Gene detail

Detailed information of PE_Scaf6877_8.10 in Paraescarpia echinospica Gene info

Gene ID	Annotation	Chromosome	Start	End	Strand
PE_Scaf6877_8.10	LEUCINE-RICH REPEAT-CONTAINING	Superscaffold3	45244076	45266443	+

Gene Structure

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CDS

PE_Scaf6877_8.10

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PE_Scaf6877_8.10

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Protein

Gene family

Gene family	Subfamily
-	-

Pfam domain

Pfam accession	Pfam name	Description	Type	Source
PF08477	Roc	Ras of Complex, Roc, domain of DAPkinase	Domain	Interproscan
PF12796	Ank_2	Ankyrin repeats (3 copies)	Repeat	Interproscan
PF16095	COR	C-terminal of Roc, COR, domain	Family	Interproscan

InterPro

InterPro term	Type	Description	Source
IPR002110	Repeat	Ankyrin repeat	Interproscan
IPR003591	Repeat	Leucine-rich repeat, typical subtype	Interproscan
IPR020859	Domain	Roc domain	Interproscan
IPR027417	Homologous_superfamily	P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolase	Interproscan
IPR032171	Domain	C-terminal of Roc (COR) domain	Interproscan
IPR032675	Homologous_superfamily	Leucine-rich repeat domain superfamily	Interproscan
IPR036388	Homologous_superfamily	Winged helix-like DNA-binding domain superfamily	Interproscan
IPR036770	Homologous_superfamily	Ankyrin repeat-containing domain superfamily	Interproscan
IPR050715	Family	Leucine-rich repeat and signaling effector domain-containing protein	Interproscan

PANTHER

PANTHER term	Description	Source
PTHR45752	LEUCINE-RICH REPEAT-CONTAINING	Interproscan

Gene Ontology

GO terms	Category	Description	Source
GO:0005515	Molecular Function	protein binding	Interproscan
GO:0007165	Biological Process	signal transduction	Interproscan

KEGG pathway

KO	Enzyme	Enzyme ID	pathway	mapID	Source
-	-	-	-	-	-

Expression pattern

1. Expression trend for PE_Scaf6877_8.10 global RNA-seq network