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Detailed information of Bpl_scaf_11412-0.14 in Gigantidas platifrons Gene info

Gene ID	Annotation	Scaffold	Start	End	Strand
Bpl_scaf_11412-0.14	VITELLOGENIN RECEPTOR-LIKE PROTEIN-RELATED-RELATED	Bpl_scaf_11412	13114	49151	-

Gene Structure

More details in Jbrowse Sequence

CDS

Bpl_scaf_11412-0.14

ATGTATTGGACAGACACTGGAGAATACCCGAAGATAGAAAGAGGGTCGATGGATGGCAATCAGCTCCATCGAGCTACAATTATACAGAACAATATATATTGGCCGATCGGTTTGTCAGTAGACTATGAGGAGTCAAGGATTTATTGGGTTGATGCTAGGCTGAAGTATATCCATAGTTGTAATATGGATGGTTCAAACCGTCGTGTGGTTCTCTCAAAAAATATAAGACGTCCGTATGACATTACAGTTTACGACAACACTTTATATTGGACAGATTGGAGGGATCGAAGAATTTATTCTTGTGATAAAAAGACTGGCAAAAATCGTACCAGGATACAAGATGTCTACTCCCCCTTGGGTATCAAAGTATTTAGTGCTAAACGACAACCCAAAGACCAAGGTGAAAACATTTGTAATTCTCAAAACGGAGGATGTTCGCATCTTTGTCTGAGATCACCCATTGAACCATATTACACATGTGCTTGTCCAACAGGAATAAAATTAAAACAAGACAAGAAAACATGTAATGAAGGATATGACCAATTATTATTGATTGCGAGAAGAACGGGTCTACGACTATTATCATTGGATACACCAGATTACACAGATGTTGATATAGAACTGATGGATATTAAACAAGCCGTTGCCATTGACTACGACCCAGTTGATAATTATGTGTATTGGACTGATGATCTAGTAAAGGCAATCTCAAGAGTTCACCTAGATGGAACAGGTCAAGAAATTGTTATTAATGAAAGTCTGATAAATCCAGATGGTGTAGCTGTTGACTGGATAGCTCGAAATTTATACTGGATAGATCAGGGTACTAAACGGATAGAAGTTTCACGTCTCAACGGAACGTCACGCTTAGTATTGGTTATGGACGACATGGAAGAACCGAGAGCTATAACTCTTGATCCAGTAACTGGGTATATGTACTGGACAGATTGGGGCAGCAAGCCAAAAATAGAACGAGCACATCTTGATGGTTCTGGACGTGTTTGTATTGTTAATTCGTGGTTAGGGTGGCCTTATGGGATAGCTGTTGACCACGAAGAGCAACTGGTGTACTGGGGTGATGCTCAAGTGGACAAAATAGAAGTAGCCAATGTTGATGGGACAGGAAGACGTGTGTTAGTAAAGCATAATCTACCTCATTTATTTGGATTCAGTTTATTAGGAGATTATATATATTGGTCAGATTGGCAGAAACGATCAATAGAAAGAATCAACAAAAGGACTGGGAATGACAGAAAAACGATTTTGTCTCAACGACCAGATATAATGGGATTAGTCGCTGTCAGCACAAAGAATATAGGTACGAATCCTTGTGCTGATAACAATGGTGGATGTAGCCATCTCTGTTTAATGAAACCGTTACCATTCAAACCAGTGTGTGCATGCCCAGTGAATCTGGATATTGGTAATGACAACAAGACTTGCATAGAATTTGATGGCTTTTTACTATTCAGCGACGGGAGATCACTCAACACATTGTCGTTGGTGGGGAATCATTTAGCCAGGCGACTGCCAATTAAGGGAATCAAAAAAGCTGTTTCCATGGACTTTGACATGGAAGAAAAGCGTGTTTACTGGGTAGATTTAAAATTGAAGACAATAAATCGAGCTTTTATGGATGGAAATGAAGTAGAGACCATAATTCGCTATGGCGTCAAGCAACCAGTCAGCATTGCGATAGACTGGGTATCTAAGAATATATATTGGATAGATAGACATTCAAAACAGATAGAAGTAGCCAGGACAGATGGAACGTCTCGCAGAGTCATTGTATGGAAACATGTACATAGACCTAAAACATTGGCAGTAGATCCACCAAATGGTTATATGTACTGGTCTGATTGGTCAGGAAAGGGTAGAATAGAAAGAGCTTCATTAGATGGGACAAGTCGATTGGTACTGATACCTAATGTTAGCAAAGTGAATGTCATAGTATTAGATTTCATGGAAAAGAAATTATATTGGACTAGGAAATTTGACACTATGATTGAATTTGCAAATATTGACGGTACTAACCGAAAACAGATAATTGCATCCAAGATATTCAAAATACGGAGCTTTACATTGTATAATGATCTTATATTCTGGCATGATTGGAATCAAAAGACAATAATGAGAGCTGATAAAAGATATGGAGGTAACCAGACAACATTGACGGACAAGATAGAAAGTGTGTATGATATGAAGATCTATCACCCGTCAAGACAAGCAGGTTCTAACAGCTGCCATGACAACAATGGAGATTGTTCCTATTTATGTATTGCAAATCCAGCTGTTGATGGAAAAATCCAGAGGCACCAATGCTCTTGCCCCACGCACTATGCACTCGATCCAAATAATAGATCTTGCTCAGCGCCGACGTCATATTTATTATATAGTCAAAGGAATACGATAAGCCGCTTAATCATGGATGAGAACGACACTGATACTAAAATACCGGAAGTTGTTTTGCCCATTCCAAATTTGAGAAATGTGAAGGCGTTATCGTATGATCCAATAGATGAGGATATATACTGGATTGAGGGAAAGACGAATATTATCAAAAGGGCAACATCTAATGGTACATACTGGACAACAGTAGTTTCTAATGACAACAAATACTATCGACCATATGATATGGATATAGATCCATACGGTCGTTCACTGTATTGGACGTGCTCTAAACGGAACGTCATCAATATATCCCGATTAGATGGCACTCCGTTGGGAGTGGTGATACAAGGAGACAATGAAAAACCTAGATCTATAGTATTAAGTCCACGAAAAAGGTTTATGTACTGGGTAAACATGGTACAACAACCTACTATTGAGAGTGCAGCAATGGACGGTACAGACAGACGGACGTTAATATCCACATTAATGGGTATATCGGATCCACTAATTATTGATGTCGATGATGAAACGTTATATTGGGCAGATGAAGGTTTAGAACGTATTGAGTATTATGACATTACAAGCGGTAATCGTAAGGTTTTAGTATCTAGTCAGATTGTACGACCAACAGGAATGGCCGTTTTTGGAAAATATTTATACTGGATCGACAGAGATAGCATGTTAATGTCACGAGTTGATAAAAGCACGGGACAGGAACGAAGTGTCTTCTCGAATAGATTTAGACGTGCTAGTGACCTTCATGTTGCTGTGAATAATTTACCTGATCATCTTGGTCAATTGTGCTTACATAGTAATGGTGGATGTTCTCACATTTGTGTTGCTTATGGTGAACGTGACATTCATTGTGCATGTCCATTAGGGTTTTATTTAAAGTTGGATGAAAAGACGTGCTCAGATAAGCATGAATGCTCTGCGAGTCAGTTTTCCTGCGTGAGTGGTCAAATCCTCTGCATTCCTTTGGTATGGCGATGCGATCTTAGCACCGAATGCATGGATAGCTCAGATGAATTAGGTTGCCCAATATGTCTTGACTATCAATTTAAATGTGTGAATGATGAATGCATTCATGCTAGCTATGTTTGTGATGGATTTGCACACTGTAATGACCAAAGTGATGAGACACACTGTGCCAGGAACTGCATTGTTGGACAGTTTGCTTGTCTCAGTGGCAATATATCTTGCATTCCGGGTGAAAGGAGATGCGATAATTTTCCAGATTGCCAAGACGGGTCAGATGAAGCAGACTGTCCCCTTTGCCCCAATCAGTTGTTTTGTACGGATGGTGAATGTTTTGATGCTAGACAGGTGTGCGATGGAACTCCAAACTGTAAGGATGCAATTGACGAAAAAGATTGCTCTCGATAA

