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Detailed information of CsqKR_Scaf218_5.32 in Chrysomallon squamiferum Gene info

Gene ID	Annotation	Chromosome	Start	End	Strand
CsqKR_Scaf218_5.32	PQ-LOOP REPEAT-CONTAINING PROTEIN 1-LIKE PROTEIN	chr3	14706693	14712833	-

Gene Structure

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CDS

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CsqKR_Scaf218_5.32

AATAATATGATGTGTTTTATGTTGTGGTGTACAGGACACAGCTGTGGACATGAGGTACACCAAGACTAATGTTCACTTAGTTGCTCTTTAGAAGAATATGTTTGAAATTTTTCCTGATGTAAACTACGCTTCATATCTAGAAAGTGTCAGAATGCCTGAGATTACCTTTTTAAACCTGATAAGCTGGATTGCTGCAGGAGCAATGATAGTTGGTGGAGTTTTCCCATTTATTCCTCAGTATCTCGATATCAAGAGGACTCGCAATGCTGAGGGATTTTCAACATTTGTGTGCCTAAATCTTCTGATAGCAAACATTTTAAGAATACTCTTTTGGTTTGGAAGACATTTTGAGCTTCCACTGTTAGCTCAAAGTATACTGATGTTGTTTGCCATGCTGGCTATGGTTAGACTGTGTGTCAGTGTCACATCAAAAACTGAGATACTCTCATCCAAACATCACCGTTTCTTTGATTTTGACATACAGTATTTCTGGAAGTGGACTGATTTTCTGAGCTATGTAGAGTTTACAATGACATTTTCTCTTGTCGTTGGGACCCTGACATATCTGCTGCTGAACAACACAGTTTATATAGAATTTCTTGGCTTTATGGCTGTTTTTGCTGAAGCCATGCTGGGTACTCCTCAGTTCTATAGAAATTTTATTAACAAATCTACACTTGGGATGAGTAAAAAGATGGTGGCTATGTGGACATGTGGAGATATTTTTAAGACTGGATACTTCATTCTTCGAGAGGCTCCGGTTCAGTTCTGGGTGTGTGGGGCTCTCCAGGTTTCGATAGATGTGGCGATATTCATGCAGGTCATAATTTACCGTCGCAGACCTCCACTCAAACCACACAGCTGACCAATTGTACAAATTTAAGTCAGTATGCAAATTAACAGAACTTGTTTGCTTTTTTGACATATTTTGCTTTTTGATTCACATATTGTACATAAAGGTTTATCAGTGTAACATAATGTATTCCTTAGCTTTTATATATGTGTCTTTCTTTTCTAATTATTATTATTATTATTTTTTGACGTATTTTTGTTTCATTAATCAGCAATTCATTTAGGTGTTTATTTTAATTAATTTATTCTGGGATGTAAATTTATTACTTATTAATACAATGTTTTTAGGTGGTTTATGAAATGTTTTAATTATTGCTAAATATAATTATTAAAATTTTTATCACTATCTAAAGCAGTTCCTTTTAATTTTTATTATTATTAATAATAGTGTTAGTAGTAGTATTATGTATCATCCTACATTAGCTCAGTCATTGATATATAAATCACACTTTCCTTTATATTCATATATTAATCATTATTTATTGTAAATAAAAAGAAAATGATATTGGAACAAGTTTAGATATGTAACAGATGTGAATCATGACATGAACATTAAGTTATTCTGTATATGAAACTTTCTGGCCAGTCACAAATTGCACCAATCCTTCAAAATAATGTAAACAAATACTGCTATGATCCTTAACTTTTTGTATTTGTTCAGTATATGTAAATAAAAAGTGATTTTTAAAGATAGATTTCTTTTTCCCATAATAAACATTTCTGAAGATAGTAATAATGTGCATCATTCATTCTAGAAATAGTCATATATAAATCAAGGTAGAAAAAGATGCATAATACTTTTTTGAAATCTTAGGGATCAAAATTATGAAGAAATTTAAAATATTTAATAGGTTTATGTCACAGCTATCTATTAAAACATAATTATTTTCACTAGTTAATTTTTCCTATATATTATGAAGTGATATGTAAAAGACATGTATCTGAATATATATTATAATAATTTAACATTTTGTTATCTTCATTTATTTATTTTAGTAATATATACAAAAAGATTTAAAACCCTAAGGGTGAAACAAACAAAATAATAATGGTAGAAGAATTTTTTATTATCATTTTTTTAACATTGTTTTATTATTATTCTTTTTATTATTAACCTTTTAGAATGTGTCAGTTTCTTATTATTTCTTTTGTGAATTTTTAATGAGGTGCAACTTGAATGCTAGTTACTTATAACTACATCTGTATATAAATAAAACATCAATGTTTTGAAATCCATATAATATCATTTGTAATGGGAAATGTACTTAAGAGTAATGTGCATTTCATTATTTTGCTTGTTTTTTGCAATGGCTATGCATGGAAAATGTCTTTGTGTATGTGTGTGTGGGGGGGGGATGTTTGATGCTCCCTAAGTGAATTATGACAAACATAAAATATTGTTGCTCACCTTAAAAATACAATAGTTTGTATGAAAATTTTTGACAACAGGAATATCGATGTCATTAGATGTTTTGGTAATTTATGGTAAAATATATATTCTTCACTTCAGGTTATGTGGATGAAAGAAAAAACCCTCAATAACCTACACATTTTCATTTTGTGGTGTCATTTTAGTATTATAGAAGTATTACATAAGATACATTTTAGTATTCTTCACAACTGCCTGCAATAACATCCATTCTAGTATACATCAAAAATGATAAGAGATCATATTTAGATGTCAAATGTTTTTGATTGATGTTTGCTACCAATAATAATCTTTGGTTTTGTATGCAGCCCGTTCAAGAATATTTACAACAGAAATGTATATAGGTTATAATACCATATGTTTTATATCTCAACATACTTATTTGTGATCTACAAATGATATAAAATACATTTTTAAAGTATGACTGCAAACAATCATAAAATCTTTACACATCAAAACCTTTATTAATACGAATTGTGAAATAATTTTAACATAACTGATGAAAGTATATGTATGTTTGCTTTAAATAAGCATTATTTTTTACTTTGTTTTCTTTCATCCAAATATGAATTCTGAAACAGTATAAGCATAATGGATGAAAATAACAGTTGTTTATTCTGATTACTTTTTGTCATCTTTTCATTGGTCCACATCAAATATGAATAACAAGCTGGAATTTTTTTCTTTGTCACTATATTTCATTGTGGGATAGAGATTATGACTGATTCTTAACTGGGAGAGGTATAGTTATGTCTTGCAAGACTCTAAGACAGCAAAAGCTATATATTTATGACATATAATGATTATAACTGCATCACATAATTTATCATACTTCTATCATGGTATAAAATTTATTCTTGGGGCTCCACTCAGAAAGGTTCTATGAAATATGTTGAAAAATTAATGGACAAGAAAAACTGGTTTAAATCACTATATTGCAGAAAGTTAAGTGGGCTTCTTGCTTAGGTTGTCTCAAAAAATAAAAACAATCGCACAAAATAACAGGGTTTGGATTTGGTGATGAAACACATAAAATACTGGGTTGGAACAAAGGCTCTTAATGGGTTTTTAAGTGAAATTCAAAAACTATTTAGATATAGGTACAGATTTATTCAAGCTACATGTGCCATTTTGTTCCATGTTTCAGAATATAAAATTGTTACATACTTCAGTCACATCTGAAACAAAATCATTTGCTCAAAAGCCACCTATGGCAAAAACTGATTCCAATCCAGTATTTTATTGATGGAAAATCTTTATTTAAGGAAAACAAATTTTTGATGTATACAATTTCAGCAGGGTCTGATAATAAAGTTTTAAAGTAAATCAAACAATATTTTGTCTGAAAAAGCTGTCAAGTTATTGTGTTTTATCGTTAAGAATAATTTTAATTATTTTATATTTTATCTGGTATGTTACATATGATAGTATATTTTTTCATATTATAAAGGAAAATTCCTATATTATTTATTTCAATATTTGTTAATCCACCTTTAAAAAGACAAATATTAGTACTTATTTTATTTCTCATTTTTAATTATTATTTAATGTGCACAGTAATTTTTTTCTTTTTTTAATGTGGGTGTTTTGTTTGTGTTACAGACTTTTTTTCAGATAATATATTTTATTGGTACAAAATTATTTTTTGTGATTTACAATGTACTATTTGTAATAATATAAATAAAAATGGTTTCTGAAGAGGTGTGCCCTGAATTTTTTTTTAATGAAATGATGAACGTTTGTCAGTTAAAGCTTTCTGCATCATATGTGTCTGTTTAAAAAATAGGTACATTTAAATTTAATTTTAATAAATGTTTACATATACAAGAAATAAAAAAATGGCAGGATTAAA

Protein

Gene family

Gene family	Subfamily
-	-

Pfam domain

Pfam accession	Pfam name	Description	Type	Source
PF04193	PQ-loop	PQ loop repeat	Repeat	Interproscan

InterPro

InterPro term	Type	Description	Source
IPR006603	Repeat	PQ-loop repeat	Interproscan
IPR052241	Family	Solute Carrier Family 66 (SLC66) and Scramblase ANY1	Interproscan

PANTHER

PANTHER term	Description	Source
PTHR14856	PQ-LOOP REPEAT-CONTAINING PROTEIN 1-LIKE PROTEIN	Interproscan

Gene Ontology

GO terms	Category	Description	Source
GO:0005768	Cellular Component	endosome	Interproscan
GO:0005802	Cellular Component	trans-Golgi network	Interproscan
GO:0042147	Biological Process	retrograde transport, endosome to Golgi	Interproscan
GO:0045332	Biological Process	phospholipid translocation	Interproscan

KEGG pathway

KO	Enzyme	Enzyme ID	pathway	mapID	Source
-	-	-	-	-	-

Expression pattern

1. Expression trend for CsqKR_Scaf218_5.32 global RNA-seq network