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Detailed information of PE_Scaf6091_0.6 in Paraescarpia echinospica Gene info

Gene ID	Annotation	Chromosome	Start	End	Strand
PE_Scaf6091_0.6	EGF-LIKE DOMAIN-CONTAINING PROTEIN	Superscaffold4	5084940	5103385	+

Gene Structure

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CDS

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PE_Scaf6091_0.6

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Protein

Gene family

Gene family	Subfamily
-	-

Pfam domain

Pfam accession	Pfam name	Description	Type	Source
PF00008	EGF	EGF-like domain	Domain	Interproscan
PF00235	Profilin	Profilin	Domain	Interproscan
PF07699	Ephrin_rec_like	Tyrosine-protein kinase ephrin type A/B receptor-like	Domain	Interproscan

InterPro

InterPro term	Type	Description	Source
IPR000152	PTM	EGF-type aspartate/asparagine hydroxylation site	Interproscan
IPR000742	Domain	EGF-like domain	Interproscan
IPR001881	Domain	EGF-like calcium-binding domain	Interproscan
IPR011641	Domain	Tyrosine-protein kinase ephrin type A/B receptor-like	Interproscan
IPR018097	Conserved_site	EGF-like calcium-binding, conserved site	Interproscan
IPR036140	Homologous_superfamily	Profilin superfamily	Interproscan
IPR048278	Family	Profilin	Interproscan
IPR051830	Family	Neurogenic locus notch homolog	Interproscan

PANTHER

PANTHER term	Description	Source
PTHR24033	EGF-LIKE DOMAIN-CONTAINING PROTEIN	Interproscan

Gene Ontology

GO terms	Category	Description	Source
GO:0003779	Molecular Function	actin binding	Interproscan
GO:0005509	Molecular Function	calcium ion binding	Interproscan

KEGG pathway

KO	Enzyme	Enzyme ID	pathway	mapID	Source
-	-	-	-	-	-

Expression pattern

1. Expression trend for PE_Scaf6091_0.6 global RNA-seq network