Gene detail

Detailed information of PE_Scaf2160_3.7 in Paraescarpia echinospica Gene info

Gene ID	Annotation	Chromosome	Start	End	Strand
PE_Scaf2160_3.7	PROTEIN CBG18333	Superscaffold3	25637611	25664210	-

Gene Structure

More details in Jbrowse Sequence

CDS

PE_Scaf2160_3.7

ATGTTGCGACAGCAACACCAGCAGGGCGTTGACCCGACTTCCTTCTACACCACGTGGAGTCATGTAGACTCACAATCCACCGCACCCACCGATGTCTCCCTCAACTTCACCTCAACCTCTGATACTCACCTGTCCCCTGACCAGCTCATCGGTAATGCCTTCTGTGGTGATGCAGCCGACAAGTTCAAGGCCAGCGAGCAAATCTTCGAGAAATTGAGTGGCTCCACAGTCGACAGGATGGTCGACGGCCTCGGGTCAAACGTGTCGCCGAATGCGGAGTTCGTACTTGACGAATTCCTCTCGAAACTCATCGACGATGACCCGCATTCACAGCTGAGCGTCGACAATGGCTTCTGCGATGGAACCAACATTGAGTTAAAGTCGAAGAGTACGCACAGTGGAGATGTCTACTCATTTGACGGTTCTCCGGGGCATAACCTGAGCCTGTGGTCAGGTGGCGCCACCAGTAGCACACCGTCCATTCACTCAGAGCACAACTCGGTGTCGTATGGCAGTCTGGAGCGCACGGATCACCTGTGGGACCTTGACCAGCACGACCTCGGATCCAGCTTCCTGCCGGACACGTCCACAGGGTACGACCCTGCGTACGGCGCGAGGGAGCAGTCGCACCAGTCACAGTACAGCCGCGAGAGACTCCACTACACCAAGTCCCTGCAGCAGCAGTTGCCGCTGTTCACGTCGCGTCACCTGTCCGATGGCACCGACATGTCGATGTCATCGTCACAGCACCAGGCTGTCAGCGCGGAGCAGCGACAGAGCGTAGGTCACGGTCGCGTTTTCGGAGTGGACAAGTGGCATGCCTCTGAATTTGGCAGCGGGCAGGATGACGTGTTTTGCGAGAGCGCACATTTTGAGGCGCCATCTCGTGGCAGGTACGGCGCGCTGTACATGCATCCGACAACAAACGGCCACGACGTGTCGCCACCCGCCGACGTCTTCGACAAGGAGCTGCTCGTGAAGAAGTTGCTCGCACAGCAGCAGGCGCAGCAGCTACAGATGTCAGCAGGTGGCGGTACTGTCTGTGGCGGCAGCGATCTGTTGCAGTCGGCCATCAGGGAAAAGACATACGATCGCGGGCGGCTCCACGTGGACATGCGGCCATGCGACTCACACACCATGCAGTTCCGCTCGCAGCCGCCAGTTGGCAGTGTGATGCAGCCGATTTCTGTGATGACGCAGAGTCCTGGCGGCTACCTCGGCGGCGTATACTCGAATCCGTGCACGCCGGATTCGCTGAGTGACGGCGTCGGTGGCCAGGTGCCTTTCGAAGTACAGCAACAACAGCAGGCGGTTGCCAACGCCCGCTACCACCGCATGCTCATGCAACAGCAGCAGCAACAAAAGGTTGGGTATCAGAAGTTCATCCCCCATTCCGTGCCTCACCAGTCCCCAATTGCGACTACATACGAGAGGCGGCCGACCGTCGCTGCCCAGCCCGGCCCAGTGGCGTCTTACCGGGCAACACACAGCTTCCCATTCTACACCCGCCAACGCCATGTCAGCGATACGGGATACAATGCACGATATGCAGGTGGCAGCACTGAGGCGTGCCTGCCACATGGCAGCCTCTCACTCCCCGACCACTTCTCTACCGAGCAGCCCGTGCCATTCCCGAAGGAGTTCGCCTACGCACACCACCATGGCCAGATCATCGACGACATGGTAATGCCGGAGTTCGCCTCTGGGTTGCCGCCGGCAACAACCGCGTTTCCTGCAAAGTTCCACCCCAGTTTCCCGCCGCCCCAGTTGCAGGGGCAGTTCGGCATGGAGGCGACCTTTGACCCGTACTGCCAGCAGTTCGAGCCGTTCATTCGTGGAAGGATGGCACCACCGTTCTTCAGCGCCGGTCATGACGTGTACTTTGATATGTTTTCACATCATTTCCTCAACGGGATGCCGCCATTCTTTCACGGATTTAAGCCTCCTCGGCGTACTGGACCCTCCAACGAGCTGCATGTGTGCTTAGAGGAAGCGTCGGAACAATTCAAGAACTTAGAAAAAGAACGCAAAAAGACTGAGGCTGAGTTGGCACGTCAGAACCCTGGCAAGAAACTGTCGAGTGCGAACAACATCACCATTCCCCGCCTGCCCTCCAACCCCTCCAGAGTGGACCGGCTCATAGTCGACTCACTGCGTGAACATGCCAAGGTGACGACTCTGAACAGTAAGATGGAGAAGCTGCGGGGAAAGACGCTCCACGCCAACATCCTCTCCGCCATGGACATGTGGCTTGAGGGCATCCGCAAAGTACAGACCAGGCGCAAGGAGGAGATCATCAACGCCACTAACCGACACCGCAACGGCGGCCCTCGCTACCAGGAGGAGAAGGATGTGCTGGCGCTGGCCGCGGCCATCCGAGAGTTGACGACGCTGACCCGCCGCAGTCGCACAGCCATGTGGTGTGCCCTGCAACTGTCCAGCCAGGACATGCCCCCGCAGTGCCTCAAGTCAGCCGAGATGGCCAGTCACGGCTTCTCGAACTTTCTCGGTACCAGCGTCATCGGACAGGTGGACGCGACCTCAGACGGAGGTCAGGAGATTAAGGACAGCGACGTTGCGAAAGATGGGGTCGAGAGCAATTCGGAGAACTGA

Transcript

PE_Scaf2160_3.7

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Protein

Gene family

Gene family	Subfamily
-	-

Pfam domain

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InterPro

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PANTHER

PANTHER term	Description	Source
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Gene Ontology

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GO:0005634	Cellular Component	nucleus	Interproscan
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KEGG pathway

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-	-	-	-	-	-

Expression pattern

1. Expression trend for PE_Scaf2160_3.7 global RNA-seq network