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Detailed information of PE_Scaf12039_13.1 in Paraescarpia echinospica Gene info

Gene ID	Annotation	Chromosome	Start	End	Strand
PE_Scaf12039_13.1	MYD88	Superscaffold3	22484743	22512152	+

Gene Structure

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CDS

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PE_Scaf12039_13.1

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Protein

Gene family

Gene family	Subfamily
-	-

Pfam domain

Pfam accession	Pfam name	Description	Type	Source
PF13676	TIR_2	TIR domain	Domain	Interproscan

InterPro

InterPro term	Type	Description	Source
IPR000157	Domain	Toll/interleukin-1 receptor homology (TIR) domain	Interproscan
IPR011029	Homologous_superfamily	Death-like domain superfamily	Interproscan
IPR017281	Family	Myeloid differentiation primary response protein MyD88	Interproscan
IPR035897	Homologous_superfamily	Toll/interleukin-1 receptor homology (TIR) domain superfamily	Interproscan

PANTHER

PANTHER term	Description	Source
PTHR15079	MYD88	Interproscan

Gene Ontology

GO terms	Category	Description	Source
GO:0002755	Biological Process	MyD88-dependent toll-like receptor signaling pathway	Interproscan
GO:0005886	Cellular Component	plasma membrane	Interproscan
GO:0007165	Biological Process	signal transduction	Interproscan
GO:0008063	Biological Process	Toll signaling pathway	Interproscan
GO:0034142	Biological Process	toll-like receptor 4 signaling pathway	Interproscan
GO:0035325	Molecular Function	Toll-like receptor binding	Interproscan
GO:0043123	Biological Process	positive regulation of canonical NF-kappaB signal transduction	Interproscan
GO:0045087	Biological Process	innate immune response	Interproscan
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GO:0070976	Molecular Function	TIR domain binding	Interproscan

KEGG pathway

KO	Enzyme	Enzyme ID	pathway	mapID	Source
-	-	-	-	-	-

Expression pattern

1. Expression trend for PE_Scaf12039_13.1 global RNA-seq network