Transcript

Bpl_scaf_11412-0.14

TATAGAACACATCTTATACAGGTATATGTATTGGACAGACACTGGAGAATACCCGAAGATAGAAAGAGGGTCGATGGATGGCAATCAGCTCCATCGAGCTACAATTATACAGAACAATATATATTGGCCGATCGGTTTGTCAGTAGACTATGAGGAGTCAAGGATTTATTGGGTTGATGCTAGGCTGAAGTATATCCATAGTTGTAATATGGATGGTTCAAACCGTCGTGTGGTTCTCTCAAAAAATATAAGACGTCCGTATGACATTACAGTTTACGACAACACTTTATATTGGACAGATTGGAGGGATCGAAGAATTTATTCTTGTGATAAAAAGACTGGCAAAAATCGTACCAGGATACAAGATGTCTACTCCCCCTTGGGTATCAAAGTATTTAGTGCTAAACGACAACCCAAAGACCAAGGTGAAAACATTTGTAATTCTCAAAACGGAGGATGTTCGCATCTTTGTCTGAGATCACCCATTGAACCATATTACACATGTGCTTGTCCAACAGGAATAAAATTAAAACAAGACAAGAAAACATGTAATGAAGGATATGACCAATTATTATTGATTGCGAGAAGAACGGGTCTACGACTATTATCATTGGATACACCAGATTACACAGATGTTGATATAGAACTGATGGATATTAAACAAGCCGTTGCCATTGACTACGACCCAGTTGATAATTATGTGTATTGGACTGATGATCTAGTAAAGGCAATCTCAAGAGTTCACCTAGATGGAACAGGTCAAGAAATTGTTATTAATGAAAGTCTGATAAATCCAGATGGTGTAGCTGTTGACTGGATAGCTCGAAATTTATACTGGATAGATCAGGGTACTAAACGGATAGAAGTTTCACGTCTCAACGGAACGTCACGCTTAGTATTGGTTATGGACGACATGGAAGAACCGAGAGCTATAACTCTTGATCCAGTAACTGGGTATATGTACTGGACAGATTGGGGCAGCAAGCCAAAAATAGAACGAGCACATCTTGATGGTTCTGGACGTGTTTGTATTGTTAATTCGTGGTTAGGGTGGCCTTATGGGATAGCTGTTGACCACGAAGAGCAACTGGTGTACTGGGGTGATGCTCAAGTGGACAAAATAGAAGTAGCCAATGTTGATGGGACAGGAAGACGTGTGTTAGTAAAGCATAATCTACCTCATTTATTTGGATTCAGTTTATTAGGAGATTATATATATTGGTCAGATTGGCAGAAACGATCAATAGAAAGAATCAACAAAAGGACTGGGAATGACAGAAAAACGATTTTGTCTCAACGACCAGATATAATGGGATTAGTCGCTGTCAGCACAAAGAATATAGGTACGAATCCTTGTGCTGATAACAATGGTGGATGTAGCCATCTCTGTTTAATGAAACCGTTACCATTCAAACCAGTGTGTGCATGCCCAGTGAATCTGGATATTGGTAATGACAACAAGACTTGCATAGAATTTGATGGCTTTTTACTATTCAGCGACGGGAGATCACTCAACACATTGTCGTTGGTGGGGAATCATTTAGCCAGGCGACTGCCAATTAAGGGAATCAAAAAAGCTGTTTCCATGGACTTTGACATGGAAGAAAAGCGTGTTTACTGGGTAGATTTAAAATTGAAGACAATAAATCGAGCTTTTATGGATGGAAATGAAGTAGAGACCATAATTCGCTATGGCGTCAAGCAACCAGTCAGCATTGCGATAGACTGGGTATCTAAGAATATATATTGGATAGATAGACATTCAAAACAGATAGAAGTAGCCAGGACAGATGGAACGTCTCGCAGAGTCATTGTATGGAAACATGTACATAGACCTAAAACATTGGCAGTAGATCCACCAAATGGTTATATGTACTGGTCTGATTGGTCAGGAAAGGGTAGAATAGAAAGAGCTTCATTAGATGGGACAAGTCGATTGGTACTGATACCTAATGTTAGCAAAGTGAATGTCATAGTATTAGATTTCATGGAAAAGAAATTATATTGGACTAGGAAATTTGACACTATGATTGAATTTGCAAATATTGACGGTACTAACCGAAAACAGATAATTGCATCCAAGATATTCAAAATACGGAGCTTTACATTGTATAATGATCTTATATTCTGGCATGATTGGAATCAAAAGACAATAATGAGAGCTGATAAAAGATATGGAGGTAACCAGACAACATTGACGGACAAGATAGAAAGTGTGTATGATATGAAGATCTATCACCCGTCAAGACAAGCAGGTTCTAACAGCTGCCATGACAACAATGGAGATTGTTCCTATTTATGTATTGCAAATCCAGCTGTTGATGGAAAAATCCAGAGGCACCAATGCTCTTGCCCCACGCACTATGCACTCGATCCAAATAATAGATCTTGCTCAGCGCCGACGTCATATTTATTATATAGTCAAAGGAATACGATAAGCCGCTTAATCATGGATGAGAACGACACTGATACTAAAATACCGGAAGTTGTTTTGCCCATTCCAAATTTGAGAAATGTGAAGGCGTTATCGTATGATCCAATAGATGAGGATATATACTGGATTGAGGGAAAGACGAATATTATCAAAAGGGCAACATCTAATGGTACATACTGGACAACAGTAGTTTCTAATGACAACAAATACTATCGACCATATGATATGGATATAGATCCATACGGTCGTTCACTGTATTGGACGTGCTCTAAACGGAACGTCATCAATATATCCCGATTAGATGGCACTCCGTTGGGAGTGGTGATACAAGGAGACAATGAAAAACCTAGATCTATAGTATTAAGTCCACGAAAAAGGTTTATGTACTGGGTAAACATGGTACAACAACCTACTATTGAGAGTGCAGCAATGGACGGTACAGACAGACGGACGTTAATATCCACATTAATGGGTATATCGGATCCACTAATTATTGATGTCGATGATGAAACGTTATATTGGGCAGATGAAGGTTTAGAACGTATTGAGTATTATGACATTACAAGCGGTAATCGTAAGGTTTTAGTATCTAGTCAGATTGTACGACCAACAGGAATGGCCGTTTTTGGAAAATATTTATACTGGATCGACAGAGATAGCATGTTAATGTCACGAGTTGATAAAAGCACGGGACAGGAACGAAGTGTCTTCTCGAATAGATTTAGACGTGCTAGTGACCTTCATGTTGCTGTGAATAATTTACCTGATCATCTTGGTCAATTGTGCTTACATAGTAATGGTGGATGTTCTCACATTTGTGTTGCTTATGGTGAACGTGACATTCATTGTGCATGTCCATTAGGGTTTTATTTAAAGTTGGATGAAAAGACGTGCTCAGATAAGCATGAATGCTCTGCGAGTCAGTTTTCCTGCGTGAGTGGTCAAATCCTCTGCATTCCTTTGGTATGGCGATGCGATCTTAGCACCGAATGCATGGATAGCTCAGATGAATTAGGTTGCCCAATATGTCTTGACTATCAATTTAAATGTGTGAATGATGAATGCATTCATGCTAGCTATGTTTGTGATGGATTTGCACACTGTAATGACCAAAGTGATGAGACACACTGTGCCAGGAACTGCATTGTTGGACAGTTTGCTTGTCTCAGTGGCAATATATCTTGCATTCCGGGTGAAAGGAGATGCGATAATTTTCCAGATTGCCAAGACGGGTCAGATGAAGCAGACTGTCCCCTTTGCCCCAATCAGTTGTTTTGTACGGATGGTGAATGTTTTGATGCTAGACAGGTGTGCGATGGAACTCCAAACTGTAAGGATGCAATTGACGAAAAAGATTGCTCTCGATAACCTACAAATAATACAGACGAAACCAGCTCAGATGATCCTCTGGTGGTTGCACCTGGAAATGCTTGAATAGTACAGCCATATATACCATCAACATATTAAATCAATAAGAAATAAAAATGTCTCCTGCAATGATTAAAACTTTTTCTTTTTCTTTCAAAACATGAGTTATCAATATGTTTCTTATATGTGTC

