Gene detail

Detailed information of PE_Scaf10496_0.2 in Paraescarpia echinospica Gene info

Gene ID	Annotation	Chromosome	Start	End	Strand
PE_Scaf10496_0.2	ASPARTATE AMINOTRANSFERASE	Superscaffold3	53149721	53160253	+

Gene Structure

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CDS

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PE_Scaf10496_0.2

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Protein

Gene family

Gene family	Subfamily
-	-

Pfam domain

Pfam accession	Pfam name	Description	Type	Source
PF00155	Aminotran_1_2	Aminotransferase class I and II	Domain	Interproscan

InterPro

InterPro term	Type	Description	Source
IPR004838	Binding_site	Aminotransferases, class-I, pyridoxal-phosphate-binding site	Interproscan
IPR004839	Domain	Aminotransferase, class I/classII	Interproscan
IPR015421	Homologous_superfamily	Pyridoxal phosphate-dependent transferase, major domain	Interproscan
IPR015422	Homologous_superfamily	Pyridoxal phosphate-dependent transferase, small domain	Interproscan
IPR015424	Homologous_superfamily	Pyridoxal phosphate-dependent transferase	Interproscan
IPR050596	Family	Class-I Pyridoxal-Phosphate-Dependent Aminotransferase	Interproscan

PANTHER

PANTHER term	Description	Source
PTHR46383	ASPARTATE AMINOTRANSFERASE	Interproscan

Gene Ontology

GO terms	Category	Description	Source
GO:0003824	Molecular Function	catalytic activity	Interproscan
GO:0009058	Biological Process	biosynthetic process	Interproscan
GO:0030170	Molecular Function	pyridoxal phosphate binding	Interproscan

KEGG pathway

KO	Enzyme	Enzyme ID	pathway	mapID	Source
-	-	-	-	-	-

Expression pattern

1. Expression trend for PE_Scaf10496_0.2 global RNA-seq network