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Detailed information of PE_Scaf12158_1.1 in Paraescarpia echinospica Gene info

Gene ID	Annotation	Chromosome	Start	End	Strand
PE_Scaf12158_1.1	U1 SMALL NUCLEAR RIBONUCLEOPROTEIN 70 KD	Superscaffold6	17540902	17567580	+

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CDS

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PE_Scaf12158_1.1

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Protein

Gene family

Gene family	Subfamily
-	-

Pfam domain

Pfam accession	Pfam name	Description	Type	Source
PF12220	U1snRNP70_N	U1 small nuclear ribonucleoprotein of 70kDa MW N terminal	Family	Interproscan

InterPro

InterPro term	Type	Description	Source
IPR012677	Homologous_superfamily	Nucleotide-binding alpha-beta plait domain superfamily	Interproscan
IPR022023	Domain	U1 small nuclear ribonucleoprotein of 70kDa N-terminal	Interproscan
IPR035979	Homologous_superfamily	RNA-binding domain superfamily	Interproscan
IPR051183	Family	U1 snRNP 70 kDa and U11/U12 snRNP 35 kDa	Interproscan

PANTHER

PANTHER term	Description	Source
PTHR13952	U1 SMALL NUCLEAR RIBONUCLEOPROTEIN 70 KD	Interproscan

Gene Ontology

GO terms	Category	Description	Source
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GO:0003676	Molecular Function	nucleic acid binding	Interproscan
GO:0003729	Molecular Function	mRNA binding	Interproscan
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KEGG pathway

KO	Enzyme	Enzyme ID	pathway	mapID	Source
-	-	-	-	-	-

Expression pattern

1. Expression trend for PE_Scaf12158_1.1 global RNA-seq network