAAGGGTGAATATCTTTATTAAATGTTGCTTTTAAATGACGGCAGTGTCTGTCCATATCAGTGCATTACAGTAGTTTTGCCATGCGAACAGTTTAATTATTTTTAAACATGCATATGAGCTAGTCAAGTGCTCAACATTGTATTACATATTTACGCCATATTGAATAAGTTGAGCAACCGTGAAGATTCATTTATACAAATGTTTAGGTGCCACAAGATACAGACGCACATTGCGTACTCTACTTTATAATTATGCTCCAGCTACGTGTTTGTACTTTTTCTAGGAAGTTGAATAGCGCGTAGCTAGCCCAGCGTCAGGTGCACGATGCCAGCGTGACCCAGTTATTGGCCGACGGCGCGGCAGGTCTACGCCGCTGCTAAACTAGATGCCATTGCCCAGGCCATGCCGCGTCGCGGAGTCTTTTGAGGAGCTGTGCTAATTTTTCGATTCATACCCTATTTACTCAACTGTTGTATGTAATAATTAAAATGTGTACCCTTCCACGTGATACAGTTTGACAGTTGTAAAAATGGTATGACGGCAAACATTATTTTCTAAACGATGCGGCACCATTCACTCGGTCGAAAACATCCGCCATATTGGCTTCGAACGACGTTTTGCACGTTTGTCAAATGCGCTTATTACGCGATATTGGTCCGTCAAATTCAGATTGTAGCGGAGTTTTTCAACACTATAACACAAAGTTCGTTCAGTATCAAAGATACCAACCTATAAGCTCCACTATTTTTTAGTAATTCGCGGTGATTCTGCGACATCATGATCGACACGACCAACGCCGCGCTAGACATCCTTTGTTCTGGCATTGGCTGGGCTTCGTGTGGAGCATTACATTTCCCCAATGTAAAAGAATGTAATTTTTCCAGACTGCAATTTCAGATGCATAATTTCGAGGAGTTAGTAATACTGATTAGCCTAAATTTACAAGACACATTTTAAAATTGACATGCGGCGCCGTGTTGCAATAACATTATCTATGCATAAATTATTACAATGAGGTCACCTGGTTGCGCTATTTGTGACTAAGAAAAGTTGCAAATAAAGTATGTCAGTTGAATGATGCATGACCAAATGCATGTTATCAGTATATTGTATTAGTTGAATAATACATATTGTAAATAGGTATTGGTGTTCAGTAAACACATTGTTTTTTCAGTGACTTGTATAATTGTTCTGTTTAATTGAGTTTACAGTCTGTTTATGCACGTAAACCTTATTTACGCATGGATTAGTATGTGGTTTTGAAATATGTATATTAAGTAAGGTTTATATTATAATTAAGTAAGAAAATCCACAGTAAATCTGTAAAACATTCAAAATATCCATGTTAAGTTGATGGTTCTGCAGTTTCCCAAACTCTTGTTTGTGTTTCTGGATGACAGGAACACAACAGATAATTTGACCAGTAAATAAACTAGTAAGCAGTGACGTCATCTTTTGATATTTTCTACATGTTAAAAGTGAAATGTTCTTGTTGTAGATCAAAGACTTGAACCTGGATAACTGCCGTGCTACACAGATCACCGGTCTGACGGAAGCATTCACCAACCTAGAGTCACTCAGCTTGATCAATGTAGGGCTAACAACGCTGAAGGGGTTCCCCAAATTGCCAAACTTAAGAAAGGTATGTTGTGCTACGGTTGCTACCAAATGCAGTTTTAAAAGACTTGATTGAATGCGTCAAGTGGTATCTCCTTGTTTATATGAATTTATCAAATTGCCAGCTACGTGTTTTAATTCCTGTTAAAACATGTAGGAGTAAGTTCGTGTAGTCATTACCACTATAATAACAATTACAACATGTGCCAATTGATTTGTACCATGATATACCTGATGTTTTATATGGTTTAGTATACAAAACGCATGCTTGTTTTGATAAAACATGATAAATTTGAACATCACCCGGATGCTCCATAAGACAATTAATTTTTTTTAATAATTGTATTTCAGCTCGAGCTCAGTGACAACAGGATATCAAGTGGCCTGAACTTACTACAGGGGTGTGCCAACTTGCAGTACCTGAATCTCAGTGGGAATAAACTGAAAGACATTGAGACATTAGAGCCCCTGGTGAGTGTTCATAGTGGTAATATCACATCACACTGATAGATCTGAGTAATTCTACAGCACCTCGGTGGTTGCAAATGATGACTATCTACGATCCAATTCTGAATCAAATGTGTGGCACACTGTTTCTGACTGATGCAACTACGACTTTATCTAGAGACCAGTCATTTGTACAGGAGACGTTTGTTTTGGAGGGGATATAATTTGAGCAGATGAGAACAACCCAGTTAAACATTTGCAGACAGCATTGTGATTTGAATATTTACCATCATATTGGGGATTGTTTGGCTTCCTGCTTTTCCAATTTTTTATAATCACAAAATGTTTACACAAATTACGTTTCAAAAAAGTGTTTTGTTGCAGGAATGAAAATATCGGCCTATGTAGCATTATACAGAATATTTTATGAGTGCAGTCTTGCTTGCTAACTGAACTGATACCATAAACATAAAATATGTTGCTTACAGAAAATAATATTGAGATGCCATAATTTAGCTACGGCTGTTCTTTTGTTTTGAATCCGCAGAAGGACTTCAAAGACCTGAAGAACCTAGATTTGTTTAACTGCGAAGTAACAAACATAGAGAACTACCGCGAGAAAGTGTTTGAGTTGCTCGAGGGACTGCAGTACTTGGACGGCTACGACCGCAACAACCAGGAGGCTGATGACGGGGAGGAGGACGAAGATGAGGATGGAGAAGACTCGGATGAGGACGGTGAGTTGTTTCTTACTCTTTAATTGTAACACCATATCCCCTGAGTTTGTTACTCTTCTATCTGTAACACCATATTCCATGAGTTTGTTACTCTTCTAACTGTAACACCATATTCCCTGAGTTTGTTACTCTTCTAACTGTAACACCATATTCCCAGGGGATTCAGATATAAAGGATATTAAGTTTTATTTGTACCTAACATTTCTCTGATGGTTTTTAGTTGTTTCATTGAGTGATCGTGTGGGTTTACTGTATAACATTTTGTATTTTTAGCCATTTGAACGAGTTATTTTTCTTTGGTAGCCAATTTTGCTCCCAGCCAAATTGACAAAAAAAGTATTACATTTTTTTAGCCGAACTGTGGACCTAGATAATTAATTGTTTTTGCCCCTATTGGCACTAATCAAGATATTTCCTGTTCCAATGTATCGGTTGTATGTCAAGAAAACCATTGCCTGAAACATATTCTAGCGTATGACGCCTTCGAAGTTCTGTTGCATTTTACATGTTTCTTACAGATGAGGATGAAGATGGTGATGAAGTAGTTGACGTTGATGAGGAGGATGATGATGACGATGATGATGACGAGGATGGTGAAGATGATGATGAAGAGGAGGTTGGTCTCAGCTATCTGGAGAAGGAAAATTTGGAAGTTAGTCAAACTATGTTTCTGGGCCAGGATGCAGATCCCAGGATCCACTGATGCAGGCCTGCGCATTGCATAGTTTTGGGTATAGATCAAAGCAACTGCAGCTCTGTGTCCTGGGATCTGAACATCTTTTTGTCGTTGTAGTTAGTAATTGTCTTGTGATAAAGTATAACTGTCTTAGTTTTCTAATTTAGAGAGACCATTGCACACAATTGTTTGTATAGTGCATGAATGTAACACCTTTCCAACTTGATATAATGTATGTATAAAATAATCAACACCATTTATTCGTGAGTTTAAAACAAATATGCAGATAAAAATATTGTTGCCACAACATAAATATATTATGTTTTATAGCATTGATATCTTAAGGATGGTATGGCAGCTAGATATGAAATTTGTTTTAAAAGCTTAATTGATATATTGACATTTTTTCTGCCCGACCCCGCATTTCCATG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Protein

Gene family

Gene family	Subfamily
-	-

Pfam domain

Pfam accession	Pfam name	Description	Type	Source
PF14580	LRR_9	Leucine-rich repeat	Repeat	Interproscan

InterPro

InterPro term	Type	Description	Source
IPR001611	Repeat	Leucine-rich repeat	Interproscan
IPR032675	Homologous_superfamily	Leucine-rich repeat domain superfamily	Interproscan
IPR045081	Family	Acidic leucine-rich nuclear phosphoprotein 32	Interproscan

PANTHER

PANTHER term	Description	Source
PTHR11375	ACIDIC LEUCINE-RICH NUCLEAR PHOSPHOPROTEIN 32	Interproscan

Gene Ontology

GO terms	Category	Description	Source
GO:0005515	Molecular Function	protein binding	Interproscan
GO:0005634	Cellular Component	nucleus	Interproscan
GO:0042393	Molecular Function	histone binding	Interproscan

KEGG pathway

KO	Enzyme	Enzyme ID	pathway	mapID	Source
-	-	-	-	-	-

Expression pattern

1. Expression trend for PE_Scaf6973_3.2 global RNA-seq network