Gene detail

Detailed information of HK74SY85_g3467 in Paraphelliactis xishaensis sp. nov.

Genomic Location: ctg15:1114965...1117620
NR annotation: XP_031550026.1, zinc finger protein 143-like [Actinia tenebrosa]

Gene Structure

More details in Jbrowse

Sequence

CDS

Transcript

HK74SY85_g3467

AAAAATGTATGTGATTTCAAAGGATGCGGGAAAACTTTCAAGAAGAAACACAGACTCATTGAACACAAGCGTGCTCACACTGGAGAGGTAAGTGTTGGTAGGATGTAGGATAATTTTCGCCAGTACGATGGAATACTTGATCTAATTTGTACACGTGTAAGGTTTGGGCTAGTCTGAACTGGTCTGTGTCATCAAAGAAAGACTTCAAATGAGCACAAAAATCTTACCCTTTTTACAGTGAAATTTTTAATTTAGCATTGATATTTGCTTGGAAAATTAAATTTGACTTTATGAGGAGATCTGATTGTGTGTTGTTCAGTTTCCAAGTAAGACATAAAGTTTCCCTCGCGCAAAAATCAACAAGTTGAAATACTACTGAATATTAAACTCGGGTGTTAATAAGATTTGTTTCACGGAAATTATATCTGAAATAGAAGGTTTTCTTGCTAATTTAATAAAGAAGTTACAAATCTGTATATTTGTACACCCTAACTTTTGTTTTCATCAAGAAAACTGACTCATTTTAACTCTAACTATTTGTTGAGATATCGTCTGCAATGTTTCAGCTAGAAATCATTGAAACTTCtatcctgcgagcaaaggttcttttctaatccctccacgaagcaaggggaaaagtaacccctgtcggccctcacaatttccacatccacatttctggtaaaaactatggtctattcgacaaaaacctgtttcaaaaccggttttgtatgcaaatgtcatcacacgcatgacagttttgtttgcaaggtatcgctggctcgcgaaaatgacgtctttctacatcacattcacacatgctcaacagaaatagtcatgaggaccggcagaggtttttcccctcacttgcttgctagcagaggatttaaaaaaatctctgctcgcaggataTGAAACTTCAGGATTTCAACTTGTAAAGATTTATGATCCGTtccttaatctttaatctttaatcgggtatctcctaaaacagtataactttactaggagttTGGataatataaataaatataattataatatgatGTCGatatatacagcattttgcaaaaattatgtaaaaaaccatatataatacatatatatcaaaactgagcttaaaattatgggatagccacaactatatttcaatcagatagtcctcatgataaacaactattgcagaatataattgaagacatcccataatttgaagctcagttttgatatatatgtattatatatgcttttttacataatttttgcaaaatgctgtatacagaaatatatgaatacatatatatatatatATatatataaatatgacaataaataattaaaataaattgaataaaataatgttcaattTCGTTGGTTTATAAATAAGATAATTTAGGTTAATGACCTAATGGCTGGAAGTATAGTAGCCTTAAATTTATGGAACAGTTCATTTACATTCTCTGATTGGTTCTTCAAGTGACTACGGTTATAGAATCCTGTTTATAATGTATTCCATTCATTATTCAACAGAGACCTTGCTTATGCACACATGCAGAATGCAACAAGACATTTGTACGAGAAAGACATTTAAAACGGCATCTACTGAGCCATAATGGTACAAAACCATACAGGTACAGAAATCGATTTCATAGATTATAGTAGATGACTATTTAtatacacctattccaaaaatcattgtccctgccgaaagcaacaagcaagaagctgacgactgcaaagggcattgggacttaattctccttattcatttactcatccgtagacattttgacaacatgcattttcaaatggcccaatagttccaaatgattgctattcaacgcttgtagggataacttctcaagtaaccacggataaattaattaattaggagattcccaaagtcctttgcagtcgtcagcttcttgcttgttgcttttggcctggacaacgatatttggaataggtgtataAGTAATGCTGCTTAGTTTGAACTGGACTTCCATTTTCATGAATGATGCAATAATGAAACAACTACCATAAGGTTGGCTCAGTTGATTGACTTGAACCAGAACTAGACCATCATAGACTTAGTATTGAGTAGAGGATACTAACTCTTGTCATCAACAAATGGCTACATATTTATGTTCTCTTAGATAAGGAAGTAATTTAATTTTTTTTTCATTCATATTAACATTTCACTTCAAATGCACAGTTGTTCTCATACTGGTTGTAACTTGATGTTTACAACTAAACACTTCCTAAAACGACACCAAGAAAGAGCTCACAATAGGCCCTTCAAGGTAAAATACATGTACATACACAATTGCATACTTTTATTTATAGTTATTATAAATACCTAGATATGTATGGAGGGTAAAGGCTTGAAATCTTGAGTAAAGTCAATTACGCCTTCTTATTTAACAGTGTTTCAGACCTGAAATAAATGTACTTGTCATTGTACATGCTAGAGTTAATCATGCAATTAAACATGTACCCTACTACGTACATGTAACTTTGTATTTAACATTAATTTTATTCTGATATCCAGTGTCCATATGAAGGATGTGACATGACATTTAAGAAAAATAATCGTCTGAAAATCCATCAGTATGTACATACCAAGGAAACACCCTTTAGGTTAGTATCAGTTGGGAAAAATGTATGTGATTTCAAAGGATGCGGGAAAACTTTCAAGAAGAAACACAGACTCATTGAACACAAGCGTGCTCACACTGGAGAGAGACCTTGCTTATGCACACATGCAGAATGCAACAAGACATTTGTACGAGAAAGACATTTAAAACGGCATCTACTGAGCCATAATGGTACAAAACCATACAGTTGTTCTCATACTGGTTGTAACTTGATGTTTACAACTAAACACTTCCTAAAACGACACCAAGAAAGAGCTCACAATAGGCCCTTCAAGTGTCCATATGAAGGATGTGACATGACATTTAAGAAAAATAATCGTCTGAAAATCCATCAGTATGTACATACCAAGGAAACACCCTTTAGGTTAGTATCAGTTGGG

Protein

Pfam domain

Pfam accession	Pfam name	Description	Type	Source
PF00096	zf-C2H2	Zinc finger, C2H2 type	Domain	Interproscan

InterPro

InterPro term	Type	Description	Source
IPR013087	Domain	Zinc finger C2H2-type	Interproscan
IPR036236	Homologous_superfamily	Zinc finger C2H2 superfamily	Interproscan
IPR051061	Family	Zinc finger transcriptional regulators	Interproscan

PANTHER

PANTHER term	Description	Source
PTHR46179	ZINC FINGER PROTEIN	Interproscan

Gene Ontology

GO terms	Category	Description	Source
GO:0005634	Cellular Component	nucleus	Interproscan

KEGG pathway

KO	Enzyme	Enzyme ID	pathway	mapID	Source
K09191	GTF3A; general transcription factor IIIA	-	Transcription machinery	ko03021	deepkoala