Gene detail

Detailed information of PE_Scaf12331_0.15 in Paraescarpia echinospica Gene info

Gene ID	Annotation	Chromosome	Start	End	Strand
PE_Scaf12331_0.15	BETAINE--HOMOCYSTEINE S-METHYLTRANSFERASE 1	Superscaffold11	18555712	18572741	+

Gene Structure

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CDS

Transcript

PE_Scaf12331_0.15

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Protein

Gene family

Gene family	Subfamily
-	-

Pfam domain

Pfam accession	Pfam name	Description	Type	Source
PF02574	S-methyl_trans	Homocysteine S-methyltransferase	Family	Interproscan

InterPro

InterPro term	Type	Description	Source
IPR003726	Domain	Homocysteine-binding domain	Interproscan
IPR017226	Family	Betaine-homocysteine S-methyltransferase, BHMT	Interproscan
IPR036589	Homologous_superfamily	Homocysteine-binding domain superfamily	Interproscan
IPR051524	Family	Betaine-homocysteine S-methyltransferase	Interproscan

PANTHER

PANTHER term	Description	Source
PTHR46120	BETAINE--HOMOCYSTEINE S-METHYLTRANSFERASE 1	Interproscan

Gene Ontology

GO terms	Category	Description	Source
GO:0008168	Molecular Function	methyltransferase activity	Interproscan
GO:0008270	Molecular Function	zinc ion binding	Interproscan
GO:0009086	Biological Process	methionine biosynthetic process	Interproscan
GO:0047150	Molecular Function	betaine-homocysteine S-methyltransferase activity	Interproscan

KEGG pathway

KO	Enzyme	Enzyme ID	pathway	mapID	Source
-	-	-	-	-	-

Expression pattern

1. Expression trend for PE_Scaf12331_0.15 global RNA-seq network