Gene detail

Detailed information of PE_Scaf10035_0.3 in Paraescarpia echinospica Gene info

Gene ID	Annotation	Chromosome	Start	End	Strand
PE_Scaf10035_0.3	LYSINE-SPECIFIC DEMETHYLASE	unanchor10033	18076	27797	-

Gene Structure

More details in Jbrowse Sequence

CDS

Transcript

PE_Scaf10035_0.3

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Protein

Gene family

Gene family	Subfamily
-	-

Pfam domain

Pfam accession	Pfam name	Description	Type	Source
PF02373	JmjC	JmjC domain, hydroxylase	Domain	Interproscan
PF21322	KDM6_C-hel	Lysine-specific demethylase 6/UTY, C-terminal helical domain	Domain	Interproscan

InterPro

InterPro term	Type	Description	Source
IPR003347	Domain	JmjC domain	Interproscan
IPR048562	Domain	Lysine-specific demethylase 6A/B-like, C-terminal helical domain	Interproscan
IPR051630	Family	Transcriptional Corepressor and Histone Demethylase	Interproscan

PANTHER

PANTHER term	Description	Source
PTHR14017	LYSINE-SPECIFIC DEMETHYLASE	Interproscan

Gene Ontology

GO terms	Category	Description	Source
GO:0000978	Molecular Function	RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding	Interproscan
GO:0010468	Biological Process	regulation of gene expression	Interproscan
GO:0031490	Molecular Function	chromatin DNA binding	Interproscan
GO:0044666	Cellular Component	MLL3/4 complex	Interproscan
GO:0071557	Biological Process	obsolete histone H3-K27 demethylation	Interproscan
GO:0071558	Molecular Function	histone H3K27me2/H3K27me3 demethylase activity	Interproscan

KEGG pathway

KO	Enzyme	Enzyme ID	pathway	mapID	Source
-	-	-	-	-	-

Expression pattern

1. Expression trend for PE_Scaf10035_0.3 global RNA-seq network