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Detailed information of Bpl_scaf_18776-0.20 in Gigantidas platifrons Gene info

Gene ID	Annotation	Scaffold	Start	End	Strand
Bpl_scaf_18776-0.20	-	Bpl_scaf_18776	40501	45178	-

Gene Structure

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CDS

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Bpl_scaf_18776-0.20

TTCAAAATGAAAGAAGAACTTGTAATTATATTGCTTTCCATTGCCTTCACTGCAGTCACAAAATGTCGTATTTTGGGAACATTTGTAATGCCACACGGAGGAATAGCTCTCGATCCTTCCCAATTTAACACAACAAATCAAACTGCTAAAACAGAGGCAGTCGAGTTACACGATTCATGCGAGTTGGTAGGAAAACAGATCGATGCATTGAATCCTGATCTTATTTTCTTAAGCACTCCGCACGGTATTTCTGACTTAAATAATTTTGTATTCTACTTGAATCCTAATGGATATGGGGAGGCAGACACTGATAACTGTCAATGCCCACCGTGCTGTTTTTCAGTCAAAATCAAAATCGACAATTCAACATCATTGAATTTAGTGAACTTTTTAAAAACTTGTTCTAATGTCAGTGGACTCAGTGGCTTTGGACCACCTGGACAAAGTGAAGAACCGTTTCCATTGAGATGGGGAGAAGTGATTCCTCTTCATTTTCTTCCAAATATCAACAGAAGTAAAGTGATTGTTCTGTCACATCCAAGTAGACGATATACACAGGATGTTTCCATGATCCCAGAACTGCTTGAACTGGGATATGACCTTTACAAATATTTGGAGAATTTAAAACAAAGGGTGGTGGTGATTATAAGTGCAGACTTGGCCCATACACATCTCAAATCTGGTCCTTATGGCTATTCTGATGCTGCAGAACCCTTTGATAAGGCTGTTGGCAGATGGGCAGAAACATTAGATGAATTCCTTTTAACAGTTGATGCAGCCAAATATGTTGACAAAGCCTTATCCTGTGGATACACTGGATTGGTCATGTTACATGGAATGATGAAAGCTGGGTATCTGTCGTCATGGTATCCAACGTTATATGCAAATTACCATCCAAGTTATTATGGAATGATGGTAGCTTCATTTATAAAAACACAATAAAAGATATATTTTATATATAGATAGTTTAAATAATTTAGAAAGAGGGGCTGTCATGGTCGTGATCGTATGGTAGTTTGATTTACAACTACCTATATGCAATCAGTGCCTACACCACTAAAGTTGTGAGTTCGAATCCAGCTCTTGGCGATGGGGAACTCAATACAACTTTATGTGATAAAGTTTGTCAGTGACATGCGGCAACTCAATAGTTTTCTCTGGGTACTTCCATCAATAAAACTGACCGCAACGATATAACTGAAACATTGGTGAAGTGTGCATTAAAAAGTTTTGATGACATTCTCTATTAAATTGTAGGAGAAGTTGTGCGTACAAACATTTGAGACAGACTGACAGGGTGAACAGAATATGTCTAGCCCAGAATTTAATTAGATTTTAATTATCAAATTATTAATTTAATTAAAAAGATAAGAACCCAATATCTAGTTTTAATCAAATGCTTAGAGGATTTATGGTAGTAAAATGAACTACAGCATACAAGTATAAATTTCATCATGATGTTTATTTATAACTTAACATACATGGCTGTTGCTGGGTAACAAAGTAAGAAAACACCACAGTATTTATTGTATGTAACAGTCAAGTTATTTTACTTCAAAGGTTTTTCTAATGGAAAATATGCAAATTAGACCTATTGTCCATTAAATATAGAACCCTTTTTTATTGTACAGAAAATACATTACCTTTTATTGTTTAATTTCAAATTTGATTTTAAATCCATTTTTCACATGTCTGTGAAACAAACTTAAAATTAAAACTTTTACCACATAAAAAGAACTCGATACAACATTGACTTGCGGCAGGTCAGTGGTTTTCCCCGGGTACTCAGGTTTCCTCCACTAATAATACTGACTGCCACAATATAGCTGAAATATTGTAGAAAGTGGCATTAAACACCATAACCCAACACAACCCAATATGAAAAGAAACAGTACATAAATCAACATGCATTCAATATTTGTGTTATTTTGTCAAACTAAATAGCTATTTGTTATACATGTATTAGCTTTATAAAACTTATACATAGTAAAAAGACTTAATATAGTTTTAACAAAGACCAACAACATCTTTTAAACAAATCACAATGTCTGATAAAAAATACGTTCCTTGCTTCCACTATAAAATTTCATATGCATTTCTGATAGTGTCATACTGTGTAATACATGTAATCTCCATTGAATTCTAGTCGTGAAAGCAGTATTAGTTATCGATAATCGACGGATGTACACAGGACCCTGATGGTCCATCCTTAAGCTGTCTTATTGATAACAGCCACATGTAGATTTGACAGCTGTTGTGTCCATTTATCTAAAGCATTGTATCTAGCACATGTTGATTCTCTCTTTAACTCTAAAACTTGATTTACTTGATCTATCCTTCCCATGATGGCACTGAAAAATATTATATTCGTCGTGATATTTTATAAACTTCATTCTATCAAAATACATAAATAATGGGTAAATTATTTTTTTCTCATTCTATCTGATTATAATCGGCTGTCGTAATACAAAAACAGTGCAAAATTAAAGGAGCTGTTAAAATTTTACCAGCAGCGATTTCATTGGCTGGTCAAGAATTCATCAGACCATGACCTCTTATCTGGTTCTGTCAGATGTTAGAGGGAGCATAGCATATTATAACAACTTATTTTAATTTTTTTTTAAATGTTTTTTGTTACCGTTTTTAGGTACGTATAGAATGCGGTCTTAAGCTTTAAAAGGATAATTTGTAGGTGGGGGGCGTTTTATGCATAGGAGCAAGTATCAGACACTTTTTTTCAGGTCACGCAGAGACTTGCCGGTAGCATAGCTTCGAGTTCACGGACGGCAATATTCCCAATGATCGGTGAATTATTGTTCAAATAACATTAATTGTGTTCAT

Protein

Gene family

Gene family	Subfamily
-	-

Pfam domain

Pfam accession	Pfam name	Description	Type	Source
PF02900	LigB	Catalytic LigB subunit of aromatic ring-opening dioxygenase	Domain	Interproscan

InterPro

InterPro term	Type	Description	Source
IPR004183	Domain	Extradiol ring-cleavage dioxygenase, class III enzyme, subunit B	Interproscan

PANTHER

PANTHER term	Description	Source
-	-	-

Gene Ontology

GO terms	Category	Description	Source
GO:0006725	Biological Process	obsolete cellular aromatic compound metabolic process	Interproscan
GO:0008198	Molecular Function	ferrous iron binding	Interproscan
GO:0016491	Molecular Function	oxidoreductase activity	Interproscan

KEGG pathway

KO	Enzyme	Enzyme ID	pathway	mapID	Source
-	-	-	-	-	-

Expression pattern

1. Expression trend for Bpl_scaf_18776-0.20 global RNA-seq network