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Detailed information of PE_Scaf3992_18.7 in Paraescarpia echinospica Gene info

Gene ID	Annotation	Chromosome	Start	End	Strand
PE_Scaf3992_18.7	DEADENYLATION COMPLEX CATALYTIC SUBUNIT PAN2	Superscaffold4	30992651	31014148	-

Gene Structure

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CDS

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PE_Scaf3992_18.7

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Protein

Gene family

Gene family	Subfamily
-	-

Pfam domain

Pfam accession	Pfam name	Description	Type	Source
PF00929	RNase_T	Exonuclease	Family	Interproscan
PF13423	UCH_1	Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase	Domain	Interproscan

InterPro

InterPro term	Type	Description	Source
IPR012337	Homologous_superfamily	Ribonuclease H-like superfamily	Interproscan
IPR013520	Domain	Exonuclease, RNase T/DNA polymerase III	Interproscan
IPR028881	Domain	PAN2, UCH domain	Interproscan
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IPR036397	Homologous_superfamily	Ribonuclease H superfamily	Interproscan
IPR038765	Homologous_superfamily	Papain-like cysteine peptidase superfamily	Interproscan
IPR050785	Family	PAN2-PAN3 complex catalytic subunit	Interproscan

PANTHER

PANTHER term	Description	Source
PTHR15728	DEADENYLATION COMPLEX CATALYTIC SUBUNIT PAN2	Interproscan

Gene Ontology

GO terms	Category	Description	Source
GO:0000289	Biological Process	nuclear-transcribed mRNA poly(A) tail shortening	Interproscan
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GO:0003676	Molecular Function	nucleic acid binding	Interproscan
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GO:0031251	Cellular Component	PAN complex	Interproscan

KEGG pathway

KO	Enzyme	Enzyme ID	pathway	mapID	Source
-	-	-	-	-	-

Expression pattern

1. Expression trend for PE_Scaf3992_18.7 global RNA-seq network