Gene detail

Detailed information of PE_Scaf5154_8.2 in Paraescarpia echinospica Gene info

Gene ID	Annotation	Chromosome	Start	End	Strand
PE_Scaf5154_8.2	URIDINE KINASE	Superscaffold9	23462258	23486694	-

Gene Structure

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CDS

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PE_Scaf5154_8.2

CTCGCTTATTAGCTACTAGGTGGCTCTACCAATTTGTGAACCGATGCTTTTTTAACAGCGGAGACAATTTTTCTGCTCTAATTTTCCAGTCAGTCAGCGTAGTTACCTTACCTGGTTGGCCTAGCTGACGTAATAGGTACTTTTTTGCAAATATACATGAAATCCTGATCTAAACTGCTGTTGCGTCACCGGTAACATAGTCGCAAGGTGGCGCCACTCTATCTGGCGTTCCGTTGTAGTAAACATCAAAGATGGCTTCTAGCGGACAAGACGATCAAACGACTGCAGTCAGAGTTAACGGGTTTAATGATGTTCCTAAGCCATTTCTCATTGGTGTTAGCGGTGGCACTGCATCCGGAAAGGTTTGTGAATGTGTTTAGTCATTAGTAGCCACACAGGTAGTTAACATTTTAAACCAGCACTATGAATTAAATGTGAAGGTTACGTCTTGCGATGCATCTGATCTGTGTCCTGACATCTCATCTGTTTATCATTAATTTATGATTATCAGTAGCACGAGGACACCAACCCCTCCGTAAAAATTACGTCCATGTGATTATTCTTTTATTTTGTAAAATCACTTGGGTACCATTTACATGTGTCACATCAAGATTCTAGTTTTTATTTGTAAATGTATTTTTTAAGAGTTTTGGTCTGCTGTCGAACACAGGCCCAAACGTGGCAAACGAGGCGCCGGCGAATGCATTAATTTTCATTTGACGTCTCAATAAATTTGTCGTCTGCTAAAACGGATTGTTTGCGCATGTATATACTTTACTACAAGAGTGTGAGTCAGGCTAGACTAAGTATAACTAACTAATACTTAGACTTAGAGAACTTAAAAGGAGAATAAGAAATGCAGAATATGCAATATTTAAATTAATAATTATTTATTTAAAAACCTAATGTAGTAATGGGTGTCATGTCTTGTACGTCACTTTGAATCTTCTTTTGTCTTTACTTGAGTCTTGAGGGATATCAATGACAAAGTTGAACTGTTGTGAGTCGACTGTCAAGACTCAAGTGGATCTACAAAATCGTGGACCCTTTTCAAAGCCAAATACCTGTTTTAAAACAGGAAACAATAATTTTGGGCCTATGGCTAAACAACTAAAATAGTTAATAAAAGTAAATTAACCAATTACACCTATATAATCAACAGTTCCACACAGGCTAGTGGTTTACGCAGAATCATTCTGAGTTAAATGTCACTTTGAGAATACATTCTGAATGTATTATCAACGTGCATGTTAACTTATAGTCTGATAAAATCTTATAAGTTTCTGATGGCTGACATATTGGGACACTATCCTCCCCCTAATACATAACCAACAAGAGCCAAGTTTTTGTTGTGTGGGTGTAGTGTGTGTATGCATGTCCAAGTATTTGTATGTATGCCAGGGCTGATATTCTGTAGATGGTGGTTCATTTTGTACAAAGGTGGTTCATAATTTTTAGGTTTTCACATTTTGCTCAGGGCCTCAGTGGTATGTGATCTTGGTAGGTTCAACATAATATTCTTTTGGATGCCATCATAGTTATAAAGATGCCATAAATCTGGACATCTGTGCAGGTATATTTTATTTTAAAATATTTGCTGTTTATAGCTTCTATAAGTTGGCTATAGTTAAATTTATTTGAACCAAAGAGCGGTCATATCTTACTGAGGAATCAGGAATGGGCTCAGTTTTAAATGTGCACACTGGATTTTCGGAGTGGGCTGGATTTAAGCGACATCTTTTGGATAGGTAAATTTTCAGTGTTCAGAATTATGCCAGTTAAAAAAGTGGGGGATAAGATTATAGTGCACATGTATGTAACCATATCGCCGGCCAATGTTTTGATGGGCCAAAATGTGATCCTAGGTGAATCTATGCATCCGTGTGATATCTGTGTGTTGTTCTTGCAGTCAACAGTCTGCAGCAAGATTATGGCTGACTTGGGACAGAATGACATAGACCAGAAACAGAAGCAAGTGGTGATTATCAGCCAGGAGAGCTTCTATTACCCTCTCAGCAGTGATGACGAATCCCGCGCCAGCAGAGGACAGTACAACTTTGATCATCCTAGTAGGTTCACCGCAATTTAGTCCCATTCACACAGATAAAATATTACAGTAAATGTAAAGTAAAGGTCTTATATAGCGCATAACCAGTCCTCAGGACTGCTCAAAGCGCTTTACATTTTACTCCCTAGCAGACCTGTTGAATCGAACACCATCTCTGGGAAGCATTCAGCCACGCTGCAATTAATGCGCGAAGACTATTCGTACACAAATATCCACCACTATAGCCAGGTACTCCTTCATACAGCGAACCTTCATACAGTGAACTGAACCAATGTAGAGTAAACAAACTTGCCCAAGGTTCGACACCGCCTCACAGGATTCGAACCCGCGTTCTCTCAGTCGAGAGTCCGGAGCTCTTAGCGCTGCGCTACTGCGCTCCACCAATGTAAAATGTAAGATGTGTCACACACACAGACACGCACACACCCACACACACCACACACGTACACACAACAATCAAACTCACTCAGTTGTGTGCTCGCTCGCTCGCACGCAGTGCGCGAGGAAAGGTTGACATGGAGAGCATAGAAAACAGAATGGTGGTAGAACTAGAGGGAAAAGACCAAAATTAAGACAAAGAGACACTGTCAAGAGAATTCTCGAAAGGGAAGGGATGAACAGTCGGAGCTGGGAGACAACTGATGGTCCCGCAATGTCACAGTTTGATTATGTTGAAATCAGAATTATGCACAAGGCTTTGCCTTTGCCAACAATGTTGATAACAGTTACATCTGCGAATTAGATTACTATTGCTGCATGGAATCTCATAAACAAAAACACATTTCCACATATAGGTGTCACTTTTAACCATTTCAGTGCTGGGTTTCTGGCCACTCAGTTACCACTGAATACTGAGTTTCTTTTGAGCTTTCAGTGAAACAGGATAATACTTTTTTAACTTCACTTTTTACACAGAAGGGTGCATTTAGAAAAAGGAACGCTGTTTATATTAGTAAACTAGGTTTATCAAAGAATACTGTAAGTACACAAATTGTAAGATTGGTTGCCATTGAAACCAGGAAATTCAAGATGGTGGAACACACATACCCGGTATGTGTTTTAGCGTGTTTCTCATAGAAATATACATTTTTTAGTAGGAACACCACATACATTATGAGACCAAGACCATCAAGGAATATTATGGACATGTCCATTATCACAACAGTTGACACAGAAACCAGTAAACCCGAGATCAACTGTTTTGCTGTGATGAAACTTGAACTGACATGACTGACCTACAACTGTGCCACAATTTTGAAAATTCAGTGTTGACTAATTGTACTAATATTTTATAATATATAATATTCTGTAATTTGTTACAGTTACTATACAAATAATTATTGAATAGTAAACGTGACATTTTCCTAAGTAACAGGTCATATGATGGATGGGTCAATTGCAGAAAATTGGGACAGGTGGAGAAATATCATCATTGTAACTGTAAGGGTGGAACTGACAGAGTGACGTTACTCCCACCCAAAAAGAGACGAACAACGAAGACTAAGAAGTTACAACTGGTAAGTAGTATAATTTACTATGTATTGTCATAACGATGGTTGCTTGTATCATTAAGTCCTATTCATTGGCTTGTTTCAGGTGCAGTGGATGATGAACTGATCCTACACACTCTGTCCGATCTGAAGCAAGGCAAGGCTGTGAAGATCCCCGAATATGACTTTGTCACTCACAGCAGGTTTGCGTGAAGATAATTATTATGACATGATCTGAAAATGACAGGATCCTGACCTGCAGATGGCAGGATGCAATATCCTGTGTTATAAAATGTGGCTCTCTGCAAAATATATTTAAGATTAATAAAATCACTTAGATAAAGGGCTGAATTGTGTCACATGTTTGTGGGAACTTCATTGTGTTAGATCCATTGTGATGAGTTAAATAGATTATTATTTCGTGCTGTAATCTACTACCAGACCAATATTTCATAGTTTTAAATATACCTTAAAATTGAAAGAAATAGCCAGTTTCCTTTTCATCATACACTCCCCTCATGACTGCAACACACCATTATGTCTTGAAAAGAGTATATCTACCCCATTTTGTCTACAAAATTACTTGGTTCCCATCTAGAGACCCATTGACCTGTCTTGTGGATGGTCTGAGTTCGTTTTGGATGTGTGGAAATTTTATCTGAGTGGTTAAAAGATATATGTCCATTATGGTTTAAAATTGTGTGTCACATTGGTGTTTGCATGCTTTATTGCATACATATGTATTTATGTATATATATATATGTGTATATATATATGCTCGTTTGACTAGATTGTATGTGTGCGAACACCGACGCACGTGTCTACCAGAACATTTTTGGACTGGTAAAAAAGTGATCCTGCATAAAGGCCTGTTGGTATCTCGGCAAAATCTGTGAGTTAAGATGGAGTTGTGTTGTAGGAAGCCAGATGCTTGGCGGACAGTCTACCCGGCGGACGTGATCCTCTTCGAGGGAATCCTCGTCTTCTATTTCAAAGACATCCGAGAGTTGTTTGACATGAAGCTGTTTGTTGACACCGACGCTGATACGAGACTGTCAAGGCGAGGTGGGCTATCTTTTTAATGTTTTGAAGTACTTGTACTAATGTACTTGTGTAGTTATGTCCATCTAACACCTCACTTGAAAAAGCCATGATCTCGTGTGAGAAGCGCTTGCTTGTGTTTATGTATACATTAGTCACCCAATAGTGGAATCAACAAAGAAAGAACATGTTTTGTTCAAATAAACTCCTCCGTCATGTTGATTAAAATATATGTGATGAAATGAACATTTCGATGATTAAGTTGAACAAACATAAACCACCTTTGCATGCTCGTCGGACATCATCATCATCATCGTTTTATTGCATGTAACATGACTAATGGTGCAAGCGTGTTTTGGCGGTAACAAAATTTTGACGTTTTAAACTTGTAAGTACTCCAT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Protein

Gene family

Gene family	Subfamily
-	-

Pfam domain

Pfam accession	Pfam name	Description	Type	Source
PF00485	PRK	Phosphoribulokinase / Uridine kinase family	Domain	Interproscan

InterPro

InterPro term	Type	Description	Source
IPR000764	Family	Uridine kinase-like	Interproscan
IPR006083	Domain	Phosphoribulokinase/uridine kinase	Interproscan
IPR027417	Homologous_superfamily	P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolase	Interproscan

PANTHER

PANTHER term	Description	Source
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Gene Ontology

GO terms	Category	Description	Source
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GO:0005737	Cellular Component	cytoplasm	Interproscan
GO:0016301	Molecular Function	kinase activity	Interproscan
GO:0050262	Molecular Function	ribosylnicotinamide kinase activity	Interproscan

KEGG pathway

KO	Enzyme	Enzyme ID	pathway	mapID	Source
-	-	-	-	-	-

Expression pattern

1. Expression trend for PE_Scaf5154_8.2 global RNA-seq network