Protein

Gene family

Gene family	Subfamily
-	-

Pfam domain

Pfam accession	Pfam name	Description	Type	Source
PF00057	Ldl_recept_a	Low-density lipoprotein receptor domain class A	Repeat	Interproscan
PF00058	Ldl_recept_b	Low-density lipoprotein receptor repeat class B	Repeat	Interproscan
PF14670	FXa_inhibition	Coagulation Factor Xa inhibitory site	Domain	Interproscan

InterPro

InterPro term	Type	Description	Source
IPR000033	Repeat	LDLR class B repeat	Interproscan
IPR000742	Domain	EGF-like domain	Interproscan
IPR002172	Repeat	Low-density lipoprotein (LDL) receptor class A repeat	Interproscan
IPR011042	Homologous_superfamily	Six-bladed beta-propeller, TolB-like	Interproscan
IPR023415	Conserved_site	Low-density lipoprotein (LDL) receptor class A, conserved site	Interproscan
IPR036055	Homologous_superfamily	LDL receptor-like superfamily	Interproscan
IPR050778	Family	Cueball/EGF/LRP/Nidogen	Interproscan

PANTHER

PANTHER term	Description	Source
PTHR46513	VITELLOGENIN RECEPTOR-LIKE PROTEIN-RELATED-RELATED	Interproscan

Gene Ontology

GO terms	Category	Description	Source
GO:0005515	Molecular Function	protein binding	Interproscan

KEGG pathway

KO	Enzyme	Enzyme ID	pathway	mapID	Source
K03068	LRP5_6; low density lipoprotein receptor-related protein 5/6	-	Wnt signaling pathway	ko04310	PMID: 28812709
			mTOR signaling pathway	ko04150	PMID: 28812709
			Breast cancer	ko05224	PMID: 28812709

Expression pattern

1. Expression trend for Bpl_scaf_11412-0.14 global RNA-seq network