Gene detail

Detailed information of PE_Scaf1489_1.3 in Paraescarpia echinospica Gene info

Gene ID	Annotation	Chromosome	Start	End	Strand
PE_Scaf1489_1.3	37S RIBOSOMAL PROTEIN S26, MITOCHONDRIAL	Superscaffold6	71049940	71061971	-

Gene Structure

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CDS

Transcript

PE_Scaf1489_1.3

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Protein

Gene family

Gene family	Subfamily
-	-

Pfam domain

Pfam accession	Pfam name	Description	Type	Source
PF00081	Sod_Fe_N	Iron/manganese superoxide dismutases, alpha-hairpin domain	Domain	Interproscan
PF02777	Sod_Fe_C	Iron/manganese superoxide dismutases, C-terminal domain	Domain	Interproscan

InterPro

InterPro term	Type	Description	Source
IPR001189	Family	Manganese/iron superoxide dismutase	Interproscan
IPR019831	Domain	Manganese/iron superoxide dismutase, N-terminal	Interproscan
IPR019832	Domain	Manganese/iron superoxide dismutase, C-terminal	Interproscan
IPR019833	Binding_site	Manganese/iron superoxide dismutase, binding site	Interproscan
IPR036314	Homologous_superfamily	Manganese/iron superoxide dismutase, C-terminal domain superfamily	Interproscan
IPR036324	Homologous_superfamily	Manganese/iron superoxide dismutase, N-terminal domain superfamily	Interproscan

PANTHER

PANTHER term	Description	Source
PTHR43595	37S RIBOSOMAL PROTEIN S26, MITOCHONDRIAL	Interproscan

Gene Ontology

GO terms	Category	Description	Source
GO:0004784	Molecular Function	superoxide dismutase activity	Interproscan
GO:0006801	Biological Process	superoxide metabolic process	Interproscan
GO:0046872	Molecular Function	metal ion binding	Interproscan

KEGG pathway

KO	Enzyme	Enzyme ID	pathway	mapID	Source
-	-	-	-	-	-

Expression pattern

1. Expression trend for PE_Scaf1489_1.3 global RNA-seq network