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Detailed information of PE_Scaf11661_25.6 in Paraescarpia echinospica Gene info

Gene ID	Annotation	Chromosome	Start	End	Strand
PE_Scaf11661_25.6	GENERAL TRANSCRIPTION FACTOR IIF SUBUNIT 2	Superscaffold2	2274536	2286193	-

Gene Structure

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CDS

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PE_Scaf11661_25.6

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Protein

Gene family

Gene family	Subfamily
-	-

Pfam domain

Pfam accession	Pfam name	Description	Type	Source
PF02270	TFIIF_beta	TFIIF, beta subunit HTH domain	Domain	Interproscan
PF17683	TFIIF_beta_N	TFIIF, beta subunit N-terminus	Family	Interproscan

InterPro

InterPro term	Type	Description	Source
IPR003196	Family	Transcription initiation factor IIF, beta subunit	Interproscan
IPR011039	Homologous_superfamily	Transcription Factor IIF, Rap30/Rap74, interaction	Interproscan
IPR036388	Homologous_superfamily	Winged helix-like DNA-binding domain superfamily	Interproscan
IPR036390	Homologous_superfamily	Winged helix DNA-binding domain superfamily	Interproscan
IPR040450	Domain	TFIIF beta subunit, HTH domain	Interproscan
IPR040504	Domain	TFIIF, beta subunit, N-terminal	Interproscan

PANTHER

PANTHER term	Description	Source
PTHR10445	GENERAL TRANSCRIPTION FACTOR IIF SUBUNIT 2	Interproscan

Gene Ontology

GO terms	Category	Description	Source
GO:0005674	Cellular Component	transcription factor TFIIF complex	Interproscan
GO:0006366	Biological Process	transcription by RNA polymerase II	Interproscan
GO:0006367	Biological Process	transcription initiation at RNA polymerase II promoter	Interproscan

KEGG pathway

KO	Enzyme	Enzyme ID	pathway	mapID	Source
-	-	-	-	-	-

Expression pattern

1. Expression trend for PE_Scaf11661_25.6 global RNA-seq network